Doublet Group distance statistics: 52349

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.013, 0.026, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.014, 0.033, 0.053, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.033 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.018, 0.039, 0.060, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.039 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.011, 0.031, 0.052, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.020, 0.044, 0.067, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.044 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.016, 0.047, 0.078, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.047 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.021, 0.060, 0.098, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.060 std_dev=0.039
N6	A	0, 0.037, 0.077, 0.116, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.077 std_dev=0.039
O2'	B	0, 0.368, 0.637, 0.906, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.637 std_dev=0.269
C2'	B	0, 0.333, 0.611, 0.889, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.611 std_dev=0.278
C1'	B	0, 0.334, 0.636, 0.938, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.636 std_dev=0.302
N3	B	0, 0.365, 0.682, 0.999, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.682 std_dev=0.317
N9	B	0, 0.339, 0.672, 1.005, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.672 std_dev=0.333
C4	B	0, 0.344, 0.685, 1.026, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.685 std_dev=0.341
C3'	B	0, 0.327, 0.669, 1.012, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.669 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.442, 0.799, 1.156, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.799 std_dev=0.357
O4'	A	0, 0.060, 0.427, 0.793, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.427 std_dev=0.367
C2'	A	0, 0.079, 0.450, 0.821, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.450 std_dev=0.371
N2	B	0, 0.525, 0.906, 1.286, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.906 std_dev=0.381
O3'	B	0, 0.366, 0.765, 1.163, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.765 std_dev=0.398
O4'	B	0, 0.289, 0.707, 1.124, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.707 std_dev=0.417
N1	B	0, 0.496, 0.931, 1.367, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.931 std_dev=0.435
C4'	B	0, 0.321, 0.769, 1.217, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.769 std_dev=0.448
P	A	0, 0.130, 0.613, 1.097, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.613 std_dev=0.483
C5	B	0, 0.341, 0.828, 1.316, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.828 std_dev=0.488
C8	B	0, 0.283, 0.774, 1.265, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.774 std_dev=0.491
OP1	A	0, 0.216, 0.710, 1.204, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.710 std_dev=0.494
O5'	B	0, 0.353, 0.850, 1.347, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.850 std_dev=0.497
OP2	A	0, 0.379, 0.881, 1.383, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.881 std_dev=0.502
