Doublet Group distance statistics: 52239

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C5	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C4	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N9	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.000, 0.041, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C2	A	0, 0.000, 0.044, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.044 std_dev=0.044
C8	A	0, 0.000, 0.044, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.044 std_dev=0.044
C1'	A	0, 0.000, 0.044, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.044 std_dev=0.044
N3	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
N6	A	0, 0.000, 0.098, 0.196, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.098 std_dev=0.098
O4'	A	0, 0.000, 0.315, 0.630, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.315 std_dev=0.315
O3'	B	0, 0.000, 0.383, 0.765, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.383 std_dev=0.383
C2'	A	0, 0.000, 0.419, 0.837, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.419 std_dev=0.419
OP1	A	0, 0.000, 0.528, 1.057, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.528 std_dev=0.528
C2'	B	0, 0.000, 0.536, 1.073, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.536 std_dev=0.536
P	A	0, 0.000, 0.548, 1.096, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.548 std_dev=0.548
O5'	A	0, 0.000, 0.590, 1.179, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.590 std_dev=0.590
C5'	A	0, 0.000, 0.610, 1.220, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.610 std_dev=0.610
C4'	A	0, 0.000, 0.620, 1.241, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.620 std_dev=0.620
O2'	A	0, 0.000, 0.646, 1.291, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.646 std_dev=0.646
C3'	B	0, 0.000, 0.679, 1.358, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.679 std_dev=0.679
O2'	B	0, 0.000, 0.786, 1.573, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.786 std_dev=0.786
C3'	A	0, 0.000, 0.806, 1.613, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.806 std_dev=0.806
OP2	A	0, 0.000, 0.842, 1.684, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.842 std_dev=0.842
C1'	B	0, 0.000, 0.848, 1.696, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.848 std_dev=0.848
C4'	B	0, 0.000, 1.267, 2.534, 2.534 max_d=2.534 avg_d=1.267 std_dev=1.267
O3'	A	0, 0.000, 1.450, 2.899, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.450 std_dev=1.450
O4'	B	0, 0.000, 1.459, 2.919, 2.919 max_d=2.919 avg_d=1.459 std_dev=1.459
N1	B	0, 0.000, 1.598, 3.195, 3.195 max_d=3.195 avg_d=1.598 std_dev=1.598
O2	B	0, 0.000, 1.630, 3.259, 3.259 max_d=3.259 avg_d=1.630 std_dev=1.630
C2	B	0, 0.000, 1.808, 3.617, 3.617 max_d=3.617 avg_d=1.808 std_dev=1.808
C5'	B	0, 0.000, 1.970, 3.939, 3.939 max_d=3.939 avg_d=1.970 std_dev=1.970
C6	B	0, 0.000, 2.477, 4.954, 4.954 max_d=4.954 avg_d=2.477 std_dev=2.477
N3	B	0, 0.000, 2.710, 5.419, 5.419 max_d=5.419 avg_d=2.710 std_dev=2.710
O5'	B	0, 0.000, 3.243, 6.486, 6.486 max_d=6.486 avg_d=3.243 std_dev=3.243
C5	B	0, 0.000, 3.265, 6.530, 6.530 max_d=6.530 avg_d=3.265 std_dev=3.265
C4	B	0, 0.000, 3.374, 6.749, 6.749 max_d=6.749 avg_d=3.374 std_dev=3.374
OP1	B	0, 0.000, 4.058, 8.116, 8.116 max_d=8.116 avg_d=4.058 std_dev=4.058
P	B	0, 0.000, 4.157, 8.314, 8.314 max_d=8.314 avg_d=4.157 std_dev=4.157
O4	B	0, 0.000, 4.175, 8.351, 8.351 max_d=8.351 avg_d=4.175 std_dev=4.175
