Doublet Group distance statistics: 52304

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.022, 0.045, 0.068, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.045 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.018, 0.052, 0.086, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.052 std_dev=0.034
O4'	A	0, -0.041, 0.129, 0.299, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.129 std_dev=0.170
P	B	0, 0.151, 0.337, 0.522, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.337 std_dev=0.185
C2'	A	0, -0.026, 0.163, 0.353, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.163 std_dev=0.190
OP2	B	0, 0.074, 0.272, 0.469, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.272 std_dev=0.198
OP1	B	0, 0.183, 0.433, 0.682, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.433 std_dev=0.249
P	A	0, 0.080, 0.409, 0.738, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.409 std_dev=0.329
O5'	A	0, -0.027, 0.323, 0.674, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.323 std_dev=0.350
C5'	A	0, 0.005, 0.358, 0.711, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.358 std_dev=0.353
O5'	B	0, 0.064, 0.435, 0.806, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.435 std_dev=0.371
C4'	A	0, -0.111, 0.265, 0.641, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.265 std_dev=0.376
O2'	A	0, -0.111, 0.320, 0.751, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.320 std_dev=0.431
N7	B	0, 0.018, 0.466, 0.915, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.466 std_dev=0.448
C5'	B	0, 0.134, 0.587, 1.040, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.587 std_dev=0.453
C3'	A	0, -0.159, 0.317, 0.793, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.317 std_dev=0.476
C8	B	0, 0.009, 0.523, 1.037, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.523 std_dev=0.514
O6	B	0, 0.120, 0.669, 1.218, 1.974 max_d=1.974 avg_d=0.669 std_dev=0.549
OP1	A	0, -0.051, 0.593, 1.236, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.593 std_dev=0.644
C5	B	0, -0.029, 0.645, 1.319, 2.334 max_d=2.334 avg_d=0.645 std_dev=0.674
C6	B	0, 0.011, 0.727, 1.443, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.727 std_dev=0.716
C4'	B	0, -0.004, 0.726, 1.455, 2.550 max_d=2.550 avg_d=0.726 std_dev=0.729
O4'	B	0, -0.015, 0.756, 1.527, 2.693 max_d=2.693 avg_d=0.756 std_dev=0.771
N9	B	0, -0.072, 0.712, 1.497, 2.705 max_d=2.705 avg_d=0.712 std_dev=0.784
O3'	A	0, -0.317, 0.507, 1.331, 2.674 max_d=2.674 avg_d=0.507 std_dev=0.824
OP2	A	0, -0.068, 0.806, 1.679, 2.991 max_d=2.991 avg_d=0.806 std_dev=0.873
C4	B	0, -0.093, 0.792, 1.676, 3.048 max_d=3.048 avg_d=0.792 std_dev=0.885
C3'	B	0, -0.172, 0.720, 1.612, 3.011 max_d=3.011 avg_d=0.720 std_dev=0.892
C1'	B	0, -0.125, 0.821, 1.767, 3.243 max_d=3.243 avg_d=0.821 std_dev=0.946
N1	B	0, -0.054, 0.929, 1.912, 3.426 max_d=3.426 avg_d=0.929 std_dev=0.983
O3'	B	0, -0.282, 0.796, 1.874, 3.580 max_d=3.580 avg_d=0.796 std_dev=1.078
C2'	B	0, -0.267, 0.843, 1.954, 3.719 max_d=3.719 avg_d=0.843 std_dev=1.111
N3	B	0, -0.151, 0.993, 2.137, 3.931 max_d=3.931 avg_d=0.993 std_dev=1.144
C2	B	0, -0.134, 1.050, 2.233, 4.084 max_d=4.084 avg_d=1.050 std_dev=1.184
O2'	B	0, -0.398, 0.998, 2.395, 4.624 max_d=4.624 avg_d=0.998 std_dev=1.397
N2	B	0, -0.173, 1.257, 2.687, 4.931 max_d=4.931 avg_d=1.257 std_dev=1.430

