Doublet Group distance statistics: 52339

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 4, 1, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.007, 0.012, 0.031, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.012 std_dev=0.019
N1	A	0, -0.003, 0.020, 0.042, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.020 std_dev=0.022
N3	A	0, -0.004, 0.020, 0.044, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.020 std_dev=0.024
C5	A	0, -0.004, 0.020, 0.043, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.020 std_dev=0.024
C1'	A	0, -0.007, 0.020, 0.047, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.020 std_dev=0.027
C4	A	0, -0.005, 0.025, 0.056, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.025 std_dev=0.030
N9	A	0, -0.005, 0.030, 0.065, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.030 std_dev=0.035
N6	A	0, -0.006, 0.035, 0.076, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.035 std_dev=0.041
N7	A	0, -0.009, 0.041, 0.090, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.041 std_dev=0.049
C8	A	0, -0.011, 0.048, 0.107, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.048 std_dev=0.059
O4'	A	0, 0.026, 0.088, 0.151, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.088 std_dev=0.062
C2'	A	0, 0.031, 0.124, 0.218, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.124 std_dev=0.094
C4'	A	0, 0.042, 0.180, 0.318, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.180 std_dev=0.138
O5'	A	0, 0.090, 0.235, 0.380, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.235 std_dev=0.145
O2'	A	0, 0.041, 0.194, 0.347, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.194 std_dev=0.153
C3'	A	0, 0.032, 0.189, 0.346, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.189 std_dev=0.157
C5'	A	0, 0.096, 0.256, 0.416, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.256 std_dev=0.160
P	A	0, 0.077, 0.316, 0.554, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.316 std_dev=0.238
C2'	B	0, 0.186, 0.424, 0.663, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.424 std_dev=0.238
O2'	B	0, 0.221, 0.461, 0.701, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.461 std_dev=0.240
C3'	B	0, 0.125, 0.373, 0.621, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.373 std_dev=0.248
O3'	B	0, 0.093, 0.352, 0.612, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.352 std_dev=0.260
C1'	B	0, 0.188, 0.456, 0.724, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.456 std_dev=0.268
N3	B	0, 0.243, 0.517, 0.790, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.517 std_dev=0.273
OP2	A	0, 0.089, 0.374, 0.660, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.374 std_dev=0.286
O3'	A	0, 0.031, 0.318, 0.604, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.318 std_dev=0.286
N2	B	0, 0.274, 0.567, 0.861, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.567 std_dev=0.293
OP1	A	0, 0.067, 0.365, 0.664, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.365 std_dev=0.299
C2	B	0, 0.298, 0.603, 0.907, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.603 std_dev=0.305
C4	B	0, 0.290, 0.613, 0.935, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.613 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.154, 0.480, 0.805, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.480 std_dev=0.325
N9	B	0, 0.249, 0.582, 0.915, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.582 std_dev=0.333
C4'	B	0, 0.102, 0.435, 0.769, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.435 std_dev=0.333
N1	B	0, 0.412, 0.780, 1.147, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.780 std_dev=0.368
O5'	B	0, 0.134, 0.530, 0.927, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.530 std_dev=0.396
C5'	B	0, 0.077, 0.495, 0.913, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.495 std_dev=0.418
