Doublet Group distance statistics: 52328

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 3, 0, 5, 4, 4, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.009, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.010, 0.017, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.013, 0.028, 0.042, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.012, 0.033, 0.053, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.019, 0.041, 0.062, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.041 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.023, 0.048, 0.074, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.048 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.050, 0.136, 0.223, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.136 std_dev=0.086
C2'	A	0, 0.050, 0.141, 0.232, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.141 std_dev=0.091
C5'	A	0, 0.196, 0.364, 0.532, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.364 std_dev=0.168
C2'	B	0, 0.212, 0.381, 0.549, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.381 std_dev=0.168
O5'	A	0, 0.285, 0.472, 0.659, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.472 std_dev=0.187
C4'	A	0, 0.033, 0.222, 0.412, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.222 std_dev=0.189
O2'	A	0, -0.025, 0.201, 0.428, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.201 std_dev=0.226
P	A	0, 0.410, 0.642, 0.874, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.642 std_dev=0.232
O3'	B	0, 0.329, 0.571, 0.814, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.571 std_dev=0.242
C3'	A	0, -0.026, 0.254, 0.534, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.254 std_dev=0.280
OP2	A	0, 0.507, 0.797, 1.086, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.797 std_dev=0.289
OP1	A	0, 0.452, 0.754, 1.056, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.754 std_dev=0.302
C1'	B	0, 0.280, 0.588, 0.895, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.588 std_dev=0.308
O2'	B	0, 0.281, 0.604, 0.927, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.604 std_dev=0.323
C3'	B	0, 0.416, 0.779, 1.141, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.779 std_dev=0.363
N9	B	0, 0.453, 0.976, 1.499, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.976 std_dev=0.523
O3'	A	0, -0.133, 0.399, 0.930, 2.988 max_d=2.988 avg_d=0.399 std_dev=0.531
C4	B	0, 0.440, 1.065, 1.691, 1.951 max_d=1.951 avg_d=1.065 std_dev=0.625
N3	B	0, 0.397, 1.045, 1.694, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.045 std_dev=0.648
O4'	B	0, 0.543, 1.207, 1.871, 2.589 max_d=2.589 avg_d=1.207 std_dev=0.664
C4'	B	0, 0.595, 1.267, 1.938, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.267 std_dev=0.671
C8	B	0, 0.698, 1.689, 2.679, 2.954 max_d=2.954 avg_d=1.689 std_dev=0.991
C2	B	0, 0.558, 1.574, 2.589, 3.057 max_d=3.057 avg_d=1.574 std_dev=1.015
C5	B	0, 0.629, 1.692, 2.755, 3.077 max_d=3.077 avg_d=1.692 std_dev=1.063
C5'	B	0, 0.858, 1.922, 2.986, 3.782 max_d=3.782 avg_d=1.922 std_dev=1.064
N7	B	0, 0.782, 2.048, 3.313, 3.580 max_d=3.580 avg_d=2.048 std_dev=1.266
N1	B	0, 0.667, 1.940, 3.213, 3.678 max_d=3.678 avg_d=1.940 std_dev=1.273
N2	B	0, 0.717, 2.002, 3.288, 3.737 max_d=3.737 avg_d=2.002 std_dev=1.286
C6	B	0, 0.712, 2.068, 3.424, 3.836 max_d=3.836 avg_d=2.068 std_dev=1.356
O6	B	0, 0.879, 2.629, 4.379, 4.867 max_d=4.867 avg_d=2.629 std_dev=1.750
O5'	B	0, 1.072, 2.928, 4.784, 5.291 max_d=5.291 avg_d=2.928 std_dev=1.856
P	B	0, 1.468, 3.805, 6.141, 6.584 max_d=6.584 avg_d=3.805 std_dev=2.337
OP1	B	0, 1.636, 4.060, 6.485, 7.020 max_d=7.020 avg_d=4.060 std_dev=2.425
OP2	B	0, 1.565, 4.063, 6.560, 6.868 max_d=6.868 avg_d=4.063 std_dev=2.498