OP2	B	0, 0.000, 4.618, 9.237, 9.237 max_d=9.237 avg_d=4.618 std_dev=4.618

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.04	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.21	0.00	0.15	0.01	0.14	0.09
C2	0.06	0.00	0.23	0.27	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.05	0.10	0.02	0.03
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.05	0.13	0.09	0.09	0.18	0.23	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.25	0.13	0.27	0.22
C3'	0.02	0.27	0.00	0.00	0.25	0.00	0.29	0.01	0.31	0.25	0.31	0.24	0.30	0.29	0.21	0.02	0.01	0.02	0.13	0.18	0.04	0.14
C4	0.02	0.00	0.12	0.25	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.14	0.03	0.04	0.06	0.06	0.03	0.03
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.07	0.07	0.03	0.07	0.07	0.26	0.01	0.00	0.02	0.08	0.06	0.03
C5	0.00	0.01	0.05	0.29	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.21	0.15	0.05	0.06	0.10	0.02	0.03
C5'	0.04	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.12	0.18	0.00	0.00	0.09	0.09	0.00
C6	0.00	0.01	0.09	0.31	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.20	0.16	0.06	0.07	0.15	0.03	0.05
C8	0.03	0.00	0.09	0.25	0.00	0.08	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.21	0.17	0.00	0.08	0.02	0.03	0.02
N1	0.04	0.00	0.18	0.31	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.05	0.05	0.13	0.02	0.03
N3	0.06	0.00	0.23	0.24	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.02
N6	0.03	0.00	0.03	0.30	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.25	0.20	0.09	0.10	0.22	0.06	0.09
N7	0.02	0.01	0.05	0.29	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.24	0.22	0.03	0.06	0.09	0.01	0.02
N9	0.00	0.01	0.01	0.21	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.14	0.02	0.01	0.08	0.02	0.05	0.03
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.14	0.26	0.21	0.12	0.20	0.21	0.13	0.04	0.25	0.24	0.14	0.00	0.05	0.19	0.11	0.00	0.13	0.12
O3'	0.21	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.15	0.18	0.16	0.17	0.10	0.04	0.20	0.22	0.02	0.05	0.00	0.16	0.37	0.30	0.37	0.38
O4'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.09	0.03	0.01	0.19	0.16	0.00	0.09	0.04	0.09	0.03
O5'	0.15	0.05	0.25	0.13	0.06	0.02	0.06	0.00	0.07	0.08	0.05	0.05	0.10	0.06	0.08	0.11	0.37	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.01	0.10	0.13	0.18	0.06	0.08	0.10	0.09	0.15	0.02	0.13	0.05	0.22	0.09	0.02	0.00	0.30	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.02	0.27	0.04	0.03	0.06	0.02	0.09	0.03	0.03	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.13	0.37	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.03	0.22	0.14	0.03	0.03	0.03	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.09	0.02	0.03	0.12	0.38	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.59	0.44	0.17	0.46	1.22	0.78	1.64	1.17	1.45	0.86	0.67	0.09	0.19	0.04	1.27	0.91	1.81	1.80	2.35	2.04
C2	0.55	0.97	0.10	0.33	2.26	0.51	2.25	0.85	1.71	1.11	1.58	0.32	0.46	0.10	2.67	0.72	1.49	1.42	2.12	1.73
C2'	0.67	0.20	0.21	0.58	0.86	1.04	1.46	1.51	1.42	0.78	0.30	0.33	0.04	0.22	0.81	1.13	2.24	2.31	2.78	2.53
C3'	0.01	0.53	0.37	0.00	0.00	0.49	0.55	1.02	0.56	0.01	0.48	0.94	0.49	0.22	0.04	0.49	1.66	2.02	2.26	2.06
C4	0.57	0.86	0.13	0.37	1.91	0.55	2.05	0.88	1.65	1.07	1.32	0.24	0.40	0.08	2.10	0.75	1.47	1.37	1.99	1.65
C4'	0.17	0.21	0.12	0.15	0.21	0.49	0.64	0.88	0.63	0.20	0.16	0.55	0.26	0.08	0.19	0.50	1.37	1.57	1.76	1.61
C5	0.55	1.05	0.17	0.34	1.95	0.42	1.94	0.68	1.55	1.10	1.53	0.49	0.43	0.10	2.13	0.62	1.17	1.03	1.60	1.30
