Doublet Group distance statistics: 52243

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.000, 0.109, 0.219, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.109 std_dev=0.109
C2'	B	0, 0.000, 0.238, 0.475, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.238 std_dev=0.238
C2'	A	0, 0.000, 0.252, 0.503, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.252 std_dev=0.252
C5'	A	0, 0.000, 0.278, 0.557, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.278 std_dev=0.278
C4'	A	0, 0.000, 0.322, 0.643, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.322 std_dev=0.322
P	A	0, 0.000, 0.407, 0.815, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.407 std_dev=0.407
OP1	A	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
C3'	B	0, 0.000, 0.506, 1.012, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.506 std_dev=0.506
C3'	A	0, 0.000, 0.544, 1.087, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.544 std_dev=0.544
OP1	B	0, 0.000, 0.588, 1.176, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.588 std_dev=0.588
OP2	A	0, 0.000, 0.600, 1.200, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.600 std_dev=0.600
C5'	B	0, 0.000, 0.660, 1.319, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.660 std_dev=0.660
O3'	B	0, 0.000, 0.662, 1.324, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.662 std_dev=0.662
O2'	B	0, 0.000, 0.708, 1.417, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.708 std_dev=0.708
O5'	B	0, 0.000, 0.748, 1.496, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.748 std_dev=0.748
O5'	A	0, 0.000, 0.803, 1.607, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.803 std_dev=0.803
O2'	A	0, 0.000, 0.826, 1.652, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.826 std_dev=0.826
C4'	B	0, 0.000, 0.834, 1.668, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.834 std_dev=0.834
P	B	0, 0.000, 1.035, 2.069, 2.069 max_d=2.069 avg_d=1.035 std_dev=1.035
C1'	B	0, 0.000, 1.120, 2.240, 2.240 max_d=2.240 avg_d=1.120 std_dev=1.120
O3'	A	0, 0.000, 1.214, 2.429, 2.429 max_d=2.429 avg_d=1.214 std_dev=1.214
O4'	B	0, 0.000, 1.236, 2.473, 2.473 max_d=2.473 avg_d=1.236 std_dev=1.236
N1	B	0, 0.000, 1.619, 3.239, 3.239 max_d=3.239 avg_d=1.619 std_dev=1.619
OP2	B	0, 0.000, 1.669, 3.338, 3.338 max_d=3.338 avg_d=1.669 std_dev=1.669
O2	B	0, 0.000, 1.702, 3.404, 3.404 max_d=3.404 avg_d=1.702 std_dev=1.702
C2	B	0, 0.000, 1.746, 3.492, 3.492 max_d=3.492 avg_d=1.746 std_dev=1.746
C6	B	0, 0.000, 2.198, 4.397, 4.397 max_d=4.397 avg_d=2.198 std_dev=2.198
N3	B	0, 0.000, 2.256, 4.513, 4.513 max_d=4.513 avg_d=2.256 std_dev=2.256
C4	B	0, 0.000, 2.846, 5.692, 5.692 max_d=5.692 avg_d=2.846 std_dev=2.846
C5	B	0, 0.000, 2.853, 5.705, 5.705 max_d=5.705 avg_d=2.853 std_dev=2.853
O4	B	0, 0.000, 3.404, 6.808, 6.808 max_d=6.808 avg_d=3.404 std_dev=3.404

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.00	0.09	0.21	0.32	0.15
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.33	0.04	0.04	0.27	0.24	0.07
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.03	0.10	0.00	0.05	0.05	0.09	0.04	0.00	0.04	0.02	0.07	0.02	0.53	0.29
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.15	0.21	0.09	0.02	0.18	0.22	0.12	0.02	0.01	0.01	0.26	0.31	0.17	0.08
