Doublet Group distance statistics: 52350

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.002, 0.023, 0.049, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.023 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.004, 0.030, 0.056, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.015, 0.051, 0.086, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.051 std_dev=0.036
N7	A	0, 0.002, 0.041, 0.080, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.041 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.001, 0.049, 0.097, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.049 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.039, 0.163, 0.287, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.163 std_dev=0.124
O4'	A	0, -0.013, 0.131, 0.275, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.131 std_dev=0.144
O2'	A	0, 0.082, 0.248, 0.413, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.248 std_dev=0.165
O5'	A	0, 0.133, 0.336, 0.540, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.336 std_dev=0.204
P	A	0, 0.279, 0.495, 0.712, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.495 std_dev=0.217
C3'	A	0, 0.047, 0.266, 0.485, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.266 std_dev=0.219
C4'	A	0, -0.025, 0.206, 0.438, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.206 std_dev=0.231
O3'	B	0, 0.306, 0.577, 0.848, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.577 std_dev=0.271
OP2	A	0, 0.254, 0.555, 0.855, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.555 std_dev=0.301
C5'	A	0, 0.025, 0.351, 0.677, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.351 std_dev=0.326
O3'	A	0, 0.056, 0.407, 0.758, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.407 std_dev=0.351
C3'	B	0, 0.567, 0.968, 1.369, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.968 std_dev=0.401
O2'	B	0, 0.509, 0.918, 1.326, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.918 std_dev=0.408
OP1	A	0, 0.589, 1.019, 1.450, 1.296 max_d=1.296 avg_d=1.019 std_dev=0.431
C4'	B	0, 0.661, 1.139, 1.616, 1.566 max_d=1.566 avg_d=1.139 std_dev=0.478
C2'	B	0, 0.789, 1.339, 1.889, 1.666 max_d=1.666 avg_d=1.339 std_dev=0.550
C5'	B	0, 0.945, 1.715, 2.486, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.715 std_dev=0.771
O4'	B	0, 1.467, 2.485, 3.502, 3.008 max_d=3.008 avg_d=2.485 std_dev=1.018
C1'	B	0, 1.784, 3.019, 4.255, 3.623 max_d=3.623 avg_d=3.019 std_dev=1.235
O5'	B	0, 1.804, 3.101, 4.397, 3.864 max_d=3.864 avg_d=3.101 std_dev=1.296
OP1	B	0, 2.143, 3.758, 5.374, 4.786 max_d=4.786 avg_d=3.758 std_dev=1.616
P	B	0, 2.338, 4.058, 5.778, 5.142 max_d=5.142 avg_d=4.058 std_dev=1.720
N9	B	0, 2.748, 4.656, 6.564, 5.606 max_d=5.606 avg_d=4.656 std_dev=1.908
C8	B	0, 3.171, 5.363, 7.555, 6.354 max_d=6.354 avg_d=5.363 std_dev=2.192
OP2	B	0, 3.379, 5.762, 8.144, 7.042 max_d=7.042 avg_d=5.762 std_dev=2.383
C4	B	0, 3.735, 6.335, 8.936, 7.687 max_d=7.687 avg_d=6.335 std_dev=2.601
N7	B	0, 4.173, 7.062, 9.951, 8.405 max_d=8.405 avg_d=7.062 std_dev=2.889
N3	B	0, 4.159, 7.056, 9.953, 8.606 max_d=8.606 avg_d=7.056 std_dev=2.897
C5	B	0, 4.462, 7.562, 10.662, 9.108 max_d=9.108 avg_d=7.562 std_dev=3.100
C2	B	0, 5.217, 8.849, 12.481, 10.765 max_d=10.765 avg_d=8.849 std_dev=3.632
C6	B	0, 5.546, 9.402, 13.259, 11.347 max_d=11.347 avg_d=9.402 std_dev=3.856
N1	B	0, 5.797, 9.833, 13.868, 11.924 max_d=11.924 avg_d=9.833 std_dev=4.035
N2	B	0, 5.935, 10.061, 14.187, 12.224 max_d=12.224 avg_d=10.061 std_dev=4.126
O6	B	0, 6.358, 10.775, 15.191, 12.955 max_d=12.955 avg_d=10.775 std_dev=4.416

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.09	0.19	0.10
