Doublet Group distance statistics: 52352

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.018, 0.037, 0.056, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.037 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.010, 0.030, 0.049, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.013, 0.034, 0.054, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.019, 0.040, 0.061, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.040 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.024, 0.051, 0.078, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.051 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.008, 0.036, 0.064, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.036 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.021, 0.053, 0.086, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.053 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.109, 0.268, 0.427, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.268 std_dev=0.159
C2'	A	0, 0.077, 0.302, 0.526, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.302 std_dev=0.224
C4'	A	0, 0.231, 0.499, 0.767, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.499 std_dev=0.268
C2'	B	0, 0.235, 0.523, 0.811, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.523 std_dev=0.288
O2'	A	0, 0.270, 0.602, 0.935, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.602 std_dev=0.332
C3'	A	0, 0.154, 0.497, 0.839, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.497 std_dev=0.343
OP1	A	0, 0.374, 0.783, 1.192, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.783 std_dev=0.409
C3'	B	0, 0.114, 0.549, 0.983, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.549 std_dev=0.434
P	A	0, 0.272, 0.714, 1.157, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.714 std_dev=0.442
O2'	B	0, 0.400, 0.871, 1.342, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.871 std_dev=0.471
O3'	B	0, 0.204, 0.684, 1.163, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.684 std_dev=0.480
C5'	A	0, 0.382, 0.863, 1.344, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.863 std_dev=0.481
C4'	B	0, 0.251, 0.736, 1.220, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.736 std_dev=0.485
O3'	A	0, 0.216, 0.702, 1.188, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.702 std_dev=0.486
O5'	A	0, 0.329, 1.023, 1.717, 1.748 max_d=1.748 avg_d=1.023 std_dev=0.694
O4'	B	0, 0.157, 1.008, 1.858, 2.177 max_d=2.177 avg_d=1.008 std_dev=0.850
C1'	B	0, 0.167, 1.024, 1.881, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.024 std_dev=0.857
OP2	A	0, 0.479, 1.405, 2.331, 2.481 max_d=2.481 avg_d=1.405 std_dev=0.926
C5'	B	0, 0.364, 1.315, 2.267, 2.516 max_d=2.516 avg_d=1.315 std_dev=0.952
N9	B	0, 0.246, 1.595, 2.945, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.595 std_dev=1.350
C8	B	0, 0.379, 1.942, 3.505, 3.887 max_d=3.887 avg_d=1.942 std_dev=1.563
O5'	B	0, 0.289, 2.005, 3.721, 4.230 max_d=4.230 avg_d=2.005 std_dev=1.716
C4	B	0, 0.408, 2.176, 3.943, 4.352 max_d=4.352 avg_d=2.176 std_dev=1.768
N3	B	0, 0.490, 2.367, 4.245, 4.626 max_d=4.626 avg_d=2.367 std_dev=1.877
N7	B	0, 0.556, 2.607, 4.657, 5.130 max_d=5.130 avg_d=2.607 std_dev=2.051
C5	B	0, 0.557, 2.702, 4.848, 5.336 max_d=5.336 avg_d=2.702 std_dev=2.145
C2	B	0, 0.661, 2.984, 5.307, 5.742 max_d=5.742 avg_d=2.984 std_dev=2.323
N2	B	0, 0.789, 3.346, 5.904, 6.315 max_d=6.315 avg_d=3.346 std_dev=2.557
P	B	0, 0.443, 3.038, 5.633, 6.404 max_d=6.404 avg_d=3.038 std_dev=2.595
C6	B	0, 0.740, 3.356, 5.972, 6.528 max_d=6.528 avg_d=3.356 std_dev=2.616
N1	B	0, 0.763, 3.407, 6.052, 6.575 max_d=6.575 avg_d=3.407 std_dev=2.644
OP1	B	0, 0.595, 3.327, 6.059, 6.853 max_d=6.853 avg_d=3.327 std_dev=2.732
O6	B	0, 0.901, 3.924, 6.947, 7.572 max_d=7.572 avg_d=3.924 std_dev=3.023
OP2	B	0, 0.475, 3.683, 6.891, 7.864 max_d=7.864 avg_d=3.683 std_dev=3.208

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.14	0.09	0.37	0.14
