Doublet Group distance statistics: 52315

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.000, 0.048, 0.096, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.048
O2	A	0, 0.000, 0.063, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.063 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.000, 0.173, 0.346, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.173 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.000, 0.201, 0.401, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.201 std_dev=0.201
C2'	A	0, 0.000, 0.203, 0.405, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.203 std_dev=0.203
P	B	0, 0.000, 0.380, 0.760, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.380 std_dev=0.380
C4'	A	0, 0.000, 0.404, 0.808, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.404 std_dev=0.404
C3'	A	0, 0.000, 0.448, 0.895, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.448 std_dev=0.448
OP1	B	0, 0.000, 0.470, 0.940, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.470 std_dev=0.470
O5'	A	0, 0.000, 0.504, 1.008, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.504 std_dev=0.504
C5'	A	0, 0.000, 0.530, 1.060, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.530 std_dev=0.530
OP2	B	0, 0.000, 0.671, 1.341, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.671 std_dev=0.671
O3'	A	0, 0.000, 0.699, 1.397, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.699 std_dev=0.699
P	A	0, 0.000, 0.739, 1.478, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.739 std_dev=0.739
OP2	A	0, 0.000, 0.799, 1.597, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.799 std_dev=0.799
OP1	A	0, 0.000, 0.895, 1.790, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.895 std_dev=0.895
O5'	B	0, 0.000, 1.094, 2.189, 2.189 max_d=2.189 avg_d=1.094 std_dev=1.094
O4'	B	0, 0.000, 2.263, 4.527, 4.527 max_d=4.527 avg_d=2.263 std_dev=2.263
C4'	B	0, 0.000, 2.345, 4.691, 4.691 max_d=4.691 avg_d=2.345 std_dev=2.345
C5'	B	0, 0.000, 2.359, 4.717, 4.717 max_d=4.717 avg_d=2.359 std_dev=2.359
C1'	B	0, 0.000, 2.995, 5.989, 5.989 max_d=5.989 avg_d=2.995 std_dev=2.995
O2'	B	0, 0.000, 3.430, 6.859, 6.859 max_d=6.859 avg_d=3.430 std_dev=3.430
C3'	B	0, 0.000, 3.639, 7.277, 7.277 max_d=7.277 avg_d=3.639 std_dev=3.639
C2'	B	0, 0.000, 3.724, 7.447, 7.447 max_d=7.447 avg_d=3.724 std_dev=3.724
O3'	B	0, 0.000, 3.984, 7.969, 7.969 max_d=7.969 avg_d=3.984 std_dev=3.984
N9	B	0, 0.000, 4.121, 8.242, 8.242 max_d=8.242 avg_d=4.121 std_dev=4.121
N3	B	0, 0.000, 4.686, 9.373, 9.373 max_d=9.373 avg_d=4.686 std_dev=4.686
C8	B	0, 0.000, 4.739, 9.477, 9.477 max_d=9.477 avg_d=4.739 std_dev=4.739
C4	B	0, 0.000, 4.921, 9.842, 9.842 max_d=9.842 avg_d=4.921 std_dev=4.921
N2	B	0, 0.000, 5.599, 11.198, 11.198 max_d=11.198 avg_d=5.599 std_dev=5.599
C2	B	0, 0.000, 5.670, 11.340, 11.340 max_d=11.340 avg_d=5.670 std_dev=5.670
N7	B	0, 0.000, 5.910, 11.820, 11.820 max_d=11.820 avg_d=5.910 std_dev=5.910
C5	B	0, 0.000, 6.037, 12.075, 12.075 max_d=12.075 avg_d=6.037 std_dev=6.037
N1	B	0, 0.000, 6.840, 13.681, 13.681 max_d=13.681 avg_d=6.840 std_dev=6.840
C6	B	0, 0.000, 7.133, 14.267, 14.267 max_d=14.267 avg_d=7.133 std_dev=7.133
O6	B	0, 0.000, 8.260, 16.521, 16.521 max_d=16.521 avg_d=8.260 std_dev=8.260

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.04	0.01
C2	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.15	0.01	0.13	0.14	0.06	0.08
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.03	0.05	0.11	0.10	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.03	0.03
