Doublet Group distance statistics: 52343

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N9	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N7	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C8	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N6	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.008
O4'	A	0, 0.009, 0.095, 0.182, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.095 std_dev=0.087
C2'	A	0, -0.036, 0.124, 0.283, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.124 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.092, 0.262, 0.433, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.262 std_dev=0.171
C3'	A	0, 0.051, 0.304, 0.557, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.304 std_dev=0.253
OP1	A	0, 0.243, 0.506, 0.769, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.506 std_dev=0.263
O2'	A	0, 0.012, 0.309, 0.607, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.309 std_dev=0.298
C3'	B	0, 0.232, 0.559, 0.887, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.559 std_dev=0.327
C5'	A	0, 0.105, 0.439, 0.772, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.439 std_dev=0.333
C2'	B	0, 0.156, 0.516, 0.876, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.516 std_dev=0.360
P	A	0, 0.165, 0.544, 0.923, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.544 std_dev=0.379
O3'	A	0, 0.098, 0.499, 0.900, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.499 std_dev=0.401
O3'	B	0, 0.186, 0.610, 1.033, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.610 std_dev=0.424
C1'	B	0, 0.249, 0.747, 1.245, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.747 std_dev=0.498
OP2	A	0, 0.141, 0.661, 1.180, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.661 std_dev=0.520
O2'	B	0, 0.215, 0.766, 1.317, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.766 std_dev=0.551
O5'	A	0, -0.022, 0.598, 1.219, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.598 std_dev=0.621
C4'	B	0, 0.029, 0.948, 1.867, 2.567 max_d=2.567 avg_d=0.948 std_dev=0.919
N9	B	0, 0.183, 1.115, 2.047, 2.625 max_d=2.625 avg_d=1.115 std_dev=0.932
O4'	B	0, 0.049, 1.082, 2.114, 2.855 max_d=2.855 avg_d=1.082 std_dev=1.032
C4	B	0, 0.121, 1.294, 2.468, 3.299 max_d=3.299 avg_d=1.294 std_dev=1.173
N3	B	0, 0.064, 1.347, 2.630, 3.598 max_d=3.598 avg_d=1.347 std_dev=1.283
C5'	B	0, -0.127, 1.236, 2.599, 3.714 max_d=3.714 avg_d=1.236 std_dev=1.363
C8	B	0, -0.055, 1.589, 3.232, 4.533 max_d=4.533 avg_d=1.589 std_dev=1.643
C2	B	0, -0.104, 1.668, 3.440, 4.870 max_d=4.870 avg_d=1.668 std_dev=1.772
C5	B	0, -0.098, 1.711, 3.520, 4.946 max_d=4.946 avg_d=1.711 std_dev=1.809
O5'	B	0, -0.358, 1.645, 3.648, 5.322 max_d=5.322 avg_d=1.645 std_dev=2.003
OP2	B	0, -0.253, 1.827, 3.907, 5.629 max_d=5.629 avg_d=1.827 std_dev=2.080
N1	B	0, -0.192, 1.898, 3.988, 5.694 max_d=5.694 avg_d=1.898 std_dev=2.090
N7	B	0, -0.216, 1.929, 4.073, 5.826 max_d=5.826 avg_d=1.929 std_dev=2.145
C6	B	0, -0.239, 2.000, 4.238, 6.061 max_d=6.061 avg_d=2.000 std_dev=2.239
N2	B	0, -0.287, 1.954, 4.195, 6.078 max_d=6.078 avg_d=1.954 std_dev=2.241
P	B	0, -0.444, 1.897, 4.237, 6.215 max_d=6.215 avg_d=1.897 std_dev=2.341
OP1	B	0, -0.492, 1.940, 4.372, 6.439 max_d=6.439 avg_d=1.940 std_dev=2.432
O6	B	0, -0.452, 2.414, 5.279, 7.661 max_d=7.661 avg_d=2.414 std_dev=2.866

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.12	0.10	0.52	0.11
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.08	0.01	0.39	0.14	0.38	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.05	0.08	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.21	0.39	0.02
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.03	0.09	0.17	0.07	0.07	0.11	0.16	0.09	0.01	0.00	0.01	0.30	0.29	0.27	0.11