C5'	B	0, 0.348, 0.877, 1.407, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.877 std_dev=0.530
O5'	A	0, 0.119, 0.659, 1.199, 1.890 max_d=1.890 avg_d=0.659 std_dev=0.540
C6	B	0, 0.419, 0.972, 1.525, 1.930 max_d=1.930 avg_d=0.972 std_dev=0.553
OP2	B	0, 0.374, 0.954, 1.533, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.954 std_dev=0.579
O2'	A	0, -0.123, 0.460, 1.043, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.460 std_dev=0.583
P	B	0, 0.356, 0.942, 1.528, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.942 std_dev=0.586
C3'	A	0, 0.142, 0.755, 1.368, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.755 std_dev=0.613
N7	B	0, 0.255, 0.868, 1.481, 2.113 max_d=2.113 avg_d=0.868 std_dev=0.613
C4'	A	0, 0.117, 0.742, 1.366, 2.118 max_d=2.118 avg_d=0.742 std_dev=0.624
O6	B	0, 0.418, 1.166, 1.915, 2.655 max_d=2.655 avg_d=1.166 std_dev=0.748
OP1	B	0, 0.263, 1.055, 1.847, 2.550 max_d=2.550 avg_d=1.055 std_dev=0.792
C5'	A	0, 0.203, 1.018, 1.833, 2.714 max_d=2.714 avg_d=1.018 std_dev=0.815
O3'	A	0, 0.258, 1.120, 1.983, 2.998 max_d=2.998 avg_d=1.120 std_dev=0.862

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.21	0.01	0.13	0.12	0.16	0.13
C2	0.04	0.00	0.21	0.27	0.02	0.10	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.22	0.10	0.19	0.22	0.33	0.25
C2'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.16	0.10	0.12	0.16	0.22	0.09	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.33	0.34	0.44	0.35
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.22	0.00	0.26	0.02	0.29	0.19	0.29	0.23	0.31	0.24	0.16	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.10	0.06
C4	0.02	0.02	0.11	0.22	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.18	0.10	0.05	0.15	0.18	0.26	0.21
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.10	0.10	0.08	0.12	0.11	0.06	0.22	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.26	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.26	0.10	0.03	0.20	0.25	0.36	0.28
C5'	0.06	0.12	0.16	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.13	0.08	0.13	0.10	0.16	0.11	0.05	0.06	0.16	0.02	0.01	0.05	0.06	0.02
C6	0.02	0.02	0.10	0.29	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.26	0.15	0.05	0.23	0.28	0.43	0.31
C8	0.01	0.02	0.12	0.19	0.01	0.10	0.01	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.24	0.10	0.05	0.13	0.18	0.21	0.19
N1	0.04	0.01	0.16	0.29	0.02	0.10	0.02	0.13	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.23	0.20	0.09	0.22	0.26	0.40	0.29
N3	0.04	0.01	0.22	0.23	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.12	0.21	0.10	0.15	0.18	0.26	0.21
N6	0.04	0.02	0.09	0.31	0.03	0.12	0.03	0.16	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.04	0.30	0.18	0.05	0.27	0.34	0.50	0.35
N7	0.01	0.02	0.07	0.24	0.01	0.11	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.28	0.11	0.03	0.19	0.26	0.36	0.28
N9	0.01	0.02	0.02	0.16	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.16	0.05	0.01	0.09	0.13	0.17	0.16
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.18	0.22	0.26	0.06	0.26	0.24	0.23	0.12	0.30	0.28	0.16	0.00	0.05	0.16	0.25	0.24	0.52	0.31
