Doublet Group distance statistics: 52303

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 3, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.028, 0.063, 0.099, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.063 std_dev=0.035
O2	A	0, 0.029, 0.081, 0.133, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.081 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.061, 0.170, 0.279, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.170 std_dev=0.109
C2'	A	0, 0.058, 0.223, 0.387, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.223 std_dev=0.165
C4'	A	0, 0.036, 0.216, 0.397, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.216 std_dev=0.181
O2'	A	0, 0.100, 0.304, 0.508, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.304 std_dev=0.204
P	B	0, 0.139, 0.355, 0.572, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.355 std_dev=0.217
C3'	A	0, 0.074, 0.293, 0.512, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.293 std_dev=0.219
OP1	B	0, 0.088, 0.372, 0.656, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.372 std_dev=0.284
O3'	A	0, 0.135, 0.428, 0.721, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.428 std_dev=0.293
O5'	B	0, 0.188, 0.513, 0.839, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.513 std_dev=0.325
C5'	A	0, 0.050, 0.385, 0.721, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.385 std_dev=0.335
OP2	B	0, 0.064, 0.468, 0.872, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.468 std_dev=0.404
OP2	A	0, 0.114, 0.537, 0.960, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.537 std_dev=0.423
C5'	B	0, 0.150, 0.655, 1.160, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.655 std_dev=0.505
P	A	0, -0.014, 0.619, 1.251, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.619 std_dev=0.633
O3'	B	0, 0.133, 0.819, 1.505, 2.252 max_d=2.252 avg_d=0.819 std_dev=0.686
C3'	B	0, 0.108, 0.808, 1.508, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.808 std_dev=0.700
OP1	A	0, 0.038, 0.763, 1.489, 2.086 max_d=2.086 avg_d=0.763 std_dev=0.726
C4'	B	0, 0.070, 0.827, 1.583, 2.357 max_d=2.357 avg_d=0.827 std_dev=0.756
O5'	A	0, -0.159, 0.639, 1.437, 2.577 max_d=2.577 avg_d=0.639 std_dev=0.798
O4'	B	0, 0.035, 0.942, 1.849, 2.822 max_d=2.822 avg_d=0.942 std_dev=0.907
C8	B	0, 0.153, 1.066, 1.979, 2.965 max_d=2.965 avg_d=1.066 std_dev=0.913
C2'	B	0, 0.065, 1.018, 1.970, 2.998 max_d=2.998 avg_d=1.018 std_dev=0.953
N9	B	0, 0.045, 1.077, 2.108, 3.280 max_d=3.280 avg_d=1.077 std_dev=1.032
C1'	B	0, 0.030, 1.063, 2.097, 3.250 max_d=3.250 avg_d=1.063 std_dev=1.034
N7	B	0, 0.128, 1.195, 2.263, 3.517 max_d=3.517 avg_d=1.195 std_dev=1.067
O2'	B	0, 0.014, 1.160, 2.306, 3.591 max_d=3.591 avg_d=1.160 std_dev=1.146
C4	B	0, -0.033, 1.195, 2.424, 3.914 max_d=3.914 avg_d=1.195 std_dev=1.229
C5	B	0, 0.010, 1.255, 2.500, 4.038 max_d=4.038 avg_d=1.255 std_dev=1.245
N3	B	0, -0.094, 1.321, 2.736, 4.533 max_d=4.533 avg_d=1.321 std_dev=1.415
C6	B	0, -0.057, 1.410, 2.877, 4.782 max_d=4.782 avg_d=1.410 std_dev=1.467
C2	B	0, -0.123, 1.450, 3.023, 5.088 max_d=5.088 avg_d=1.450 std_dev=1.573
O6	B	0, -0.048, 1.553, 3.154, 5.284 max_d=5.284 avg_d=1.553 std_dev=1.601
N1	B	0, -0.133, 1.471, 3.075, 5.199 max_d=5.199 avg_d=1.471 std_dev=1.604
N2	B	0, -0.121, 1.642, 3.406, 5.750 max_d=5.750 avg_d=1.642 std_dev=1.763

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.15	0.28	0.21	0.06
C2	0.03	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.03	0.15	0.28	0.23	0.06
