Doublet Group distance statistics: 52360

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N6	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.013, 0.030, 0.048, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.014, 0.035, 0.055, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.035 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.015, 0.037, 0.060, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.037 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.016, 0.040, 0.064, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.040 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.018, 0.046, 0.074, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.046 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.022, 0.053, 0.085, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.053 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.022, 0.055, 0.088, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.055 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.027, 0.066, 0.105, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.066 std_dev=0.039
O2'	B	0, 0.121, 0.296, 0.470, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.296 std_dev=0.174
O4'	A	0, 0.163, 0.462, 0.761, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.462 std_dev=0.299
C2'	A	0, 0.189, 0.569, 0.949, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.569 std_dev=0.380
O5'	A	0, -0.012, 0.472, 0.956, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.472 std_dev=0.484
C4'	A	0, 0.315, 0.815, 1.316, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.815 std_dev=0.500
O2'	A	0, 0.309, 0.868, 1.427, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.868 std_dev=0.559
C2'	B	0, 0.343, 0.917, 1.490, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.917 std_dev=0.573
C3'	A	0, 0.428, 1.024, 1.619, 1.443 max_d=1.443 avg_d=1.024 std_dev=0.596
P	A	0, 0.126, 0.732, 1.338, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.732 std_dev=0.606
C3'	B	0, 0.492, 1.174, 1.857, 1.684 max_d=1.684 avg_d=1.174 std_dev=0.682
C5'	A	0, 0.229, 0.920, 1.611, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.920 std_dev=0.691
O3'	B	0, 0.140, 0.832, 1.525, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.832 std_dev=0.692
OP1	A	0, 0.532, 1.262, 1.992, 1.749 max_d=1.749 avg_d=1.262 std_dev=0.730
OP2	A	0, 0.536, 1.297, 2.058, 1.938 max_d=1.938 avg_d=1.297 std_dev=0.761
C8	B	0, 0.502, 1.349, 2.196, 2.341 max_d=2.341 avg_d=1.349 std_dev=0.847
C1'	B	0, 0.624, 1.618, 2.611, 2.469 max_d=2.469 avg_d=1.618 std_dev=0.993
O3'	A	0, 0.735, 1.757, 2.779, 2.522 max_d=2.522 avg_d=1.757 std_dev=1.022
C4'	B	0, 0.779, 1.857, 2.935, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.857 std_dev=1.078
N7	B	0, 0.636, 1.759, 2.881, 3.127 max_d=3.127 avg_d=1.759 std_dev=1.123
N9	B	0, 0.754, 1.889, 3.024, 2.794 max_d=2.794 avg_d=1.889 std_dev=1.135
O4'	B	0, 0.949, 2.378, 3.807, 3.532 max_d=3.532 avg_d=2.378 std_dev=1.429
C5'	B	0, 0.866, 2.449, 4.032, 3.893 max_d=3.893 avg_d=2.449 std_dev=1.583
O5'	B	0, 1.058, 2.668, 4.277, 4.029 max_d=4.029 avg_d=2.668 std_dev=1.609
C5	B	0, 1.216, 3.001, 4.786, 4.370 max_d=4.370 avg_d=3.001 std_dev=1.785
C4	B	0, 1.067, 3.115, 5.163, 4.954 max_d=4.954 avg_d=3.115 std_dev=2.048
P	B	0, 0.807, 3.015, 5.223, 5.176 max_d=5.176 avg_d=3.015 std_dev=2.208
OP1	B	0, 1.107, 3.506, 5.905, 5.737 max_d=5.737 avg_d=3.506 std_dev=2.399
