Doublet Group distance statistics: 52265

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.001, 0.005, 0.008, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C4'	B	0, 0.189, 0.403, 0.618, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.403 std_dev=0.214
O4'	A	0, 0.075, 0.312, 0.548, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.312 std_dev=0.237
C3'	B	0, 0.184, 0.424, 0.663, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.424 std_dev=0.239
C2'	A	0, 0.066, 0.310, 0.553, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.310 std_dev=0.243
C2'	B	0, 0.319, 0.591, 0.864, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.591 std_dev=0.272
C5'	B	0, 0.148, 0.420, 0.692, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.420 std_dev=0.272
C4'	A	0, 0.129, 0.426, 0.723, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.426 std_dev=0.297
O4'	B	0, 0.249, 0.552, 0.856, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.552 std_dev=0.304
C1'	B	0, 0.321, 0.629, 0.937, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.629 std_dev=0.308
P	B	0, 0.131, 0.444, 0.757, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.444 std_dev=0.313
O5'	B	0, 0.118, 0.446, 0.773, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.446 std_dev=0.327
OP2	B	0, 0.129, 0.464, 0.798, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.464 std_dev=0.334
O2'	A	0, 0.056, 0.402, 0.749, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.402 std_dev=0.346
C8	B	0, 0.299, 0.649, 0.999, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.649 std_dev=0.350
N9	B	0, 0.347, 0.700, 1.054, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.700 std_dev=0.353
C3'	A	0, 0.119, 0.481, 0.844, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.481 std_dev=0.362
N7	B	0, 0.325, 0.758, 1.192, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.758 std_dev=0.433
C4	B	0, 0.423, 0.865, 1.306, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.865 std_dev=0.441
O3'	B	0, 0.387, 0.830, 1.272, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.830 std_dev=0.442
OP1	B	0, 0.202, 0.685, 1.167, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.685 std_dev=0.483
C5	B	0, 0.407, 0.894, 1.381, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.894 std_dev=0.487
N3	B	0, 0.492, 0.987, 1.481, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.987 std_dev=0.495
O3'	A	0, 0.165, 0.675, 1.185, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.675 std_dev=0.510
O2'	B	0, 0.393, 0.908, 1.423, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.908 std_dev=0.515
O5'	A	0, 0.253, 0.785, 1.317, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.785 std_dev=0.532
C5'	A	0, 0.204, 0.757, 1.310, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.757 std_dev=0.553
P	A	0, 0.399, 0.971, 1.543, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.971 std_dev=0.572
C2	B	0, 0.554, 1.138, 1.722, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.138 std_dev=0.584
C6	B	0, 0.469, 1.058, 1.646, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.058 std_dev=0.588
OP1	A	0, 0.475, 1.073, 1.670, 1.977 max_d=1.977 avg_d=1.073 std_dev=0.598
N1	B	0, 0.548, 1.178, 1.808, 2.431 max_d=2.431 avg_d=1.178 std_dev=0.630
OP2	A	0, 0.380, 1.011, 1.641, 2.021 max_d=2.021 avg_d=1.011 std_dev=0.630
