Doublet Group distance statistics: 52232

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.009, 0.031, 0.054, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.031 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.011, 0.039, 0.068, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.039 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.014, 0.048, 0.082, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.048 std_dev=0.034
N6	A	0, 0.014, 0.051, 0.089, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.051 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.024, 0.082, 0.140, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.082 std_dev=0.058
C8	A	0, 0.027, 0.094, 0.160, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.094 std_dev=0.067
O2'	B	0, 0.038, 0.323, 0.609, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.323 std_dev=0.286
C2'	B	0, 0.087, 0.488, 0.889, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.488 std_dev=0.401
C2'	A	0, 0.133, 0.651, 1.170, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.651 std_dev=0.518
O4'	A	0, 0.154, 0.673, 1.193, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.673 std_dev=0.520
O5'	A	0, 0.263, 0.917, 1.570, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.917 std_dev=0.653
O2'	A	0, 0.078, 0.754, 1.429, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.754 std_dev=0.676
C4'	A	0, 0.238, 0.940, 1.641, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.940 std_dev=0.701
O3'	B	0, 0.212, 0.976, 1.740, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.976 std_dev=0.764
C3'	B	0, -0.040, 0.745, 1.530, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.745 std_dev=0.785
C3'	A	0, 0.240, 1.032, 1.825, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.032 std_dev=0.792
C1'	B	0, 0.269, 1.107, 1.945, 2.027 max_d=2.027 avg_d=1.107 std_dev=0.838
P	A	0, 0.369, 1.401, 2.432, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.401 std_dev=1.031
O3'	A	0, 0.346, 1.380, 2.414, 2.488 max_d=2.488 avg_d=1.380 std_dev=1.034
O4'	B	0, 0.311, 1.435, 2.558, 2.743 max_d=2.743 avg_d=1.435 std_dev=1.123
C4'	B	0, 0.142, 1.281, 2.420, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.281 std_dev=1.139
C5'	A	0, 0.348, 1.555, 2.762, 2.942 max_d=2.942 avg_d=1.555 std_dev=1.207
N1	B	0, 0.408, 1.749, 3.091, 3.260 max_d=3.260 avg_d=1.749 std_dev=1.342
O2	B	0, 0.618, 2.112, 3.606, 3.226 max_d=3.226 avg_d=2.112 std_dev=1.494
OP1	A	0, 0.404, 1.923, 3.441, 3.714 max_d=3.714 avg_d=1.923 std_dev=1.519
C2	B	0, 0.623, 2.194, 3.765, 3.593 max_d=3.593 avg_d=2.194 std_dev=1.571
OP2	A	0, 0.514, 2.120, 3.726, 3.887 max_d=3.887 avg_d=2.120 std_dev=1.606
C5'	B	0, 0.102, 1.817, 3.533, 4.117 max_d=4.117 avg_d=1.817 std_dev=1.715
C6	B	0, 0.259, 2.040, 3.820, 4.338 max_d=4.338 avg_d=2.040 std_dev=1.781
O5'	B	0, 0.095, 1.990, 3.884, 4.538 max_d=4.538 avg_d=1.990 std_dev=1.894
N3	B	0, 0.791, 2.866, 4.941, 4.845 max_d=4.845 avg_d=2.866 std_dev=2.075
C5	B	0, 0.408, 2.660, 4.913, 5.508 max_d=5.508 avg_d=2.660 std_dev=2.252
C4	B	0, 0.739, 3.123, 5.507, 5.784 max_d=5.784 avg_d=3.123 std_dev=2.384
P	B	0, 0.139, 2.631, 5.124, 5.978 max_d=5.978 avg_d=2.631 std_dev=2.492
