Doublet Group distance statistics: 52351

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.019
O4'	A	0, 0.046, 0.189, 0.332, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.189 std_dev=0.143
C2'	A	0, 0.017, 0.174, 0.330, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.174 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.054, 0.232, 0.410, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.232 std_dev=0.178
C3'	A	0, 0.129, 0.347, 0.565, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.347 std_dev=0.218
C4'	A	0, 0.118, 0.337, 0.557, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.337 std_dev=0.219
O3'	A	0, 0.193, 0.503, 0.812, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.503 std_dev=0.309
C3'	B	0, 0.368, 0.683, 0.999, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.683 std_dev=0.315
C2'	B	0, 0.327, 0.667, 1.006, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.667 std_dev=0.339
O2'	B	0, 0.406, 0.786, 1.166, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.786 std_dev=0.380
P	A	0, 0.223, 0.605, 0.988, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.605 std_dev=0.383
C5'	A	0, 0.188, 0.572, 0.955, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.572 std_dev=0.384
C4'	B	0, 0.290, 0.704, 1.118, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.704 std_dev=0.414
OP2	A	0, 0.299, 0.714, 1.129, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.714 std_dev=0.415
O5'	A	0, 0.198, 0.624, 1.051, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.624 std_dev=0.427
C1'	B	0, 0.196, 0.624, 1.052, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.624 std_dev=0.428
O3'	B	0, 0.421, 0.912, 1.402, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.912 std_dev=0.491
OP1	A	0, 0.559, 1.051, 1.543, 1.433 max_d=1.433 avg_d=1.051 std_dev=0.492
O5'	B	0, 0.471, 0.971, 1.471, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.971 std_dev=0.500
O4'	B	0, 0.141, 0.652, 1.164, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.652 std_dev=0.512
N9	B	0, 0.309, 0.861, 1.412, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.861 std_dev=0.552
C5'	B	0, 0.476, 1.042, 1.607, 1.692 max_d=1.692 avg_d=1.042 std_dev=0.566
C4	B	0, 0.456, 1.053, 1.651, 1.755 max_d=1.755 avg_d=1.053 std_dev=0.598
N3	B	0, 0.362, 1.089, 1.815, 2.075 max_d=2.075 avg_d=1.089 std_dev=0.726
P	B	0, 0.509, 1.257, 2.005, 2.193 max_d=2.193 avg_d=1.257 std_dev=0.748
C5	B	0, 0.631, 1.393, 2.155, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.393 std_dev=0.762
C8	B	0, 0.417, 1.196, 1.975, 2.244 max_d=2.244 avg_d=1.196 std_dev=0.779
OP2	B	0, 0.457, 1.292, 2.128, 2.395 max_d=2.395 avg_d=1.292 std_dev=0.835
N7	B	0, 0.619, 1.497, 2.375, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.497 std_dev=0.878
C6	B	0, 0.754, 1.687, 2.620, 3.076 max_d=3.076 avg_d=1.687 std_dev=0.933
C2	B	0, 0.459, 1.410, 2.361, 2.803 max_d=2.803 avg_d=1.410 std_dev=0.951
N1	B	0, 0.658, 1.654, 2.649, 3.249 max_d=3.249 avg_d=1.654 std_dev=0.995
O6	B	0, 0.905, 2.020, 3.135, 3.747 max_d=3.747 avg_d=2.020 std_dev=1.115
OP1	B	0, 0.478, 1.686, 2.895, 3.577 max_d=3.577 avg_d=1.686 std_dev=1.208
N2	B	0, 0.316, 1.586, 2.856, 3.419 max_d=3.419 avg_d=1.586 std_dev=1.270

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.30	0.15	0.12
C2	0.01	0.00	0.15	0.19	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.24	0.04	0.29	0.49	0.45	0.34
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.05	0.01	0.08	0.06	0.12	0.15	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.46	0.11	0.14
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.13	0.00	0.13	0.01	0.16	0.12	0.18	0.18	0.15	0.13	0.08	0.02	0.01	0.02	0.04	0.49	0.08	0.16
