Doublet Group distance statistics: 52278

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.026 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.004, 0.026, 0.048, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.022
P	B	0, 0.090, 0.379, 0.669, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.379 std_dev=0.289
O4'	A	0, 0.132, 0.438, 0.743, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.438 std_dev=0.306
OP2	B	0, 0.173, 0.505, 0.836, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.505 std_dev=0.332
C2'	A	0, 0.076, 0.438, 0.799, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.438 std_dev=0.361
N7	B	0, 0.101, 0.545, 0.990, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.545 std_dev=0.444
C4'	A	0, 0.200, 0.676, 1.153, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.676 std_dev=0.476
N6	B	0, 0.134, 0.612, 1.089, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.612 std_dev=0.477
C8	B	0, 0.181, 0.663, 1.145, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.663 std_dev=0.482
C3'	A	0, 0.171, 0.656, 1.140, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.656 std_dev=0.485
C5'	B	0, 0.128, 0.629, 1.131, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.629 std_dev=0.502
O5'	B	0, 0.056, 0.562, 1.068, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.562 std_dev=0.506
O2'	A	0, 0.076, 0.593, 1.110, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.593 std_dev=0.517
O3'	A	0, 0.173, 0.749, 1.325, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.749 std_dev=0.576
C5	B	0, 0.108, 0.685, 1.263, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.685 std_dev=0.577
C6	B	0, 0.140, 0.741, 1.342, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.741 std_dev=0.601
C4'	B	0, 0.133, 0.757, 1.381, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.757 std_dev=0.624
N9	B	0, 0.215, 0.852, 1.488, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.852 std_dev=0.636
O5'	A	0, 0.371, 1.007, 1.644, 1.754 max_d=1.754 avg_d=1.007 std_dev=0.637
OP1	B	0, -0.091, 0.549, 1.188, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.549 std_dev=0.640
O4'	B	0, 0.258, 0.928, 1.598, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.928 std_dev=0.670
C3'	B	0, 0.050, 0.736, 1.423, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.736 std_dev=0.686
C4	B	0, 0.196, 0.891, 1.585, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.891 std_dev=0.695
C1'	B	0, 0.281, 1.021, 1.760, 2.022 max_d=2.022 avg_d=1.021 std_dev=0.739
O3'	B	0, 0.043, 0.788, 1.533, 2.014 max_d=2.014 avg_d=0.788 std_dev=0.745
N1	B	0, 0.245, 0.998, 1.750, 2.119 max_d=2.119 avg_d=0.998 std_dev=0.752
C5'	A	0, 0.343, 1.124, 1.905, 2.115 max_d=2.115 avg_d=1.124 std_dev=0.781
C2'	B	0, 0.260, 1.048, 1.836, 2.157 max_d=2.157 avg_d=1.048 std_dev=0.788
P	A	0, 0.408, 1.197, 1.986, 2.209 max_d=2.209 avg_d=1.197 std_dev=0.789
OP2	A	0, 0.430, 1.280, 2.130, 2.379 max_d=2.379 avg_d=1.280 std_dev=0.850
N3	B	0, 0.270, 1.123, 1.976, 2.389 max_d=2.389 avg_d=1.123 std_dev=0.853
C2	B	0, 0.287, 1.158, 2.028, 2.445 max_d=2.445 avg_d=1.158 std_dev=0.871
OP1	A	0, 0.510, 1.397, 2.285, 2.459 max_d=2.459 avg_d=1.397 std_dev=0.888
O2'	B	0, 0.378, 1.341, 2.305, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.341 std_dev=0.963

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.24	0.30	0.15	0.17