C5'	0.12	0.23	0.06	0.13	0.01	0.39	0.31	0.68	0.37	0.09	0.24	0.45	0.12	0.01	0.07	0.37	0.99	1.13	1.13	1.11
C6	0.52	1.19	0.16	0.31	2.18	0.35	2.02	0.61	1.55	1.12	1.78	0.65	0.47	0.10	2.47	0.55	1.09	0.95	1.56	1.23
C8	0.56	0.72	0.22	0.42	1.34	0.52	1.53	0.77	1.35	0.94	0.98	0.26	0.27	0.06	1.39	0.68	1.21	1.04	1.50	1.28
N1	0.52	1.12	0.12	0.31	2.32	0.41	2.17	0.70	1.64	1.12	1.78	0.52	0.49	0.11	2.74	0.61	1.26	1.16	1.82	1.45
N3	0.57	0.83	0.10	0.35	2.05	0.58	2.19	0.94	1.71	1.07	1.35	0.17	0.42	0.09	2.36	0.79	1.61	1.55	2.25	1.85
N6	0.49	1.30	0.21	0.30	2.10	0.26	1.85	0.47	1.42	1.10	1.87	0.90	0.43	0.06	2.38	0.44	0.85	0.70	1.26	0.95
N7	0.54	0.97	0.23	0.35	1.58	0.37	1.60	0.57	1.35	1.02	1.30	0.53	0.37	0.10	1.67	0.55	0.97	0.79	1.27	1.03
N9	0.59	0.67	0.16	0.41	1.52	0.63	1.80	0.96	1.53	0.97	0.99	0.11	0.30	0.04	1.60	0.80	1.53	1.43	1.99	1.69
O2'	0.94	0.51	0.40	0.67	1.25	1.20	1.90	1.63	1.79	1.09	0.62	0.03	0.16	0.24	1.20	1.41	2.50	2.53	3.22	2.86
O3'	0.37	0.97	0.68	0.35	0.50	0.12	0.09	0.61	0.10	0.42	0.98	1.32	0.73	0.47	0.54	0.11	1.31	1.81	2.05	1.80
O4'	0.41	0.25	0.08	0.33	0.84	0.57	1.19	0.92	1.07	0.59	0.42	0.16	0.20	0.02	0.88	0.66	1.43	1.45	1.87	1.62
O5'	0.11	0.21	0.05	0.13	0.03	0.35	0.23	0.57	0.29	0.06	0.21	0.38	0.09	0.01	0.08	0.31	0.82	0.84	0.81	0.85
OP1	0.16	0.22	0.18	0.12	0.31	0.01	0.34	0.01	0.31	0.24	0.26	0.15	0.07	0.01	0.32	0.07	0.04	0.16	0.07	0.02
OP2	0.24	0.46	0.14	0.21	0.60	0.22	0.53	0.32	0.43	0.39	0.56	0.40	0.04	0.01	0.66	0.25	0.34	0.32	0.53	0.40
P	0.01	0.13	0.00	0.01	0.10	0.02	0.00	0.05	0.04	0.03	0.15	0.18	0.02	0.00	0.13	0.02	0.12	0.07	0.06	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.23	0.24	0.07	0.22
C2	0.02	0.00	0.03	0.08	0.00	0.05	0.02	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.01	0.33	0.24	0.16	0.29
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.18	0.08	0.17
C3'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.09	0.10	0.01	0.00	0.08	0.01	0.18	0.16	0.05	0.14
C4	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.35	0.23	0.20	0.31
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.10	0.00	0.08	0.01	0.05	0.03	0.08	0.02	0.04	0.01	0.12	0.00	0.03	0.12	0.10	0.04
C5	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.37	0.28	0.22	0.34
C5'	0.00	0.10	0.02	0.02	0.20	0.01	0.17	0.00	0.10	0.07	0.16	0.07	0.05	0.03	0.23	0.01	0.01	0.18	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.39	0.31	0.20	0.34
N1	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.34	0.28	0.16	0.30
N3	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.01	0.34	0.23	0.18	0.30
O2	0.04	0.00	0.05	0.10	0.00	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.04	0.30	0.22	0.14	0.27
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.09	0.11	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05
O4	0.02	0.00	0.01	0.08	0.00	0.12	0.02	0.23	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.00	0.05	0.34	0.21	0.19	0.29
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.17	0.23	0.00	0.17
O5'	0.23	0.33	0.19	0.18	0.35	0.03	0.37	0.01	0.39	0.34	0.34	0.30	0.07	0.07	0.34	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.24	0.24	0.18	0.16	0.23	0.12	0.28	0.18	0.31	0.28	0.23	0.22	0.11	0.05	0.21	0.23	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.16	0.08	0.05	0.20	0.10	0.22	0.19	0.20	0.16	0.18	0.14	0.00	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.29	0.17	0.14	0.31	0.04	0.34	0.02	0.34	0.30	0.30	0.27	0.08	0.05	0.29	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00