C5	B	0, 0.368, 0.794, 1.220, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.794 std_dev=0.426
C6	B	0, 0.442, 0.890, 1.338, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.890 std_dev=0.448
C8	B	0, 0.281, 0.736, 1.191, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.736 std_dev=0.455
P	B	0, 0.042, 0.531, 1.021, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.531 std_dev=0.489
N7	B	0, 0.348, 0.867, 1.386, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.867 std_dev=0.519
O6	B	0, 0.509, 1.061, 1.613, 2.040 max_d=2.040 avg_d=1.061 std_dev=0.552
OP2	B	0, 0.058, 0.642, 1.226, 2.317 max_d=2.317 avg_d=0.642 std_dev=0.584
OP1	B	0, -0.175, 0.797, 1.769, 3.581 max_d=3.581 avg_d=0.797 std_dev=0.972

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.08	0.07
C2	0.05	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.03	0.09	0.08	0.14	0.10
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.09	0.04	0.11	0.09	0.10	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.06	0.02
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.14	0.09	0.13	0.10	0.16	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.09	0.04
C4	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.08	0.08	0.12	0.09
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05	0.07	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.02	0.13	0.12	0.17	0.13
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.11	0.12	0.08	0.03	0.14	0.14	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01
C6	0.03	0.00	0.09	0.14	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.18	0.02	0.15	0.15	0.20	0.15
C8	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.12	0.10	0.14	0.10
N1	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.12	0.12	0.18	0.13
N3	0.05	0.00	0.09	0.10	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.03	0.06	0.06	0.11	0.07
N6	0.02	0.00	0.10	0.16	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.21	0.03	0.18	0.19	0.24	0.19
N7	0.00	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.15	0.14	0.18	0.15
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.06	0.10	0.07
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.11	0.11	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.06	0.05	0.01
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.10	0.01	0.15	0.02	0.18	0.10	0.18	0.12	0.21	0.14	0.06	0.03	0.00	0.01	0.06	0.12	0.17	0.10
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.10	0.10	0.11
O5'	0.03	0.09	0.03	0.04	0.08	0.01	0.13	0.01	0.15	0.12	0.12	0.06	0.18	0.15	0.07	0.02	0.06	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.08	0.04	0.07	0.08	0.05	0.12	0.06	0.15	0.10	0.12	0.06	0.19	0.14	0.06	0.06	0.12	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.14	0.06	0.09	0.12	0.03	0.17	0.03	0.20	0.14	0.18	0.11	0.24	0.18	0.10	0.05	0.17	0.10	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.02	0.04	0.09	0.02	0.13	0.01	0.15	0.10	0.13	0.07	0.19	0.15	0.07	0.01	0.10	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.15	0.15	0.14	0.18	0.27	0.23	0.40	0.21	0.31	0.16	0.19	0.14	0.31	0.22	0.18	0.16	0.28	0.38	0.25	0.41	0.55	0.38
C2	0.20	0.22	0.18	0.16	0.22	0.26	0.26	0.33	0.25	0.30	0.23	0.27	0.20	0.31	0.24	0.21	0.13	0.27	0.34	0.28	0.38	0.41	0.34
C2'	0.16	0.14	0.12	0.14	0.16	0.29	0.21	0.42	0.19	0.29	0.14	0.20	0.12	0.29	0.20	0.14	0.10	0.27	0.38	0.22	0.40	0.61	0.39
C3'	0.14	0.11	0.11	0.14	0.13	0.30	0.18	0.42	0.16	0.25	0.12	0.16	0.10	0.25	0.17	0.10	0.06	0.27	0.35	0.18	0.33	0.63	0.35
C4	0.18	0.18	0.16	0.15	0.18	0.26	0.22	0.35	0.21	0.28	0.18	0.23	0.16	0.28	0.21	0.20	0.12	0.27	0.33	0.23	0.32	0.42	0.32
C4'	0.17	0.08	0.16	0.16	0.16	0.30	0.22	0.44	0.20	0.31	0.12	0.09	0.08	0.30	0.21	0.13	0.11	0.27	0.38	0.23	0.37	0.66	0.39
C5	0.20	0.19	0.17	0.17	0.19	0.28	0.21	0.34	0.20	0.26	0.19	0.23	0.17	0.25	0.21	0.21	0.13	0.28	0.32	0.22	0.25	0.37	0.29