C2	0.04	0.00	0.11	0.17	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.20	0.02	0.39	0.16	0.22	0.03
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.07	0.12	0.03	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.26	0.35	0.31	0.06
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.03	0.04	0.16	0.11	0.16	0.04	0.13	0.04	0.02	0.01	0.01	0.34	0.52	0.29	0.16
C4	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.40	0.14	0.22	0.03
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.12	0.06	0.07	0.05	0.10	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.23	0.44	0.08
C5	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.52	0.15	0.13	0.09
C5'	0.01	0.14	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.08	0.13	0.12	0.13	0.08	0.11	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.32	0.48	0.02
C6	0.04	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.05	0.04	0.53	0.17	0.13	0.11
C8	0.02	0.02	0.09	0.16	0.01	0.12	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.17	0.05	0.50	0.12	0.16	0.07
N1	0.04	0.00	0.07	0.11	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.03	0.48	0.17	0.14	0.07
N3	0.04	0.00	0.12	0.16	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.02	0.34	0.16	0.27	0.05
N6	0.04	0.01	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03	0.05	0.60	0.19	0.19	0.18
N7	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.13	0.05	0.57	0.14	0.15	0.13
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.35	0.12	0.26	0.05
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.08	0.10	0.05	0.03	0.01	0.00	0.10	0.03	0.10	0.29	0.36	0.07
O3'	0.04	0.20	0.05	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.05	0.17	0.14	0.18	0.03	0.13	0.05	0.10	0.00	0.03	0.26	0.64	0.31	0.20
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.03	0.03	0.00	0.07	0.05	0.47	0.24
O5'	0.14	0.39	0.26	0.34	0.40	0.02	0.52	0.01	0.53	0.50	0.48	0.34	0.60	0.57	0.35	0.10	0.26	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.09	0.16	0.35	0.52	0.14	0.23	0.15	0.32	0.17	0.12	0.17	0.16	0.19	0.14	0.12	0.29	0.64	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.22	0.31	0.29	0.22	0.44	0.13	0.48	0.13	0.16	0.14	0.27	0.19	0.15	0.26	0.36	0.31	0.47	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.03	0.06	0.16	0.03	0.08	0.09	0.02	0.11	0.07	0.07	0.05	0.18	0.13	0.05	0.07	0.20	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.54	0.90	0.19	0.14	0.64	0.18	0.52	0.23	0.60	0.34	0.77	1.08	0.86	0.36	0.50	0.39	0.37	0.45	0.27	0.54	0.55	0.32	0.31
C2	0.57	1.16	0.14	0.13	0.85	0.16	0.84	0.12	0.97	0.59	1.12	1.35	1.02	0.69	0.66	0.26	0.37	0.50	0.23	0.97	0.24	0.25	0.25
C2'	0.58	0.86	0.30	0.04	0.62	0.19	0.50	0.16	0.56	0.35	0.73	1.04	0.83	0.36	0.51	0.55	0.19	0.47	0.25	0.50	0.63	0.34	0.30
C3'	0.64	0.73	0.45	0.14	0.57	0.26	0.42	0.09	0.44	0.34	0.58	0.88	0.75	0.31	0.50	0.78	0.06	0.51	0.28	0.37	0.73	0.47	0.37
C4	0.55	1.01	0.16	0.14	0.76	0.15	0.70	0.13	0.80	0.50	0.93	1.17	0.94	0.56	0.60	0.29	0.37	0.46	0.21	0.77	0.31	0.20	0.20
C4'	0.61	0.69	0.40	0.08	0.51	0.25	0.34	0.15	0.35	0.25	0.52	0.85	0.72	0.21	0.44	0.75	0.08	0.50	0.31	0.27	0.76	0.51	0.42
C5	0.51	0.94	0.13	0.13	0.73	0.12	0.72	0.08	0.80	0.54	0.89	1.03	0.86	0.61	0.59	0.26	0.35	0.41	0.21	0.79	0.18	0.20	0.20
C5'	0.64	0.52	0.54	0.25	0.41	0.36	0.23	0.07	0.21	0.22	0.34	0.64	0.59	0.17	0.41	0.94	0.22	0.54	0.32	0.17	0.80	0.62	0.47
C6	0.49	1.00	0.11	0.12	0.77	0.12	0.81	0.09	0.92	0.61	1.01	1.10	0.86	0.71	0.62	0.23	0.34	0.42	0.25	0.94	0.09	0.28	0.26
C8	0.48	0.71	0.16	0.15	0.57	0.11	0.50	0.12	0.54	0.38	0.63	0.80	0.71	0.41	0.47	0.35	0.37	0.36	0.18	0.51	0.32	0.15	0.16
N1	0.53	1.10	0.12	0.13	0.83	0.14	0.86	0.10	1.00	0.63	1.11	1.25	0.95	0.74	0.65	0.23	0.35	0.46	0.25	1.01	0.14	0.29	0.27
N3	0.58	1.13	0.17	0.13	0.82	0.17	0.77	0.14	0.89	0.54	1.05	1.33	1.02	0.61	0.64	0.29	0.37	0.50	0.23	0.86	0.33	0.23	0.24
N6	0.44	0.90	0.09	0.10	0.74	0.12	0.84	0.12	0.95	0.66	0.98	0.93	0.74	0.78	0.60	0.24	0.29	0.38	0.30	1.00	0.07	0.37	0.33