OP2	B	0, 0.313, 2.962, 5.611, 6.429 max_d=6.429 avg_d=2.962 std_dev=2.649
OP1	B	0, -0.154, 2.538, 5.230, 6.265 max_d=6.265 avg_d=2.538 std_dev=2.692
O4	B	0, 0.961, 3.822, 6.683, 6.884 max_d=6.884 avg_d=3.822 std_dev=2.861

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.44	0.13	0.17
C2	0.01	0.00	0.26	0.21	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.31	0.10	0.16	0.73	0.23	0.28
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.13	0.02	0.08	0.02	0.13	0.11	0.21	0.25	0.10	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.25	0.50	0.08	0.24
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.09	0.21	0.16	0.19	0.09	0.17	0.08	0.01	0.00	0.02	0.38	0.52	0.09	0.29
C4	0.01	0.00	0.13	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.12	0.06	0.19	0.68	0.21	0.26
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.03	0.30	0.08	0.07
C5	0.00	0.00	0.08	0.08	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.09	0.04	0.28	0.76	0.25	0.30
C5'	0.04	0.10	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.09	0.09	0.06	0.02	0.03	0.09	0.07	0.03	0.01	0.28	0.12	0.00
C6	0.00	0.01	0.13	0.09	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.13	0.07	0.29	0.81	0.28	0.32
C8	0.01	0.00	0.11	0.21	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.21	0.05	0.31	0.64	0.21	0.25
N1	0.01	0.00	0.21	0.16	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.23	0.09	0.23	0.79	0.27	0.31
N3	0.01	0.00	0.25	0.19	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.28	0.10	0.12	0.66	0.20	0.25
N6	0.00	0.01	0.10	0.09	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.12	0.06	0.34	0.84	0.31	0.35
N7	0.00	0.00	0.06	0.17	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.18	0.01	0.35	0.74	0.25	0.30
N9	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.18	0.59	0.18	0.22
O2'	0.00	0.34	0.00	0.01	0.18	0.10	0.13	0.09	0.20	0.05	0.29	0.32	0.17	0.02	0.04	0.00	0.06	0.06	0.17	0.41	0.07	0.18
O3'	0.03	0.31	0.02	0.00	0.12	0.02	0.09	0.07	0.13	0.21	0.23	0.28	0.12	0.18	0.05	0.06	0.00	0.01	0.37	0.45	0.22	0.32
O4'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.03	0.07	0.05	0.09	0.10	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.10	0.35	0.16	0.15
O5'	0.05	0.16	0.25	0.38	0.19	0.03	0.28	0.01	0.29	0.31	0.23	0.12	0.34	0.35	0.18	0.17	0.37	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.44	0.73	0.50	0.52	0.68	0.30	0.76	0.28	0.81	0.64	0.79	0.66	0.84	0.74	0.59	0.41	0.45	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.23	0.08	0.09	0.21	0.08	0.25	0.12	0.28	0.21	0.27	0.20	0.31	0.25	0.18	0.07	0.22	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.28	0.24	0.29	0.26	0.07	0.30	0.00	0.32	0.25	0.31	0.25	0.35	0.30	0.22	0.18	0.32	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.63	0.09	0.30	0.92	0.73	0.72	0.87	0.48	0.40	0.87	0.59	0.21	0.60	1.09	0.47	0.48	0.76	0.18	0.53
C2	0.27	0.51	0.03	0.43	0.73	1.00	0.48	1.26	0.28	0.27	0.74	0.53	0.12	0.59	0.89	0.79	0.89	1.28	0.68	1.05
C2'	0.42	1.16	0.44	0.23	1.55	0.32	1.32	0.38	1.01	0.90	1.47	1.07	0.15	0.43	1.75	0.06	0.16	0.31	0.47	0.18
C3'	0.66	1.29	0.61	0.42	1.71	0.15	1.56	0.18	1.28	1.12	1.58	1.12	0.04	0.27	1.88	0.36	0.54	0.46	0.91	0.59