C5'	0.19	0.10	0.17	0.19	0.18	0.31	0.22	0.41	0.20	0.28	0.14	0.07	0.11	0.28	0.22	0.12	0.07	0.28	0.32	0.23	0.30	0.63	0.31
C6	0.22	0.22	0.20	0.19	0.22	0.29	0.24	0.33	0.24	0.27	0.23	0.26	0.20	0.27	0.24	0.22	0.15	0.29	0.32	0.25	0.26	0.35	0.29
C8	0.17	0.16	0.14	0.15	0.16	0.29	0.18	0.35	0.17	0.23	0.15	0.20	0.14	0.23	0.18	0.18	0.11	0.29	0.31	0.18	0.20	0.40	0.26
N1	0.22	0.24	0.20	0.18	0.23	0.27	0.26	0.33	0.26	0.29	0.24	0.28	0.21	0.30	0.25	0.22	0.14	0.28	0.33	0.28	0.32	0.37	0.32
N3	0.19	0.20	0.16	0.14	0.20	0.24	0.24	0.33	0.23	0.29	0.20	0.25	0.18	0.30	0.22	0.20	0.13	0.26	0.34	0.26	0.39	0.43	0.34
N6	0.24	0.24	0.22	0.22	0.24	0.30	0.26	0.33	0.26	0.27	0.25	0.27	0.23	0.27	0.25	0.23	0.18	0.30	0.31	0.27	0.21	0.31	0.27
N7	0.18	0.16	0.17	0.18	0.16	0.30	0.18	0.33	0.17	0.22	0.16	0.20	0.15	0.21	0.19	0.20	0.13	0.29	0.29	0.18	0.18	0.35	0.25
N9	0.17	0.16	0.14	0.13	0.17	0.27	0.21	0.36	0.19	0.27	0.16	0.21	0.15	0.26	0.20	0.18	0.13	0.27	0.33	0.21	0.31	0.45	0.31
O2'	0.19	0.15	0.16	0.15	0.19	0.29	0.26	0.44	0.24	0.35	0.17	0.20	0.14	0.35	0.24	0.14	0.12	0.29	0.43	0.28	0.51	0.69	0.46
O3'	0.14	0.11	0.12	0.15	0.13	0.30	0.18	0.42	0.15	0.26	0.11	0.16	0.10	0.25	0.17	0.08	0.04	0.26	0.36	0.18	0.36	0.70	0.38
O4'	0.18	0.11	0.16	0.15	0.17	0.28	0.23	0.41	0.21	0.32	0.14	0.14	0.11	0.32	0.22	0.18	0.20	0.27	0.38	0.24	0.40	0.58	0.38
O5'	0.10	0.10	0.05	0.10	0.09	0.24	0.10	0.28	0.10	0.13	0.09	0.13	0.10	0.12	0.10	0.10	0.01	0.21	0.17	0.10	0.34	0.45	0.17
OP1	0.04	0.07	0.08	0.03	0.06	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.07	0.08	0.07	0.09	0.06	0.15	0.01	0.05	0.15	0.08	0.75	0.41	0.32
OP2	0.15	0.22	0.20	0.07	0.21	0.03	0.22	0.03	0.23	0.20	0.23	0.22	0.21	0.22	0.19	0.32	0.01	0.05	0.15	0.24	0.65	0.32	0.29
P	0.04	0.09	0.08	0.01	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.06	0.09	0.11	0.09	0.06	0.06	0.17	0.00	0.05	0.08	0.08	0.58	0.33	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.19	0.19	0.12
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.06	0.14	0.01	0.15	0.36	0.20
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.40	0.17	0.14
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.44	0.19	0.15
C4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.03	0.14	0.01	0.17	0.36	0.21
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.17	0.00	0.25	0.45	0.27
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.15	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.17	0.00	0.27	0.47	0.28
C8	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.17	0.00	0.25	0.42	0.27
N1	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.04	0.04	0.16	0.00	0.21	0.43	0.24
N2	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.06	0.08	0.13	0.01	0.13	0.34	0.18
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.05	0.06	0.12	0.01	0.14	0.32	0.18
N7	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.18	0.00	0.31	0.49	0.31
N9	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.13	0.01	0.17	0.32	0.20
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.07	0.11	0.09	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.04	0.50	0.19	0.16
O3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.07	0.02	0.49	0.22	0.17
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.08	0.06	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.08	0.02	0.06	0.12	0.08
O5'	0.08	0.14	0.05	0.07	0.14	0.01	0.17	0.00	0.17	0.17	0.16	0.13	0.12	0.18	0.13	0.06	0.07	0.08	0.00	0.18	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.18	0.00	0.33	0.52	0.31
OP1	0.19	0.15	0.40	0.44	0.17	0.19	0.25	0.06	0.27	0.25	0.21	0.13	0.14	0.31	0.17	0.50	0.49	0.06	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.36	0.17	0.19	0.36	0.12	0.45	0.15	0.47	0.42	0.43	0.34	0.32	0.49	0.32	0.19	0.22	0.12	0.02	0.52	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.20	0.14	0.15	0.21	0.05	0.27	0.01	0.28	0.27	0.24	0.18	0.18	0.31	0.20	0.16	0.17	0.08	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00