Doublet Group distance statistics: 52330

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 4, 5, 6, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.011, 0.019, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.016, 0.034, 0.051, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.018, 0.037, 0.056, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.023, 0.047, 0.071, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.047 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.023, 0.051, 0.079, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.030, 0.062, 0.094, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.062 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.142, 0.266, 0.391, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.266 std_dev=0.125
O4'	A	0, 0.071, 0.220, 0.369, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.220 std_dev=0.149
O2'	A	0, 0.129, 0.304, 0.478, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.304 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.215, 0.426, 0.638, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.426 std_dev=0.211
O3'	B	0, 0.366, 0.580, 0.794, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.580 std_dev=0.214
C1'	B	0, 0.482, 0.696, 0.911, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.696 std_dev=0.214
O4'	B	0, 0.424, 0.638, 0.852, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.638 std_dev=0.214
C4'	A	0, 0.154, 0.371, 0.587, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.371 std_dev=0.216
P	A	0, 0.356, 0.587, 0.818, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.587 std_dev=0.231
C2'	B	0, 0.477, 0.712, 0.946, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.712 std_dev=0.235
C3'	B	0, 0.397, 0.634, 0.871, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.634 std_dev=0.237
O5'	A	0, 0.302, 0.563, 0.823, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.563 std_dev=0.261
OP2	A	0, 0.359, 0.622, 0.886, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.622 std_dev=0.263
OP1	A	0, 0.367, 0.642, 0.916, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.642 std_dev=0.275
C4'	B	0, 0.406, 0.685, 0.965, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.685 std_dev=0.280
N9	B	0, 0.591, 0.887, 1.184, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.887 std_dev=0.296
O2'	B	0, 0.594, 0.892, 1.189, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.892 std_dev=0.298
O3'	A	0, 0.333, 0.652, 0.972, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.652 std_dev=0.320
C5'	A	0, 0.264, 0.594, 0.924, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.594 std_dev=0.330
C5'	B	0, 0.510, 0.921, 1.333, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.921 std_dev=0.411
C8	B	0, 0.768, 1.223, 1.677, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.223 std_dev=0.454
C4	B	0, 0.706, 1.245, 1.784, 1.845 max_d=1.845 avg_d=1.245 std_dev=0.539
N7	B	0, 0.845, 1.399, 1.953, 1.846 max_d=1.846 avg_d=1.399 std_dev=0.554
O5'	B	0, 0.702, 1.273, 1.844, 1.927 max_d=1.927 avg_d=1.273 std_dev=0.571
C5	B	0, 0.774, 1.365, 1.955, 1.992 max_d=1.992 avg_d=1.365 std_dev=0.591
P	B	0, 0.880, 1.618, 2.356, 2.465 max_d=2.465 avg_d=1.618 std_dev=0.738
N3	B	0, 0.914, 1.752, 2.589, 2.584 max_d=2.584 avg_d=1.752 std_dev=0.837
C6	B	0, 0.934, 1.795, 2.656, 2.719 max_d=2.719 avg_d=1.795 std_dev=0.861
O6	B	0, 1.035, 1.998, 2.962, 3.018 max_d=3.018 avg_d=1.998 std_dev=0.964
N1	B	0, 1.107, 2.215, 3.324, 3.336 max_d=3.336 avg_d=2.215 std_dev=1.108
C2	B	0, 1.124, 2.258, 3.392, 3.336 max_d=3.336 avg_d=2.258 std_dev=1.134
OP2	B	0, 1.367, 2.759, 4.151, 4.031 max_d=4.031 avg_d=2.759 std_dev=1.392
N2	B	0, 1.406, 2.946, 4.486, 4.260 max_d=4.260 avg_d=2.946 std_dev=1.540
