Doublet Group distance statistics: 52340

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.003, 0.015, 0.033, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.015 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.026 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.028 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.011, 0.034, 0.057, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.014, 0.043, 0.072, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.043 std_dev=0.029
N6	A	0, -0.003, 0.044, 0.091, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.044 std_dev=0.047
O3'	B	0, 0.107, 0.338, 0.569, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.338 std_dev=0.231
O4'	A	0, -0.019, 0.221, 0.460, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.221 std_dev=0.239
C2'	A	0, -0.046, 0.214, 0.473, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.214 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.155, 0.418, 0.681, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.418 std_dev=0.263
C2'	B	0, 0.124, 0.416, 0.708, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.416 std_dev=0.292
P	A	0, 0.114, 0.440, 0.765, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.440 std_dev=0.326
O5'	A	0, 0.025, 0.440, 0.855, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.440 std_dev=0.415
O2'	B	0, 0.076, 0.500, 0.924, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.500 std_dev=0.424
O2'	A	0, -0.107, 0.317, 0.742, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.317 std_dev=0.425
C1'	B	0, 0.130, 0.559, 0.989, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.559 std_dev=0.430
C4'	A	0, -0.082, 0.359, 0.800, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.359 std_dev=0.441
C4'	B	0, 0.200, 0.651, 1.102, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.651 std_dev=0.451
N9	B	0, 0.189, 0.655, 1.121, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.655 std_dev=0.466
OP1	A	0, 0.129, 0.633, 1.137, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.633 std_dev=0.504
C3'	A	0, -0.137, 0.379, 0.895, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.379 std_dev=0.516
O4'	B	0, 0.182, 0.700, 1.218, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.700 std_dev=0.518
C5'	A	0, 0.027, 0.567, 1.107, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.567 std_dev=0.540
OP2	A	0, 0.075, 0.628, 1.180, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.628 std_dev=0.552
C4	B	0, 0.117, 0.725, 1.332, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.725 std_dev=0.608
O5'	B	0, 0.169, 0.804, 1.440, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.804 std_dev=0.636
C8	B	0, 0.204, 0.860, 1.516, 2.147 max_d=2.147 avg_d=0.860 std_dev=0.656
OP2	B	0, 0.299, 0.955, 1.612, 2.067 max_d=2.067 avg_d=0.955 std_dev=0.657
P	B	0, 0.272, 0.955, 1.638, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.955 std_dev=0.683
C5'	B	0, 0.227, 0.928, 1.630, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.928 std_dev=0.701
C5	B	0, 0.086, 0.808, 1.530, 2.685 max_d=2.685 avg_d=0.808 std_dev=0.722
N7	B	0, 0.181, 0.938, 1.694, 2.593 max_d=2.593 avg_d=0.938 std_dev=0.756
N3	B	0, 0.158, 0.928, 1.699, 2.314 max_d=2.314 avg_d=0.928 std_dev=0.770
OP1	B	0, 0.274, 1.051, 1.828, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.051 std_dev=0.777
O3'	A	0, -0.261, 0.573, 1.407, 3.054 max_d=3.054 avg_d=0.573 std_dev=0.834
C6	B	0, -0.003, 0.940, 1.883, 3.492 max_d=3.492 avg_d=0.940 std_dev=0.943
C2	B	0, 0.139, 1.152, 2.165, 3.128 max_d=3.128 avg_d=1.152 std_dev=1.013
N1	B	0, 0.082, 1.126, 2.171, 3.619 max_d=3.619 avg_d=1.126 std_dev=1.045
O6	B	0, -0.027, 1.059, 2.145, 4.154 max_d=4.154 avg_d=1.059 std_dev=1.086
N2	B	0, 0.133, 1.468, 2.804, 3.896 max_d=3.896 avg_d=1.468 std_dev=1.335

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.23	0.01	0.10	0.12	0.39	0.16
C2	0.05	0.00	0.20	0.16	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.25	0.13	0.16	0.11	0.42	0.16