O6	B	0, 1.787, 4.347, 6.908, 6.261 max_d=6.261 avg_d=4.347 std_dev=2.561
C6	B	0, 1.626, 4.228, 6.830, 6.407 max_d=6.407 avg_d=4.228 std_dev=2.602
N3	B	0, 1.118, 4.275, 7.432, 7.310 max_d=7.310 avg_d=4.275 std_dev=3.157
OP2	B	0, 0.654, 3.984, 7.314, 7.319 max_d=7.319 avg_d=3.984 std_dev=3.330
N1	B	0, 1.735, 5.418, 9.102, 8.838 max_d=8.838 avg_d=5.418 std_dev=3.683
C2	B	0, 1.444, 5.410, 9.377, 9.219 max_d=9.219 avg_d=5.410 std_dev=3.966
N2	B	0, 1.501, 6.683, 11.865, 11.741 max_d=11.741 avg_d=6.683 std_dev=5.182

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.10	0.15	0.15	0.11
C2	0.03	0.00	0.16	0.18	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.18	0.03	0.21	0.48	0.23	0.29
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.08	0.02	0.04	0.08	0.07	0.09	0.12	0.17	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.00	0.20	0.20	0.30	0.23
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.19	0.20	0.18	0.17	0.21	0.21	0.12	0.02	0.01	0.02	0.07	0.13	0.07	0.08
C4	0.01	0.00	0.08	0.14	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.10	0.02	0.24	0.48	0.23	0.30
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.08	0.15	0.05	0.06	0.10	0.15	0.06	0.16	0.01	0.00	0.00	0.10	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.09	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.16	0.02	0.34	0.67	0.31	0.44
C5'	0.05	0.09	0.08	0.01	0.14	0.00	0.24	0.00	0.23	0.30	0.16	0.06	0.28	0.32	0.16	0.09	0.10	0.01	0.01	0.15	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.19	0.01	0.08	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.17	0.03	0.34	0.72	0.32	0.47
C8	0.02	0.01	0.09	0.20	0.00	0.15	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.21	0.01	0.37	0.62	0.31	0.42
N1	0.02	0.00	0.12	0.18	0.01	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.03	0.28	0.62	0.27	0.39
N3	0.03	0.00	0.17	0.17	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.16	0.02	0.17	0.39	0.20	0.23
N6	0.02	0.01	0.05	0.21	0.01	0.10	0.01	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.22	0.03	0.39	0.84	0.38	0.55
N7	0.01	0.01	0.07	0.21	0.00	0.15	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.23	0.02	0.41	0.77	0.38	0.53
N9	0.00	0.00	0.02	0.12	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.01	0.22	0.41	0.21	0.26
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.10	0.16	0.10	0.09	0.11	0.10	0.13	0.15	0.11	0.11	0.07	0.00	0.04	0.10	0.12	0.13	0.28	0.17
O3'	0.06	0.18	0.02	0.01	0.10	0.01	0.16	0.10	0.17	0.21	0.17	0.16	0.22	0.23	0.08	0.04	0.00	0.05	0.11	0.11	0.14	0.09
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.10	0.05	0.00	0.05	0.08	0.04	0.04
O5'	0.10	0.21	0.20	0.07	0.24	0.00	0.34	0.01	0.34	0.37	0.28	0.17	0.39	0.41	0.22	0.12	0.11	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.15	0.48	0.20	0.13	0.48	0.10	0.67	0.15	0.72	0.62	0.62	0.39	0.84	0.77	0.41	0.13	0.11	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.23	0.30	0.07	0.23	0.06	0.31	0.15	0.32	0.31	0.27	0.20	0.38	0.38	0.21	0.28	0.14	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.29	0.23	0.08	0.30	0.02	0.44	0.01	0.47	0.42	0.39	0.23	0.55	0.53	0.26	0.17	0.09	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.67	0.65	0.29	0.16	0.80	0.62	0.94	0.74	0.93	1.00	0.79	0.52	0.63	1.05	0.84	0.08	0.10	0.87	0.45	1.01	0.68	0.36	0.40
C2	0.45	0.63	0.04	0.31	0.55	0.14	0.84	0.17	0.77	1.16	0.61	0.97	0.50	1.20	0.71	0.07	0.39	0.42	0.71	0.94	0.63	0.90	0.70