OP1	B	0, 1.623, 3.190, 4.756, 4.662 max_d=4.662 avg_d=3.190 std_dev=1.567

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.12	0.16	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.02	0.09	0.11	0.21	0.13
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.10	0.04	0.12	0.11	0.10	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.05
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.16	0.09	0.17	0.13	0.17	0.11	0.06	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04	0.02
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.01	0.07	0.10	0.20	0.13
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.02	0.11	0.12	0.23	0.13
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.08	0.09	0.07	0.05	0.10	0.10	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.16	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.20	0.03	0.12	0.13	0.24	0.14
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.10	0.10	0.21	0.12
N1	0.01	0.00	0.12	0.17	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.22	0.03	0.11	0.12	0.23	0.14
N3	0.02	0.00	0.11	0.13	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.16	0.02	0.07	0.10	0.20	0.13
N6	0.01	0.01	0.10	0.17	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.23	0.03	0.15	0.15	0.26	0.15
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.03	0.12	0.12	0.24	0.13
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.08	0.19	0.12
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.07	0.02	0.09	0.10	0.06	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.07	0.06	0.05
O3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.12	0.01	0.16	0.02	0.20	0.09	0.22	0.16	0.23	0.13	0.06	0.04	0.00	0.01	0.03	0.10	0.10	0.05
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.11	0.14	0.13
O5'	0.02	0.09	0.02	0.03	0.07	0.01	0.11	0.01	0.12	0.10	0.11	0.07	0.15	0.12	0.05	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.11	0.03	0.05	0.10	0.06	0.12	0.06	0.13	0.10	0.12	0.10	0.15	0.12	0.08	0.07	0.10	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.21	0.08	0.04	0.20	0.04	0.23	0.02	0.24	0.21	0.23	0.20	0.26	0.24	0.19	0.06	0.10	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.05	0.02	0.13	0.04	0.13	0.01	0.14	0.12	0.14	0.13	0.15	0.13	0.12	0.05	0.05	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.88	0.24	0.17	0.57	0.12	0.52	0.16	0.65	0.25	0.81	1.05	0.77	0.34	0.37	0.32	0.23	0.19	0.38	0.63	0.25	0.56	0.28
C2	0.28	0.94	0.25	0.14	0.61	0.13	0.65	0.19	0.82	0.37	0.95	1.10	0.75	0.51	0.41	0.39	0.17	0.12	0.27	0.86	0.21	0.34	0.23
C2'	0.26	0.84	0.17	0.12	0.51	0.09	0.46	0.17	0.60	0.18	0.77	1.02	0.72	0.27	0.31	0.25	0.17	0.15	0.33	0.58	0.34	0.58	0.23
C3'	0.16	0.63	0.09	0.09	0.36	0.08	0.30	0.19	0.41	0.07	0.57	0.79	0.55	0.13	0.19	0.16	0.11	0.09	0.22	0.38	0.61	0.50	0.20
C4	0.30	0.89	0.26	0.14	0.60	0.11	0.61	0.15	0.75	0.36	0.87	1.03	0.75	0.47	0.41	0.39	0.18	0.14	0.25	0.76	0.21	0.33	0.19
C4'	0.15	0.57	0.11	0.12	0.31	0.09	0.23	0.21	0.33	0.06	0.49	0.73	0.50	0.07	0.15	0.16	0.15	0.08	0.26	0.29	0.56	0.56	0.20
C5	0.26	0.76	0.25	0.12	0.55	0.10	0.60	0.14	0.72	0.39	0.79	0.84	0.63	0.50	0.40	0.40	0.14	0.10	0.14	0.75	0.24	0.17	0.11
C5'	0.06	0.32	0.11	0.14	0.12	0.14	0.07	0.23	0.12	0.17	0.24	0.44	0.28	0.13	0.06	0.12	0.08	0.10	0.16	0.09	0.90	0.41	0.30
C6	0.23	0.73	0.25	0.11	0.53	0.12	0.61	0.16	0.74	0.40	0.79	0.79	0.58	0.53	0.38	0.40	0.12	0.09	0.12	0.80	0.21	0.15	0.10
C8	0.30	0.71	0.26	0.13	0.53	0.08	0.53	0.10	0.62	0.35	0.69	0.77	0.63	0.43	0.39	0.38	0.16	0.15	0.16	0.62	0.35	0.21	0.10
N1	0.24	0.83	0.25	0.12	0.57	0.13	0.64	0.18	0.80	0.40	0.88	0.94	0.65	0.53	0.39	0.40	0.14	0.10	0.18	0.85	0.18	0.21	0.16
N3	0.30	0.97	0.26	0.15	0.63	0.12	0.64	0.18	0.80	0.35	0.95	1.15	0.80	0.47	0.42	0.38	0.19	0.15	0.32	0.82	0.22	0.43	0.26
N6	0.18	0.56	0.23	0.10	0.45	0.14	0.57	0.16	0.68	0.42	0.67	0.54	0.42	0.54	0.34	0.40	0.10	0.10	0.07	0.77	0.26	0.18	0.11