C4	0.01	0.00	0.00	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.20	0.03	0.02	0.27	0.23	0.07
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.09	0.01	0.02	0.06	0.09	0.04	0.19	0.02	0.00	0.02	0.21	0.20	0.05
C5	0.01	0.00	0.05	0.16	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.09	0.02	0.02	0.29	0.16	0.02
C5'	0.04	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.02	0.03	0.07	0.08	0.02	0.02	0.15	0.00	0.02	0.19	0.20	0.05
C6	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.13	0.02	0.02	0.29	0.15	0.00
C8	0.01	0.00	0.10	0.21	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.05	0.00	0.04	0.27	0.18	0.04
N1	0.01	0.00	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.24	0.03	0.01	0.29	0.19	0.03
N3	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.35	0.04	0.05	0.26	0.26	0.09
N6	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.35	0.06	0.02	0.05	0.29	0.10	0.03
N7	0.01	0.00	0.09	0.22	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.05	0.00	0.06	0.29	0.12	0.01
N9	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.12	0.01	0.03	0.25	0.25	0.09
O2'	0.01	0.23	0.00	0.02	0.23	0.19	0.29	0.02	0.32	0.23	0.29	0.18	0.35	0.29	0.17	0.00	0.06	0.15	0.03	0.11	0.45	0.22
O3'	0.27	0.33	0.04	0.01	0.20	0.02	0.09	0.15	0.13	0.05	0.24	0.35	0.06	0.05	0.12	0.06	0.00	0.18	0.37	0.39	0.14	0.27
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.15	0.18	0.00	0.20	0.21	0.25	0.15
O5'	0.09	0.04	0.07	0.26	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.03	0.03	0.37	0.20	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.21	0.27	0.02	0.31	0.27	0.21	0.29	0.19	0.29	0.27	0.29	0.26	0.29	0.29	0.25	0.11	0.39	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.32	0.24	0.53	0.17	0.23	0.20	0.16	0.20	0.15	0.18	0.19	0.26	0.10	0.12	0.25	0.45	0.14	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.07	0.29	0.08	0.07	0.05	0.02	0.05	0.00	0.04	0.03	0.09	0.03	0.01	0.09	0.22	0.27	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.48	0.73	0.12	0.29	0.43	0.34	0.27	0.30	0.27	0.48	0.64	1.02	0.20	0.43	0.41	0.45	0.33	0.15	0.37	0.32
C2	0.66	1.15	0.15	0.27	1.27	0.36	1.09	0.30	0.94	0.94	1.30	1.18	0.11	0.33	1.36	0.66	0.46	0.24	0.69	0.53
C2'	0.46	0.64	0.25	0.40	0.34	0.39	0.21	0.40	0.24	0.44	0.54	0.93	0.47	0.55	0.29	0.45	0.46	0.34	0.53	0.47
C3'	0.19	0.03	0.33	0.16	0.39	0.18	0.57	0.15	0.53	0.27	0.14	0.32	0.04	0.06	0.42	0.20	0.15	0.22	0.13	0.16
C4	0.66	1.05	0.14	0.28	0.98	0.38	0.82	0.31	0.74	0.83	1.08	1.18	0.08	0.35	1.01	0.63	0.42	0.20	0.57	0.45
C4'	0.06	0.16	0.15	0.04	0.29	0.07	0.48	0.06	0.40	0.08	0.00	0.54	0.16	0.23	0.35	0.06	0.01	0.13	0.09	0.05
C5	0.74	1.12	0.16	0.28	1.14	0.42	1.02	0.33	0.92	0.95	1.19	1.16	0.21	0.29	1.18	0.74	0.46	0.22	0.63	0.51
C5'	0.06	0.12	0.09	0.06	0.36	0.09	0.55	0.07	0.46	0.12	0.05	0.49	0.24	0.19	0.43	0.05	0.04	0.16	0.17	0.10
C6	0.76	1.21	0.16	0.27	1.38	0.41	1.26	0.32	1.10	1.05	1.36	1.15	0.25	0.25	1.46	0.77	0.50	0.25	0.73	0.57
C8	0.66	0.86	0.14	0.31	0.70	0.42	0.58	0.33	0.56	0.70	0.82	1.02	0.12	0.36	0.69	0.64	0.39	0.16	0.45	0.39
N1	0.72	1.22	0.16	0.27	1.43	0.38	1.27	0.31	1.09	1.04	1.41	1.16	0.19	0.28	1.53	0.73	0.50	0.26	0.75	0.57
N3	0.62	1.06	0.14	0.28	1.04	0.35	0.86	0.30	0.76	0.82	1.14	1.18	0.03	0.37	1.09	0.60	0.43	0.22	0.60	0.47
