Doublet Group distance statistics: 52336

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 1, 6, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.015, 0.025, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.019, 0.031, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.031 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.018, 0.032, 0.046, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.032 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.023, 0.040, 0.057, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.040 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.039, 0.065, 0.091, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.065 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.045, 0.077, 0.108, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.077 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.054, 0.087, 0.119, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.087 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.088, 0.139, 0.190, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.139 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.124, 0.196, 0.268, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.196 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.095, 0.183, 0.271, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.183 std_dev=0.088
C4'	A	0, 0.207, 0.345, 0.483, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.345 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.196, 0.342, 0.488, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.342 std_dev=0.146
O2'	B	0, 0.231, 0.390, 0.548, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.390 std_dev=0.158
O2'	A	0, 0.193, 0.357, 0.521, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.357 std_dev=0.164
C1'	B	0, 0.142, 0.320, 0.499, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.320 std_dev=0.179
C2'	B	0, 0.224, 0.416, 0.607, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.416 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.214, 0.413, 0.611, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.413 std_dev=0.199
O5'	A	0, 0.316, 0.523, 0.729, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.523 std_dev=0.207
C5'	A	0, 0.286, 0.499, 0.713, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.499 std_dev=0.213
N9	B	0, 0.188, 0.402, 0.615, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.402 std_dev=0.214
N3	B	0, 0.115, 0.335, 0.555, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.335 std_dev=0.220
C2	B	0, 0.154, 0.388, 0.621, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.388 std_dev=0.234
C4	B	0, 0.107, 0.345, 0.582, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.345 std_dev=0.237
N2	B	0, 0.293, 0.536, 0.778, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.536 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.253, 0.502, 0.750, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.502 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.204, 0.461, 0.718, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.461 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.140, 0.423, 0.706, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.423 std_dev=0.283
N1	B	0, 0.081, 0.364, 0.647, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.364 std_dev=0.283
C8	B	0, 0.303, 0.589, 0.876, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.589 std_dev=0.287
O6	B	0, 0.211, 0.514, 0.818, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.514 std_dev=0.304
C3'	B	0, 0.328, 0.633, 0.938, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.633 std_dev=0.305
N7	B	0, 0.322, 0.628, 0.934, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.628 std_dev=0.306
O5'	B	0, 0.453, 0.767, 1.081, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.767 std_dev=0.314
C4'	B	0, 0.283, 0.597, 0.911, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.597 std_dev=0.314