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.01	0.38	0.14	0.41	0.10
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.10	0.05	0.05	0.07	0.09	0.05	0.08	0.01	0.00	0.01	0.19	0.43	0.07
C5	0.00	0.00	0.02	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.01	0.48	0.16	0.33	0.16
C5'	0.02	0.11	0.02	0.03	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.12	0.11	0.10	0.11	0.12	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.25	0.40	0.02
C6	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.01	0.51	0.17	0.29	0.19
C8	0.00	0.00	0.06	0.17	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.19	0.01	0.44	0.15	0.40	0.10
N1	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.01	0.46	0.16	0.32	0.16
N3	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.08	0.01	0.33	0.13	0.43	0.09
N6	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.55	0.19	0.23	0.24
N7	0.00	0.00	0.05	0.16	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.20	0.01	0.52	0.17	0.29	0.18
N9	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.00	0.33	0.13	0.46	0.07
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.08	0.04	0.07	0.07	0.03	0.11	0.13	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.15	0.27	0.37	0.02
O3'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.08	0.01	0.13	0.03	0.12	0.19	0.08	0.08	0.16	0.20	0.10	0.02	0.00	0.01	0.28	0.37	0.16	0.19
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.00	0.08	0.06	0.59	0.21
O5'	0.12	0.39	0.22	0.30	0.38	0.01	0.48	0.01	0.51	0.44	0.46	0.33	0.55	0.52	0.33	0.15	0.28	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.10	0.14	0.21	0.29	0.14	0.19	0.16	0.25	0.17	0.15	0.16	0.13	0.19	0.17	0.13	0.27	0.37	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.52	0.38	0.39	0.27	0.41	0.43	0.33	0.40	0.29	0.40	0.32	0.43	0.23	0.29	0.46	0.37	0.16	0.59	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.02	0.11	0.10	0.07	0.16	0.02	0.19	0.10	0.16	0.09	0.24	0.18	0.07	0.02	0.19	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.54	0.14	0.24	0.10	0.86	0.22	1.32	0.10	0.68	0.35	0.87	0.40	0.58	0.34	0.39	0.13	0.83	1.73	0.14	2.06	1.37	1.80
C2	0.19	0.86	0.22	0.17	0.40	0.83	0.43	1.14	0.67	0.16	0.87	1.08	0.61	0.20	0.13	0.26	0.12	0.74	1.54	0.71	1.91	1.10	1.58
C2'	0.37	0.55	0.08	0.31	0.12	0.87	0.33	1.34	0.13	0.84	0.32	0.95	0.39	0.75	0.44	0.30	0.08	0.85	1.74	0.24	2.20	1.40	1.85
C3'	0.45	0.50	0.15	0.40	0.21	0.84	0.47	1.25	0.24	1.02	0.24	0.96	0.34	0.94	0.56	0.12	0.14	0.82	1.56	0.39	1.96	1.21	1.62
C4	0.19	0.79	0.20	0.18	0.32	0.81	0.30	1.12	0.52	0.23	0.75	1.04	0.58	0.13	0.10	0.28	0.10	0.72	1.48	0.52	1.79	1.06	1.50
C4'	0.47	0.40	0.15	0.38	0.30	0.82	0.60	1.30	0.40	1.13	0.13	0.84	0.29	1.08	0.64	0.20	0.08	0.83	1.60	0.56	1.94	1.31	1.67
C5	0.14	0.93	0.25	0.15	0.51	0.73	0.56	0.95	0.79	0.19	0.96	1.12	0.70	0.35	0.22	0.22	0.17	0.59	1.23	0.84	1.50	0.82	1.22
C5'	0.56	0.38	0.30	0.47	0.38	0.78	0.70	1.15	0.47	1.26	0.10	0.86	0.25	1.20	0.75	0.08	0.12	0.80	1.30	0.65	1.50	1.03	1.31
C6	0.16	1.02	0.27	0.15	0.62	0.71	0.73	0.91	0.99	0.32	1.11	1.17	0.75	0.54	0.32	0.21	0.21	0.57	1.19	1.08	1.49	0.76	1.18
C8	0.14	0.79	0.20	0.16	0.33	0.73	0.29	0.97	0.49	0.22	0.72	1.03	0.61	0.14	0.09	0.25	0.10	0.59	1.21	0.47	1.41	0.85	1.19
N1	0.16	0.97	0.26	0.16	0.55	0.77	0.64	1.01	0.91	0.23	1.05	1.14	0.70	0.44	0.25	0.22	0.17	0.65	1.35	0.99	1.70	0.91	1.37
N3	0.22	0.76	0.20	0.19	0.28	0.85	0.25	1.21	0.47	0.28	0.71	1.02	0.55	0.14	0.12	0.30	0.08	0.78	1.62	0.47	2.00	1.20	1.68
N6	0.20	1.13	0.31	0.16	0.78	0.63	0.97	0.76	1.24	0.54	1.31	1.22	0.84	0.82	0.48	0.22	0.27	0.47	0.99	1.39	1.28	0.57	0.96
N7	0.13	0.95	0.26	0.15	0.54	0.66	0.59	0.82	0.81	0.22	0.97	1.13	0.73	0.38	0.26	0.19	0.20	0.50	1.03	0.84	1.25	0.67	1.00