N6	0.78	1.21	0.17	0.26	1.50	0.42	1.41	0.33	1.23	1.12	1.41	1.07	0.32	0.19	1.60	0.83	0.53	0.28	0.79	0.62
N7	0.75	1.01	0.16	0.29	0.97	0.46	0.88	0.35	0.82	0.88	1.02	1.05	0.26	0.27	0.98	0.76	0.45	0.20	0.56	0.47
N9	0.60	0.89	0.13	0.29	0.70	0.38	0.54	0.31	0.51	0.67	0.85	1.10	0.00	0.39	0.69	0.57	0.37	0.17	0.45	0.38
O2'	0.70	1.03	0.44	0.50	0.72	0.55	0.54	0.55	0.55	0.76	0.95	1.32	0.68	0.59	0.67	0.67	0.63	0.50	0.75	0.66
O3'	0.51	0.42	0.62	0.45	0.92	0.44	1.12	0.44	1.02	0.69	0.58	0.03	0.11	0.13	0.96	0.52	0.51	0.56	0.57	0.53
O4'	0.38	0.53	0.04	0.24	0.15	0.31	0.02	0.26	0.03	0.30	0.40	0.86	0.18	0.40	0.10	0.37	0.21	0.04	0.16	0.18
O5'	0.23	0.19	0.47	0.22	0.61	0.13	0.78	0.13	0.72	0.41	0.34	0.15	0.23	0.01	0.65	0.20	0.28	0.34	0.41	0.32
OP1	0.17	0.16	0.06	0.15	0.15	0.29	0.26	0.30	0.20	0.02	0.04	0.37	0.15	0.01	0.20	0.24	0.13	0.00	0.04	0.07
OP2	0.10	0.13	0.12	0.07	0.33	0.05	0.55	0.02	0.47	0.10	0.03	0.45	0.41	0.01	0.38	0.00	0.20	0.36	0.42	0.32
P	0.06	0.10	0.10	0.02	0.27	0.08	0.44	0.03	0.38	0.10	0.04	0.37	0.03	0.01	0.31	0.04	0.12	0.26	0.27	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.01	0.00	0.11	0.09	0.22	0.15
C2	0.00	0.00	0.10	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.29	0.00	0.04	0.07	0.08	0.22	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.09	0.04	0.02	0.08	0.16	0.00	0.01	0.02	0.02	0.22	0.16	0.34	0.25
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.14	0.00	0.24	0.01	0.24	0.09	0.03	0.17	0.00	0.01	0.15	0.03	0.01	0.07	0.03	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.03	0.00	0.02	0.05	0.14	0.25	0.18
C4'	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.22	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.24	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.13	0.00	0.06	0.05	0.17	0.27	0.22
C5'	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.24	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.12	0.00	0.07	0.07	0.15	0.27	0.22
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.11	0.01	0.00	0.07	0.10	0.23	0.16
N3	0.00	0.00	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.20	0.00	0.02	0.06	0.10	0.23	0.14
O2	0.01	0.00	0.16	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.50	0.01	0.08	0.07	0.06	0.20	0.10
O2'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.26	0.22	0.15	0.13	0.09	0.15	0.33	0.39	0.00	0.03	0.28	0.11	0.09	0.03	0.28	0.10
O3'	0.20	0.29	0.01	0.01	0.03	0.01	0.13	0.12	0.12	0.11	0.20	0.50	0.03	0.00	0.01	0.09	0.17	0.35	0.22	0.23
O4	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.28	0.01	0.00	0.02	0.05	0.15	0.26	0.19
O4'	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.02	0.08	0.11	0.09	0.02	0.00	0.05	0.06	0.15	0.11
O5'	0.11	0.07	0.22	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.07	0.07	0.06	0.07	0.09	0.17	0.05	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.09	0.08	0.16	0.07	0.14	0.02	0.17	0.01	0.15	0.10	0.10	0.06	0.03	0.35	0.15	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.22	0.34	0.03	0.25	0.05	0.27	0.02	0.27	0.23	0.23	0.20	0.28	0.22	0.26	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.13	0.25	0.03	0.18	0.03	0.22	0.01	0.22	0.16	0.14	0.10	0.10	0.23	0.19	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00