O3'	0.21	0.22	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.16	0.15	0.10	0.20	0.21	0.18	0.11	0.05	0.05	0.00	0.14	0.18	0.21	0.23	0.18
O4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.09	0.10	0.05	0.03	0.01	0.16	0.14	0.00	0.06	0.13	0.11	0.14
O5'	0.13	0.19	0.33	0.05	0.15	0.02	0.20	0.01	0.23	0.13	0.22	0.15	0.27	0.19	0.09	0.25	0.18	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.12	0.22	0.34	0.13	0.18	0.06	0.25	0.05	0.28	0.18	0.26	0.18	0.34	0.26	0.13	0.24	0.21	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.33	0.44	0.10	0.26	0.04	0.36	0.06	0.43	0.21	0.40	0.26	0.50	0.36	0.17	0.52	0.23	0.11	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.25	0.35	0.06	0.21	0.04	0.28	0.02	0.31	0.19	0.29	0.21	0.35	0.28	0.16	0.31	0.18	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.34	0.27	0.33	0.22	0.44	0.23	0.53	0.24	0.31	0.30	0.48	0.28	0.28	0.25	0.27	0.30	0.41	0.47	0.23	0.76	0.53	0.57
C2	0.25	0.45	0.24	0.31	0.27	0.40	0.29	0.46	0.38	0.25	0.46	0.58	0.33	0.26	0.23	0.25	0.30	0.39	0.40	0.41	0.66	0.41	0.45
C2'	0.23	0.38	0.28	0.25	0.23	0.30	0.22	0.38	0.26	0.24	0.34	0.52	0.32	0.21	0.21	0.39	0.30	0.28	0.31	0.25	0.64	0.39	0.45
C3'	0.09	0.36	0.13	0.16	0.17	0.23	0.14	0.33	0.21	0.11	0.32	0.49	0.30	0.09	0.09	0.19	0.15	0.18	0.26	0.20	0.68	0.42	0.46
C4	0.27	0.44	0.26	0.32	0.28	0.41	0.29	0.46	0.36	0.27	0.43	0.57	0.35	0.27	0.25	0.26	0.31	0.41	0.41	0.37	0.68	0.44	0.47
C4'	0.11	0.28	0.17	0.22	0.11	0.25	0.08	0.37	0.12	0.18	0.21	0.42	0.23	0.14	0.10	0.20	0.20	0.19	0.32	0.11	0.73	0.47	0.51
C5	0.26	0.49	0.24	0.31	0.32	0.39	0.34	0.42	0.43	0.25	0.50	0.60	0.38	0.29	0.26	0.25	0.30	0.39	0.37	0.45	0.64	0.39	0.42
C5'	0.13	0.30	0.10	0.11	0.17	0.21	0.15	0.31	0.18	0.16	0.24	0.40	0.26	0.15	0.13	0.17	0.12	0.20	0.24	0.19	0.69	0.42	0.45
C6	0.24	0.51	0.22	0.29	0.32	0.36	0.36	0.39	0.47	0.24	0.54	0.62	0.38	0.30	0.24	0.24	0.29	0.37	0.35	0.51	0.61	0.36	0.38
C8	0.29	0.44	0.27	0.33	0.31	0.41	0.31	0.43	0.36	0.28	0.42	0.54	0.37	0.28	0.27	0.26	0.31	0.41	0.39	0.36	0.67	0.43	0.46
N1	0.24	0.48	0.23	0.29	0.29	0.37	0.33	0.41	0.44	0.23	0.51	0.60	0.35	0.28	0.23	0.24	0.29	0.37	0.37	0.48	0.62	0.37	0.40
N3	0.27	0.43	0.26	0.32	0.26	0.42	0.28	0.48	0.34	0.27	0.42	0.56	0.33	0.26	0.24	0.26	0.31	0.41	0.42	0.35	0.69	0.45	0.48
N6	0.23	0.53	0.21	0.27	0.34	0.34	0.41	0.36	0.54	0.26	0.60	0.63	0.39	0.35	0.25	0.22	0.29	0.35	0.33	0.60	0.57	0.34	0.35
N7	0.28	0.50	0.25	0.31	0.35	0.38	0.36	0.39	0.44	0.27	0.50	0.59	0.41	0.31	0.28	0.25	0.30	0.39	0.36	0.45	0.63	0.39	0.41
N9	0.28	0.41	0.27	0.33	0.27	0.43	0.27	0.48	0.31	0.28	0.38	0.53	0.33	0.27	0.26	0.27	0.31	0.41	0.42	0.31	0.71	0.46	0.50
O2'	0.22	0.35	0.25	0.26	0.20	0.39	0.19	0.54	0.21	0.28	0.29	0.51	0.29	0.24	0.21	0.40	0.28	0.36	0.45	0.19	0.83	0.55	0.63
O3'	0.09	0.35	0.18	0.21	0.16	0.22	0.13	0.34	0.20	0.12	0.30	0.48	0.28	0.10	0.09	0.25	0.18	0.15	0.30	0.19	0.79	0.52	0.54
O4'	0.23	0.27	0.29	0.38	0.15	0.43	0.16	0.52	0.14	0.30	0.21	0.41	0.22	0.25	0.21	0.27	0.34	0.34	0.48	0.13	0.81	0.56	0.60
O5'	0.11	0.33	0.03	0.06	0.19	0.22	0.17	0.28	0.22	0.10	0.29	0.41	0.28	0.11	0.11	0.14	0.02	0.18	0.18	0.22	0.63	0.35	0.38
OP1	0.08	0.26	0.16	0.05	0.15	0.21	0.11	0.31	0.14	0.12	0.21	0.34	0.24	0.11	0.10	0.34	0.02	0.11	0.16	0.12	0.62	0.39	0.37
