Doublet Group distance statistics: 52334

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 2, 3, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.001, 0.020, 0.040, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.003, 0.025, 0.048, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.025 std_dev=0.022
C2'	A	0, -0.006, 0.129, 0.265, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.129 std_dev=0.135
O4'	A	0, -0.022, 0.120, 0.263, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.120 std_dev=0.143
O2'	A	0, 0.001, 0.157, 0.314, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.157 std_dev=0.157
O2'	B	0, 0.146, 0.319, 0.492, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.319 std_dev=0.173
C3'	A	0, -0.026, 0.208, 0.442, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.208 std_dev=0.234
C4'	A	0, -0.050, 0.208, 0.465, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.208 std_dev=0.258
O5'	A	0, 0.039, 0.297, 0.555, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.297 std_dev=0.258
C2'	B	0, 0.113, 0.380, 0.647, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.380 std_dev=0.267
O3'	A	0, 0.002, 0.315, 0.629, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.315 std_dev=0.313
C1'	B	0, 0.093, 0.477, 0.862, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.477 std_dev=0.385
P	A	0, 0.001, 0.400, 0.798, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.400 std_dev=0.399
C5'	A	0, -0.093, 0.348, 0.789, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.348 std_dev=0.441
OP1	A	0, 0.024, 0.525, 1.026, 2.156 max_d=2.156 avg_d=0.525 std_dev=0.501
O3'	B	0, 0.031, 0.538, 1.045, 2.027 max_d=2.027 avg_d=0.538 std_dev=0.507
C3'	B	0, 0.031, 0.553, 1.076, 2.040 max_d=2.040 avg_d=0.553 std_dev=0.522
O4'	B	0, 0.119, 0.672, 1.225, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.672 std_dev=0.553
OP2	A	0, -0.161, 0.488, 1.137, 2.609 max_d=2.609 avg_d=0.488 std_dev=0.649
C4'	B	0, 0.079, 0.732, 1.384, 2.556 max_d=2.556 avg_d=0.732 std_dev=0.653
N9	B	0, -0.040, 0.680, 1.400, 2.909 max_d=2.909 avg_d=0.680 std_dev=0.720
C4	B	0, -0.156, 0.770, 1.697, 3.758 max_d=3.758 avg_d=0.770 std_dev=0.926
N3	B	0, -0.202, 0.740, 1.683, 3.828 max_d=3.828 avg_d=0.740 std_dev=0.942
C8	B	0, -0.109, 0.931, 1.971, 4.220 max_d=4.220 avg_d=0.931 std_dev=1.040
C5'	B	0, 0.014, 1.068, 2.122, 3.949 max_d=3.949 avg_d=1.068 std_dev=1.054
O5'	B	0, -0.061, 1.202, 2.465, 4.621 max_d=4.621 avg_d=1.202 std_dev=1.263
C5	B	0, -0.249, 1.030, 2.310, 5.183 max_d=5.183 avg_d=1.030 std_dev=1.279
C2	B	0, -0.360, 0.963, 2.287, 5.338 max_d=5.338 avg_d=0.963 std_dev=1.323
N7	B	0, -0.215, 1.122, 2.458, 5.421 max_d=5.421 avg_d=1.122 std_dev=1.336
N2	B	0, -0.443, 1.077, 2.597, 6.131 max_d=6.131 avg_d=1.077 std_dev=1.520
N1	B	0, -0.422, 1.175, 2.772, 6.451 max_d=6.451 avg_d=1.175 std_dev=1.597
C6	B	0, -0.373, 1.233, 2.838, 6.494 max_d=6.494 avg_d=1.233 std_dev=1.605
P	B	0, -0.092, 1.605, 3.302, 6.099 max_d=6.099 avg_d=1.605 std_dev=1.697
OP1	B	0, -0.180, 1.729, 3.638, 7.109 max_d=7.109 avg_d=1.729 std_dev=1.909
OP2	B	0, -0.125, 1.801, 3.727, 6.877 max_d=6.877 avg_d=1.801 std_dev=1.926
O6	B	0, -0.452, 1.489, 3.429, 7.850 max_d=7.850 avg_d=1.489 std_dev=1.940

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.19	0.30	0.15
C2	0.02	0.00	0.11	0.19	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.22	0.02	0.12	0.15	0.55	0.26
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.03	0.07	0.07	0.09	0.11	0.07	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.15	0.19	0.30	0.11
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.13	0.01	0.12	0.03	0.15	0.06	0.18	0.17	0.14	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.21	0.17	0.27	0.13