C2	0.02	0.00	0.08	0.14	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.11	0.04	0.29	0.29	0.18	0.19
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.10	0.02	0.12	0.02	0.05	0.03	0.19	0.00	0.04	0.00	0.07	0.08	0.35	0.09
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.12	0.06	0.20	0.01	0.00	0.01	0.27	0.06	0.42	0.22
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.05	0.06	0.32	0.22	0.21	0.18
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.03	0.05	0.08	0.15	0.01	0.00	0.01	0.28	0.24	0.02
C5	0.01	0.00	0.10	0.03	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.03	0.06	0.32	0.20	0.21	0.17
C5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.13	0.00	0.17	0.00	0.15	0.06	0.08	0.15	0.05	0.12	0.06	0.01	0.01	0.36	0.34	0.02
C6	0.02	0.00	0.12	0.05	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.06	0.31	0.24	0.20	0.17
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.03	0.30	0.28	0.17	0.19
N3	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.11	0.05	0.31	0.26	0.20	0.19
N4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.06	0.06	0.32	0.20	0.22	0.17
O2	0.03	0.00	0.19	0.20	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.18	0.03	0.27	0.32	0.17	0.19
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.09	0.15	0.11	0.12	0.10	0.06	0.07	0.10	0.07	0.00	0.05	0.10	0.06	0.24	0.18	0.09
O3'	0.03	0.11	0.04	0.00	0.05	0.01	0.03	0.06	0.06	0.02	0.11	0.06	0.18	0.05	0.00	0.02	0.43	0.13	0.43	0.30
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.03	0.10	0.02	0.00	0.37	0.42	0.10	0.26
O5'	0.24	0.29	0.07	0.27	0.32	0.01	0.32	0.01	0.31	0.30	0.31	0.32	0.27	0.06	0.43	0.37	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.30	0.29	0.08	0.06	0.22	0.28	0.20	0.36	0.24	0.28	0.26	0.20	0.32	0.24	0.13	0.42	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.18	0.35	0.42	0.21	0.24	0.21	0.34	0.20	0.17	0.20	0.22	0.17	0.18	0.43	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.19	0.09	0.22	0.18	0.02	0.17	0.02	0.17	0.19	0.19	0.17	0.19	0.09	0.30	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.16	0.09	0.07	0.05	0.15	0.03	0.19	0.11	0.14	0.18	0.10	0.14	0.11	0.08	0.10	0.05	0.17	0.16	0.06	0.19	0.03
C2	0.06	0.15	0.08	0.01	0.03	0.09	0.02	0.11	0.12	0.12	0.18	0.09	0.16	0.09	0.05	0.08	0.03	0.13	0.10	0.15	0.19	0.05
C2'	0.03	0.34	0.13	0.04	0.14	0.11	0.14	0.18	0.29	0.07	0.38	0.23	0.33	0.02	0.03	0.14	0.04	0.12	0.18	0.09	0.30	0.10
C3'	0.06	0.29	0.13	0.07	0.14	0.13	0.15	0.18	0.26	0.07	0.33	0.21	0.31	0.06	0.07	0.13	0.06	0.13	0.17	0.08	0.21	0.09
C4	0.13	0.07	0.04	0.03	0.05	0.13	0.03	0.14	0.07	0.17	0.10	0.04	0.13	0.12	0.12	0.03	0.02	0.20	0.13	0.14	0.18	0.03
C4'	0.18	0.09	0.09	0.19	0.08	0.29	0.07	0.35	0.06	0.21	0.12	0.05	0.11	0.16	0.16	0.08	0.19	0.28	0.31	0.23	0.26	0.20
C5	0.17	0.08	0.08	0.09	0.10	0.20	0.07	0.22	0.06	0.19	0.09	0.08	0.10	0.14	0.15	0.08	0.06	0.26	0.19	0.07	0.17	0.06
C5'	0.33	0.08	0.23	0.35	0.21	0.46	0.18	0.53	0.08	0.33	0.05	0.16	0.05	0.27	0.29	0.24	0.37	0.44	0.47	0.43	0.37	0.36
C6	0.16	0.10	0.09	0.11	0.09	0.20	0.07	0.22	0.07	0.18	0.12	0.08	0.11	0.14	0.14	0.09	0.08	0.24	0.20	0.08	0.18	0.06
N1	0.11	0.12	0.07	0.06	0.05	0.15	0.04	0.17	0.09	0.15	0.15	0.07	0.13	0.12	0.10	0.07	0.04	0.18	0.15	0.05	0.19	0.02
N3	0.07	0.13	0.07	0.03	0.02	0.08	0.03	0.09	0.13	0.12	0.16	0.07	0.18	0.09	0.06	0.06	0.06	0.13	0.10	0.21	0.19	0.07