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.19	0.00	0.16	0.00	0.12	0.11	0.19	0.21	0.11	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.23	0.02	0.19	0.17	0.10	0.13
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.08	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.02	0.02
C5	0.00	0.00	0.06	0.16	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.19	0.01	0.18	0.15	0.06	0.12
C5'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.11	0.13	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.14	0.12	0.01	0.08
N1	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.12	0.01	0.05
N3	0.01	0.00	0.11	0.19	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.21	0.02	0.17	0.16	0.09	0.11
N4	0.00	0.00	0.10	0.21	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.25	0.03	0.20	0.17	0.12	0.14
O2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.10	0.13	0.05	0.06
O2'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.05	0.04
O3'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.23	0.01	0.19	0.01	0.13	0.10	0.21	0.25	0.11	0.01	0.00	0.01	0.04	0.19	0.19	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.05
O5'	0.02	0.13	0.02	0.02	0.19	0.02	0.18	0.01	0.14	0.10	0.17	0.20	0.10	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.07	0.14	0.11	0.13	0.17	0.11	0.15	0.09	0.12	0.12	0.16	0.17	0.13	0.14	0.19	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.06	0.03	0.10	0.10	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.09	0.12	0.05	0.05	0.19	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.08	0.03	0.07	0.13	0.02	0.12	0.02	0.08	0.05	0.11	0.14	0.06	0.04	0.12	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.47	0.92	0.74	0.89	0.89	0.52	1.15	0.64	1.27	1.00	1.14	0.85	0.77	1.23	0.78	0.78	1.01	0.30	0.14	1.46	0.15	0.16	0.14
C2	0.30	0.89	0.38	0.43	0.83	0.22	1.14	0.32	1.31	0.94	1.15	0.80	0.70	1.23	0.68	0.42	0.45	0.16	0.01	1.54	0.16	0.25	0.11
C2'	0.23	0.57	0.53	0.71	0.54	0.36	0.73	0.45	0.83	0.61	0.73	0.52	0.46	0.78	0.45	0.63	0.93	0.07	0.00	0.97	0.01	0.03	0.04
C3'	0.14	0.35	0.55	0.79	0.33	0.38	0.45	0.47	0.51	0.38	0.45	0.31	0.28	0.49	0.28	0.68	1.10	0.02	0.05	0.60	0.15	0.17	0.09
C4	0.21	0.75	0.23	0.25	0.71	0.11	0.99	0.22	1.13	0.81	0.99	0.67	0.58	1.07	0.57	0.29	0.23	0.10	0.05	1.32	0.18	0.28	0.11
C4'	0.45	0.72	0.90	1.13	0.71	0.64	0.88	0.76	0.95	0.79	0.86	0.67	0.63	0.94	0.65	0.96	1.39	0.25	0.15	1.07	0.03	0.07	0.02
C5	0.30	0.70	0.47	0.60	0.68	0.36	0.90	0.52	1.00	0.79	0.88	0.63	0.58	0.98	0.58	0.54	0.65	0.19	0.11	1.15	0.19	0.22	0.14
C5'	0.48	0.65	1.03	1.31	0.65	0.74	0.76	0.86	0.81	0.72	0.74	0.60	0.59	0.81	0.61	1.10	1.62	0.27	0.18	0.89	0.10	0.18	0.04
C6	0.39	0.76	0.64	0.80	0.75	0.48	0.96	0.64	1.05	0.85	0.94	0.69	0.64	1.04	0.66	0.70	0.91	0.25	0.15	1.20	0.16	0.18	0.15
N1	0.39	0.85	0.58	0.70	0.82	0.41	1.09	0.54	1.21	0.93	1.08	0.78	0.70	1.17	0.70	0.63	0.79	0.23	0.09	1.40	0.16	0.20	0.13
N3	0.22	0.84	0.20	0.21	0.78	0.08	1.10	0.16	1.27	0.88	1.11	0.75	0.65	1.18	0.61	0.26	0.18	0.10	0.09	1.50	0.17	0.28	0.10
N4	0.09	0.69	0.01	0.05	0.64	0.10	0.93	0.03	1.08	0.72	0.94	0.61	0.51	1.00	0.47	0.07	0.13	0.01	0.17	1.27	0.18	0.34	0.08
O2	0.31	0.95	0.36	0.39	0.88	0.19	1.22	0.28	1.41	0.98	1.24	0.86	0.74	1.30	0.71	0.39	0.40	0.16	0.04	1.67	0.16	0.26	0.11
O2'	0.31	0.71	0.59	0.76	0.67	0.40	0.88	0.49	1.01	0.73	0.90	0.65	0.58	0.94	0.56	0.68	0.96	0.13	0.03	1.18	0.05	0.06	0.06
O3'	0.01	0.15	0.46	0.73	0.13	0.30	0.21	0.37	0.25	0.16	0.21	0.12	0.10	0.23	0.10	0.62	1.10	0.15	0.13	0.31	0.25	0.31	0.18