C4	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.11	0.14	0.52	0.26
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.12	0.08	0.12	0.09	0.13	0.10	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.29	0.12	0.13
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.13	0.20	0.61	0.32
C5'	0.04	0.20	0.03	0.03	0.18	0.01	0.22	0.00	0.25	0.17	0.24	0.17	0.26	0.22	0.13	0.04	0.03	0.01	0.01	0.13	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.12	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.03	0.13	0.22	0.65	0.34
C8	0.01	0.02	0.07	0.06	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.05	0.13	0.18	0.54	0.29
N1	0.02	0.00	0.09	0.18	0.01	0.12	0.01	0.24	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.22	0.03	0.13	0.19	0.61	0.31
N3	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.19	0.02	0.11	0.14	0.49	0.23
N6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.13	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.18	0.04	0.14	0.29	0.70	0.38
N7	0.01	0.02	0.07	0.07	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.05	0.14	0.25	0.63	0.35
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.03	0.10	0.12	0.46	0.22
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.07	0.04	0.08	0.04	0.09	0.05	0.10	0.09	0.10	0.06	0.04	0.00	0.07	0.06	0.05	0.37	0.18	0.16
O3'	0.03	0.22	0.03	0.01	0.14	0.02	0.14	0.03	0.18	0.07	0.22	0.19	0.18	0.10	0.06	0.07	0.00	0.02	0.22	0.28	0.23	0.14
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.08	0.27	0.23	0.19
O5'	0.06	0.12	0.15	0.21	0.11	0.01	0.13	0.01	0.13	0.13	0.13	0.11	0.14	0.14	0.10	0.05	0.22	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.19	0.15	0.19	0.17	0.14	0.29	0.20	0.13	0.22	0.18	0.19	0.14	0.29	0.25	0.12	0.37	0.28	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.55	0.30	0.27	0.52	0.12	0.61	0.07	0.65	0.54	0.61	0.49	0.70	0.63	0.46	0.18	0.23	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.26	0.11	0.13	0.26	0.13	0.32	0.02	0.34	0.29	0.31	0.23	0.38	0.35	0.22	0.16	0.14	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.99	0.24	0.29	0.71	0.20	0.82	0.26	0.99	0.53	1.06	1.05	0.78	0.71	0.49	0.14	0.32	0.17	0.41	1.04	0.51	0.58	0.44
C2	0.44	1.26	0.34	0.45	1.04	0.35	1.38	0.51	1.67	1.03	1.63	1.21	0.92	1.33	0.82	0.13	0.35	0.41	0.83	1.90	0.93	1.21	0.95
C2'	0.23	0.99	0.22	0.22	0.70	0.13	0.84	0.21	1.02	0.53	1.09	1.07	0.77	0.73	0.48	0.16	0.23	0.13	0.40	1.10	0.54	0.64	0.47
C3'	0.26	0.78	0.24	0.18	0.57	0.10	0.67	0.14	0.80	0.44	0.85	0.83	0.63	0.58	0.41	0.28	0.16	0.15	0.34	0.85	0.47	0.55	0.40
C4	0.40	1.11	0.33	0.44	0.94	0.33	1.19	0.47	1.39	0.90	1.35	1.04	0.85	1.14	0.74	0.13	0.35	0.37	0.75	1.51	0.85	1.06	0.85
C4'	0.21	0.65	0.18	0.10	0.44	0.12	0.47	0.15	0.58	0.27	0.66	0.74	0.54	0.37	0.29	0.29	0.19	0.13	0.20	0.60	0.33	0.33	0.23
C5	0.45	0.92	0.34	0.51	0.92	0.45	1.23	0.64	1.39	1.02	1.24	0.78	0.71	1.26	0.78	0.15	0.39	0.48	0.94	1.54	1.06	1.30	1.07
C5'	0.29	0.38	0.27	0.17	0.29	0.25	0.28	0.23	0.32	0.23	0.37	0.42	0.34	0.25	0.25	0.43	0.18	0.26	0.21	0.33	0.29	0.27	0.22
C6	0.48	0.96	0.35	0.54	0.96	0.50	1.36	0.71	1.57	1.13	1.37	0.81	0.72	1.42	0.84	0.16	0.40	0.53	1.04	1.82	1.19	1.48	1.21
C8	0.35	0.67	0.30	0.47	0.69	0.38	0.87	0.52	0.92	0.74	0.83	0.57	0.56	0.88	0.60	0.15	0.38	0.37	0.76	0.99	0.85	0.98	0.84
N1	0.47	1.12	0.35	0.50	1.03	0.44	1.42	0.64	1.70	1.12	1.55	1.00	0.83	1.43	0.85	0.15	0.37	0.49	0.97	1.97	1.11	1.41	1.13
N3	0.40	1.27	0.32	0.40	1.00	0.29	1.27	0.42	1.53	0.92	1.54	1.27	0.94	1.19	0.75	0.12	0.33	0.34	0.71	1.69	0.80	1.03	0.80
N6	0.50	0.79	0.36	0.58	0.91	0.59	1.35	0.85	1.53	1.21	1.23	0.67	0.59	1.50	0.85	0.18	0.43	0.61	1.19	1.84	1.38	1.70	1.41
N7	0.42	0.65	0.33	0.55	0.76	0.50	1.03	0.70	1.08	0.94	0.90	0.53	0.52	1.11	0.71	0.17	0.42	0.49	0.98	1.18	1.10	1.28	1.10