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.05	0.04	0.14	0.00	0.02	0.01	0.04	0.28	0.21	0.05
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.05	0.07	0.07	0.14	0.01	0.01	0.02	0.15	0.29	0.21	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.05	0.14	0.33	0.22	0.07
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.29	0.21	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.06	0.15	0.36	0.22	0.08
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.10	0.01	0.09	0.00	0.08	0.08	0.10	0.10	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.30	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.06	0.16	0.34	0.23	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.16	0.30	0.22	0.06
N3	0.03	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.15	0.30	0.22	0.06
N4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.11	0.05	0.13	0.35	0.21	0.08
O2	0.07	0.00	0.14	0.14	0.01	0.09	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.14	0.06	0.15	0.23	0.23	0.07
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.02	0.05	0.05	0.12	0.00	0.03	0.07	0.07	0.28	0.23	0.11
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.03	0.11	0.06	0.09	0.11	0.14	0.03	0.00	0.01	0.32	0.28	0.19	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.06	0.07	0.01	0.00	0.23	0.28	0.22	0.08
O5'	0.15	0.15	0.04	0.15	0.14	0.01	0.15	0.01	0.16	0.16	0.15	0.13	0.15	0.07	0.32	0.23	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.28	0.28	0.28	0.29	0.33	0.29	0.36	0.30	0.34	0.30	0.30	0.35	0.23	0.28	0.28	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.23	0.21	0.21	0.22	0.21	0.22	0.27	0.23	0.22	0.22	0.21	0.23	0.23	0.19	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.06	0.05	0.08	0.07	0.04	0.08	0.02	0.08	0.06	0.06	0.08	0.07	0.11	0.15	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.28	0.18	0.13	0.21	0.12	0.28	0.17	0.34	0.24	0.31	0.32	0.23	0.31	0.17	0.21	0.17	0.15	0.22	0.44	0.08	0.26	0.15
C2	0.17	0.33	0.18	0.14	0.27	0.10	0.37	0.12	0.45	0.29	0.40	0.34	0.27	0.39	0.22	0.20	0.24	0.16	0.21	0.57	0.10	0.36	0.19
C2'	0.16	0.19	0.21	0.15	0.16	0.10	0.24	0.14	0.28	0.25	0.23	0.23	0.16	0.30	0.16	0.26	0.23	0.13	0.22	0.39	0.16	0.31	0.20
C3'	0.20	0.14	0.26	0.17	0.15	0.11	0.22	0.12	0.23	0.27	0.16	0.18	0.14	0.30	0.19	0.30	0.23	0.14	0.21	0.32	0.19	0.30	0.21
C4	0.15	0.25	0.17	0.16	0.21	0.11	0.29	0.13	0.35	0.23	0.30	0.26	0.21	0.31	0.17	0.19	0.27	0.15	0.20	0.46	0.11	0.37	0.19
C4'	0.17	0.15	0.22	0.13	0.13	0.10	0.19	0.12	0.20	0.24	0.15	0.21	0.14	0.26	0.16	0.26	0.17	0.12	0.18	0.29	0.08	0.19	0.11
C5	0.12	0.17	0.16	0.13	0.14	0.10	0.21	0.14	0.25	0.20	0.20	0.19	0.14	0.26	0.12	0.18	0.22	0.12	0.19	0.36	0.08	0.27	0.15
C5'	0.22	0.13	0.26	0.14	0.17	0.10	0.23	0.08	0.21	0.30	0.14	0.18	0.15	0.32	0.23	0.28	0.17	0.14	0.15	0.28	0.10	0.20	0.11
C6	0.12	0.18	0.16	0.11	0.14	0.09	0.23	0.15	0.26	0.22	0.21	0.21	0.15	0.27	0.13	0.18	0.18	0.12	0.19	0.36	0.07	0.24	0.14
N1	0.14	0.26	0.17	0.12	0.21	0.09	0.30	0.14	0.36	0.25	0.31	0.29	0.22	0.33	0.17	0.19	0.20	0.14	0.20	0.47	0.07	0.29	0.16
N3	0.17	0.32	0.18	0.16	0.28	0.11	0.37	0.12	0.45	0.29	0.40	0.33	0.27	0.39	0.22	0.20	0.27	0.17	0.21	0.57	0.12	0.40	0.20
N4	0.14	0.23	0.17	0.17	0.20	0.13	0.28	0.13	0.34	0.21	0.28	0.24	0.19	0.29	0.15	0.19	0.29	0.15	0.19	0.45	0.17	0.41	0.20
O2	0.18	0.38	0.17	0.13	0.31	0.10	0.43	0.12	0.52	0.32	0.47	0.39	0.30	0.44	0.24	0.20	0.25	0.17	0.22	0.65	0.11	0.38	0.20
O2'	0.16	0.21	0.21	0.14	0.16	0.09	0.24	0.13	0.28	0.24	0.24	0.26	0.18	0.29	0.16	0.27	0.22	0.12	0.22	0.38	0.15	0.29	0.19