C2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.11	0.01	0.07	0.13	0.11	0.09	0.16	0.20	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.33	0.28	0.50	0.32
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.18	0.00	0.25	0.02	0.25	0.26	0.21	0.13	0.28	0.29	0.17	0.02	0.01	0.02	0.24	0.19	0.29	0.12
C4	0.02	0.01	0.11	0.18	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.07	0.17	0.11	0.42	0.16
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.07	0.16	0.05	0.06	0.09	0.15	0.07	0.20	0.01	0.00	0.01	0.15	0.32	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.25	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.19	0.05	0.04	0.25	0.18	0.44	0.20
C5'	0.04	0.10	0.13	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.13	0.18	0.11	0.09	0.15	0.19	0.09	0.07	0.16	0.01	0.01	0.21	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.25	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.07	0.06	0.26	0.20	0.45	0.21
C8	0.01	0.01	0.09	0.26	0.01	0.16	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.24	0.14	0.08	0.25	0.18	0.42	0.19
N1	0.04	0.00	0.16	0.21	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.12	0.15	0.11	0.21	0.16	0.44	0.19
N3	0.04	0.01	0.20	0.13	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.27	0.13	0.13	0.08	0.41	0.15
N6	0.01	0.01	0.09	0.28	0.01	0.09	0.02	0.15	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.22	0.09	0.05	0.30	0.26	0.47	0.24
N7	0.01	0.01	0.04	0.29	0.01	0.15	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.25	0.15	0.05	0.30	0.24	0.45	0.23
N9	0.00	0.02	0.02	0.17	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.08	0.01	0.14	0.09	0.40	0.15
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.12	0.20	0.19	0.07	0.18	0.24	0.12	0.08	0.22	0.25	0.14	0.00	0.06	0.15	0.23	0.18	0.53	0.26
O3'	0.23	0.25	0.03	0.01	0.13	0.01	0.05	0.16	0.07	0.14	0.15	0.27	0.09	0.15	0.08	0.06	0.00	0.14	0.32	0.34	0.34	0.25
O4'	0.01	0.13	0.02	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.08	0.11	0.13	0.05	0.05	0.01	0.15	0.14	0.00	0.14	0.18	0.40	0.22
O5'	0.10	0.16	0.33	0.24	0.17	0.01	0.25	0.01	0.26	0.25	0.21	0.13	0.30	0.30	0.14	0.23	0.32	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.12	0.11	0.28	0.19	0.11	0.15	0.18	0.21	0.20	0.18	0.16	0.08	0.26	0.24	0.09	0.18	0.34	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.42	0.50	0.29	0.42	0.32	0.44	0.29	0.45	0.42	0.44	0.41	0.47	0.45	0.40	0.53	0.34	0.40	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.16	0.32	0.12	0.16	0.07	0.20	0.01	0.21	0.19	0.19	0.15	0.24	0.23	0.15	0.26	0.25	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.80	0.22	0.19	0.46	0.15	0.43	0.16	0.59	0.25	0.75	0.97	0.66	0.30	0.26	0.25	0.15	0.18	0.10	0.59	0.26	0.19	0.12
C2	0.38	1.16	0.29	0.24	0.70	0.22	0.74	0.22	0.96	0.49	1.16	1.42	0.92	0.61	0.47	0.37	0.14	0.34	0.13	1.01	0.16	0.31	0.14
C2'	0.25	0.76	0.25	0.27	0.39	0.21	0.40	0.25	0.54	0.42	0.72	0.97	0.59	0.40	0.28	0.26	0.27	0.21	0.35	0.56	0.48	0.38	0.38
C3'	0.13	0.74	0.14	0.10	0.37	0.14	0.36	0.20	0.55	0.18	0.72	0.91	0.57	0.21	0.16	0.23	0.13	0.12	0.30	0.56	0.42	0.13	0.28
C4	0.32	0.99	0.26	0.22	0.59	0.18	0.61	0.20	0.79	0.41	0.96	1.19	0.81	0.49	0.39	0.38	0.13	0.27	0.09	0.81	0.16	0.26	0.10
C4'	0.08	0.55	0.07	0.07	0.27	0.15	0.27	0.21	0.42	0.12	0.54	0.67	0.42	0.14	0.09	0.15	0.07	0.11	0.24	0.43	0.38	0.14	0.24
C5	0.37	1.00	0.29	0.24	0.62	0.22	0.66	0.27	0.83	0.49	0.98	1.18	0.82	0.57	0.44	0.44	0.13	0.32	0.15	0.85	0.13	0.32	0.16
C5'	0.19	0.40	0.17	0.15	0.19	0.26	0.21	0.29	0.32	0.22	0.41	0.49	0.28	0.17	0.14	0.26	0.17	0.24	0.34	0.35	0.44	0.18	0.33
C6	0.43	1.13	0.31	0.26	0.71	0.26	0.77	0.32	0.98	0.57	1.14	1.34	0.90	0.68	0.52	0.46	0.14	0.39	0.19	1.02	0.15	0.38	0.22
C8	0.26	0.75	0.24	0.21	0.45	0.15	0.44	0.23	0.57	0.35	0.71	0.89	0.63	0.38	0.30	0.38	0.12	0.22	0.10	0.58	0.15	0.25	0.10
N1	0.42	1.19	0.30	0.26	0.73	0.25	0.80	0.28	1.02	0.56	1.21	1.45	0.93	0.68	0.52	0.42	0.14	0.38	0.17	1.08	0.15	0.36	0.20
N3	0.33	1.07	0.26	0.22	0.64	0.18	0.65	0.18	0.86	0.41	1.05	1.31	0.86	0.51	0.41	0.35	0.13	0.29	0.09	0.89	0.18	0.25	0.09