P	A	0, 0.377, 0.695, 1.012, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.695 std_dev=0.318
O3'	B	0, 0.486, 0.826, 1.166, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.826 std_dev=0.340
OP2	A	0, 0.496, 0.896, 1.296, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.896 std_dev=0.400
C5'	B	0, 0.449, 0.913, 1.376, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.913 std_dev=0.464
OP1	A	0, 0.480, 0.950, 1.419, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.950 std_dev=0.469
P	B	0, 0.545, 1.069, 1.593, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.069 std_dev=0.524
OP1	B	0, 0.854, 1.424, 1.994, 2.089 max_d=2.089 avg_d=1.424 std_dev=0.570
OP2	B	0, 0.736, 1.356, 1.976, 2.176 max_d=2.176 avg_d=1.356 std_dev=0.620

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.18	0.17	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.12	0.09	0.05	0.07	0.20	0.20	0.08
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.07	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.14	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.10	0.06	0.04	0.07	0.17	0.14	0.08
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.03	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.13	0.16	0.06
C5	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.11	0.07	0.04	0.10	0.18	0.10	0.12
C5'	0.03	0.07	0.03	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.10	0.08	0.06	0.12	0.11	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01
C6	0.03	0.03	0.06	0.05	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.12	0.08	0.05	0.12	0.20	0.11	0.13
C8	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.05	0.04	0.11	0.16	0.08	0.12
N1	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.09	0.05	0.09	0.19	0.15	0.10
N3	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.10	0.08	0.05	0.06	0.20	0.20	0.07
N6	0.04	0.03	0.07	0.06	0.03	0.07	0.03	0.12	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.04	0.04	0.13	0.08	0.07	0.15	0.24	0.11	0.18
N7	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.09	0.05	0.04	0.12	0.19	0.08	0.14
N9	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.06	0.16	0.12	0.07
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.10	0.01	0.11	0.03	0.12	0.07	0.13	0.10	0.13	0.09	0.06	0.00	0.04	0.02	0.03	0.14	0.16	0.04
O3'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.05	0.09	0.08	0.08	0.05	0.05	0.04	0.00	0.03	0.05	0.18	0.26	0.12
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.07	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.18	0.17	0.09
O5'	0.04	0.07	0.04	0.01	0.07	0.02	0.10	0.01	0.12	0.11	0.09	0.06	0.15	0.12	0.06	0.03	0.05	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.18	0.20	0.12	0.11	0.17	0.13	0.18	0.04	0.20	0.16	0.19	0.20	0.24	0.19	0.16	0.14	0.18	0.18	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.20	0.14	0.16	0.14	0.16	0.10	0.10	0.11	0.08	0.15	0.20	0.11	0.08	0.12	0.16	0.26	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.04	0.06	0.08	0.06	0.12	0.01	0.13	0.12	0.10	0.07	0.18	0.14	0.07	0.04	0.12	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.03	0.12	0.15	0.05	0.10	0.05	0.10	0.04	0.08	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.11	0.25	0.09	0.10	0.04	0.15	0.13	0.10
C2	0.11	0.07	0.09	0.09	0.09	0.11	0.10	0.16	0.08	0.12	0.07	0.08	0.07	0.12	0.11	0.11	0.15	0.13	0.16	0.08	0.21	0.19	0.18
C2'	0.10	0.04	0.13	0.14	0.07	0.12	0.07	0.13	0.06	0.10	0.04	0.05	0.06	0.09	0.09	0.13	0.22	0.12	0.12	0.06	0.14	0.14	0.11
C3'	0.09	0.05	0.14	0.16	0.07	0.10	0.07	0.10	0.06	0.09	0.05	0.05	0.06	0.08	0.08	0.12	0.24	0.10	0.10	0.06	0.15	0.13	0.10
C4	0.08	0.05	0.09	0.10	0.06	0.09	0.07	0.12	0.06	0.09	0.05	0.07	0.05	0.09	0.08	0.10	0.18	0.10	0.12	0.06	0.17	0.14	0.13
C4'	0.10	0.06	0.16	0.20	0.08	0.11	0.09	0.11	0.08	0.11	0.07	0.06	0.06	0.11	0.10	0.11	0.28	0.10	0.13	0.09	0.19	0.15	0.13
C5	0.10	0.08	0.10	0.09	0.09	0.10	0.09	0.14	0.08	0.11	0.08	0.09	0.08	0.11	0.10	0.11	0.13	0.11	0.14	0.08	0.19	0.16	0.15