C2	0.02	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.02	0.11	0.10	0.29	0.13
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.08	0.02	0.08	0.01	0.10	0.05	0.12	0.10	0.11	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.22	0.10
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.15	0.11	0.15	0.12	0.17	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.12	0.09	0.26	0.15
C4	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.11	0.09	0.27	0.12
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.12	0.07
C5	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.15	0.02	0.12	0.12	0.30	0.14
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.07	0.06	0.04	0.07	0.06	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.19	0.02	0.13	0.14	0.32	0.15
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.12	0.09	0.26	0.11
N1	0.01	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.20	0.02	0.12	0.12	0.31	0.15
N3	0.01	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.08	0.26	0.12
N6	0.01	0.01	0.11	0.17	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.22	0.02	0.14	0.17	0.33	0.17
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.02	0.12	0.13	0.29	0.13
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.11	0.07	0.24	0.11
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.09	0.03	0.10	0.09	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.05	0.20	0.10
O3'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.12	0.02	0.15	0.03	0.19	0.12	0.20	0.15	0.22	0.15	0.07	0.03	0.00	0.01	0.18	0.15	0.29	0.19
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.14	0.17	0.14
O5'	0.09	0.11	0.07	0.12	0.11	0.02	0.12	0.01	0.13	0.12	0.12	0.10	0.14	0.12	0.11	0.06	0.18	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.10	0.04	0.09	0.09	0.07	0.12	0.07	0.14	0.09	0.12	0.08	0.17	0.13	0.07	0.05	0.15	0.14	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.29	0.22	0.26	0.27	0.12	0.30	0.02	0.32	0.26	0.31	0.26	0.33	0.29	0.24	0.20	0.29	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.13	0.10	0.15	0.12	0.07	0.14	0.02	0.15	0.11	0.15	0.12	0.17	0.13	0.11	0.10	0.19	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.34	0.28	0.29	0.32	0.32	0.32	0.37	0.31	0.38	0.30	0.39	0.34	0.37	0.34	0.27	0.27	0.37	0.36	0.31	0.46	0.50	0.42
C2	0.39	0.72	0.21	0.20	0.51	0.24	0.46	0.26	0.53	0.35	0.65	0.87	0.65	0.38	0.40	0.17	0.19	0.37	0.25	0.51	0.39	0.40	0.31
C2'	0.32	0.30	0.28	0.29	0.28	0.34	0.30	0.42	0.27	0.37	0.26	0.37	0.31	0.37	0.31	0.27	0.25	0.35	0.42	0.30	0.56	0.62	0.51
C3'	0.32	0.26	0.30	0.32	0.27	0.36	0.31	0.46	0.29	0.39	0.24	0.30	0.27	0.40	0.31	0.31	0.26	0.35	0.44	0.33	0.58	0.69	0.55
C4	0.38	0.62	0.22	0.20	0.46	0.24	0.41	0.26	0.46	0.33	0.55	0.73	0.58	0.35	0.38	0.18	0.19	0.36	0.24	0.43	0.36	0.39	0.29
C4'	0.29	0.19	0.29	0.31	0.27	0.36	0.34	0.47	0.32	0.41	0.23	0.18	0.21	0.43	0.31	0.30	0.25	0.33	0.45	0.37	0.55	0.66	0.54
C5	0.38	0.75	0.18	0.15	0.53	0.18	0.48	0.17	0.55	0.31	0.68	0.87	0.68	0.35	0.41	0.14	0.15	0.33	0.15	0.53	0.29	0.31	0.20
C5'	0.29	0.23	0.30	0.33	0.30	0.40	0.38	0.53	0.37	0.45	0.29	0.18	0.23	0.47	0.33	0.29	0.19	0.35	0.49	0.43	0.57	0.70	0.58
C6	0.40	0.86	0.17	0.14	0.60	0.17	0.55	0.15	0.65	0.33	0.79	1.02	0.77	0.39	0.44	0.13	0.13	0.34	0.13	0.62	0.28	0.29	0.19
C8	0.36	0.56	0.21	0.17	0.43	0.19	0.38	0.20	0.42	0.29	0.50	0.64	0.54	0.30	0.36	0.19	0.16	0.32	0.17	0.39	0.27	0.32	0.22
N1	0.40	0.83	0.18	0.16	0.58	0.20	0.53	0.20	0.62	0.34	0.77	1.00	0.74	0.39	0.43	0.14	0.16	0.35	0.18	0.60	0.33	0.33	0.24
N3	0.38	0.61	0.23	0.23	0.45	0.27	0.41	0.30	0.45	0.36	0.54	0.73	0.56	0.37	0.38	0.19	0.21	0.38	0.29	0.43	0.42	0.44	0.35