C4	0.00	0.01	0.08	0.13	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.15	0.03	0.29	0.46	0.40	0.31
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.06	0.11	0.12	0.06	0.09	0.02	0.01	0.01	0.22	0.02	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.03	0.36	0.53	0.51	0.40
C5'	0.04	0.14	0.01	0.01	0.15	0.00	0.21	0.00	0.21	0.21	0.18	0.12	0.24	0.24	0.14	0.09	0.06	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.20	0.03	0.38	0.57	0.57	0.43
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.03	0.35	0.46	0.37	0.32
N1	0.01	0.00	0.12	0.18	0.00	0.08	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.24	0.04	0.34	0.55	0.53	0.40
N3	0.01	0.00	0.15	0.18	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.21	0.03	0.25	0.44	0.38	0.28
N6	0.00	0.01	0.06	0.15	0.00	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.21	0.03	0.41	0.61	0.63	0.47
N7	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.03	0.40	0.54	0.52	0.42
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.25	0.40	0.30	0.25
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.09	0.05	0.09	0.07	0.03	0.11	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.06	0.06	0.05	0.41	0.06	0.09
O3'	0.01	0.24	0.02	0.01	0.15	0.02	0.16	0.06	0.20	0.13	0.24	0.21	0.21	0.15	0.08	0.06	0.00	0.01	0.15	0.53	0.14	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.06	0.14	0.10	0.11
O5'	0.11	0.29	0.04	0.04	0.29	0.01	0.36	0.01	0.38	0.35	0.34	0.25	0.41	0.40	0.25	0.05	0.15	0.06	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.30	0.49	0.46	0.49	0.46	0.22	0.53	0.07	0.57	0.46	0.55	0.44	0.61	0.54	0.40	0.41	0.53	0.14	0.03	0.00	0.04	0.00
OP2	0.15	0.45	0.11	0.08	0.40	0.02	0.51	0.02	0.57	0.37	0.53	0.38	0.63	0.52	0.30	0.06	0.14	0.10	0.02	0.04	0.00	0.00
P	0.12	0.34	0.14	0.16	0.31	0.04	0.40	0.01	0.43	0.32	0.40	0.28	0.47	0.42	0.25	0.09	0.19	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.86	0.26	0.20	0.49	0.18	0.44	0.29	0.59	0.20	0.78	1.07	0.73	0.28	0.26	0.32	0.35	0.12	0.25	0.58	0.51	0.35	0.22
C2	0.28	1.20	0.25	0.23	0.72	0.15	0.74	0.22	0.98	0.34	1.19	1.46	0.96	0.51	0.43	0.25	0.41	0.19	0.17	1.01	0.38	0.42	0.15
C2'	0.20	0.82	0.23	0.07	0.44	0.21	0.39	0.31	0.54	0.21	0.73	1.04	0.68	0.26	0.23	0.35	0.17	0.20	0.22	0.52	0.67	0.20	0.25
C3'	0.28	0.73	0.30	0.08	0.40	0.27	0.34	0.34	0.46	0.26	0.63	0.94	0.63	0.27	0.24	0.45	0.06	0.27	0.24	0.44	0.79	0.14	0.33
C4	0.26	1.08	0.25	0.23	0.66	0.14	0.65	0.23	0.84	0.29	1.03	1.31	0.89	0.44	0.38	0.26	0.41	0.15	0.17	0.85	0.39	0.41	0.16
C4'	0.20	0.58	0.20	0.05	0.27	0.27	0.17	0.37	0.28	0.21	0.46	0.78	0.51	0.18	0.12	0.36	0.12	0.28	0.26	0.25	0.72	0.23	0.33
C5	0.28	1.12	0.24	0.24	0.70	0.12	0.72	0.19	0.92	0.36	1.10	1.34	0.92	0.52	0.43	0.23	0.43	0.17	0.15	0.94	0.32	0.46	0.16
C5'	0.32	0.46	0.26	0.12	0.24	0.36	0.13	0.38	0.15	0.29	0.32	0.63	0.44	0.25	0.21	0.46	0.03	0.40	0.25	0.11	0.75	0.20	0.35
C6	0.30	1.22	0.22	0.24	0.76	0.13	0.81	0.18	1.04	0.41	1.22	1.45	0.97	0.60	0.47	0.21	0.44	0.21	0.16	1.08	0.28	0.48	0.17
C8	0.23	0.91	0.25	0.23	0.58	0.13	0.56	0.22	0.71	0.28	0.86	1.08	0.78	0.40	0.35	0.26	0.43	0.10	0.16	0.70	0.37	0.42	0.15
N1	0.30	1.24	0.23	0.23	0.77	0.14	0.81	0.19	1.06	0.39	1.25	1.50	0.99	0.59	0.46	0.22	0.43	0.21	0.16	1.10	0.32	0.46	0.16
N3	0.26	1.13	0.26	0.22	0.67	0.15	0.66	0.24	0.88	0.29	1.09	1.38	0.92	0.44	0.38	0.27	0.40	0.16	0.19	0.89	0.42	0.40	0.16
N6	0.32	1.25	0.20	0.24	0.80	0.12	0.88	0.15	1.12	0.47	1.29	1.47	0.99	0.68	0.50	0.19	0.44	0.24	0.18	1.18	0.22	0.52	0.21
N7	0.27	1.03	0.23	0.25	0.67	0.11	0.67	0.18	0.85	0.35	1.00	1.20	0.86	0.50	0.41	0.21	0.44	0.15	0.15	0.86	0.30	0.46	0.16
N9	0.22	0.95	0.26	0.22	0.57	0.15	0.55	0.24	0.71	0.25	0.89	1.16	0.80	0.37	0.33	0.29	0.39	0.12	0.19	0.71	0.42	0.39	0.17
