Doublet Group distance statistics: 52355

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.015, 0.030, 0.046, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.014, 0.031, 0.047, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.012, 0.030, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.023, 0.048, 0.073, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.048 std_dev=0.025
O2'	B	0, 0.189, 0.538, 0.888, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.538 std_dev=0.350
C2'	B	0, 0.281, 0.703, 1.126, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.703 std_dev=0.422
C3'	B	0, 0.299, 0.837, 1.375, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.837 std_dev=0.538
O4'	A	0, -0.429, 0.595, 1.619, 2.637 max_d=2.637 avg_d=0.595 std_dev=1.024
C2'	A	0, -0.379, 0.662, 1.704, 2.738 max_d=2.738 avg_d=0.662 std_dev=1.042
C1'	B	0, 0.236, 1.335, 2.434, 3.329 max_d=3.329 avg_d=1.335 std_dev=1.099
O2'	A	0, -0.305, 0.795, 1.896, 2.978 max_d=2.978 avg_d=0.795 std_dev=1.101
C4'	B	0, 0.254, 1.436, 2.619, 3.584 max_d=3.584 avg_d=1.436 std_dev=1.183
C8	B	0, 0.992, 2.249, 3.507, 3.533 max_d=3.533 avg_d=2.249 std_dev=1.257
O4'	B	0, 0.390, 1.711, 3.033, 4.046 max_d=4.046 avg_d=1.711 std_dev=1.322
N9	B	0, 0.624, 2.009, 3.393, 4.274 max_d=4.274 avg_d=2.009 std_dev=1.385
O3'	B	0, -0.490, 0.979, 2.447, 3.903 max_d=3.903 avg_d=0.979 std_dev=1.468
O5'	B	0, 0.415, 1.930, 3.445, 4.118 max_d=4.118 avg_d=1.930 std_dev=1.515
C4'	A	0, -0.600, 0.919, 2.439, 3.946 max_d=3.946 avg_d=0.919 std_dev=1.519
C3'	A	0, -0.638, 1.042, 2.722, 4.392 max_d=4.392 avg_d=1.042 std_dev=1.680
OP2	B	0, 1.094, 2.787, 4.480, 4.364 max_d=4.364 avg_d=2.787 std_dev=1.693
N7	B	0, 1.264, 2.970, 4.676, 4.995 max_d=4.995 avg_d=2.970 std_dev=1.706
C5'	B	0, 0.491, 2.259, 4.027, 5.428 max_d=5.428 avg_d=2.259 std_dev=1.768
P	B	0, 0.780, 2.798, 4.816, 5.737 max_d=5.737 avg_d=2.798 std_dev=2.018
C4	B	0, 0.542, 2.692, 4.841, 6.554 max_d=6.554 avg_d=2.692 std_dev=2.150
C5	B	0, 1.012, 3.297, 5.582, 7.061 max_d=7.061 avg_d=3.297 std_dev=2.285
O3'	A	0, -0.815, 1.519, 3.852, 6.168 max_d=6.168 avg_d=1.519 std_dev=2.334
C5'	A	0, -1.087, 1.536, 4.160, 6.774 max_d=6.774 avg_d=1.536 std_dev=2.623
N3	B	0, 0.044, 2.810, 5.576, 8.099 max_d=8.099 avg_d=2.810 std_dev=2.766
OP1	B	0, 0.582, 3.410, 6.239, 8.321 max_d=8.321 avg_d=3.410 std_dev=2.828
O5'	A	0, -1.186, 1.674, 4.535, 7.388 max_d=7.388 avg_d=1.674 std_dev=2.861
C6	B	0, 1.059, 4.171, 7.282, 9.569 max_d=9.569 avg_d=4.171 std_dev=3.111
O6	B	0, 1.427, 4.811, 8.195, 10.450 max_d=10.450 avg_d=4.811 std_dev=3.384
C2	B	0, 0.114, 3.659, 7.203, 10.416 max_d=10.416 avg_d=3.659 std_dev=3.545
N1	B	0, 0.588, 4.301, 8.014, 11.171 max_d=11.171 avg_d=4.301 std_dev=3.713
P	A	0, -1.394, 2.374, 6.142, 9.890 max_d=9.890 avg_d=2.374 std_dev=3.768
OP1	A	0, -1.248, 2.819, 6.885, 10.901 max_d=10.901 avg_d=2.819 std_dev=4.066
N2	B	0, -0.282, 3.988, 8.258, 12.267 max_d=12.267 avg_d=3.988 std_dev=4.270
OP2	A	0, -1.289, 3.047, 7.382, 11.667 max_d=11.667 avg_d=3.047 std_dev=4.335

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.06	0.37	0.16
C2	0.01	0.00	0.08	0.74	0.00	0.85	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.72	0.55	0.95	1.34	1.03	1.25
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.07	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.28	0.20	0.36	0.23
C3'	0.01	0.74	0.00	0.00	0.34	0.00	0.17	0.02	0.32	0.35	0.57	0.72	0.23	0.23	0.06	0.01	0.00	0.01	0.36	0.38	0.22	0.25
C4	0.01	0.00	0.05	0.34	0.00	0.38	0.00	0.56	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.31	0.28	0.15	0.44	0.23	0.27