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.10	0.08	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.10	0.14	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.15	0.02	0.17	0.18	0.33	0.21
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05	0.09	0.10	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.13	0.12	0.14	0.12
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.13	0.00	0.17	0.02	0.18	0.16	0.17	0.12	0.20	0.18	0.11	0.02	0.00	0.01	0.08	0.05	0.12	0.08
C4	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.01	0.15	0.15	0.28	0.18
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.05	0.09	0.08	0.04	0.13	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.17	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.09	0.02	0.17	0.21	0.34	0.23
C5'	0.03	0.09	0.08	0.02	0.08	0.00	0.11	0.00	0.12	0.10	0.11	0.07	0.14	0.13	0.06	0.05	0.10	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.02	0.19	0.24	0.39	0.26
C8	0.01	0.00	0.05	0.16	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.10	0.04	0.13	0.16	0.25	0.17
N1	0.02	0.00	0.09	0.17	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.13	0.02	0.19	0.22	0.37	0.24
N3	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.15	0.02	0.15	0.14	0.28	0.17
N6	0.02	0.00	0.07	0.20	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.14	0.02	0.20	0.28	0.42	0.29
N7	0.01	0.00	0.04	0.18	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.12	0.03	0.16	0.22	0.34	0.23
N9	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.01	0.12	0.11	0.21	0.14
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.13	0.13	0.15	0.05	0.17	0.10	0.17	0.14	0.17	0.13	0.09	0.00	0.04	0.10	0.07	0.05	0.13	0.07
O3'	0.12	0.15	0.01	0.00	0.07	0.02	0.09	0.10	0.12	0.10	0.13	0.15	0.14	0.12	0.03	0.04	0.00	0.08	0.18	0.16	0.24	0.17
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.10	0.08	0.00	0.07	0.08	0.11	0.07
O5'	0.10	0.17	0.13	0.08	0.15	0.01	0.17	0.01	0.19	0.13	0.19	0.15	0.20	0.16	0.12	0.07	0.18	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.18	0.12	0.05	0.15	0.05	0.21	0.05	0.24	0.16	0.22	0.14	0.28	0.22	0.11	0.05	0.16	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.33	0.14	0.12	0.28	0.03	0.34	0.02	0.39	0.25	0.37	0.28	0.42	0.34	0.21	0.13	0.24	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.21	0.12	0.08	0.18	0.02	0.23	0.01	0.26	0.17	0.24	0.17	0.29	0.23	0.14	0.07	0.17	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.52	0.20	0.12	0.38	0.19	0.46	0.22	0.56	0.33	0.58	0.56	0.41	0.42	0.27	0.14	0.09	0.14	0.12	0.61	0.44	0.24	0.22
C2	0.19	0.71	0.22	0.26	0.63	0.14	0.91	0.16	1.07	0.72	0.97	0.67	0.51	0.94	0.50	0.25	0.16	0.15	0.52	1.26	0.79	0.89	0.66
C2'	0.11	0.48	0.16	0.11	0.33	0.14	0.40	0.18	0.50	0.29	0.53	0.53	0.37	0.37	0.23	0.10	0.10	0.10	0.14	0.56	0.51	0.28	0.27
C3'	0.13	0.36	0.17	0.11	0.24	0.11	0.28	0.12	0.35	0.25	0.38	0.43	0.29	0.28	0.19	0.14	0.10	0.10	0.21	0.38	0.60	0.36	0.36
C4	0.20	0.62	0.23	0.26	0.55	0.12	0.75	0.14	0.87	0.62	0.80	0.60	0.47	0.78	0.45	0.21	0.16	0.13	0.47	1.00	0.73	0.74	0.58
C4'	0.08	0.29	0.12	0.07	0.15	0.17	0.16	0.26	0.22	0.16	0.28	0.37	0.23	0.15	0.10	0.13	0.06	0.12	0.21	0.23	0.51	0.24	0.30
C5	0.24	0.60	0.24	0.34	0.60	0.17	0.85	0.28	0.95	0.77	0.81	0.55	0.45	0.94	0.53	0.27	0.21	0.20	0.73	1.10	0.98	1.02	0.86
C5'	0.07	0.18	0.11	0.08	0.07	0.10	0.08	0.18	0.11	0.17	0.16	0.25	0.14	0.15	0.08	0.15	0.08	0.07	0.21	0.12	0.53	0.28	0.32
C6	0.25	0.63	0.23	0.36	0.67	0.19	0.99	0.34	1.12	0.88	0.93	0.56	0.45	1.09	0.59	0.31	0.22	0.22	0.85	1.32	1.11	1.22	1.00
C8	0.24	0.48	0.26	0.30	0.46	0.15	0.59	0.21	0.64	0.56	0.58	0.49	0.39	0.64	0.42	0.18	0.20	0.18	0.57	0.72	0.81	0.71	0.65
N1	0.22	0.69	0.22	0.32	0.67	0.15	1.00	0.25	1.16	0.84	1.00	0.61	0.49	1.07	0.56	0.30	0.19	0.18	0.72	1.38	1.00	1.13	0.88
N3	0.18	0.68	0.22	0.22	0.57	0.15	0.79	0.13	0.94	0.61	0.88	0.67	0.50	0.80	0.44	0.20	0.14	0.14	0.37	1.08	0.64	0.69	0.49
