Doublet Group distance statistics: 52242

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N1	B	0, 0.000, 0.146, 0.292, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.146 std_dev=0.146
C2	B	0, 0.000, 0.200, 0.399, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.200 std_dev=0.200
C1'	B	0, 0.000, 0.220, 0.440, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.220 std_dev=0.220
O4'	B	0, 0.000, 0.224, 0.448, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.224 std_dev=0.224
C5'	B	0, 0.000, 0.249, 0.497, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.249 std_dev=0.249
C4'	B	0, 0.000, 0.253, 0.506, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.253 std_dev=0.253
C2'	B	0, 0.000, 0.311, 0.621, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.311 std_dev=0.311
O2	B	0, 0.000, 0.332, 0.664, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.332 std_dev=0.332
C3'	B	0, 0.000, 0.358, 0.716, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.358 std_dev=0.358
C6	B	0, 0.000, 0.359, 0.719, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.359 std_dev=0.359
N3	B	0, 0.000, 0.400, 0.800, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.400 std_dev=0.400
C5	B	0, 0.000, 0.485, 0.970, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.485 std_dev=0.485
C4	B	0, 0.000, 0.503, 1.006, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.503 std_dev=0.503
O2'	B	0, 0.000, 0.538, 1.075, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.538 std_dev=0.538
O4'	A	0, 0.000, 0.556, 1.113, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.556 std_dev=0.556
O3'	B	0, 0.000, 0.592, 1.183, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.592 std_dev=0.592
OP1	A	0, 0.000, 0.639, 1.279, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.639 std_dev=0.639
C2'	A	0, 0.000, 0.654, 1.307, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.654 std_dev=0.654
P	A	0, 0.000, 0.698, 1.396, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.698 std_dev=0.698
O4	B	0, 0.000, 0.715, 1.430, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.715 std_dev=0.715
OP2	A	0, 0.000, 0.915, 1.830, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.915 std_dev=0.915
C3'	A	0, 0.000, 0.960, 1.921, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.960 std_dev=0.960
O5'	A	0, 0.000, 0.970, 1.940, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.970 std_dev=0.970
C4'	A	0, 0.000, 1.038, 2.077, 2.077 max_d=2.077 avg_d=1.038 std_dev=1.038
O2'	A	0, 0.000, 1.039, 2.078, 2.078 max_d=2.078 avg_d=1.039 std_dev=1.039
O3'	A	0, 0.000, 1.202, 2.404, 2.404 max_d=2.404 avg_d=1.202 std_dev=1.202
O5'	B	0, 0.000, 1.328, 2.655, 2.655 max_d=2.655 avg_d=1.328 std_dev=1.328
C5'	A	0, 0.000, 1.677, 3.355, 3.355 max_d=3.355 avg_d=1.677 std_dev=1.677
P	B	0, 0.000, 2.069, 4.139, 4.139 max_d=4.139 avg_d=2.069 std_dev=2.069
OP2	B	0, 0.000, 2.271, 4.542, 4.542 max_d=4.542 avg_d=2.271 std_dev=2.271
OP1	B	0, 0.000, 2.830, 5.659, 5.659 max_d=5.659 avg_d=2.830 std_dev=2.830

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.03	0.17	0.01	0.02
C2	0.03	0.00	0.34	0.43	0.01	0.14	0.02	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.24	0.00	0.11	0.16	0.13	0.06
C2'	0.00	0.34	0.00	0.01	0.18	0.02	0.10	0.03	0.16	0.12	0.26	0.34	0.12	0.05	0.02	0.00	0.00	0.02	0.26	0.13	0.26	0.32