C4'	0.01	0.85	0.01	0.00	0.38	0.00	0.15	0.01	0.34	0.43	0.64	0.83	0.21	0.26	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.13	0.11	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.15	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.18	0.11	0.28	0.09	0.75	0.24
C5'	0.02	1.37	0.02	0.02	0.56	0.01	0.22	0.00	0.54	0.65	1.05	1.26	0.34	0.43	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.31	0.31	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.32	0.01	0.34	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.33	0.23	0.09	0.40	0.39	0.20
C8	0.01	0.00	0.03	0.35	0.00	0.43	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.32	0.31	1.11	0.86	1.65	1.18
N1	0.01	0.00	0.08	0.57	0.00	0.64	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.57	0.42	0.58	1.00	0.54	0.85
N3	0.01	0.00	0.07	0.72	0.00	0.83	0.00	1.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.66	0.56	0.87	1.15	0.84	1.07
N6	0.01	0.00	0.07	0.23	0.01	0.21	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.26	0.14	0.24	0.16	0.74	0.18
N7	0.01	0.00	0.04	0.23	0.00	0.26	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.24	0.18	0.96	0.74	1.65	1.05
N9	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.38	0.13	0.71	0.35
O2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.12	0.03	0.06	0.02	0.11	0.12	0.20	0.26	0.08	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.07	0.18	0.09
O3'	0.01	0.72	0.01	0.00	0.31	0.01	0.18	0.02	0.33	0.32	0.57	0.66	0.26	0.24	0.06	0.02	0.00	0.01	0.31	0.47	0.09	0.22
O4'	0.00	0.55	0.01	0.01	0.28	0.00	0.11	0.01	0.23	0.31	0.42	0.56	0.14	0.18	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.13	0.12	0.06
O5'	0.16	0.95	0.28	0.36	0.15	0.02	0.28	0.01	0.09	1.11	0.58	0.87	0.24	0.96	0.38	0.09	0.31	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.06	1.34	0.20	0.38	0.44	0.13	0.09	0.31	0.40	0.86	1.00	1.15	0.16	0.74	0.13	0.07	0.47	0.13	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	1.03	0.36	0.22	0.23	0.11	0.75	0.31	0.39	1.65	0.54	0.84	0.74	1.65	0.71	0.18	0.09	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	1.25	0.23	0.25	0.27	0.03	0.24	0.01	0.20	1.18	0.85	1.07	0.18	1.05	0.35	0.09	0.22	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.84	1.08	0.25	0.26	0.88	0.29	0.75	0.20	0.80	0.57	0.94	1.19	1.08	0.59	0.76	0.37	0.92	0.84	0.13	0.74	0.29	0.23	0.10
C2	0.46	0.81	0.19	0.14	0.53	0.71	0.74	0.76	1.00	0.42	1.03	0.87	0.52	0.64	0.35	0.27	0.36	0.87	0.56	1.16	0.65	0.37	0.58
C2'	1.23	1.60	0.76	0.20	1.31	0.58	1.14	0.35	1.22	0.88	1.43	1.77	1.58	0.91	1.14	1.02	0.45	1.10	0.26	1.13	0.24	0.12	0.14
C3'	0.51	1.10	0.15	0.59	0.66	0.26	0.48	0.60	0.62	0.18	0.90	1.38	1.02	0.25	0.42	0.43	1.20	0.34	0.66	0.54	1.17	1.03	0.82
C4	0.59	0.47	0.19	0.20	0.40	0.62	0.51	0.60	0.64	0.39	0.62	0.46	0.38	0.48	0.39	0.30	0.58	0.92	0.47	0.75	0.46	0.32	0.46
C4'	0.08	0.76	0.62	1.28	0.23	0.94	0.16	1.23	0.29	0.41	0.58	1.09	0.61	0.34	0.13	0.38	1.97	0.31	1.25	0.24	1.71	1.49	1.35
C5	0.50	0.77	0.22	0.19	0.53	0.78	0.75	0.81	0.98	0.45	0.99	0.80	0.51	0.66	0.36	0.25	0.46	0.97	0.64	1.12	0.71	0.42	0.65
C5'	0.88	0.13	1.36	2.12	0.60	1.79	0.81	2.14	0.61	1.29	0.24	0.46	0.17	1.20	0.93	1.01	2.79	1.12	2.20	0.71	2.67	2.47	2.31
C6	0.39	1.21	0.25	0.15	0.78	0.87	1.06	0.98	1.40	0.55	1.46	1.31	0.82	0.89	0.44	0.23	0.27	0.94	0.76	1.59	0.94	0.50	0.79
C8	0.74	0.39	0.20	0.30	0.43	0.57	0.41	0.49	0.44	0.42	0.41	0.36	0.46	0.41	0.50	0.30	0.85	1.03	0.45	0.49	0.38	0.32	0.41
N1	0.39	1.17	0.22	0.14	0.74	0.82	1.01	0.93	1.36	0.52	1.43	1.28	0.79	0.85	0.41	0.25	0.26	0.89	0.70	1.55	0.88	0.46	0.74
