Doublet Group distance statistics: 52329

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 2, 5, 5, 9, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.011, 0.036, 0.062, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.036 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.011, 0.040, 0.070, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.040 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.018, 0.055, 0.092, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.055 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.015, 0.060, 0.104, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.060 std_dev=0.045
C8	A	0, 0.016, 0.071, 0.125, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.071 std_dev=0.055
C2'	B	0, 0.237, 0.403, 0.568, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.403 std_dev=0.165
C3'	B	0, 0.276, 0.461, 0.646, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.461 std_dev=0.185
O2'	B	0, 0.262, 0.455, 0.648, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.455 std_dev=0.193
C1'	B	0, 0.151, 0.388, 0.624, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.388 std_dev=0.236
O4'	B	0, 0.223, 0.470, 0.716, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.470 std_dev=0.246
C4'	B	0, 0.248, 0.505, 0.763, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.505 std_dev=0.257
O4'	A	0, 0.038, 0.316, 0.593, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.316 std_dev=0.278
O3'	B	0, 0.249, 0.544, 0.840, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.544 std_dev=0.295
C2'	A	0, 0.022, 0.322, 0.622, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.322 std_dev=0.300
C3'	A	0, 0.043, 0.366, 0.688, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.366 std_dev=0.322
O3'	A	0, -0.043, 0.333, 0.710, 2.131 max_d=2.131 avg_d=0.333 std_dev=0.376
C4'	A	0, 0.033, 0.419, 0.806, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.419 std_dev=0.387
N9	B	0, 0.010, 0.431, 0.853, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.431 std_dev=0.422
N3	B	0, 0.000, 0.437, 0.873, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.437 std_dev=0.437
C5'	B	0, 0.195, 0.646, 1.096, 2.418 max_d=2.418 avg_d=0.646 std_dev=0.450
C4	B	0, -0.035, 0.456, 0.947, 2.319 max_d=2.319 avg_d=0.456 std_dev=0.491
O2'	A	0, 0.004, 0.518, 1.032, 2.480 max_d=2.480 avg_d=0.518 std_dev=0.514
C2	B	0, -0.051, 0.505, 1.061, 2.515 max_d=2.515 avg_d=0.505 std_dev=0.556
N2	B	0, -0.028, 0.539, 1.105, 2.404 max_d=2.404 avg_d=0.539 std_dev=0.566
P	A	0, 0.208, 0.774, 1.341, 2.627 max_d=2.627 avg_d=0.774 std_dev=0.566
C8	B	0, -0.053, 0.519, 1.092, 2.679 max_d=2.679 avg_d=0.519 std_dev=0.572
O5'	A	0, 0.078, 0.666, 1.254, 3.075 max_d=3.075 avg_d=0.666 std_dev=0.588
C5'	A	0, 0.060, 0.694, 1.329, 2.678 max_d=2.678 avg_d=0.694 std_dev=0.635
C5	B	0, -0.105, 0.552, 1.209, 3.133 max_d=3.133 avg_d=0.552 std_dev=0.657
O5'	B	0, 0.056, 0.727, 1.397, 2.844 max_d=2.844 avg_d=0.727 std_dev=0.670
N1	B	0, -0.105, 0.592, 1.290, 3.281 max_d=3.281 avg_d=0.592 std_dev=0.698
N7	B	0, -0.120, 0.588, 1.296, 3.336 max_d=3.336 avg_d=0.588 std_dev=0.708
C6	B	0, -0.130, 0.632, 1.395, 3.669 max_d=3.669 avg_d=0.632 std_dev=0.763
OP2	A	0, 0.218, 0.984, 1.750, 3.449 max_d=3.449 avg_d=0.984 std_dev=0.766
OP1	A	0, 0.192, 1.099, 2.006, 3.480 max_d=3.480 avg_d=1.099 std_dev=0.907
O6	B	0, -0.165, 0.750, 1.664, 4.448 max_d=4.448 avg_d=0.750 std_dev=0.914
P	B	0, -0.211, 0.881, 1.973, 4.278 max_d=4.278 avg_d=0.881 std_dev=1.092
OP2	B	0, -0.258, 0.988, 2.233, 4.998 max_d=4.998 avg_d=0.988 std_dev=1.245
OP1	B	0, -0.233, 1.096, 2.425, 5.192 max_d=5.192 avg_d=1.096 std_dev=1.329

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.00	0.14	0.08	0.40	0.12