C4	0.26	0.43	0.01	0.44	0.61	0.98	0.40	1.20	0.23	0.21	0.62	0.44	0.12	0.60	0.74	0.77	0.85	1.18	0.64	0.98
C4'	0.29	0.77	0.25	0.03	1.16	0.28	1.05	0.27	0.82	0.65	1.02	0.61	0.32	0.37	1.31	0.15	0.11	0.19	0.45	0.15
C5	0.38	0.26	0.06	0.50	0.34	1.08	0.22	1.34	0.23	0.21	0.38	0.30	0.04	0.56	0.42	0.93	1.05	1.36	0.90	1.20
C5'	0.28	0.46	0.27	0.12	0.82	0.17	0.83	0.04	0.67	0.47	0.65	0.27	0.53	0.27	0.93	0.20	0.26	0.37	0.56	0.35
C6	0.43	0.29	0.07	0.50	0.34	1.10	0.25	1.40	0.29	0.27	0.39	0.33	0.03	0.54	0.42	0.98	1.13	1.48	1.02	1.32
C8	0.33	0.18	0.05	0.49	0.27	1.02	0.16	1.21	0.17	0.12	0.29	0.21	0.06	0.57	0.34	0.83	0.91	1.15	0.74	1.01
N1	0.36	0.39	0.05	0.47	0.51	1.06	0.31	1.36	0.24	0.23	0.55	0.43	0.07	0.57	0.64	0.91	1.04	1.43	0.89	1.23
N3	0.21	0.57	0.04	0.40	0.82	0.94	0.57	1.16	0.34	0.30	0.81	0.56	0.15	0.61	0.99	0.70	0.78	1.14	0.52	0.90
N6	0.52	0.33	0.11	0.53	0.34	1.14	0.38	1.48	0.45	0.40	0.35	0.34	0.05	0.50	0.36	1.08	1.27	1.61	1.24	1.49
N7	0.45	0.16	0.09	0.53	0.19	1.12	0.24	1.37	0.33	0.28	0.20	0.16	0.05	0.53	0.21	0.99	1.11	1.36	0.99	1.25
N9	0.20	0.42	0.02	0.41	0.61	0.91	0.42	1.09	0.24	0.21	0.61	0.42	0.14	0.61	0.74	0.68	0.74	1.03	0.51	0.83
O2'	0.50	1.36	0.49	0.22	1.85	0.29	1.57	0.36	1.19	1.05	1.74	1.25	0.17	0.40	2.12	0.08	0.17	0.23	0.60	0.17
O3'	1.07	1.86	0.89	0.72	2.44	0.48	2.25	0.54	1.87	1.65	2.25	1.62	0.22	0.27	2.67	0.80	1.02	0.85	1.50	1.10
O4'	0.28	0.42	0.20	0.39	0.70	0.75	0.58	0.83	0.42	0.32	0.62	0.33	0.41	0.65	0.82	0.55	0.49	0.68	0.21	0.51
O5'	0.50	0.71	0.50	0.32	0.81	0.18	0.76	0.14	0.69	0.65	0.79	0.67	0.31	0.01	0.87	0.34	0.30	0.29	0.42	0.31
OP1	0.16	0.22	0.13	0.22	0.45	0.21	0.55	0.39	0.49	0.30	0.31	0.10	0.22	0.01	0.46	0.21	0.53	0.61	0.69	0.61
OP2	0.31	0.40	0.46	0.05	0.21	0.18	0.12	0.49	0.14	0.29	0.35	0.50	0.60	0.02	0.16	0.10	0.53	0.96	0.66	0.73
P	0.06	0.02	0.11	0.01	0.08	0.08	0.14	0.17	0.14	0.07	0.03	0.07	0.15	0.00	0.08	0.03	0.13	0.32	0.15	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02
C2	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.02
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.05	0.15	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.02
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.13	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03
C4	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.04
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.05	0.06	0.05	0.06
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01
C6	0.00	0.00	0.08	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.03	0.03
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02
O2	0.02	0.00	0.15	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.15	0.00	0.05	0.04	0.07	0.02	0.01
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.01	0.05	0.14	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.02	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.03	0.08	0.00	0.06	0.15	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.09	0.03	0.04
O4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02
O5'	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.04	0.06	0.03	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.09	0.05	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00