Doublet Group distance statistics: 52338

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 2, 0, 1, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C6	A	0, -0.002, 0.011, 0.025, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.011 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.001, 0.017, 0.032, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.003, 0.030, 0.057, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.030 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.008, 0.035, 0.062, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.035 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.038, 0.128, 0.218, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.128 std_dev=0.090
C2'	A	0, 0.044, 0.137, 0.230, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.137 std_dev=0.093
O2'	A	0, 0.054, 0.157, 0.260, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.157 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.095, 0.243, 0.391, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.243 std_dev=0.148
C3'	A	0, 0.091, 0.241, 0.391, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.241 std_dev=0.150
O5'	A	0, 0.171, 0.343, 0.515, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.343 std_dev=0.172
O3'	B	0, 0.185, 0.376, 0.568, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.376 std_dev=0.192
P	A	0, 0.186, 0.380, 0.574, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.380 std_dev=0.194
OP1	A	0, 0.192, 0.416, 0.639, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.416 std_dev=0.223
C5'	A	0, 0.157, 0.382, 0.608, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.382 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.195, 0.431, 0.668, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.431 std_dev=0.236
O3'	A	0, 0.107, 0.348, 0.588, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.348 std_dev=0.241
C3'	B	0, 0.194, 0.461, 0.728, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.461 std_dev=0.267
OP2	A	0, 0.212, 0.502, 0.791, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.502 std_dev=0.290
O2'	B	0, 0.196, 0.505, 0.813, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.505 std_dev=0.309
N3	B	0, 0.266, 0.625, 0.983, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.625 std_dev=0.359
C4	B	0, 0.230, 0.599, 0.969, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.599 std_dev=0.369
C2	B	0, 0.249, 0.659, 1.070, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.659 std_dev=0.410
C1'	B	0, 0.212, 0.627, 1.043, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.627 std_dev=0.416
N1	B	0, 0.266, 0.686, 1.105, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.686 std_dev=0.419
N9	B	0, 0.191, 0.615, 1.039, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.615 std_dev=0.424
C6	B	0, 0.297, 0.731, 1.164, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.731 std_dev=0.434
C5	B	0, 0.236, 0.675, 1.114, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.675 std_dev=0.439
C4'	B	0, 0.226, 0.673, 1.120, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.673 std_dev=0.447
N2	B	0, 0.318, 0.786, 1.254, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.786 std_dev=0.468
C8	B	0, 0.210, 0.733, 1.256, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.733 std_dev=0.523
O6	B	0, 0.318, 0.852, 1.386, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.852 std_dev=0.534
O4'	B	0, 0.205, 0.769, 1.333, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.769 std_dev=0.564
N7	B	0, 0.205, 0.769, 1.333, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.769 std_dev=0.564
C5'	B	0, 0.283, 0.890, 1.497, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.890 std_dev=0.607
O5'	B	0, 0.218, 0.961, 1.703, 2.659 max_d=2.659 avg_d=0.961 std_dev=0.743
P	B	0, 0.253, 1.231, 2.209, 3.382 max_d=3.382 avg_d=1.231 std_dev=0.978
OP2	B	0, 0.273, 1.291, 2.308, 3.613 max_d=3.613 avg_d=1.291 std_dev=1.018