C2	0.02	0.00	0.22	0.18	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.09	0.15	0.21	0.23	0.53	0.19
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.09	0.11	0.09	0.18	0.22	0.09	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.32	0.18	0.25	0.24
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.02	0.17	0.10	0.18	0.16	0.17	0.13	0.10	0.01	0.01	0.01	0.19	0.07	0.32	0.12
C4	0.01	0.00	0.12	0.15	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.06	0.08	0.19	0.20	0.51	0.19
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.09	0.08	0.08	0.07	0.08	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.08	0.35	0.08
C5	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.06	0.04	0.19	0.26	0.57	0.21
C5'	0.04	0.12	0.09	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.09	0.11	0.11	0.09	0.09	0.04	0.02	0.12	0.01	0.01	0.11	0.24	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.17	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.07	0.07	0.21	0.29	0.58	0.22
C8	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.04	0.09	0.17	0.23	0.54	0.21
N1	0.01	0.00	0.18	0.18	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.09	0.12	0.22	0.27	0.57	0.21
N3	0.01	0.00	0.22	0.16	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.09	0.14	0.20	0.19	0.49	0.18
N6	0.01	0.00	0.09	0.17	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.07	0.05	0.20	0.32	0.61	0.24
N7	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.05	0.05	0.18	0.29	0.58	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.01	0.17	0.16	0.48	0.17
O2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.13	0.09	0.15	0.02	0.18	0.19	0.22	0.24	0.19	0.18	0.09	0.00	0.04	0.05	0.24	0.18	0.28	0.24
O3'	0.14	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.12	0.07	0.04	0.09	0.09	0.07	0.05	0.06	0.04	0.00	0.09	0.09	0.10	0.35	0.11
O4'	0.00	0.15	0.02	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.09	0.12	0.14	0.05	0.05	0.01	0.05	0.09	0.00	0.10	0.12	0.50	0.18
O5'	0.14	0.21	0.32	0.19	0.19	0.01	0.19	0.01	0.21	0.17	0.22	0.20	0.20	0.18	0.17	0.24	0.09	0.10	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.08	0.23	0.18	0.07	0.20	0.08	0.26	0.11	0.29	0.23	0.27	0.19	0.32	0.29	0.16	0.18	0.10	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.53	0.25	0.32	0.51	0.35	0.57	0.24	0.58	0.54	0.57	0.49	0.61	0.58	0.48	0.28	0.35	0.50	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.19	0.24	0.12	0.19	0.08	0.21	0.02	0.22	0.21	0.21	0.18	0.24	0.23	0.17	0.24	0.11	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.27	0.13	0.08	0.22	0.18	0.23	0.23	0.25	0.20	0.27	0.30	0.24	0.22	0.19	0.25	0.19	0.15	0.13	0.26	0.30	0.14	0.17
C2	0.27	0.52	0.17	0.13	0.44	0.15	0.49	0.16	0.54	0.40	0.56	0.55	0.45	0.46	0.37	0.16	0.26	0.23	0.22	0.57	0.16	0.45	0.25
C2'	0.33	0.30	0.38	0.34	0.34	0.16	0.38	0.17	0.36	0.42	0.33	0.27	0.29	0.42	0.37	0.46	0.40	0.19	0.28	0.39	0.39	0.30	0.31
C3'	0.17	0.20	0.20	0.18	0.19	0.10	0.20	0.15	0.20	0.22	0.20	0.21	0.18	0.22	0.19	0.30	0.21	0.10	0.24	0.21	0.45	0.20	0.32
C4	0.25	0.42	0.16	0.12	0.37	0.14	0.40	0.15	0.43	0.35	0.44	0.42	0.38	0.38	0.33	0.18	0.26	0.20	0.18	0.45	0.14	0.37	0.19
C4'	0.16	0.24	0.13	0.09	0.20	0.20	0.19	0.25	0.21	0.16	0.23	0.26	0.23	0.17	0.17	0.22	0.12	0.17	0.18	0.20	0.39	0.19	0.28
C5	0.29	0.44	0.18	0.15	0.43	0.15	0.46	0.16	0.48	0.41	0.47	0.41	0.41	0.45	0.38	0.14	0.27	0.24	0.28	0.50	0.22	0.50	0.31
C5'	0.19	0.22	0.17	0.17	0.20	0.18	0.19	0.20	0.19	0.18	0.21	0.22	0.21	0.19	0.19	0.22	0.19	0.19	0.17	0.19	0.33	0.20	0.27
C6	0.30	0.52	0.19	0.16	0.48	0.17	0.54	0.20	0.58	0.46	0.57	0.49	0.47	0.52	0.42	0.13	0.27	0.27	0.34	0.61	0.29	0.60	0.39
C8	0.23	0.27	0.16	0.13	0.29	0.14	0.31	0.13	0.31	0.30	0.29	0.25	0.27	0.32	0.28	0.20	0.27	0.18	0.18	0.32	0.15	0.34	0.19