O4'	0.64	1.04	1.01	1.19	1.02	0.74	1.26	0.88	1.37	1.14	1.24	0.96	0.91	1.35	0.93	1.02	1.34	0.44	0.27	1.54	0.16	0.13	0.17
O5'	0.34	0.41	0.91	1.21	0.42	0.67	0.48	0.79	0.49	0.47	0.46	0.38	0.38	0.51	0.41	1.02	1.57	0.16	0.13	0.53	0.17	0.25	0.09
OP1	0.47	0.34	1.21	1.57	0.36	0.92	0.31	0.99	0.27	0.37	0.29	0.35	0.37	0.31	0.40	1.36	2.07	0.27	0.26	0.22	0.19	0.34	0.07
OP2	0.30	0.11	0.99	1.38	0.13	0.82	0.04	0.92	0.01	0.11	0.04	0.13	0.16	0.02	0.18	1.18	1.88	0.15	0.26	0.08	0.20	0.35	0.06
P	0.43	0.36	1.12	1.47	0.38	0.86	0.37	0.96	0.35	0.41	0.35	0.36	0.37	0.38	0.41	1.24	1.91	0.25	0.25	0.33	0.18	0.32	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.11	0.01	0.14	0.81	0.34
C2	0.01	0.00	0.37	0.22	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	0.47	0.11	0.39	0.01	0.10	0.61	0.14
C2'	0.00	0.37	0.00	0.01	0.18	0.02	0.09	0.00	0.17	0.17	0.29	0.45	0.37	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.13	0.02	0.69	0.19
C3'	0.02	0.22	0.01	0.00	0.03	0.00	0.20	0.00	0.11	0.49	0.07	0.35	0.22	0.43	0.20	0.02	0.00	0.00	0.01	0.18	0.16	0.54	0.08
C4	0.01	0.00	0.18	0.03	0.00	0.07	0.00	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.15	0.07	0.39	0.01	0.05	0.77	0.21
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.13	0.28	0.05	0.10	0.05	0.27	0.13	0.18	0.02	0.00	0.00	0.17	0.05	0.49	0.13
C5	0.01	0.00	0.09	0.20	0.00	0.16	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.06	0.05	0.51	0.01	0.13	0.81	0.17
C5'	0.05	0.14	0.00	0.00	0.25	0.00	0.40	0.00	0.38	0.50	0.27	0.06	0.10	0.54	0.28	0.14	0.04	0.01	0.00	0.45	0.21	0.37	0.00
C6	0.01	0.00	0.17	0.11	0.01	0.13	0.00	0.38	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.48	0.05	0.07	0.54	0.00	0.18	0.74	0.12
C8	0.00	0.00	0.17	0.49	0.00	0.28	0.00	0.50	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.39	0.03	0.45	0.01	0.02	1.02	0.28
N1	0.01	0.00	0.29	0.07	0.00	0.05	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.64	0.29	0.09	0.49	0.00	0.16	0.65	0.11
N2	0.01	0.00	0.45	0.35	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.84	0.66	0.12	0.34	0.01	0.09	0.52	0.12
N3	0.01	0.00	0.37	0.22	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.68	0.46	0.09	0.31	0.01	0.03	0.65	0.19
N7	0.00	0.00	0.08	0.43	0.00	0.27	0.00	0.54	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.34	0.00	0.54	0.01	0.12	0.93	0.20
N9	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.13	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.05	0.02	0.33	0.01	0.03	0.88	0.28
O2'	0.00	0.73	0.00	0.02	0.43	0.18	0.35	0.14	0.48	0.00	0.64	0.84	0.68	0.14	0.16	0.00	0.09	0.18	0.22	0.45	0.21	0.34	0.05
O3'	0.13	0.47	0.04	0.00	0.15	0.02	0.06	0.04	0.05	0.39	0.29	0.66	0.46	0.34	0.05	0.09	0.00	0.07	0.06	0.05	0.29	0.34	0.04
O4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.09	0.12	0.09	0.00	0.02	0.18	0.07	0.00	0.12	0.06	0.18	0.77	0.35
O5'	0.11	0.39	0.05	0.01	0.39	0.00	0.51	0.00	0.54	0.45	0.49	0.34	0.31	0.54	0.33	0.22	0.06	0.12	0.00	0.60	0.03	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.13	0.18	0.01	0.17	0.01	0.45	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.45	0.05	0.06	0.60	0.00	0.23	0.74	0.09
OP1	0.14	0.10	0.02	0.16	0.05	0.05	0.13	0.21	0.18	0.02	0.16	0.09	0.03	0.12	0.03	0.21	0.29	0.18	0.03	0.23	0.00	0.00	0.00
OP2	0.81	0.61	0.69	0.54	0.77	0.49	0.81	0.37	0.74	1.02	0.65	0.52	0.65	0.93	0.88	0.34	0.34	0.77	0.01	0.74	0.00	0.00	0.00
P	0.34	0.14	0.19	0.08	0.21	0.13	0.17	0.00	0.12	0.28	0.11	0.12	0.19	0.20	0.28	0.05	0.04	0.35	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00