N7	0.26	0.64	0.26	0.11	0.51	0.08	0.55	0.11	0.64	0.39	0.67	0.66	0.55	0.48	0.38	0.40	0.11	0.10	0.09	0.66	0.35	0.14	0.11
N9	0.32	0.85	0.26	0.15	0.58	0.10	0.57	0.14	0.68	0.32	0.81	0.98	0.74	0.42	0.40	0.37	0.20	0.17	0.27	0.68	0.24	0.37	0.19
O2'	0.29	0.94	0.19	0.14	0.56	0.12	0.50	0.18	0.66	0.19	0.86	1.17	0.81	0.28	0.34	0.25	0.19	0.19	0.44	0.63	0.26	0.76	0.33
O3'	0.13	0.61	0.07	0.10	0.31	0.09	0.24	0.23	0.36	0.05	0.53	0.79	0.52	0.07	0.14	0.11	0.08	0.07	0.24	0.32	0.73	0.57	0.26
O4'	0.26	0.71	0.21	0.17	0.45	0.11	0.38	0.17	0.48	0.15	0.63	0.86	0.64	0.21	0.28	0.28	0.25	0.15	0.34	0.44	0.31	0.56	0.23
O5'	0.08	0.28	0.03	0.07	0.15	0.12	0.11	0.15	0.15	0.06	0.24	0.36	0.25	0.05	0.08	0.08	0.01	0.12	0.11	0.13	1.00	0.23	0.35
OP1	0.07	0.10	0.14	0.03	0.10	0.12	0.14	0.15	0.14	0.17	0.11	0.12	0.10	0.18	0.11	0.24	0.02	0.06	0.23	0.16	1.40	0.30	0.57
OP2	0.13	0.23	0.11	0.06	0.18	0.04	0.18	0.06	0.20	0.15	0.22	0.26	0.21	0.17	0.15	0.16	0.01	0.07	0.22	0.20	1.19	0.34	0.50
P	0.06	0.15	0.06	0.01	0.09	0.06	0.08	0.07	0.09	0.06	0.13	0.18	0.14	0.07	0.06	0.12	0.00	0.05	0.18	0.09	1.16	0.25	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.31	0.02	0.41	0.54	0.31
C2	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.15	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.16	0.05	0.01	0.42	0.51	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.04	0.05	0.03	0.06	0.07	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.55	0.05	0.97	0.79	0.65
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.09	0.06	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.34	0.03	0.98	0.35	0.49
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.08	0.26	0.01	0.12	0.75	0.22
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.12	0.10	0.20	0.14	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.37	0.12	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.44	0.01	0.14	1.04	0.38
C5'	0.02	0.13	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.05	0.20	0.07	0.19	0.13	0.18	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.08	0.35	0.31	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.06	0.34	0.00	0.16	0.99	0.28
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.02	0.09	0.77	0.01	0.58	1.27	0.73
N1	0.03	0.00	0.06	0.03	0.01	0.10	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.12	0.13	0.00	0.35	0.73	0.09
N2	0.04	0.00	0.07	0.09	0.01	0.20	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.16	0.19	0.18	0.01	0.59	0.32	0.25
N3	0.03	0.00	0.06	0.06	0.00	0.14	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.12	0.16	0.04	0.01	0.29	0.47	0.07
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.06	0.71	0.01	0.41	1.34	0.67
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.45	0.01	0.33	0.84	0.41
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.04	0.07	0.10	0.12	0.20	0.15	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.57	0.07	1.14	0.95	0.76
O3'	0.05	0.13	0.01	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.11	0.16	0.12	0.03	0.05	0.02	0.00	0.04	0.17	0.07	0.88	0.22	0.36
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.09	0.12	0.19	0.16	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.04	0.06	0.10	0.05
O5'	0.31	0.05	0.55	0.34	0.26	0.01	0.44	0.00	0.34	0.77	0.13	0.18	0.04	0.71	0.45	0.57	0.17	0.04	0.00	0.42	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.42	0.00	0.14	1.15	0.37
OP1	0.41	0.42	0.97	0.98	0.12	0.37	0.14	0.35	0.16	0.58	0.35	0.59	0.29	0.41	0.33	1.14	0.88	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01
OP2	0.54	0.51	0.79	0.35	0.75	0.12	1.04	0.31	0.99	1.27	0.73	0.32	0.47	1.34	0.84	0.95	0.22	0.10	0.02	1.15	0.01	0.00	0.01
P	0.31	0.10	0.65	0.49	0.22	0.06	0.38	0.01	0.28	0.73	0.09	0.25	0.07	0.67	0.41	0.76	0.36	0.05	0.00	0.37	0.01	0.01	0.00