OP1	B	0, 0.279, 1.316, 2.353, 3.445 max_d=3.445 avg_d=1.316 std_dev=1.037

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.16	0.06	0.06
C2	0.03	0.00	0.13	0.14	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.11	0.19	0.10	0.09
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.09	0.06	0.12	0.12	0.09	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.05	0.04
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.01	0.12	0.08	0.14	0.12	0.13	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.11	0.09	0.07
C4	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.11	0.02	0.10	0.19	0.09	0.09
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.07	0.03	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.05	0.02
C5	0.03	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.12	0.03	0.12	0.19	0.10	0.10
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.06	0.10	0.09	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.09	0.06	0.01
C6	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.15	0.03	0.12	0.18	0.11	0.10
C8	0.02	0.02	0.06	0.08	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.10	0.04	0.11	0.18	0.09	0.09
N1	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.03	0.12	0.19	0.11	0.10
N3	0.03	0.00	0.12	0.12	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.09	0.19	0.09	0.09
N6	0.04	0.01	0.09	0.13	0.02	0.07	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.16	0.05	0.14	0.18	0.13	0.11
N7	0.04	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.05	0.11	0.04	0.13	0.18	0.11	0.11
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.18	0.08	0.08
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.07	0.05	0.10	0.10	0.07	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.11	0.07	0.03
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.11	0.03	0.12	0.03	0.15	0.10	0.18	0.15	0.16	0.11	0.05	0.04	0.00	0.03	0.12	0.12	0.16	0.13
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.16	0.11	0.09
O5'	0.05	0.11	0.04	0.07	0.10	0.02	0.12	0.01	0.12	0.11	0.12	0.09	0.14	0.13	0.08	0.04	0.12	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.19	0.13	0.11	0.19	0.10	0.19	0.09	0.18	0.18	0.19	0.19	0.18	0.18	0.18	0.11	0.12	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.10	0.05	0.09	0.09	0.05	0.10	0.06	0.11	0.09	0.11	0.09	0.13	0.11	0.08	0.07	0.16	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.04	0.07	0.09	0.02	0.10	0.01	0.10	0.09	0.10	0.09	0.11	0.11	0.08	0.03	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.30	0.23	0.08	0.17	0.14	0.17	0.11	0.24	0.19	0.27	0.41	0.28	0.21	0.17	0.40	0.04	0.22	0.16	0.32	0.29	0.25	0.17
C2	0.43	0.37	0.27	0.19	0.32	0.35	0.28	0.30	0.32	0.29	0.35	0.43	0.38	0.26	0.34	0.40	0.10	0.46	0.24	0.35	0.27	0.14	0.20
C2'	0.27	0.32	0.21	0.12	0.20	0.13	0.24	0.18	0.31	0.25	0.30	0.44	0.30	0.29	0.21	0.36	0.09	0.21	0.22	0.40	0.32	0.30	0.23
C3'	0.24	0.30	0.21	0.13	0.15	0.13	0.17	0.24	0.21	0.25	0.23	0.44	0.29	0.27	0.18	0.34	0.10	0.19	0.24	0.30	0.36	0.33	0.27
C4	0.36	0.32	0.25	0.15	0.24	0.28	0.21	0.22	0.26	0.21	0.29	0.38	0.32	0.19	0.26	0.42	0.08	0.37	0.18	0.30	0.24	0.12	0.13
C4'	0.24	0.32	0.24	0.10	0.18	0.12	0.17	0.23	0.21	0.26	0.25	0.44	0.30	0.26	0.19	0.37	0.04	0.17	0.23	0.27	0.37	0.37	0.28
C5	0.37	0.29	0.24	0.17	0.25	0.34	0.22	0.30	0.25	0.24	0.28	0.34	0.29	0.20	0.28	0.38	0.10	0.42	0.23	0.28	0.28	0.15	0.20
C5'	0.24	0.37	0.25	0.12	0.26	0.14	0.26	0.27	0.29	0.31	0.33	0.45	0.34	0.32	0.24	0.34	0.04	0.16	0.27	0.31	0.40	0.40	0.32
C6	0.42	0.32	0.25	0.20	0.30	0.40	0.27	0.37	0.29	0.30	0.32	0.35	0.32	0.26	0.33	0.33	0.12	0.49	0.30	0.30	0.33	0.22	0.29
C8	0.27	0.27	0.21	0.11	0.17	0.21	0.16	0.15	0.23	0.14	0.26	0.32	0.24	0.14	0.17	0.38	0.07	0.26	0.14	0.27	0.22	0.15	0.10
N1	0.44	0.36	0.26	0.21	0.33	0.40	0.30	0.37	0.32	0.32	0.35	0.40	0.37	0.28	0.36	0.36	0.11	0.50	0.30	0.34	0.32	0.20	0.28
N3	0.39	0.36	0.26	0.15	0.28	0.30	0.24	0.23	0.29	0.24	0.33	0.43	0.36	0.22	0.29	0.42	0.08	0.40	0.19	0.34	0.23	0.12	0.13