N6	B	0, 0.451, 1.109, 1.767, 2.522 max_d=2.522 avg_d=1.109 std_dev=0.658

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.12	0.19	0.04
C2	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.02	0.27	0.23	0.19	0.19
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.16	0.00	0.02	0.01	0.18	0.22	0.11	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.12	0.02	0.13	0.04	0.05	0.06	0.14	0.03	0.01	0.02	0.24	0.27	0.09	0.18
C4	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.01	0.43	0.38	0.32	0.35
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.03	0.03	0.07	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.10	0.23	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.13	0.02	0.47	0.40	0.33	0.38
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.15	0.00	0.18	0.00	0.17	0.09	0.11	0.17	0.07	0.08	0.04	0.01	0.01	0.10	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.14	0.02	0.41	0.33	0.23	0.29
N1	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.28	0.23	0.17	0.18
N3	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.01	0.35	0.31	0.25	0.27
N4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.01	0.46	0.42	0.38	0.40
O2	0.02	0.00	0.16	0.14	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.18	0.04	0.18	0.17	0.17	0.12
O2'	0.02	0.11	0.00	0.03	0.06	0.08	0.02	0.08	0.03	0.03	0.11	0.07	0.19	0.00	0.03	0.06	0.11	0.20	0.11	0.08
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.01	0.13	0.04	0.14	0.04	0.06	0.06	0.18	0.03	0.00	0.01	0.20	0.31	0.13	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.00	0.06	0.08	0.29	0.10
O5'	0.11	0.27	0.18	0.24	0.43	0.01	0.47	0.01	0.41	0.28	0.35	0.46	0.18	0.11	0.20	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.23	0.22	0.27	0.38	0.10	0.40	0.10	0.33	0.23	0.31	0.42	0.17	0.20	0.31	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.19	0.11	0.09	0.32	0.23	0.33	0.26	0.23	0.17	0.25	0.38	0.17	0.11	0.13	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.19	0.11	0.18	0.35	0.02	0.38	0.01	0.29	0.18	0.27	0.40	0.12	0.08	0.20	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.29	0.31	0.15	0.23	0.15	0.24	0.15	0.29	0.18	0.31	0.25	0.33	0.21	0.19	0.57	0.14	0.16	0.16	0.15	0.25	0.15
C2	0.20	0.27	0.31	0.16	0.22	0.16	0.22	0.16	0.26	0.19	0.28	0.24	0.28	0.19	0.20	0.57	0.14	0.17	0.18	0.16	0.20	0.17
C2'	0.15	0.28	0.24	0.16	0.22	0.12	0.24	0.12	0.30	0.16	0.31	0.24	0.34	0.20	0.17	0.47	0.14	0.15	0.15	0.13	0.27	0.13
C3'	0.18	0.30	0.27	0.16	0.24	0.15	0.27	0.15	0.32	0.20	0.33	0.26	0.37	0.24	0.20	0.47	0.12	0.18	0.18	0.17	0.34	0.16
C4	0.20	0.25	0.33	0.16	0.22	0.17	0.23	0.17	0.25	0.19	0.26	0.23	0.26	0.21	0.20	0.56	0.15	0.18	0.17	0.15	0.21	0.17
C4'	0.20	0.29	0.30	0.17	0.24	0.18	0.26	0.18	0.30	0.21	0.31	0.26	0.34	0.24	0.21	0.53	0.13	0.21	0.20	0.21	0.37	0.19
C5	0.20	0.26	0.34	0.16	0.23	0.17	0.25	0.17	0.27	0.21	0.28	0.24	0.29	0.23	0.21	0.56	0.17	0.20	0.17	0.16	0.27	0.17
C5'	0.28	0.36	0.32	0.25	0.33	0.29	0.35	0.28	0.38	0.31	0.38	0.34	0.41	0.33	0.30	0.51	0.18	0.32	0.29	0.31	0.50	0.30
C6	0.20	0.27	0.33	0.16	0.23	0.16	0.25	0.16	0.28	0.20	0.29	0.24	0.31	0.23	0.21	0.57	0.16	0.19	0.17	0.16	0.27	0.17
N1	0.19	0.28	0.32	0.16	0.23	0.15	0.24	0.16	0.28	0.19	0.30	0.25	0.31	0.21	0.20	0.57	0.14	0.17	0.17	0.16	0.24	0.16
N3	0.20	0.26	0.32	0.16	0.22	0.17	0.22	0.17	0.25	0.19	0.27	0.24	0.26	0.19	0.20	0.57	0.13	0.17	0.18	0.16	0.18	0.17
N4	0.21	0.24	0.34	0.16	0.21	0.17	0.21	0.18	0.23	0.19	0.24	0.22	0.23	0.19	0.20	0.56	0.16	0.19	0.18	0.15	0.17	0.18