O3'	0.24	0.14	0.30	0.19	0.17	0.12	0.22	0.10	0.22	0.29	0.14	0.18	0.16	0.31	0.22	0.35	0.26	0.16	0.21	0.30	0.25	0.33	0.24
O4'	0.17	0.28	0.19	0.17	0.20	0.18	0.25	0.23	0.30	0.21	0.28	0.33	0.25	0.27	0.17	0.22	0.14	0.18	0.24	0.38	0.08	0.17	0.13
O5'	0.13	0.26	0.14	0.10	0.22	0.11	0.32	0.18	0.37	0.28	0.31	0.29	0.21	0.36	0.18	0.22	0.09	0.11	0.18	0.47	0.14	0.27	0.17
OP1	0.28	0.12	0.28	0.27	0.20	0.27	0.23	0.29	0.17	0.34	0.08	0.19	0.16	0.33	0.28	0.27	0.30	0.26	0.32	0.22	0.34	0.38	0.34
OP2	0.12	0.11	0.12	0.18	0.09	0.20	0.17	0.29	0.16	0.23	0.11	0.21	0.07	0.25	0.14	0.10	0.23	0.13	0.21	0.23	0.31	0.26	0.24
P	0.12	0.08	0.12	0.09	0.07	0.10	0.16	0.16	0.15	0.22	0.07	0.19	0.07	0.24	0.13	0.15	0.14	0.07	0.08	0.23	0.13	0.16	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.08	0.07	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.04	0.05	0.13	0.06
C2	0.07	0.00	0.10	0.14	0.02	0.08	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.10	0.17	0.07	0.10	0.02	0.10	0.14	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.07	0.12	0.11	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.08	0.06	0.08	0.17	0.09
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.09	0.08	0.11	0.16	0.13	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.10	0.17	0.11
C4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.08	0.03	0.09	0.14	0.09
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.05	0.06	0.09	0.08	0.07	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.11	0.06	0.08	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.03	0.11	0.04	0.10	0.13	0.09
C5'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.10	0.08	0.08	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.13	0.08	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.10	0.03	0.12	0.01	0.10	0.11	0.09
C8	0.03	0.03	0.05	0.08	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.09	0.05	0.13	0.07	0.12	0.17	0.11
N1	0.05	0.01	0.07	0.11	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.13	0.04	0.09	0.03	0.10	0.12	0.09
N2	0.08	0.00	0.12	0.16	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.12	0.21	0.09	0.11	0.04	0.11	0.14	0.11
N3	0.07	0.01	0.11	0.13	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.17	0.07	0.09	0.02	0.10	0.15	0.11
N7	0.03	0.02	0.05	0.07	0.01	0.07	0.00	0.08	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.05	0.14	0.07	0.12	0.15	0.11
N9	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.05	0.09	0.16	0.09
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.08	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.07	0.03	0.08	0.05	0.08	0.15	0.07
O3'	0.04	0.17	0.04	0.01	0.09	0.03	0.08	0.02	0.10	0.09	0.13	0.21	0.17	0.09	0.03	0.07	0.00	0.03	0.13	0.13	0.15	0.20	0.14
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.09	0.07	0.05	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.07	0.06	0.07	0.03
O5'	0.06	0.10	0.08	0.10	0.08	0.04	0.11	0.01	0.12	0.13	0.09	0.11	0.09	0.14	0.09	0.08	0.13	0.04	0.00	0.18	0.01	0.03	0.01
O6	0.04	0.02	0.06	0.12	0.03	0.11	0.04	0.13	0.01	0.07	0.03	0.04	0.02	0.07	0.05	0.05	0.13	0.07	0.18	0.00	0.15	0.13	0.14
OP1	0.05	0.10	0.08	0.10	0.09	0.06	0.10	0.08	0.10	0.12	0.10	0.11	0.10	0.12	0.09	0.08	0.15	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.14	0.17	0.17	0.14	0.08	0.13	0.03	0.11	0.17	0.12	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.20	0.07	0.03	0.13	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.09	0.11	0.09	0.03	0.09	0.01	0.09	0.11	0.09	0.11	0.11	0.11	0.09	0.07	0.14	0.03	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00