N7	0.45	0.73	0.12	0.14	0.62	0.09	0.60	0.06	0.64	0.48	0.69	0.77	0.71	0.52	0.52	0.27	0.34	0.34	0.18	0.62	0.17	0.14	0.15
N9	0.54	0.90	0.18	0.14	0.67	0.15	0.58	0.16	0.66	0.41	0.79	1.04	0.86	0.45	0.53	0.35	0.38	0.44	0.21	0.61	0.40	0.21	0.21
O2'	0.53	0.90	0.24	0.07	0.61	0.18	0.49	0.23	0.57	0.29	0.76	1.10	0.85	0.31	0.47	0.45	0.23	0.44	0.28	0.50	0.69	0.39	0.35
O3'	0.64	0.70	0.49	0.20	0.53	0.29	0.37	0.08	0.39	0.31	0.53	0.86	0.73	0.28	0.48	0.82	0.13	0.52	0.33	0.33	0.86	0.60	0.47
O4'	0.57	0.79	0.25	0.11	0.57	0.21	0.42	0.24	0.47	0.28	0.64	0.96	0.79	0.27	0.46	0.53	0.34	0.48	0.31	0.39	0.62	0.40	0.36
O5'	0.55	0.69	0.58	0.11	0.51	0.07	0.35	0.44	0.39	0.22	0.55	0.83	0.71	0.21	0.42	0.97	0.02	0.26	0.55	0.31	1.14	0.78	0.76
OP1	0.26	0.34	0.06	0.30	0.46	0.57	0.66	1.02	0.67	0.72	0.52	0.24	0.28	0.81	0.48	0.41	0.01	0.51	1.33	0.79	1.85	1.71	1.63
OP2	0.45	0.32	0.53	0.18	0.32	0.11	0.29	0.15	0.29	0.31	0.30	0.33	0.35	0.28	0.35	0.75	0.01	0.26	0.37	0.30	0.78	0.66	0.55
P	0.20	0.18	0.32	0.02	0.12	0.15	0.19	0.46	0.22	0.20	0.18	0.24	0.19	0.27	0.09	0.63	0.01	0.03	0.66	0.29	1.08	0.93	0.85

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.21	0.01	0.21	0.30	0.27
C2	0.02	0.00	0.19	0.23	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.19	0.13	0.24	0.01	0.31	0.48	0.41
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.10	0.01	0.05	0.06	0.09	0.12	0.15	0.22	0.19	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.14	0.07	0.08	0.16	0.14
C3'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.19	0.00	0.21	0.01	0.24	0.13	0.25	0.23	0.21	0.17	0.12	0.05	0.01	0.02	0.14	0.24	0.18	0.19	0.12
C4	0.02	0.00	0.10	0.19	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.07	0.21	0.01	0.25	0.40	0.33
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.03	0.05	0.02	0.10	0.04	0.06	0.02	0.01	0.04	0.08	0.13	0.06	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.21	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.20	0.02	0.15	0.01	0.21	0.36	0.26
C5'	0.07	0.09	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.06	0.13	0.09	0.07	0.04	0.04	0.10	0.06	0.01	0.07	0.15	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.24	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.24	0.05	0.15	0.00	0.24	0.38	0.29
C8	0.01	0.01	0.12	0.13	0.01	0.10	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.09	0.10	0.02	0.12	0.25	0.13
N1	0.02	0.00	0.15	0.25	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.09	0.20	0.01	0.28	0.44	0.36
N2	0.03	0.01	0.22	0.23	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.20	0.17	0.27	0.02	0.36	0.51	0.47
N3	0.02	0.00	0.19	0.21	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.13	0.24	0.01	0.30	0.45	0.40
N7	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.10	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.19	0.05	0.09	0.02	0.15	0.27	0.14
N9	0.01	0.00	0.02	0.12	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.01	0.19	0.01	0.20	0.34	0.27
O2'	0.03	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.04	0.05	0.12	0.01	0.08	0.05	0.12	0.07	0.00	0.16	0.05	0.08	0.07	0.12	0.14	0.10
O3'	0.06	0.19	0.03	0.01	0.14	0.02	0.20	0.10	0.24	0.14	0.23	0.20	0.15	0.19	0.08	0.16	0.00	0.04	0.29	0.27	0.43	0.38	0.30
O4'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.05	0.09	0.09	0.17	0.13	0.05	0.01	0.05	0.04	0.00	0.24	0.03	0.27	0.31	0.31
O5'	0.21	0.24	0.14	0.14	0.21	0.04	0.15	0.01	0.15	0.10	0.20	0.27	0.24	0.09	0.19	0.08	0.29	0.24	0.00	0.13	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.24	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.27	0.03	0.13	0.00	0.23	0.34	0.24
OP1	0.21	0.31	0.08	0.18	0.25	0.13	0.21	0.15	0.24	0.12	0.28	0.36	0.30	0.15	0.20	0.12	0.43	0.27	0.02	0.23	0.00	0.02	0.00
OP2	0.30	0.48	0.16	0.19	0.40	0.06	0.36	0.03	0.38	0.25	0.44	0.51	0.45	0.27	0.34	0.14	0.38	0.31	0.02	0.34	0.02	0.00	0.01
P	0.27	0.41	0.14	0.12	0.33	0.07	0.26	0.01	0.29	0.13	0.36	0.47	0.40	0.14	0.27	0.10	0.30	0.31	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00