C5'	0.14	0.10	0.19	0.23	0.12	0.16	0.14	0.17	0.13	0.16	0.11	0.09	0.10	0.16	0.14	0.13	0.28	0.14	0.18	0.13	0.22	0.19	0.18
C6	0.12	0.10	0.11	0.10	0.11	0.13	0.12	0.17	0.11	0.14	0.10	0.10	0.10	0.14	0.13	0.13	0.11	0.14	0.19	0.11	0.23	0.20	0.20
C8	0.07	0.06	0.09	0.11	0.06	0.09	0.06	0.10	0.06	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.07	0.09	0.17	0.09	0.10	0.06	0.15	0.13	0.11
N1	0.13	0.09	0.11	0.10	0.11	0.13	0.12	0.18	0.11	0.14	0.10	0.10	0.09	0.14	0.13	0.12	0.13	0.15	0.19	0.11	0.24	0.21	0.21
N3	0.09	0.05	0.09	0.10	0.07	0.10	0.07	0.13	0.06	0.10	0.05	0.06	0.06	0.09	0.08	0.10	0.18	0.11	0.13	0.06	0.18	0.15	0.14
N6	0.16	0.13	0.15	0.15	0.15	0.17	0.16	0.22	0.15	0.18	0.14	0.13	0.13	0.18	0.17	0.15	0.13	0.18	0.24	0.15	0.29	0.26	0.25
N7	0.09	0.08	0.09	0.09	0.08	0.10	0.09	0.12	0.08	0.11	0.08	0.10	0.08	0.10	0.09	0.11	0.12	0.11	0.13	0.08	0.17	0.15	0.13
N9	0.06	0.04	0.10	0.12	0.04	0.09	0.05	0.10	0.04	0.08	0.04	0.06	0.03	0.07	0.06	0.09	0.21	0.08	0.10	0.04	0.15	0.12	0.10
O2'	0.14	0.09	0.13	0.13	0.12	0.16	0.12	0.18	0.10	0.14	0.09	0.08	0.10	0.13	0.13	0.14	0.19	0.17	0.16	0.10	0.17	0.18	0.16
O3'	0.10	0.06	0.14	0.16	0.08	0.11	0.08	0.11	0.06	0.10	0.06	0.06	0.07	0.09	0.09	0.13	0.25	0.12	0.11	0.06	0.15	0.14	0.11
O4'	0.12	0.08	0.16	0.20	0.10	0.13	0.11	0.12	0.10	0.13	0.09	0.08	0.08	0.13	0.12	0.12	0.30	0.13	0.13	0.10	0.19	0.17	0.14
O5'	0.13	0.12	0.15	0.19	0.13	0.12	0.15	0.13	0.14	0.17	0.13	0.12	0.12	0.17	0.15	0.13	0.22	0.13	0.14	0.15	0.22	0.21	0.17
OP1	0.23	0.21	0.25	0.28	0.25	0.23	0.29	0.25	0.28	0.31	0.24	0.18	0.21	0.32	0.26	0.21	0.27	0.23	0.27	0.31	0.32	0.30	0.29
OP2	0.13	0.22	0.14	0.15	0.19	0.10	0.22	0.12	0.24	0.18	0.24	0.23	0.20	0.21	0.17	0.10	0.16	0.11	0.16	0.25	0.20	0.22	0.16
P	0.10	0.10	0.10	0.12	0.10	0.08	0.11	0.08	0.12	0.12	0.11	0.11	0.10	0.12	0.10	0.12	0.12	0.09	0.08	0.13	0.16	0.12	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.02	0.09	0.08	0.06
C2	0.03	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.04	0.13	0.01	0.14	0.15	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.08	0.10	0.04
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.08	0.12	0.06
C4	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.13	0.01	0.14	0.14	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.06	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.15	0.01	0.16	0.16	0.14
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.07	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.03	0.15	0.01	0.16	0.17	0.15
C8	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.15	0.02	0.15	0.14	0.13
N1	0.04	0.00	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.04	0.15	0.01	0.16	0.17	0.14
N2	0.04	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.10	0.05	0.05	0.13	0.02	0.15	0.15	0.12
N3	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.03	0.12	0.01	0.13	0.13	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.16	0.02	0.17	0.17	0.15
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.13	0.02	0.13	0.12	0.10
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.07	0.10	0.07	0.04	0.03	0.00	0.02	0.03	0.05	0.05	0.07	0.10	0.05
O3'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.06	0.07	0.04	0.05	0.03	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.07	0.11	0.18	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.03	0.08	0.08	0.05
O5'	0.07	0.13	0.04	0.06	0.13	0.02	0.15	0.01	0.15	0.15	0.15	0.13	0.12	0.16	0.13	0.05	0.12	0.06	0.00	0.15	0.03	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.07	0.03	0.15	0.00	0.17	0.18	0.15
OP1	0.09	0.14	0.08	0.08	0.14	0.08	0.16	0.10	0.16	0.15	0.16	0.15	0.13	0.17	0.13	0.07	0.11	0.08	0.03	0.17	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.15	0.10	0.12	0.14	0.06	0.16	0.03	0.17	0.14	0.17	0.15	0.13	0.17	0.12	0.10	0.18	0.08	0.03	0.18	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.04	0.06	0.12	0.02	0.14	0.02	0.15	0.13	0.14	0.12	0.11	0.15	0.10	0.05	0.11	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00