N6	0.41	0.32	0.23	0.22	0.31	0.43	0.29	0.44	0.30	0.34	0.32	0.35	0.31	0.30	0.35	0.26	0.13	0.52	0.36	0.31	0.40	0.30	0.37
N7	0.31	0.26	0.21	0.16	0.20	0.31	0.18	0.27	0.22	0.19	0.26	0.30	0.24	0.16	0.22	0.35	0.10	0.35	0.21	0.24	0.27	0.15	0.18
N9	0.30	0.29	0.23	0.10	0.19	0.21	0.17	0.14	0.24	0.16	0.27	0.37	0.28	0.16	0.20	0.41	0.06	0.28	0.14	0.29	0.23	0.16	0.10
O2'	0.26	0.34	0.22	0.13	0.20	0.14	0.27	0.22	0.34	0.28	0.32	0.49	0.31	0.34	0.21	0.36	0.07	0.21	0.23	0.45	0.35	0.35	0.26
O3'	0.24	0.35	0.21	0.19	0.14	0.20	0.17	0.36	0.19	0.30	0.22	0.54	0.32	0.32	0.19	0.30	0.16	0.21	0.32	0.31	0.44	0.42	0.36
O4'	0.26	0.28	0.25	0.11	0.16	0.13	0.15	0.15	0.19	0.22	0.22	0.39	0.27	0.22	0.18	0.40	0.07	0.20	0.19	0.26	0.34	0.33	0.24
O5'	0.19	0.31	0.22	0.07	0.21	0.07	0.22	0.15	0.26	0.22	0.29	0.36	0.28	0.23	0.18	0.31	0.02	0.11	0.23	0.28	0.34	0.28	0.25
OP1	0.06	0.23	0.10	0.02	0.15	0.09	0.18	0.17	0.22	0.16	0.24	0.27	0.18	0.18	0.10	0.16	0.01	0.05	0.26	0.24	0.33	0.32	0.27
OP2	0.08	0.32	0.12	0.05	0.23	0.19	0.25	0.33	0.29	0.18	0.32	0.36	0.27	0.23	0.14	0.14	0.02	0.12	0.33	0.31	0.47	0.37	0.37
P	0.07	0.25	0.11	0.02	0.17	0.09	0.19	0.18	0.22	0.16	0.25	0.28	0.21	0.19	0.10	0.16	0.01	0.04	0.24	0.24	0.34	0.28	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.03	0.17	0.06	0.09
C2	0.02	0.00	0.13	0.13	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.06	0.26	0.02	0.23	0.16	0.18
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.09	0.01	0.08	0.05	0.11	0.06	0.12	0.14	0.12	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.15	0.11	0.21	0.06	0.10
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.13	0.11	0.14	0.14	0.12	0.11	0.07	0.03	0.01	0.01	0.17	0.14	0.24	0.09	0.12
C4	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.05	0.01	0.15	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.03	0.27	0.02	0.23	0.15	0.19
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.04	0.04	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.08	0.12	0.18	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.02	0.32	0.02	0.26	0.20	0.23
C5'	0.06	0.13	0.05	0.04	0.15	0.01	0.19	0.00	0.20	0.20	0.17	0.12	0.12	0.21	0.14	0.04	0.04	0.02	0.02	0.22	0.20	0.29	0.04
C6	0.02	0.01	0.11	0.13	0.02	0.07	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.12	0.17	0.03	0.32	0.01	0.27	0.23	0.24
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.34	0.03	0.26	0.16	0.23
N1	0.02	0.01	0.12	0.14	0.02	0.06	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.15	0.18	0.05	0.29	0.01	0.25	0.20	0.22
N2	0.02	0.01	0.14	0.14	0.01	0.04	0.01	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.20	0.06	0.24	0.03	0.21	0.15	0.17
N3	0.02	0.01	0.12	0.12	0.00	0.04	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.14	0.05	0.24	0.02	0.21	0.13	0.16
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.14	0.02	0.36	0.02	0.29	0.23	0.27
N9	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.26	0.02	0.22	0.11	0.16
O2'	0.02	0.16	0.01	0.03	0.09	0.04	0.09	0.04	0.12	0.04	0.15	0.18	0.14	0.06	0.03	0.00	0.06	0.05	0.04	0.13	0.13	0.09	0.03
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.04	0.17	0.13	0.18	0.20	0.14	0.14	0.07	0.06	0.00	0.02	0.14	0.18	0.23	0.15	0.11
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.11	0.03	0.14	0.09	0.05
O5'	0.16	0.26	0.15	0.17	0.27	0.03	0.32	0.02	0.32	0.34	0.29	0.24	0.24	0.36	0.26	0.04	0.14	0.11	0.00	0.34	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.11	0.14	0.02	0.08	0.02	0.22	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.13	0.18	0.03	0.34	0.00	0.29	0.27	0.27
OP1	0.17	0.23	0.21	0.24	0.23	0.12	0.26	0.20	0.27	0.26	0.25	0.21	0.21	0.29	0.22	0.13	0.23	0.14	0.02	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.16	0.06	0.09	0.15	0.18	0.20	0.29	0.23	0.16	0.20	0.15	0.13	0.23	0.11	0.09	0.15	0.09	0.02	0.27	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.18	0.10	0.12	0.19	0.04	0.23	0.04	0.24	0.23	0.22	0.17	0.16	0.27	0.16	0.03	0.11	0.05	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00