C3'	0.02	0.43	0.01	0.00	0.34	0.00	0.36	0.01	0.41	0.19	0.44	0.38	0.42	0.28	0.21	0.02	0.01	0.02	0.18	0.13	0.25	0.26
C4	0.02	0.01	0.18	0.34	0.00	0.13	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.16	0.01	0.09	0.14	0.09	0.03
C4'	0.02	0.14	0.02	0.00	0.13	0.00	0.17	0.01	0.18	0.14	0.17	0.12	0.21	0.17	0.10	0.23	0.00	0.00	0.02	0.15	0.11	0.07
C5	0.02	0.02	0.10	0.36	0.00	0.17	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.23	0.02	0.13	0.09	0.10	0.04
C5'	0.02	0.27	0.03	0.01	0.25	0.01	0.32	0.00	0.35	0.27	0.32	0.21	0.40	0.33	0.19	0.17	0.10	0.02	0.00	0.07	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.16	0.41	0.00	0.18	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.28	0.02	0.15	0.09	0.12	0.05
C8	0.00	0.01	0.12	0.19	0.00	0.14	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.25	0.10	0.05	0.10	0.08	0.05	0.01
N1	0.03	0.00	0.26	0.44	0.01	0.17	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.28	0.01	0.13	0.13	0.13	0.06
N3	0.03	0.00	0.34	0.38	0.00	0.12	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.17	0.00	0.08	0.17	0.11	0.05
N6	0.03	0.01	0.12	0.42	0.00	0.21	0.01	0.40	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.30	0.31	0.03	0.18	0.08	0.14	0.07
N7	0.01	0.02	0.05	0.28	0.00	0.17	0.00	0.33	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.29	0.19	0.04	0.13	0.05	0.07	0.02
N9	0.00	0.02	0.02	0.21	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.17	0.06	0.02	0.06	0.13	0.05	0.01
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.17	0.23	0.26	0.17	0.26	0.25	0.19	0.06	0.30	0.29	0.17	0.00	0.04	0.17	0.01	0.26	0.06	0.01
O3'	0.13	0.24	0.00	0.01	0.16	0.00	0.23	0.10	0.28	0.10	0.28	0.17	0.31	0.19	0.06	0.04	0.00	0.05	0.04	0.04	0.03	0.06
O4'	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.17	0.05	0.00	0.05	0.24	0.14	0.11
O5'	0.03	0.11	0.26	0.18	0.09	0.02	0.13	0.00	0.15	0.10	0.13	0.08	0.18	0.13	0.06	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.17	0.16	0.13	0.13	0.14	0.15	0.09	0.07	0.09	0.08	0.13	0.17	0.08	0.05	0.13	0.26	0.04	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.13	0.26	0.25	0.09	0.11	0.10	0.03	0.12	0.05	0.13	0.11	0.14	0.07	0.05	0.06	0.03	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.06	0.32	0.26	0.03	0.07	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.14	0.17	0.19	0.23	0.02	0.12	0.09	0.01	0.01	0.26	0.18	0.29	0.35	0.31	0.03	0.68	1.49	0.53	0.97
C2	0.07	0.08	0.08	0.12	0.32	0.03	0.22	0.04	0.09	0.02	0.26	0.00	0.16	0.26	0.45	0.03	0.78	1.34	0.38	0.91
C2'	0.48	0.14	0.59	0.60	0.04	0.38	0.13	0.28	0.28	0.33	0.06	0.13	0.73	0.75	0.17	0.36	0.21	1.02	0.06	0.50
C3'	0.04	0.53	0.14	0.29	0.68	0.09	0.50	0.02	0.32	0.29	0.71	0.58	0.26	0.51	0.79	0.04	0.31	1.03	0.21	0.57
C4	0.10	0.10	0.10	0.14	0.28	0.04	0.17	0.04	0.04	0.01	0.26	0.06	0.19	0.28	0.38	0.05	0.75	1.32	0.38	0.89
C4'	0.35	0.69	0.21	0.05	0.71	0.17	0.59	0.20	0.48	0.50	0.77	0.78	0.16	0.10	0.77	0.28	0.51	1.31	0.49	0.79
C5	0.10	0.06	0.08	0.12	0.25	0.07	0.15	0.01	0.03	0.02	0.22	0.00	0.14	0.26	0.36	0.07	0.75	1.15	0.27	0.79
C5'	0.72	1.05	0.53	0.24	1.04	0.29	0.92	0.27	0.82	0.87	1.09	1.12	0.53	0.08	1.08	0.51	0.39	1.05	0.42	0.61
C6	0.08	0.04	0.05	0.10	0.27	0.06	0.18	0.00	0.06	0.01	0.20	0.04	0.10	0.23	0.40	0.06	0.75	1.10	0.22	0.76
C8	0.12	0.10	0.10	0.14	0.19	0.06	0.09	0.04	0.01	0.03	0.22	0.12	0.17	0.28	0.26	0.07	0.74	1.21	0.34	0.82
