sequences=7
<param>
maxmove=0.1
pval=0.1
usescval=false
complexatt=true
cooling=1.0
currcool=1.0
attfactor=10.0
attvalpow=1
repfactor=10.0
repvalpow=1
dampening=1.0
minattract=1.0
cluster2d=false
blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500
formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb
showinfo=true
zoom=1.0
dotsize=0
ovalsize=10
groupsize=4
usefoldchange=false
avgfoldchange=false
colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9;
colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23):
</param>
<rotmtx>
1.0;0.0;0.0;
0.0;1.0;0.0;
0.0;0.0;1.0;
</rotmtx>
<seq>
>3CCE-038-037
X
>3OHY-A682-A681
X
>3OI0-A682-A681
X
>3G78-A152-A151
X
>1XMQ-A682-A681
X
>3OGY-A682-A681
X
>2OEU-A20-A19
X
</seq>
<hsp>
0 1:0.104965370501
0 2:0.101733691322
0 3:0.172527060507
0 4:0.0759583136184
0 5:0.0963559155588
0 6:0.908509742095
1 2:0.00547324646394
1 3:0.134524924038
1 4:0.080232305812
1 5:0.0516981673535
1 6:0.999999490415
2 3:0.134283442937
2 4:0.0777254745652
2 5:0.0489914514618
2 6:0.997485881891
3 4:0.103614352032
3 5:0.143669327022
3 6:0.988622183858
4 5:0.0740936020612
4 6:0.942308744305
5 6:0.97852942216
</hsp>