O2'	0.18	0.82	0.23	0.11	0.43	0.20	0.37	0.33	0.52	0.18	0.72	1.05	0.68	0.23	0.21	0.33	0.18	0.16	0.27	0.50	0.64	0.26	0.28
O3'	0.31	0.71	0.34	0.17	0.39	0.33	0.33	0.39	0.44	0.31	0.61	0.91	0.61	0.32	0.26	0.49	0.16	0.32	0.29	0.43	0.95	0.20	0.46
O4'	0.14	0.69	0.25	0.23	0.37	0.19	0.31	0.31	0.43	0.19	0.60	0.88	0.59	0.22	0.18	0.33	0.39	0.15	0.28	0.41	0.53	0.35	0.25
O5'	0.39	0.53	0.35	0.12	0.31	0.32	0.20	0.25	0.25	0.26	0.40	0.69	0.52	0.24	0.24	0.61	0.02	0.39	0.25	0.22	0.68	0.15	0.26
OP1	0.20	0.18	0.08	0.23	0.30	0.33	0.49	0.58	0.45	0.69	0.27	0.23	0.17	0.72	0.39	0.28	0.03	0.30	0.61	0.56	0.97	0.71	0.70
OP2	0.29	0.39	0.33	0.10	0.28	0.10	0.34	0.12	0.34	0.43	0.32	0.50	0.39	0.47	0.27	0.58	0.03	0.20	0.59	0.40	0.65	0.47	0.47
P	0.14	0.25	0.19	0.03	0.11	0.07	0.21	0.19	0.19	0.38	0.16	0.37	0.24	0.39	0.14	0.41	0.01	0.08	0.40	0.26	0.68	0.33	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.19	0.01	0.11	0.57	0.24
C2	0.03	0.00	0.14	0.09	0.01	0.02	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.24	0.18	0.09	0.45	0.01	0.21	0.35	0.10
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.11	0.10	0.18	0.15	0.08	0.02	0.00	0.05	0.01	0.29	0.04	0.25	0.36	0.13
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.08	0.24	0.06	0.14	0.09	0.21	0.10	0.01	0.01	0.02	0.38	0.11	0.43	0.22	0.20
C4	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.07	0.05	0.50	0.00	0.21	0.32	0.08
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.16	0.05	0.03	0.02	0.15	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.10	0.11	0.50	0.18
C5	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.03	0.67	0.00	0.31	0.23	0.23
C5'	0.04	0.13	0.01	0.01	0.16	0.01	0.24	0.00	0.24	0.28	0.19	0.10	0.11	0.30	0.17	0.02	0.04	0.02	0.01	0.27	0.22	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.09	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.05	0.69	0.00	0.34	0.26	0.27
C8	0.01	0.01	0.11	0.24	0.00	0.16	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.25	0.04	0.73	0.01	0.29	0.18	0.23
N1	0.03	0.00	0.10	0.06	0.01	0.05	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.11	0.07	0.58	0.00	0.28	0.29	0.19
N2	0.04	0.00	0.18	0.14	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.29	0.26	0.10	0.38	0.01	0.19	0.39	0.11
N3	0.03	0.00	0.15	0.09	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.17	0.08	0.38	0.01	0.17	0.39	0.09
N7	0.01	0.01	0.08	0.21	0.00	0.15	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.23	0.03	0.79	0.01	0.37	0.20	0.34
N9	0.01	0.02	0.02	0.10	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.48	0.01	0.17	0.36	0.06
O2'	0.02	0.24	0.00	0.01	0.13	0.03	0.08	0.02	0.13	0.06	0.19	0.29	0.23	0.04	0.03	0.00	0.08	0.07	0.10	0.11	0.18	0.44	0.18
O3'	0.03	0.18	0.05	0.01	0.07	0.02	0.11	0.04	0.09	0.25	0.11	0.26	0.17	0.23	0.09	0.08	0.00	0.02	0.31	0.12	0.59	0.19	0.27
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.10	0.08	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.08	0.04	0.20	0.76	0.38
O5'	0.19	0.45	0.29	0.38	0.50	0.01	0.67	0.01	0.69	0.73	0.58	0.38	0.38	0.79	0.48	0.10	0.31	0.08	0.00	0.76	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.10	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.04	0.76	0.00	0.40	0.31	0.37
OP1	0.11	0.21	0.25	0.43	0.21	0.11	0.31	0.22	0.34	0.29	0.28	0.19	0.17	0.37	0.17	0.18	0.59	0.20	0.02	0.40	0.00	0.00	0.00
OP2	0.57	0.35	0.36	0.22	0.32	0.50	0.23	0.36	0.26	0.18	0.29	0.39	0.39	0.20	0.36	0.44	0.19	0.76	0.02	0.31	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.10	0.13	0.20	0.08	0.18	0.23	0.01	0.27	0.23	0.19	0.11	0.09	0.34	0.06	0.18	0.27	0.38	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00