N1	0.08	0.05	0.06	0.11	0.30	0.05	0.21	0.02	0.08	0.00	0.23	0.04	0.12	0.24	0.44	0.05	0.77	1.21	0.28	0.82
N3	0.08	0.10	0.10	0.14	0.30	0.03	0.20	0.06	0.07	0.01	0.27	0.05	0.19	0.28	0.42	0.03	0.76	1.41	0.43	0.94
N6	0.06	0.02	0.01	0.06	0.24	0.05	0.18	0.01	0.07	0.00	0.15	0.06	0.04	0.19	0.36	0.05	0.74	0.95	0.12	0.66
N7	0.12	0.05	0.08	0.12	0.19	0.08	0.10	0.01	0.01	0.04	0.19	0.03	0.12	0.25	0.27	0.09	0.73	1.05	0.22	0.72
N9	0.11	0.12	0.12	0.16	0.24	0.04	0.13	0.06	0.02	0.01	0.26	0.13	0.22	0.31	0.33	0.05	0.74	1.37	0.44	0.91
O2'	0.53	0.46	0.59	0.46	0.36	0.22	0.43	0.14	0.50	0.52	0.36	0.47	0.78	0.54	0.29	0.32	0.36	1.31	0.22	0.71
O3'	0.21	0.61	0.06	0.10	0.80	0.05	0.65	0.09	0.49	0.43	0.79	0.59	0.02	0.27	0.91	0.16	0.37	1.11	0.28	0.62
O4'	0.17	0.44	0.09	0.01	0.44	0.13	0.33	0.20	0.24	0.27	0.50	0.54	0.02	0.14	0.49	0.17	0.69	1.51	0.61	0.97
O5'	0.45	0.64	0.30	0.13	0.58	0.23	0.49	0.22	0.44	0.51	0.64	0.72	0.25	0.01	0.60	0.36	0.31	1.02	0.38	0.56
OP1	0.10	0.28	0.05	0.11	0.14	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.26	0.44	0.06	0.01	0.15	0.09	0.18	0.73	0.29	0.25
OP2	0.25	0.43	0.08	0.02	0.39	0.10	0.30	0.07	0.25	0.31	0.45	0.51	0.06	0.00	0.42	0.18	0.14	0.61	0.14	0.19
P	0.21	0.36	0.08	0.01	0.29	0.10	0.20	0.09	0.16	0.24	0.35	0.45	0.05	0.01	0.30	0.16	0.07	0.70	0.20	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.30	0.39	0.03
C2	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.11	0.31	0.51	0.37	0.18
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.32	0.10	0.55	0.32
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.09	0.01	0.01	0.03	0.01	0.33	0.11	0.23	0.16
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.88	0.24
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.14	0.02	0.04	0.20	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.48	0.02	0.13
C5	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.01	0.05	0.18	0.36	1.14	0.55
C5'	0.06	0.00	0.06	0.01	0.20	0.00	0.31	0.00	0.31	0.12	0.06	0.15	0.05	0.03	0.20	0.01	0.00	0.24	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.14	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.02	0.01	0.08	0.23	0.31	1.04	0.53
N1	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.60	0.12
N3	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.08	0.28	0.37	0.54	0.07
O2	0.07	0.00	0.02	0.09	0.01	0.20	0.02	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.01	0.20	0.52	0.90	0.04	0.50
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.05	0.11	0.03	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00	0.39	0.20	0.61	0.39
O3'	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.06	0.24	0.37	0.06	0.01
O4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.04	0.92	0.25
O4'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.08	0.20	0.00	0.06	0.02	0.00	0.26	0.59	0.10	0.24
O5'	0.01	0.31	0.32	0.33	0.07	0.00	0.18	0.00	0.23	0.05	0.28	0.52	0.39	0.24	0.09	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.30	0.51	0.10	0.11	0.01	0.48	0.36	0.24	0.31	0.17	0.37	0.90	0.20	0.37	0.04	0.59	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.39	0.37	0.55	0.23	0.88	0.02	1.14	0.07	1.04	0.60	0.54	0.04	0.61	0.06	0.92	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.18	0.32	0.16	0.24	0.13	0.55	0.01	0.53	0.12	0.07	0.50	0.39	0.01	0.25	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00