N9	0.34	0.96	0.30	0.39	0.81	0.28	0.98	0.39	1.11	0.73	1.11	0.91	0.77	0.92	0.62	0.12	0.34	0.29	0.63	1.19	0.71	0.86	0.69
O2'	0.18	1.05	0.18	0.24	0.66	0.30	0.78	0.37	1.01	0.42	1.13	1.21	0.79	0.62	0.39	0.18	0.35	0.19	0.37	1.08	0.56	0.52	0.42
O3'	0.24	0.77	0.23	0.13	0.53	0.13	0.61	0.14	0.76	0.37	0.83	0.85	0.60	0.51	0.36	0.31	0.12	0.15	0.24	0.82	0.40	0.47	0.32
O4'	0.21	0.78	0.19	0.23	0.54	0.18	0.58	0.22	0.70	0.35	0.79	0.85	0.65	0.47	0.36	0.18	0.33	0.13	0.28	0.72	0.38	0.37	0.29
O5'	0.28	0.23	0.31	0.12	0.24	0.09	0.27	0.07	0.28	0.30	0.26	0.24	0.21	0.30	0.27	0.42	0.02	0.18	0.22	0.31	0.44	0.40	0.32
OP1	0.06	0.21	0.09	0.08	0.14	0.17	0.17	0.33	0.20	0.13	0.21	0.24	0.18	0.16	0.10	0.18	0.01	0.14	0.42	0.22	0.58	0.53	0.50
OP2	0.17	0.42	0.21	0.07	0.30	0.11	0.29	0.26	0.35	0.18	0.40	0.47	0.38	0.23	0.20	0.25	0.02	0.11	0.39	0.35	0.68	0.58	0.54
P	0.08	0.22	0.14	0.02	0.13	0.06	0.14	0.17	0.19	0.12	0.22	0.27	0.18	0.14	0.08	0.21	0.01	0.04	0.28	0.20	0.48	0.41	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.18	0.11
C2	0.03	0.00	0.16	0.19	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.24	0.03	0.21	0.01	0.24	0.34	0.25
C2'	0.00	0.16	0.00	0.02	0.08	0.01	0.07	0.04	0.09	0.07	0.13	0.19	0.16	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.08	0.15	0.15	0.10
C3'	0.01	0.19	0.02	0.00	0.11	0.01	0.09	0.03	0.12	0.09	0.16	0.22	0.18	0.09	0.05	0.03	0.01	0.03	0.07	0.12	0.16	0.10	0.09
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.13	0.02	0.20	0.02	0.23	0.32	0.24
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.08	0.12	0.09	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.06	0.08	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.11	0.03	0.26	0.02	0.32	0.41	0.33
C5'	0.03	0.12	0.04	0.03	0.12	0.00	0.18	0.00	0.18	0.20	0.15	0.12	0.10	0.22	0.12	0.05	0.03	0.01	0.01	0.22	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.12	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.16	0.04	0.29	0.01	0.36	0.46	0.37
C8	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.10	0.01	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.05	0.25	0.04	0.28	0.34	0.30
N1	0.03	0.00	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.21	0.03	0.26	0.01	0.31	0.42	0.32
N2	0.04	0.00	0.19	0.22	0.01	0.12	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.30	0.03	0.20	0.01	0.23	0.33	0.23
N3	0.04	0.00	0.16	0.18	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.21	0.03	0.18	0.02	0.20	0.29	0.20
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.09	0.00	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.04	0.29	0.04	0.36	0.44	0.38
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.17	0.03	0.18	0.26	0.20
O2'	0.01	0.19	0.00	0.03	0.10	0.05	0.09	0.05	0.12	0.05	0.17	0.22	0.17	0.06	0.04	0.00	0.07	0.06	0.06	0.12	0.10	0.12	0.07
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.13	0.02	0.11	0.03	0.16	0.10	0.21	0.30	0.21	0.10	0.04	0.07	0.00	0.02	0.07	0.15	0.21	0.12	0.10
O4'	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.07	0.06	0.08	0.23	0.15
O5'	0.06	0.21	0.10	0.07	0.20	0.01	0.26	0.01	0.29	0.25	0.26	0.20	0.18	0.29	0.17	0.06	0.07	0.07	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.02	0.09	0.02	0.22	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.12	0.15	0.06	0.33	0.00	0.42	0.52	0.43
OP1	0.07	0.24	0.15	0.16	0.23	0.06	0.32	0.06	0.36	0.28	0.31	0.23	0.20	0.36	0.18	0.10	0.21	0.08	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.34	0.15	0.10	0.32	0.08	0.41	0.02	0.46	0.34	0.42	0.33	0.29	0.44	0.26	0.12	0.12	0.23	0.01	0.52	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.25	0.10	0.09	0.24	0.04	0.33	0.01	0.37	0.30	0.32	0.23	0.20	0.38	0.20	0.07	0.10	0.15	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00