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.21	0.00	0.07	0.06	0.05	0.06
C2	0.01	0.00	0.07	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.15	0.04	0.12	0.11	0.12	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.13	0.07	0.01	0.06	0.04	0.12	0.00	0.02	0.01	0.06	0.31	0.12	0.10
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.29	0.00	0.33	0.02	0.29	0.17	0.21	0.31	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.27	0.32	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.29	0.00	0.15	0.00	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.10	0.02	0.21	0.07	0.11	0.20
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.15	0.00	0.20	0.00	0.20	0.09	0.08	0.15	0.05	0.20	0.02	0.00	0.01	0.11	0.23	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.33	0.00	0.20	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.20	0.06	0.26	0.08	0.08	0.24
C5'	0.02	0.09	0.13	0.02	0.21	0.00	0.26	0.00	0.23	0.10	0.14	0.22	0.05	0.07	0.10	0.01	0.01	0.29	0.32	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.29	0.01	0.20	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.16	0.08	0.24	0.09	0.11	0.21
N1	0.00	0.01	0.01	0.17	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.06	0.01	0.15	0.07	0.06	0.13
N3	0.01	0.00	0.06	0.21	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.06	0.03	0.15	0.10	0.15	0.15
N4	0.01	0.01	0.04	0.31	0.01	0.15	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.13	0.02	0.21	0.06	0.14	0.21
O2	0.02	0.00	0.12	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.31	0.08	0.09	0.14	0.16	0.10
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.26	0.20	0.27	0.07	0.23	0.17	0.22	0.28	0.12	0.00	0.03	0.15	0.18	0.10	0.37	0.16
O3'	0.21	0.15	0.02	0.01	0.10	0.02	0.20	0.10	0.16	0.06	0.06	0.13	0.31	0.03	0.00	0.15	0.03	0.14	0.49	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.03	0.02	0.08	0.15	0.15	0.00	0.08	0.10	0.04	0.08
O5'	0.07	0.12	0.06	0.02	0.21	0.01	0.26	0.01	0.24	0.15	0.15	0.21	0.09	0.18	0.03	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.11	0.31	0.27	0.07	0.11	0.08	0.29	0.09	0.07	0.10	0.06	0.14	0.10	0.14	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.12	0.12	0.32	0.11	0.23	0.08	0.32	0.11	0.06	0.15	0.14	0.16	0.37	0.49	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.10	0.03	0.20	0.02	0.24	0.02	0.21	0.13	0.15	0.21	0.10	0.16	0.07	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.12	0.23	0.24	0.09	0.11	0.09	0.08	0.11	0.09	0.13	0.13	0.11	0.07	0.09	0.19	0.34	0.11	0.09	0.12	0.09	0.08	0.06
C2	0.11	0.14	0.19	0.18	0.11	0.11	0.11	0.08	0.13	0.11	0.15	0.15	0.12	0.10	0.11	0.17	0.24	0.11	0.07	0.14	0.03	0.03	0.04
C2'	0.12	0.17	0.10	0.16	0.13	0.06	0.13	0.05	0.17	0.10	0.18	0.19	0.15	0.11	0.11	0.07	0.26	0.16	0.06	0.19	0.16	0.12	0.08
C3'	0.37	0.26	0.17	0.13	0.30	0.34	0.28	0.36	0.25	0.35	0.24	0.26	0.29	0.31	0.34	0.24	0.06	0.48	0.33	0.23	0.25	0.25	0.33
C4	0.11	0.14	0.18	0.18	0.11	0.11	0.12	0.08	0.15	0.10	0.15	0.14	0.13	0.10	0.11	0.15	0.22	0.11	0.08	0.16	0.05	0.05	0.05
C4'	0.10	0.11	0.17	0.18	0.06	0.09	0.06	0.13	0.10	0.11	0.13	0.14	0.08	0.08	0.08	0.12	0.31	0.21	0.11	0.12	0.09	0.09	0.15
C5	0.11	0.13	0.22	0.23	0.11	0.12	0.11	0.09	0.14	0.10	0.15	0.14	0.12	0.09	0.10	0.17	0.30	0.10	0.10	0.16	0.07	0.09	0.06
C5'	0.13	0.11	0.12	0.14	0.08	0.12	0.09	0.18	0.11	0.15	0.12	0.13	0.08	0.13	0.11	0.07	0.28	0.26	0.16	0.13	0.13	0.13	0.20
