Doublet Group distance statistics: 52327

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 4, 4, 5, 6, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.012, 0.033, 0.053, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.033 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.010, 0.032, 0.053, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.032 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.013, 0.039, 0.066, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.039 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.050, 0.119, 0.188, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.119 std_dev=0.069
O4'	A	0, 0.028, 0.104, 0.180, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.104 std_dev=0.076
C3'	A	0, 0.076, 0.182, 0.288, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.182 std_dev=0.106
O2'	A	0, 0.102, 0.214, 0.326, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.214 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.070, 0.194, 0.318, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.194 std_dev=0.124
O5'	A	0, 0.142, 0.316, 0.490, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.316 std_dev=0.174
C2'	B	0, 0.291, 0.478, 0.665, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.478 std_dev=0.187
O3'	A	0, 0.136, 0.324, 0.512, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.324 std_dev=0.188
C5'	A	0, 0.115, 0.308, 0.500, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.308 std_dev=0.192
P	A	0, 0.208, 0.403, 0.597, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.403 std_dev=0.194
OP2	A	0, 0.203, 0.409, 0.616, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.409 std_dev=0.207
C3'	B	0, 0.274, 0.485, 0.695, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.485 std_dev=0.210
O3'	B	0, 0.270, 0.500, 0.730, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.500 std_dev=0.230
O2'	B	0, 0.283, 0.525, 0.766, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.525 std_dev=0.241
OP1	A	0, 0.245, 0.499, 0.753, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.499 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.347, 0.614, 0.882, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.614 std_dev=0.268
C4'	B	0, 0.395, 0.691, 0.987, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.691 std_dev=0.296
O4'	B	0, 0.460, 0.757, 1.055, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.757 std_dev=0.297
N3	B	0, 0.352, 0.674, 0.996, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.674 std_dev=0.322
C5'	B	0, 0.532, 0.864, 1.196, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.864 std_dev=0.332
N2	B	0, 0.359, 0.710, 1.062, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.710 std_dev=0.352
N9	B	0, 0.373, 0.735, 1.098, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.735 std_dev=0.362
O5'	B	0, 0.350, 0.728, 1.106, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.728 std_dev=0.378
C4	B	0, 0.375, 0.770, 1.164, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.770 std_dev=0.395
C2	B	0, 0.374, 0.774, 1.175, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.774 std_dev=0.400
C8	B	0, 0.389, 0.865, 1.342, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.865 std_dev=0.477
C5	B	0, 0.406, 0.958, 1.510, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.958 std_dev=0.552
N1	B	0, 0.408, 0.968, 1.529, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.968 std_dev=0.560
N7	B	0, 0.410, 1.012, 1.613, 2.038 max_d=2.038 avg_d=1.012 std_dev=0.602
P	B	0, 0.459, 1.070, 1.680, 2.698 max_d=2.698 avg_d=1.070 std_dev=0.611
C6	B	0, 0.421, 1.078, 1.734, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.078 std_dev=0.656