N6	0.41	0.97	0.17	0.11	0.67	0.14	0.63	0.10	0.76	0.36	0.91	1.15	0.86	0.45	0.48	0.12	0.12	0.33	0.09	0.74	0.23	0.25	0.13
N7	0.38	0.72	0.17	0.13	0.53	0.15	0.47	0.14	0.54	0.29	0.65	0.83	0.67	0.34	0.40	0.14	0.12	0.31	0.11	0.51	0.23	0.28	0.16
N9	0.37	0.50	0.24	0.22	0.40	0.26	0.36	0.28	0.38	0.33	0.44	0.58	0.48	0.33	0.35	0.22	0.21	0.36	0.27	0.36	0.37	0.41	0.31
O2'	0.32	0.22	0.30	0.32	0.27	0.35	0.32	0.46	0.29	0.43	0.22	0.28	0.24	0.43	0.32	0.29	0.27	0.35	0.48	0.34	0.64	0.69	0.59
O3'	0.31	0.23	0.31	0.34	0.28	0.37	0.36	0.50	0.35	0.44	0.26	0.25	0.25	0.47	0.32	0.33	0.27	0.34	0.50	0.41	0.66	0.79	0.64
O4'	0.33	0.23	0.30	0.31	0.27	0.34	0.31	0.40	0.28	0.38	0.23	0.25	0.25	0.38	0.32	0.30	0.29	0.35	0.38	0.31	0.45	0.52	0.43
O5'	0.10	0.13	0.11	0.12	0.08	0.17	0.13	0.28	0.12	0.21	0.08	0.20	0.14	0.23	0.09	0.20	0.03	0.11	0.26	0.17	0.38	0.48	0.35
OP1	0.20	0.37	0.22	0.05	0.31	0.06	0.34	0.14	0.36	0.33	0.37	0.41	0.35	0.36	0.26	0.41	0.01	0.08	0.17	0.38	0.33	0.32	0.21
OP2	0.27	0.45	0.22	0.10	0.33	0.05	0.29	0.09	0.32	0.28	0.39	0.54	0.44	0.28	0.27	0.32	0.02	0.19	0.22	0.30	0.24	0.24	0.17
P	0.16	0.26	0.12	0.03	0.18	0.05	0.17	0.12	0.18	0.20	0.22	0.32	0.26	0.21	0.14	0.25	0.01	0.09	0.16	0.19	0.25	0.31	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.02	0.17	0.24	0.11
C2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.16	0.11	0.19	0.01	0.31	0.29	0.27
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06	0.07	0.11	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.13	0.04	0.29	0.31	0.20
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.09	0.12	0.08	0.07	0.06	0.12	0.07	0.03	0.01	0.01	0.08	0.10	0.21	0.22	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.09	0.05	0.14	0.01	0.23	0.26	0.20
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.09	0.11	0.09	0.08	0.05	0.09	0.02	0.00	0.02	0.08	0.11	0.15	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.06	0.03	0.16	0.01	0.25	0.25	0.23
C5'	0.02	0.18	0.06	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.15	0.09	0.17	0.20	0.15	0.10	0.05	0.04	0.06	0.02	0.00	0.15	0.07	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.07	0.04	0.19	0.00	0.31	0.28	0.28
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.09	0.09	0.10	0.01	0.17	0.21	0.14
N1	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.08	0.21	0.01	0.33	0.30	0.30
N2	0.04	0.01	0.11	0.07	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.20	0.13	0.20	0.02	0.33	0.30	0.29
N3	0.04	0.00	0.09	0.06	0.00	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.16	0.11	0.16	0.01	0.26	0.28	0.23
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.09	0.07	0.14	0.01	0.19	0.21	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.06	0.03	0.08	0.01	0.18	0.24	0.14
O2'	0.02	0.20	0.00	0.03	0.12	0.09	0.13	0.04	0.15	0.15	0.17	0.23	0.18	0.15	0.08	0.00	0.07	0.09	0.13	0.15	0.29	0.33	0.18
O3'	0.11	0.16	0.03	0.01	0.09	0.02	0.06	0.06	0.07	0.09	0.12	0.20	0.16	0.09	0.06	0.07	0.00	0.09	0.09	0.07	0.18	0.25	0.10
O4'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.09	0.08	0.13	0.11	0.07	0.03	0.09	0.09	0.00	0.06	0.03	0.12	0.19	0.09
O5'	0.04	0.19	0.13	0.08	0.14	0.02	0.16	0.00	0.19	0.10	0.21	0.20	0.16	0.14	0.08	0.13	0.09	0.06	0.00	0.20	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.07	0.03	0.20	0.00	0.32	0.29	0.30
OP1	0.17	0.31	0.29	0.21	0.23	0.11	0.25	0.07	0.31	0.17	0.33	0.33	0.26	0.19	0.18	0.29	0.18	0.12	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.29	0.31	0.22	0.26	0.15	0.25	0.05	0.28	0.21	0.30	0.30	0.28	0.21	0.24	0.33	0.25	0.19	0.02	0.29	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.27	0.20	0.10	0.20	0.06	0.23	0.01	0.28	0.14	0.30	0.29	0.23	0.18	0.14	0.18	0.10	0.09	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00