C6	0.10	0.13	0.23	0.25	0.10	0.12	0.10	0.10	0.13	0.09	0.14	0.13	0.11	0.08	0.10	0.18	0.33	0.10	0.11	0.14	0.09	0.11	0.07
N1	0.10	0.13	0.21	0.23	0.10	0.11	0.09	0.08	0.12	0.09	0.14	0.14	0.11	0.08	0.09	0.18	0.30	0.10	0.09	0.13	0.06	0.07	0.05
N3	0.11	0.14	0.17	0.16	0.11	0.10	0.11	0.08	0.14	0.11	0.15	0.15	0.13	0.10	0.11	0.16	0.20	0.11	0.07	0.15	0.06	0.06	0.06
N4	0.12	0.15	0.16	0.14	0.13	0.10	0.14	0.09	0.16	0.11	0.16	0.15	0.13	0.11	0.11	0.13	0.17	0.11	0.08	0.18	0.11	0.12	0.09
O2	0.12	0.15	0.19	0.17	0.12	0.11	0.12	0.08	0.14	0.12	0.16	0.16	0.13	0.11	0.12	0.17	0.22	0.12	0.07	0.14	0.04	0.03	0.04
O2'	0.23	0.16	0.35	0.39	0.20	0.29	0.20	0.30	0.17	0.25	0.16	0.14	0.18	0.24	0.23	0.30	0.47	0.21	0.31	0.17	0.35	0.34	0.32
O3'	0.23	0.07	0.07	0.06	0.10	0.24	0.07	0.30	0.08	0.18	0.10	0.09	0.08	0.11	0.17	0.10	0.16	0.38	0.25	0.13	0.23	0.18	0.28
O4'	0.16	0.26	0.35	0.35	0.19	0.16	0.18	0.11	0.21	0.13	0.25	0.28	0.23	0.12	0.16	0.31	0.46	0.10	0.12	0.21	0.10	0.09	0.07
O5'	0.06	0.19	0.27	0.27	0.10	0.06	0.08	0.09	0.13	0.06	0.19	0.23	0.15	0.05	0.05	0.23	0.42	0.14	0.09	0.13	0.09	0.10	0.15
OP1	0.26	0.25	0.45	0.48	0.22	0.31	0.18	0.27	0.18	0.17	0.22	0.27	0.26	0.14	0.22	0.44	0.62	0.20	0.27	0.15	0.31	0.24	0.24
OP2	0.49	0.65	0.81	0.82	0.53	0.48	0.47	0.35	0.51	0.37	0.60	0.71	0.62	0.36	0.47	0.79	1.04	0.30	0.36	0.45	0.36	0.31	0.24
P	0.07	0.22	0.31	0.31	0.12	0.07	0.10	0.07	0.15	0.04	0.21	0.27	0.19	0.04	0.06	0.28	0.47	0.10	0.06	0.14	0.08	0.09	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.08	0.01	0.09	0.14	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.08	0.04
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.06	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.12	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.10	0.01	0.12	0.16	0.12
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.04	0.03	0.08	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.10	0.00	0.14	0.18	0.14
C8	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.10	0.02	0.12	0.13	0.11
N1	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02	0.09	0.00	0.11	0.16	0.12
N2	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.07	0.01	0.08	0.14	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.12	0.08
N7	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.11	0.02	0.14	0.17	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.09	0.07
O2'	0.03	0.08	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.05	0.04	0.02	0.07	0.09	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.07	0.04	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.04	0.12	0.15	0.12
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05
O5'	0.03	0.08	0.03	0.05	0.08	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.07	0.07	0.11	0.06	0.03	0.09	0.04	0.00	0.12	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.12	0.00	0.16	0.20	0.16
OP1	0.03	0.09	0.04	0.06	0.09	0.03	0.12	0.03	0.14	0.12	0.11	0.08	0.07	0.14	0.07	0.04	0.12	0.05	0.02	0.16	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.14	0.08	0.10	0.12	0.02	0.16	0.01	0.18	0.13	0.16	0.14	0.12	0.17	0.09	0.05	0.15	0.05	0.01	0.20	0.00	0.00	0.01
P	0.03	0.10	0.04	0.07	0.09	0.01	0.12	0.00	0.14	0.11	0.12	0.09	0.08	0.14	0.07	0.02	0.12	0.05	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00