N9	0.21	0.69	0.17	0.20	0.21	0.82	0.13	1.17	0.32	0.38	0.59	0.97	0.52	0.24	0.14	0.31	0.07	0.73	1.50	0.29	1.77	1.11	1.52
O2'	0.46	0.39	0.11	0.37	0.29	0.93	0.55	1.49	0.36	1.05	0.15	0.79	0.27	1.00	0.59	0.35	0.08	0.97	1.97	0.51	2.55	1.72	2.18
O3'	0.50	0.45	0.22	0.44	0.31	0.80	0.63	1.20	0.40	1.19	0.14	0.96	0.30	1.15	0.67	0.07	0.18	0.81	1.50	0.59	1.96	1.20	1.60
O4'	0.38	0.44	0.13	0.28	0.19	0.86	0.40	1.34	0.23	0.88	0.22	0.80	0.33	0.81	0.48	0.38	0.20	0.85	1.72	0.35	1.96	1.37	1.76
O5'	0.12	0.63	0.03	0.13	0.07	0.25	0.20	0.41	0.04	0.65	0.36	1.01	0.53	0.59	0.25	0.12	0.02	0.23	0.47	0.16	0.53	0.21	0.40
OP1	0.09	0.77	0.14	0.05	0.09	0.16	0.27	0.25	0.10	0.77	0.42	1.25	0.67	0.73	0.29	0.07	0.02	0.08	0.26	0.25	0.20	0.32	0.26
OP2	0.11	0.92	0.12	0.11	0.38	0.05	0.22	0.07	0.40	0.22	0.72	1.25	0.78	0.14	0.09	0.07	0.01	0.09	0.08	0.31	0.19	0.21	0.07
P	0.01	0.75	0.02	0.01	0.19	0.05	0.06	0.07	0.14	0.48	0.49	1.11	0.66	0.41	0.12	0.03	0.00	0.03	0.09	0.06	0.19	0.10	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.51	0.17
C2	0.02	0.00	0.09	0.58	0.00	0.65	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.51	0.49	1.04	0.01	0.95	0.73	0.96
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.07	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.07	0.36	0.12
C3'	0.01	0.58	0.01	0.00	0.20	0.00	0.03	0.03	0.15	0.35	0.39	0.77	0.56	0.26	0.08	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.11	0.21	0.09
C4	0.01	0.00	0.05	0.20	0.00	0.26	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.16	0.25	0.41	0.01	0.25	0.27	0.17
C4'	0.01	0.65	0.01	0.00	0.26	0.00	0.06	0.00	0.20	0.40	0.46	0.85	0.63	0.28	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.17	0.06
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.10	0.19	0.01	0.17	0.75	0.25
C5'	0.04	0.97	0.03	0.03	0.32	0.00	0.09	0.00	0.25	0.69	0.68	1.32	0.89	0.54	0.15	0.05	0.03	0.00	0.01	0.13	0.10	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.20	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.12	0.20	0.38	0.00	0.15	0.42	0.13
C8	0.00	0.00	0.03	0.35	0.00	0.40	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.29	0.28	0.66	0.01	0.82	1.63	1.04
N1	0.01	0.00	0.07	0.39	0.00	0.46	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.35	0.37	0.78	0.00	0.62	0.31	0.62
N2	0.02	0.00	0.11	0.77	0.00	0.85	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.34	0.72	0.59	1.36	0.01	1.36	1.32	1.40
N3	0.02	0.00	0.09	0.56	0.00	0.63	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.47	0.49	0.93	0.01	0.83	0.55	0.80
N7	0.00	0.00	0.02	0.26	0.00	0.28	0.00	0.54	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.23	0.15	0.50	0.01	0.76	1.55	0.92
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.14	0.01	0.18	0.79	0.34
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.08	0.05	0.04	0.05	0.04	0.20	0.15	0.34	0.25	0.17	0.06	0.00	0.03	0.07	0.06	0.04	0.09	0.31	0.12
O3'	0.02	0.51	0.02	0.00	0.16	0.01	0.02	0.03	0.12	0.29	0.35	0.72	0.47	0.23	0.05	0.03	0.00	0.00	0.04	0.05	0.13	0.07	0.04
O4'	0.00	0.49	0.01	0.01	0.25	0.00	0.10	0.00	0.20	0.28	0.37	0.59	0.49	0.15	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.13	0.08	0.39	0.13
O5'	0.06	1.04	0.03	0.02	0.41	0.01	0.19	0.01	0.38	0.66	0.78	1.36	0.93	0.50	0.14	0.06	0.04	0.04	0.00	0.26	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.13	0.26	0.00	0.18	0.67	0.20
OP1	0.05	0.95	0.07	0.11	0.25	0.09	0.17	0.10	0.15	0.82	0.62	1.36	0.83	0.76	0.18	0.09	0.13	0.08	0.02	0.18	0.00	0.01	0.00
OP2	0.51	0.73	0.36	0.21	0.27	0.17	0.75	0.05	0.42	1.63	0.31	1.32	0.55	1.55	0.79	0.31	0.07	0.39	0.02	0.67	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.96	0.12	0.09	0.17	0.06	0.25	0.01	0.13	1.04	0.62	1.40	0.80	0.92	0.34	0.12	0.04	0.13	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00