O2	0.20	0.28	0.30	0.17	0.22	0.17	0.22	0.17	0.26	0.19	0.29	0.25	0.27	0.19	0.20	0.57	0.15	0.17	0.19	0.17	0.18	0.18
O2'	0.14	0.32	0.20	0.19	0.23	0.13	0.26	0.11	0.33	0.16	0.35	0.26	0.38	0.21	0.17	0.43	0.18	0.15	0.15	0.13	0.25	0.12
O3'	0.16	0.29	0.25	0.16	0.22	0.14	0.25	0.15	0.31	0.18	0.32	0.24	0.36	0.22	0.18	0.45	0.12	0.16	0.17	0.18	0.35	0.16
O4'	0.18	0.28	0.32	0.16	0.22	0.15	0.24	0.15	0.29	0.18	0.31	0.24	0.32	0.20	0.19	0.58	0.15	0.16	0.17	0.17	0.27	0.16
O5'	0.61	0.52	0.75	0.51	0.54	0.59	0.51	0.61	0.48	0.56	0.49	0.55	0.44	0.51	0.57	0.93	0.33	0.59	0.59	0.65	0.70	0.63
OP1	0.61	0.56	0.70	0.51	0.57	0.60	0.55	0.62	0.53	0.58	0.54	0.57	0.51	0.55	0.59	0.83	0.31	0.62	0.59	0.68	0.76	0.64
OP2	0.58	0.55	0.65	0.50	0.55	0.58	0.53	0.61	0.52	0.55	0.53	0.56	0.52	0.53	0.56	0.76	0.29	0.60	0.59	0.67	0.77	0.64
P	0.58	0.52	0.69	0.49	0.53	0.57	0.50	0.60	0.48	0.54	0.49	0.54	0.46	0.50	0.55	0.83	0.27	0.58	0.58	0.66	0.73	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.00	0.07	0.10	0.19	0.10
C2	0.01	0.00	0.11	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.39	0.07	0.06	0.09	0.07	0.05
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.12	0.03	0.11	0.07	0.12	0.03	0.08	0.03	0.00	0.08	0.02	0.24	0.17	0.47	0.30
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.06	0.10	0.04	0.05	0.07	0.09	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.20	0.38	0.18
C4	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.29	0.04	0.06	0.09	0.06	0.05
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.11	0.06	0.00	0.01	0.11	0.19	0.06
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.24	0.02	0.08	0.09	0.09	0.03
C5'	0.04	0.06	0.12	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.04	0.03	0.04	0.15	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.27	0.03	0.08	0.09	0.10	0.03
C8	0.01	0.01	0.11	0.10	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.13	0.05	0.10	0.08	0.09	0.03
N1	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.34	0.05	0.06	0.09	0.07	0.03
N3	0.01	0.00	0.12	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.39	0.07	0.06	0.10	0.09	0.06
N6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.24	0.03	0.10	0.09	0.16	0.04
N7	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.15	0.03	0.11	0.09	0.15	0.04
N9	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.23	0.01	0.07	0.09	0.08	0.06
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.14	0.11	0.18	0.04	0.18	0.21	0.17	0.19	0.20	0.22	0.12	0.00	0.11	0.06	0.22	0.20	0.62	0.35
O3'	0.28	0.39	0.08	0.01	0.29	0.06	0.24	0.15	0.27	0.13	0.34	0.39	0.24	0.15	0.23	0.11	0.00	0.21	0.21	0.48	0.48	0.33
O4'	0.00	0.07	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.03	0.03	0.01	0.06	0.21	0.00	0.05	0.08	0.08	0.03
O5'	0.07	0.06	0.24	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.06	0.10	0.11	0.07	0.22	0.21	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.10	0.09	0.17	0.20	0.09	0.11	0.09	0.07	0.09	0.08	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09	0.20	0.48	0.08	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.07	0.47	0.38	0.06	0.19	0.09	0.08	0.10	0.09	0.07	0.09	0.16	0.15	0.08	0.62	0.48	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.05	0.30	0.18	0.05	0.06	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.06	0.35	0.33	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00