N1	0.30	0.55	0.18	0.15	0.48	0.16	0.54	0.18	0.60	0.45	0.60	0.55	0.48	0.51	0.41	0.13	0.27	0.26	0.30	0.63	0.24	0.56	0.35
N3	0.25	0.46	0.15	0.12	0.39	0.15	0.42	0.16	0.47	0.35	0.49	0.49	0.41	0.39	0.33	0.19	0.25	0.21	0.16	0.49	0.15	0.35	0.18
N6	0.31	0.54	0.20	0.17	0.52	0.19	0.60	0.24	0.65	0.51	0.62	0.47	0.47	0.58	0.45	0.12	0.27	0.29	0.43	0.68	0.42	0.73	0.51
N7	0.29	0.34	0.18	0.16	0.39	0.15	0.41	0.17	0.41	0.40	0.38	0.28	0.35	0.42	0.37	0.14	0.28	0.23	0.30	0.42	0.26	0.51	0.33
N9	0.21	0.32	0.15	0.11	0.29	0.14	0.31	0.15	0.33	0.28	0.33	0.32	0.30	0.30	0.27	0.22	0.25	0.17	0.12	0.34	0.15	0.27	0.13
O2'	0.38	0.36	0.47	0.39	0.41	0.24	0.46	0.30	0.46	0.51	0.41	0.34	0.34	0.52	0.43	0.59	0.39	0.23	0.35	0.49	0.49	0.34	0.37
O3'	0.17	0.30	0.19	0.14	0.23	0.12	0.24	0.19	0.26	0.22	0.30	0.35	0.27	0.23	0.20	0.31	0.13	0.11	0.24	0.27	0.48	0.19	0.33
O4'	0.21	0.28	0.17	0.15	0.24	0.30	0.23	0.35	0.24	0.20	0.27	0.31	0.27	0.20	0.21	0.23	0.12	0.25	0.24	0.24	0.37	0.23	0.27
O5'	0.08	0.17	0.08	0.02	0.11	0.13	0.10	0.19	0.11	0.09	0.15	0.20	0.15	0.08	0.09	0.16	0.01	0.11	0.21	0.10	0.42	0.24	0.32
OP1	0.16	0.27	0.21	0.09	0.22	0.27	0.22	0.28	0.25	0.18	0.26	0.30	0.25	0.20	0.18	0.39	0.02	0.26	0.39	0.25	0.48	0.46	0.50
OP2	0.28	0.43	0.24	0.08	0.35	0.21	0.33	0.19	0.36	0.27	0.41	0.48	0.41	0.29	0.29	0.41	0.02	0.24	0.19	0.36	0.46	0.16	0.26
P	0.08	0.13	0.13	0.02	0.10	0.12	0.10	0.11	0.11	0.10	0.12	0.15	0.12	0.10	0.09	0.24	0.00	0.11	0.20	0.11	0.35	0.21	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.24	0.01	0.24	0.32	0.25
C2	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.19	0.08	0.28	0.01	0.34	0.46	0.36
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.08	0.04	0.06	0.06	0.07	0.06	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.25	0.04	0.29	0.34	0.27
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.03	0.18	0.12	0.08
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.14	0.05	0.33	0.01	0.39	0.51	0.41
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.13	0.06
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.10	0.04	0.40	0.01	0.51	0.64	0.53
C5'	0.03	0.10	0.08	0.02	0.09	0.00	0.12	0.00	0.13	0.12	0.12	0.11	0.09	0.14	0.07	0.05	0.09	0.01	0.01	0.14	0.15	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.06	0.39	0.00	0.52	0.64	0.53
C8	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.06	0.04	0.44	0.01	0.54	0.66	0.56
N1	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.16	0.07	0.34	0.01	0.44	0.55	0.45
N2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.22	0.09	0.24	0.02	0.28	0.41	0.30
N3	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.18	0.07	0.26	0.01	0.30	0.42	0.32
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.04	0.46	0.01	0.60	0.74	0.62
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.35	0.01	0.39	0.49	0.41
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.09	0.03	0.10	0.05	0.12	0.13	0.15	0.19	0.14	0.12	0.06	0.00	0.06	0.02	0.24	0.13	0.31	0.41	0.28
O3'	0.13	0.19	0.04	0.01	0.14	0.01	0.10	0.09	0.12	0.06	0.16	0.22	0.18	0.06	0.10	0.06	0.00	0.10	0.13	0.10	0.28	0.17	0.17
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.07	0.09	0.07	0.04	0.01	0.02	0.10	0.00	0.16	0.05	0.18	0.21	0.18
O5'	0.24	0.28	0.25	0.09	0.33	0.02	0.40	0.01	0.39	0.44	0.34	0.24	0.26	0.46	0.35	0.24	0.13	0.16	0.00	0.42	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.05	0.42	0.00	0.59	0.70	0.58
OP1	0.24	0.34	0.29	0.18	0.39	0.09	0.51	0.15	0.52	0.54	0.44	0.28	0.30	0.60	0.39	0.31	0.28	0.18	0.01	0.59	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.46	0.34	0.12	0.51	0.13	0.64	0.17	0.64	0.66	0.55	0.41	0.42	0.74	0.49	0.41	0.17	0.21	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.36	0.27	0.08	0.41	0.06	0.53	0.01	0.53	0.56	0.45	0.30	0.32	0.62	0.41	0.28	0.17	0.18	0.00	0.58	0.00	0.01	0.00