N6	0.48	1.13	0.34	0.28	0.73	0.31	0.83	0.40	1.04	0.65	1.18	1.31	0.88	0.76	0.57	0.48	0.13	0.44	0.25	1.11	0.20	0.45	0.29
N7	0.34	0.83	0.28	0.24	0.52	0.22	0.55	0.30	0.68	0.46	0.80	0.96	0.69	0.50	0.39	0.46	0.13	0.30	0.15	0.70	0.13	0.32	0.17
N9	0.26	0.85	0.23	0.20	0.50	0.14	0.49	0.17	0.65	0.32	0.81	1.02	0.71	0.38	0.31	0.33	0.13	0.21	0.07	0.66	0.19	0.22	0.08
O2'	0.21	0.77	0.24	0.23	0.40	0.14	0.43	0.21	0.56	0.47	0.72	1.00	0.61	0.47	0.30	0.20	0.19	0.15	0.31	0.58	0.45	0.39	0.35
O3'	0.14	0.66	0.14	0.16	0.32	0.22	0.34	0.32	0.51	0.24	0.66	0.83	0.49	0.25	0.16	0.22	0.19	0.17	0.42	0.54	0.55	0.31	0.42
O4'	0.16	0.61	0.17	0.18	0.35	0.17	0.33	0.21	0.46	0.14	0.58	0.72	0.50	0.19	0.19	0.18	0.17	0.16	0.17	0.47	0.32	0.21	0.19
O5'	0.08	0.43	0.14	0.04	0.23	0.09	0.22	0.19	0.32	0.17	0.41	0.52	0.35	0.17	0.12	0.16	0.01	0.04	0.17	0.32	0.20	0.09	0.13
OP1	0.15	0.34	0.07	0.10	0.26	0.25	0.30	0.34	0.35	0.24	0.36	0.36	0.29	0.29	0.19	0.09	0.02	0.24	0.34	0.38	0.29	0.34	0.28
OP2	0.16	0.61	0.18	0.07	0.39	0.07	0.38	0.15	0.49	0.26	0.60	0.70	0.51	0.28	0.24	0.16	0.01	0.07	0.42	0.49	0.54	0.27	0.41
P	0.03	0.40	0.08	0.01	0.24	0.11	0.25	0.17	0.33	0.17	0.40	0.47	0.33	0.19	0.11	0.09	0.00	0.06	0.23	0.34	0.30	0.09	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.16	0.01	0.16	0.07	0.09
C2	0.04	0.00	0.27	0.24	0.01	0.13	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.31	0.22	0.36	0.01	0.34	0.28	0.36
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.15	0.02	0.09	0.01	0.14	0.12	0.22	0.32	0.26	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.21	0.12	0.26	0.08	0.16
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.14	0.00	0.12	0.01	0.17	0.11	0.22	0.28	0.22	0.08	0.05	0.01	0.00	0.02	0.24	0.16	0.31	0.05	0.19
C4	0.01	0.01	0.15	0.14	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.11	0.36	0.01	0.31	0.20	0.29
C4'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.07	0.11	0.15	0.11	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.19	0.03
C5	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.06	0.43	0.01	0.36	0.28	0.36
C5'	0.02	0.22	0.01	0.01	0.12	0.00	0.11	0.00	0.15	0.11	0.20	0.26	0.19	0.09	0.06	0.07	0.04	0.01	0.01	0.14	0.14	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.17	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.10	0.44	0.00	0.39	0.34	0.41
C8	0.02	0.01	0.12	0.11	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.13	0.11	0.43	0.02	0.34	0.18	0.32
N1	0.03	0.00	0.22	0.22	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.28	0.17	0.41	0.01	0.38	0.33	0.40
N2	0.05	0.00	0.32	0.28	0.01	0.15	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.29	0.37	0.26	0.35	0.01	0.35	0.29	0.37
N3	0.04	0.01	0.26	0.22	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.21	0.26	0.21	0.32	0.01	0.30	0.22	0.30
N7	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.06	0.47	0.02	0.39	0.29	0.38
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.32	0.01	0.27	0.10	0.22
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.10	0.07	0.05	0.07	0.10	0.10	0.18	0.29	0.21	0.06	0.02	0.00	0.06	0.04	0.07	0.09	0.16	0.07	0.06
O3'	0.02	0.31	0.02	0.00	0.16	0.02	0.15	0.04	0.21	0.13	0.28	0.37	0.26	0.11	0.05	0.06	0.00	0.02	0.17	0.21	0.31	0.05	0.16
O4'	0.00	0.22	0.01	0.02	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.11	0.17	0.26	0.21	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.08	0.07	0.21	0.07
O5'	0.16	0.36	0.21	0.24	0.36	0.01	0.43	0.01	0.44	0.43	0.41	0.35	0.32	0.47	0.32	0.07	0.17	0.04	0.00	0.47	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.12	0.16	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.21	0.08	0.47	0.00	0.42	0.38	0.44
OP1	0.16	0.34	0.26	0.31	0.31	0.12	0.36	0.14	0.39	0.34	0.38	0.35	0.30	0.39	0.27	0.16	0.31	0.07	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.28	0.08	0.05	0.20	0.19	0.28	0.26	0.34	0.18	0.33	0.29	0.22	0.29	0.10	0.07	0.05	0.21	0.02	0.38	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.36	0.16	0.19	0.29	0.03	0.36	0.01	0.41	0.32	0.40	0.37	0.30	0.38	0.22	0.06	0.16	0.07	0.00	0.44	0.01	0.00	0.00