N4	0.15	0.05	0.03	0.03	0.07	0.12	0.04	0.11	0.07	0.18	0.08	0.05	0.13	0.11	0.13	0.04	0.07	0.21	0.12	0.24	0.19	0.07
O2	0.01	0.20	0.10	0.02	0.06	0.05	0.05	0.08	0.16	0.08	0.23	0.13	0.19	0.07	0.01	0.12	0.05	0.08	0.09	0.19	0.19	0.07
O2'	0.03	0.34	0.13	0.02	0.12	0.10	0.10	0.17	0.25	0.13	0.37	0.23	0.27	0.09	0.03	0.15	0.05	0.14	0.18	0.10	0.35	0.11
O3'	0.06	0.31	0.14	0.06	0.15	0.11	0.16	0.16	0.27	0.05	0.35	0.23	0.31	0.05	0.07	0.14	0.05	0.10	0.15	0.07	0.20	0.07
O4'	0.21	0.05	0.10	0.20	0.14	0.29	0.13	0.34	0.05	0.25	0.04	0.09	0.03	0.22	0.20	0.09	0.18	0.30	0.29	0.19	0.23	0.15
O5'	0.22	0.42	0.38	0.29	0.30	0.18	0.29	0.12	0.38	0.16	0.44	0.36	0.40	0.19	0.23	0.37	0.31	0.16	0.16	0.07	0.12	0.21
OP1	0.06	0.36	0.20	0.09	0.19	0.10	0.21	0.18	0.34	0.03	0.40	0.26	0.39	0.10	0.08	0.18	0.10	0.12	0.13	0.21	0.16	0.08
OP2	0.26	0.11	0.12	0.18	0.19	0.33	0.20	0.41	0.16	0.31	0.13	0.14	0.18	0.27	0.25	0.14	0.16	0.38	0.34	0.49	0.32	0.28
P	0.02	0.26	0.17	0.07	0.11	0.11	0.13	0.19	0.23	0.05	0.29	0.18	0.28	0.04	0.02	0.15	0.09	0.14	0.14	0.24	0.13	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.22	0.18	0.02
C2	0.01	0.00	0.09	0.20	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.24	0.01	0.06	0.31	0.12	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.05	0.10	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.28	0.02	0.13
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.13	0.00	0.09	0.02	0.12	0.05	0.16	0.19	0.09	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.14	0.23	0.10	0.17
C4	0.00	0.00	0.04	0.13	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.00	0.09	0.30	0.14	0.09
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.08	0.10	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.01
C5	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.01	0.11	0.36	0.14	0.15
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.09	0.08	0.09	0.05	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03
C6	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.15	0.01	0.10	0.37	0.13	0.16
C8	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.17	0.32	0.16	0.11
N1	0.00	0.00	0.05	0.16	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.21	0.01	0.07	0.35	0.12	0.14
N3	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.22	0.01	0.06	0.28	0.14	0.07
N6	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.12	0.01	0.11	0.40	0.15	0.20
N7	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.16	0.37	0.16	0.17
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.11	0.28	0.16	0.07
O2'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.00	0.03	0.03	0.05	0.20	0.13	0.04
O3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.14	0.01	0.11	0.02	0.15	0.06	0.21	0.22	0.12	0.07	0.06	0.03	0.00	0.01	0.15	0.20	0.18	0.19
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.10	0.16	0.24	0.10
O5'	0.07	0.06	0.11	0.14	0.09	0.01	0.11	0.01	0.10	0.17	0.07	0.06	0.11	0.16	0.11	0.05	0.15	0.10	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.22	0.31	0.28	0.23	0.30	0.11	0.36	0.04	0.37	0.32	0.35	0.28	0.40	0.37	0.28	0.20	0.20	0.16	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.12	0.02	0.10	0.14	0.06	0.14	0.11	0.13	0.16	0.12	0.14	0.15	0.16	0.16	0.13	0.18	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.10	0.13	0.17	0.09	0.01	0.15	0.03	0.16	0.11	0.14	0.07	0.20	0.17	0.07	0.04	0.19	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00