N3	0.56	0.51	0.18	0.17	0.41	0.60	0.52	0.59	0.68	0.38	0.66	0.51	0.39	0.48	0.38	0.30	0.52	0.86	0.44	0.79	0.44	0.30	0.44
N6	0.31	1.61	0.30	0.15	1.05	0.96	1.37	1.15	1.81	0.69	1.90	1.74	1.14	1.13	0.57	0.19	0.15	0.93	0.89	2.04	1.19	0.60	0.95
N7	0.56	0.61	0.24	0.24	0.45	0.78	0.65	0.78	0.83	0.43	0.80	0.60	0.40	0.60	0.36	0.24	0.59	1.05	0.65	0.95	0.67	0.43	0.64
N9	0.74	0.54	0.19	0.25	0.52	0.49	0.46	0.40	0.47	0.43	0.49	0.55	0.60	0.42	0.54	0.34	0.80	0.93	0.34	0.49	0.28	0.26	0.31
O2'	1.63	2.36	1.16	0.54	1.94	0.80	1.81	0.55	1.96	1.42	2.20	2.57	2.27	1.52	1.67	1.27	0.14	1.38	0.56	1.88	0.15	0.33	0.44
O3'	0.67	1.50	0.33	0.42	0.93	0.25	0.74	0.66	0.93	0.28	1.29	1.86	1.36	0.38	0.62	0.67	0.99	0.39	0.68	0.83	1.33	1.06	0.91
O4'	0.05	0.58	0.67	1.18	0.23	0.70	0.19	0.86	0.28	0.29	0.45	0.80	0.48	0.27	0.12	0.54	1.87	0.11	0.88	0.26	1.17	1.08	0.89
O5'	1.25	0.38	1.84	2.65	1.03	2.15	1.29	2.51	1.07	1.76	0.65	0.16	0.53	1.70	1.37	1.39	3.35	1.43	2.63	1.20	3.08	2.97	2.74
OP1	2.09	1.00	2.58	3.54	1.80	3.20	2.10	3.77	1.82	2.72	1.30	0.47	1.20	2.62	2.22	2.03	4.05	2.39	3.89	1.96	4.43	4.20	4.03
OP2	2.43	1.83	2.90	3.71	2.51	3.07	2.89	3.48	2.72	3.29	2.22	1.31	1.93	3.34	2.78	2.15	4.03	2.51	3.85	2.91	4.15	4.43	3.99
P	2.10	1.25	2.63	3.51	1.95	2.95	2.24	3.33	2.02	2.72	1.56	0.77	1.40	2.67	2.28	2.04	4.08	2.25	3.52	2.16	3.84	3.87	3.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.08	0.01	0.06	0.26	0.03
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.21	0.00	0.10	0.22	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.03	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.20	0.04	0.19	0.15	0.10
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.04	0.06	0.09	0.06	0.09	0.06	0.09	0.04	0.00	0.01	0.01	0.29	0.07	0.26	0.09	0.18
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.22	0.01	0.10	0.22	0.06
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.06	0.28	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.27	0.01	0.10	0.19	0.09
C5'	0.03	0.10	0.03	0.04	0.09	0.01	0.11	0.00	0.13	0.10	0.12	0.10	0.08	0.12	0.08	0.02	0.05	0.01	0.02	0.14	0.08	0.33	0.03
C6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.27	0.00	0.11	0.18	0.10
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.05	0.27	0.01	0.09	0.21	0.08
N1	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.25	0.00	0.11	0.20	0.09
N2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.03	0.19	0.01	0.10	0.22	0.06
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.18	0.00	0.09	0.23	0.05
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.05	0.30	0.01	0.11	0.18	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.19	0.01	0.09	0.23	0.05
O2'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.06	0.01	0.09	0.03	0.15	0.18	0.04
O3'	0.03	0.05	0.04	0.01	0.05	0.03	0.10	0.05	0.10	0.12	0.07	0.09	0.05	0.14	0.05	0.06	0.00	0.03	0.26	0.13	0.28	0.03	0.19
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.10	0.04	0.03	0.34	0.12
O5'	0.08	0.21	0.20	0.29	0.22	0.02	0.27	0.02	0.27	0.27	0.25	0.19	0.18	0.30	0.19	0.09	0.26	0.10	0.00	0.29	0.01	0.03	0.01
O6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.13	0.04	0.29	0.00	0.11	0.16	0.11
OP1	0.06	0.10	0.19	0.26	0.10	0.06	0.10	0.08	0.11	0.09	0.11	0.10	0.09	0.11	0.09	0.15	0.28	0.03	0.01	0.11	0.00	0.06	0.00
OP2	0.26	0.22	0.15	0.09	0.22	0.28	0.19	0.33	0.18	0.21	0.20	0.22	0.23	0.18	0.23	0.18	0.03	0.34	0.03	0.16	0.06	0.00	0.01
P	0.03	0.06	0.10	0.18	0.06	0.04	0.09	0.03	0.10	0.08	0.09	0.06	0.05	0.11	0.05	0.04	0.19	0.12	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00