OP2	0.28	0.58	0.22	0.08	0.43	0.07	0.42	0.15	0.48	0.29	0.55	0.66	0.52	0.35	0.34	0.36	0.04	0.14	0.12	0.49	0.48	0.23	0.21
P	0.13	0.35	0.12	0.02	0.22	0.12	0.19	0.19	0.24	0.10	0.31	0.43	0.32	0.12	0.15	0.25	0.01	0.05	0.09	0.23	0.54	0.29	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.00	0.09	0.05	0.25	0.15	0.12
C2	0.05	0.00	0.10	0.10	0.01	0.12	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.21	0.13	0.15	0.03	0.20	0.27	0.14
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.07	0.07	0.08	0.14	0.10	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.38	0.23	0.20
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.08	0.06	0.15	0.10	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.39	0.22	0.20
C4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.07	0.18	0.03	0.24	0.27	0.18
C4'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.11	0.07	0.17	0.12	0.10	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.07	0.20	0.09	0.08
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.03	0.25	0.04	0.31	0.37	0.27
C5'	0.04	0.11	0.06	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.13	0.21	0.10	0.14	0.12	0.21	0.10	0.06	0.04	0.02	0.01	0.16	0.05	0.03	0.03
C6	0.03	0.01	0.07	0.04	0.02	0.04	0.01	0.13	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.14	0.13	0.05	0.25	0.01	0.31	0.41	0.28
C8	0.02	0.02	0.07	0.08	0.01	0.11	0.02	0.21	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.05	0.08	0.28	0.08	0.35	0.34	0.30
N1	0.04	0.01	0.08	0.06	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.17	0.18	0.09	0.20	0.03	0.25	0.35	0.21
N2	0.08	0.01	0.14	0.15	0.02	0.17	0.02	0.14	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.26	0.27	0.16	0.11	0.07	0.16	0.23	0.10
N3	0.06	0.01	0.10	0.10	0.00	0.12	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.19	0.20	0.14	0.13	0.02	0.20	0.22	0.12
N7	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.10	0.01	0.21	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.06	0.31	0.08	0.37	0.42	0.34
N9	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.10	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.18	0.06	0.27	0.24	0.18
O2'	0.02	0.21	0.01	0.01	0.11	0.01	0.10	0.06	0.14	0.12	0.17	0.26	0.19	0.11	0.05	0.00	0.03	0.01	0.12	0.15	0.44	0.29	0.23
O3'	0.07	0.21	0.02	0.01	0.12	0.03	0.10	0.04	0.13	0.05	0.18	0.27	0.20	0.05	0.07	0.03	0.00	0.06	0.04	0.13	0.43	0.23	0.21
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.09	0.16	0.14	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.06	0.13	0.11	0.09
O5'	0.09	0.15	0.10	0.04	0.18	0.02	0.25	0.01	0.25	0.28	0.20	0.11	0.13	0.31	0.18	0.12	0.04	0.07	0.00	0.29	0.02	0.01	0.02
O6	0.05	0.03	0.10	0.08	0.03	0.07	0.04	0.16	0.01	0.08	0.03	0.07	0.02	0.08	0.06	0.15	0.13	0.06	0.29	0.00	0.37	0.48	0.35
OP1	0.25	0.20	0.38	0.39	0.24	0.20	0.31	0.05	0.31	0.35	0.25	0.16	0.20	0.37	0.27	0.44	0.43	0.13	0.02	0.37	0.00	0.03	0.01
OP2	0.15	0.27	0.23	0.22	0.27	0.09	0.37	0.03	0.41	0.34	0.35	0.23	0.22	0.42	0.24	0.29	0.23	0.11	0.01	0.48	0.03	0.00	0.01
P	0.12	0.14	0.20	0.20	0.18	0.08	0.27	0.03	0.28	0.30	0.21	0.10	0.12	0.34	0.18	0.23	0.21	0.09	0.02	0.35	0.01	0.01	0.00