OP2	B	0, 0.407, 1.094, 1.780, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.094 std_dev=0.686
O6	B	0, 0.451, 1.272, 2.093, 2.687 max_d=2.687 avg_d=1.272 std_dev=0.821
OP1	B	0, 0.551, 1.457, 2.362, 2.862 max_d=2.862 avg_d=1.457 std_dev=0.905

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.02	0.10	0.10	0.15	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.08	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.08	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.09	0.08	0.10	0.08	0.10	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.10	0.09	0.13	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.04	0.06	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.12	0.11	0.15	0.11
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.08	0.12	0.06	0.04	0.10	0.12	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.13	0.12	0.16	0.12
C8	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.14	0.11	0.11	0.10
N1	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.02	0.11	0.11	0.16	0.11
N3	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.09	0.09	0.13	0.08
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.14	0.14	0.18	0.14
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.03	0.15	0.13	0.15	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.07	0.10	0.07
O2'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.10	0.10	0.07	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.06	0.07	0.03
O3'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.03	0.12	0.09	0.13	0.10	0.14	0.10	0.05	0.04	0.00	0.02	0.07	0.08	0.08	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.09	0.11	0.09
O5'	0.06	0.10	0.04	0.05	0.10	0.01	0.12	0.01	0.13	0.14	0.11	0.09	0.14	0.15	0.09	0.03	0.07	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.05	0.05	0.09	0.05	0.11	0.06	0.12	0.11	0.11	0.09	0.14	0.13	0.07	0.06	0.08	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.15	0.08	0.06	0.13	0.03	0.15	0.01	0.16	0.11	0.16	0.13	0.18	0.15	0.10	0.07	0.08	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.10	0.05	0.04	0.09	0.02	0.11	0.01	0.12	0.10	0.11	0.08	0.14	0.13	0.07	0.03	0.06	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.20	0.12	0.11	0.18	0.17	0.17	0.31	0.18	0.16	0.19	0.22	0.20	0.16	0.17	0.21	0.09	0.16	0.23	0.17	0.29	0.17	0.25
C2	0.14	0.23	0.12	0.10	0.20	0.20	0.22	0.27	0.24	0.19	0.24	0.24	0.21	0.21	0.18	0.23	0.10	0.15	0.16	0.25	0.18	0.23	0.15
C2'	0.13	0.19	0.10	0.10	0.16	0.16	0.15	0.29	0.15	0.14	0.17	0.21	0.18	0.14	0.14	0.19	0.08	0.15	0.24	0.15	0.29	0.18	0.25
C3'	0.11	0.14	0.08	0.09	0.12	0.14	0.10	0.27	0.10	0.10	0.12	0.17	0.15	0.10	0.11	0.15	0.07	0.14	0.26	0.10	0.27	0.19	0.23
C4	0.13	0.20	0.12	0.10	0.18	0.19	0.18	0.26	0.19	0.17	0.20	0.22	0.20	0.17	0.16	0.23	0.09	0.14	0.15	0.19	0.18	0.19	0.15
C4'	0.10	0.13	0.07	0.11	0.11	0.17	0.09	0.32	0.09	0.10	0.11	0.16	0.13	0.09	0.10	0.11	0.08	0.15	0.32	0.08	0.34	0.26	0.32
C5	0.14	0.20	0.13	0.11	0.19	0.21	0.20	0.25	0.21	0.19	0.21	0.20	0.19	0.20	0.18	0.23	0.13	0.14	0.14	0.23	0.18	0.25	0.14
C5'	0.09	0.12	0.08	0.12	0.09	0.16	0.08	0.29	0.08	0.09	0.10	0.14	0.11	0.08	0.09	0.08	0.07	0.14	0.32	0.08	0.30	0.26	0.29
C6	0.15	0.23	0.14	0.12	0.22	0.22	0.25	0.25	0.27	0.22	0.26	0.22	0.21	0.25	0.20	0.24	0.15	0.17	0.16	0.30	0.21	0.31	0.17
C8	0.13	0.18	0.12	0.10	0.17	0.18	0.16	0.24	0.16	0.15	0.17	0.20	0.18	0.15	0.15	0.22	0.10	0.12	0.14	0.16	0.17	0.17	0.13
N1	0.15	0.24	0.13	0.11	0.22	0.22	0.25	0.26	0.27	0.22	0.27	0.24	0.22	0.24	0.20	0.23	0.13	0.16	0.16	0.30	0.19	0.29	0.16
N3	0.14	0.22	0.12	0.09	0.19	0.19	0.19	0.27	0.21	0.17	0.22	0.24	0.21	0.18	0.17	0.23	0.08	0.15	0.16	0.21	0.19	0.19	0.16
N6	0.18	0.27	0.15	0.14	0.26	0.25	0.31	0.25	0.34	0.27	0.32	0.25	0.24	0.31	0.23	0.24	0.18	0.20	0.19	0.38	0.26	0.38	0.21