N6	0.28	0.59	0.23	0.41	0.70	0.27	1.09	0.47	1.21	1.00	0.95	0.53	0.41	1.24	0.65	0.36	0.24	0.29	1.06	1.46	1.33	1.48	1.24
N7	0.28	0.51	0.27	0.39	0.55	0.24	0.77	0.36	0.81	0.76	0.68	0.51	0.40	0.87	0.53	0.26	0.24	0.26	0.83	0.93	1.06	1.04	0.93
N9	0.19	0.55	0.23	0.21	0.46	0.11	0.59	0.11	0.68	0.49	0.65	0.55	0.43	0.60	0.37	0.16	0.14	0.12	0.34	0.77	0.61	0.53	0.44
O2'	0.13	0.52	0.18	0.08	0.33	0.22	0.39	0.30	0.51	0.25	0.56	0.60	0.40	0.33	0.22	0.17	0.06	0.18	0.17	0.55	0.48	0.17	0.25
O3'	0.09	0.36	0.12	0.11	0.20	0.12	0.23	0.18	0.30	0.22	0.36	0.45	0.28	0.24	0.14	0.07	0.11	0.09	0.25	0.34	0.67	0.42	0.42
O4'	0.11	0.40	0.16	0.08	0.25	0.23	0.28	0.30	0.36	0.20	0.41	0.46	0.32	0.24	0.17	0.13	0.08	0.17	0.20	0.38	0.44	0.19	0.25
O5'	0.04	0.25	0.07	0.02	0.10	0.05	0.10	0.10	0.16	0.13	0.22	0.32	0.19	0.10	0.05	0.11	0.01	0.02	0.32	0.16	0.69	0.33	0.44
OP1	0.08	0.35	0.12	0.08	0.29	0.25	0.37	0.33	0.43	0.28	0.41	0.36	0.28	0.37	0.21	0.09	0.02	0.17	0.30	0.48	0.68	0.28	0.41
OP2	0.17	0.51	0.31	0.06	0.29	0.21	0.23	0.49	0.33	0.16	0.46	0.61	0.44	0.13	0.16	0.41	0.02	0.11	0.93	0.31	1.28	0.88	1.05
P	0.06	0.31	0.14	0.01	0.19	0.15	0.19	0.26	0.25	0.13	0.30	0.36	0.25	0.15	0.11	0.15	0.00	0.08	0.50	0.25	0.82	0.37	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.21	0.01	0.20	0.23	0.09
C2	0.03	0.00	0.16	0.18	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.23	0.05	0.47	0.00	0.37	0.16	0.32
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.07	0.13	0.19	0.16	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.31	0.07	0.38	0.06	0.21
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.08	0.16	0.22	0.16	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.41	0.10	0.50	0.10	0.32
C4	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.11	0.02	0.50	0.01	0.37	0.13	0.32
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.06	0.08	0.06	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.16	0.34	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.64	0.01	0.45	0.26	0.45
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.05	0.08	0.08	0.07	0.06	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.20	0.41	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.02	0.66	0.00	0.48	0.33	0.49
C8	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.03	0.64	0.01	0.42	0.15	0.41
N1	0.02	0.00	0.13	0.16	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.20	0.04	0.58	0.00	0.44	0.26	0.42
N2	0.03	0.01	0.19	0.22	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.28	0.05	0.42	0.01	0.34	0.14	0.28
N3	0.03	0.00	0.16	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.19	0.04	0.41	0.01	0.33	0.11	0.26
N7	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.71	0.01	0.49	0.30	0.52
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.46	0.01	0.33	0.10	0.27
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.12	0.18	0.13	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.07	0.21	0.19	0.03
O3'	0.01	0.23	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.03	0.14	0.09	0.20	0.28	0.19	0.06	0.03	0.04	0.00	0.01	0.30	0.13	0.55	0.16	0.32
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.02	0.09	0.45	0.16
O5'	0.21	0.47	0.31	0.41	0.50	0.01	0.64	0.01	0.66	0.64	0.58	0.42	0.41	0.71	0.46	0.06	0.30	0.05	0.00	0.72	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.72	0.00	0.53	0.42	0.56
OP1	0.20	0.37	0.38	0.50	0.37	0.16	0.45	0.20	0.48	0.42	0.44	0.34	0.33	0.49	0.33	0.21	0.55	0.09	0.01	0.53	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.16	0.06	0.10	0.13	0.34	0.26	0.41	0.33	0.15	0.26	0.14	0.11	0.30	0.10	0.19	0.16	0.45	0.02	0.42	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.32	0.21	0.32	0.32	0.04	0.45	0.01	0.49	0.41	0.42	0.28	0.26	0.52	0.27	0.03	0.32	0.16	0.00	0.56	0.00	0.01	0.00