N7	0.13	0.18	0.13	0.11	0.17	0.21	0.18	0.23	0.19	0.17	0.18	0.19	0.18	0.18	0.16	0.23	0.14	0.13	0.13	0.20	0.19	0.25	0.13
N9	0.14	0.19	0.12	0.10	0.17	0.17	0.17	0.27	0.17	0.16	0.18	0.21	0.19	0.16	0.16	0.22	0.08	0.14	0.17	0.16	0.20	0.16	0.17
O2'	0.13	0.20	0.09	0.10	0.16	0.17	0.15	0.34	0.16	0.13	0.18	0.23	0.19	0.13	0.14	0.17	0.08	0.16	0.30	0.15	0.39	0.24	0.33
O3'	0.10	0.13	0.07	0.10	0.10	0.15	0.09	0.28	0.09	0.09	0.11	0.16	0.14	0.08	0.10	0.12	0.07	0.14	0.31	0.09	0.32	0.23	0.28
O4'	0.16	0.19	0.14	0.13	0.18	0.18	0.17	0.32	0.18	0.17	0.19	0.21	0.19	0.17	0.17	0.20	0.13	0.18	0.27	0.17	0.33	0.22	0.30
O5'	0.05	0.11	0.04	0.04	0.07	0.08	0.07	0.16	0.09	0.05	0.11	0.14	0.11	0.06	0.05	0.10	0.01	0.09	0.20	0.10	0.25	0.14	0.14
OP1	0.07	0.13	0.11	0.05	0.10	0.07	0.14	0.10	0.16	0.12	0.15	0.13	0.11	0.14	0.09	0.17	0.02	0.05	0.26	0.18	0.38	0.20	0.18
OP2	0.11	0.19	0.13	0.09	0.14	0.06	0.17	0.09	0.20	0.15	0.20	0.22	0.17	0.17	0.12	0.17	0.01	0.10	0.14	0.23	0.56	0.36	0.31
P	0.04	0.12	0.05	0.01	0.08	0.03	0.10	0.06	0.13	0.07	0.13	0.14	0.10	0.10	0.05	0.09	0.00	0.06	0.14	0.15	0.38	0.18	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.18	0.02	0.30	0.23	0.17
C2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.10	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.08	0.30	0.01	0.31	0.40	0.26
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.05	0.04	0.07	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.06	0.43	0.27	0.23
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.03	0.34	0.14	0.13
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04	0.34	0.01	0.37	0.42	0.30
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.12	0.05	0.14	0.10	0.12	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.17	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.04	0.45	0.02	0.49	0.56	0.44
C5'	0.06	0.09	0.07	0.01	0.13	0.01	0.23	0.00	0.22	0.30	0.14	0.11	0.08	0.32	0.16	0.07	0.02	0.02	0.01	0.27	0.09	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.05	0.46	0.01	0.49	0.58	0.45
C8	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.12	0.01	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.03	0.06	0.49	0.03	0.55	0.55	0.48
N1	0.03	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.06	0.38	0.01	0.40	0.50	0.36
N2	0.04	0.00	0.07	0.07	0.01	0.14	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.13	0.10	0.26	0.02	0.25	0.36	0.21
N3	0.03	0.00	0.06	0.05	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.09	0.09	0.26	0.01	0.28	0.34	0.21
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.12	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.05	0.06	0.52	0.03	0.58	0.64	0.54
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.34	0.02	0.40	0.39	0.31
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.11	0.07	0.12	0.15	0.10	0.15	0.11	0.17	0.05	0.00	0.04	0.02	0.11	0.16	0.51	0.35	0.28
O3'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.10	0.03	0.11	0.13	0.09	0.05	0.04	0.04	0.00	0.07	0.07	0.11	0.32	0.15	0.12
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.10	0.09	0.06	0.02	0.02	0.07	0.00	0.11	0.06	0.12	0.10	0.08
O5'	0.18	0.30	0.11	0.08	0.34	0.01	0.45	0.01	0.46	0.49	0.38	0.26	0.26	0.52	0.34	0.11	0.07	0.11	0.00	0.50	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.07	0.02	0.27	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.16	0.11	0.06	0.50	0.00	0.55	0.66	0.52
OP1	0.30	0.31	0.43	0.34	0.37	0.17	0.49	0.09	0.49	0.55	0.40	0.25	0.28	0.58	0.40	0.51	0.32	0.12	0.01	0.55	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.40	0.27	0.14	0.42	0.05	0.56	0.02	0.58	0.55	0.50	0.36	0.34	0.64	0.39	0.35	0.15	0.10	0.01	0.66	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.26	0.23	0.13	0.30	0.02	0.44	0.01	0.45	0.48	0.36	0.21	0.21	0.54	0.31	0.28	0.12	0.08	0.01	0.52	0.01	0.00	0.00