C2'	0.37	0.26	0.14	0.12	0.38	0.38	0.53	0.51	0.47	0.73	0.32	0.38	0.23	0.73	0.50	0.23	0.23	0.55	0.32	0.56	0.70	0.30	0.36
C3'	0.29	0.32	0.05	0.03	0.29	0.35	0.36	0.42	0.33	0.49	0.29	0.43	0.29	0.48	0.35	0.26	0.19	0.49	0.35	0.36	0.69	0.39	0.38
C4	0.56	0.51	0.11	0.22	0.67	0.10	0.91	0.08	0.86	1.14	0.64	0.61	0.46	1.18	0.79	0.07	0.35	0.60	0.47	0.99	0.50	0.52	0.44
C4'	0.42	0.48	0.16	0.23	0.52	0.67	0.56	0.85	0.58	0.54	0.54	0.42	0.47	0.58	0.50	0.19	0.03	0.68	0.75	0.60	1.03	0.80	0.77
C5	0.49	0.52	0.03	0.41	0.62	0.22	0.90	0.28	0.84	1.18	0.61	0.72	0.44	1.22	0.77	0.07	0.49	0.45	0.88	0.99	0.84	0.92	0.85
C5'	0.27	0.51	0.14	0.27	0.40	0.64	0.37	0.82	0.43	0.24	0.49	0.55	0.47	0.29	0.31	0.31	0.07	0.54	0.80	0.41	1.03	0.92	0.81
C6	0.38	0.67	0.09	0.53	0.52	0.44	0.83	0.57	0.77	1.18	0.61	1.04	0.53	1.23	0.68	0.07	0.55	0.27	1.17	0.95	1.09	1.32	1.16
C8	0.67	0.60	0.16	0.18	0.81	0.24	0.99	0.25	0.95	1.11	0.77	0.47	0.58	1.15	0.88	0.07	0.37	0.79	0.33	1.05	0.50	0.24	0.31
N1	0.38	0.73	0.07	0.46	0.51	0.35	0.81	0.46	0.75	1.17	0.63	1.15	0.58	1.22	0.66	0.07	0.49	0.29	1.04	0.93	0.94	1.25	1.04
N3	0.53	0.54	0.11	0.18	0.63	0.12	0.88	0.10	0.83	1.13	0.62	0.72	0.46	1.18	0.76	0.07	0.31	0.57	0.43	0.97	0.44	0.54	0.39
N6	0.28	0.80	0.19	0.68	0.46	0.69	0.79	0.92	0.73	1.18	0.64	1.24	0.64	1.24	0.60	0.08	0.64	0.14	1.53	0.93	1.46	1.73	1.54
N7	0.56	0.50	0.03	0.43	0.71	0.20	0.96	0.25	0.90	1.18	0.66	0.51	0.45	1.22	0.83	0.07	0.53	0.54	0.87	1.03	0.89	0.79	0.83
N9	0.65	0.57	0.20	0.06	0.77	0.35	0.95	0.39	0.92	1.09	0.73	0.47	0.55	1.13	0.85	0.07	0.25	0.78	0.20	1.02	0.41	0.12	0.11
O2'	0.41	0.33	0.17	0.15	0.45	0.52	0.60	0.70	0.56	0.74	0.42	0.37	0.31	0.76	0.54	0.23	0.17	0.62	0.57	0.64	0.86	0.49	0.57
O3'	0.36	0.61	0.26	0.15	0.42	0.31	0.39	0.33	0.43	0.39	0.53	0.77	0.56	0.39	0.37	0.47	0.31	0.47	0.36	0.41	0.73	0.44	0.42
O4'	0.79	0.94	0.42	0.37	0.96	0.91	1.03	1.06	1.06	0.96	1.02	0.86	0.91	1.03	0.92	0.11	0.11	1.05	0.80	1.10	0.95	0.74	0.73
O5'	0.27	0.34	0.06	0.14	0.32	0.48	0.31	0.51	0.33	0.26	0.35	0.34	0.34	0.28	0.29	0.19	0.01	0.47	0.45	0.33	0.52	0.54	0.37
OP1	0.11	0.62	0.26	0.04	0.22	0.21	0.14	0.24	0.23	0.42	0.46	0.86	0.54	0.33	0.16	0.46	0.01	0.09	0.36	0.18	0.24	0.51	0.19
OP2	0.28	0.17	0.37	0.10	0.26	0.07	0.33	0.06	0.30	0.41	0.23	0.11	0.16	0.40	0.32	0.62	0.01	0.14	0.19	0.34	0.25	0.39	0.08
P	0.05	0.23	0.18	0.00	0.07	0.21	0.04	0.21	0.07	0.20	0.17	0.33	0.21	0.15	0.07	0.38	0.00	0.14	0.28	0.05	0.26	0.45	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.02	0.67	0.35	0.08
C2	0.05	0.00	0.59	0.46	0.00	0.21	0.00	0.59	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.57	0.11	0.26	0.85	0.01	0.72	1.70	1.26
C2'	0.00	0.59	0.00	0.00	0.30	0.01	0.14	0.09	0.26	0.30	0.46	0.71	0.59	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.18	0.68	0.50	0.07
C3'	0.00	0.46	0.00	0.00	0.19	0.00	0.07	0.01	0.17	0.24	0.34	0.58	0.44	0.16	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.12	0.42	0.38	0.06
C4	0.02	0.00	0.30	0.19	0.00	0.10	0.00	0.27	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.06	0.14	0.26	0.01	0.35	0.76	0.35
C4'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.12	0.16	0.16	0.27	0.21	0.15	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.33	0.19	0.03
C5	0.01	0.00	0.14	0.07	0.00	0.10	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.04	0.07	0.04	0.00	0.76	0.50	0.19
C5'	0.09	0.59	0.09	0.01	0.27	0.00	0.29	0.00	0.31	0.46	0.44	0.78	0.56	0.43	0.23	0.08	0.03	0.01	0.01	0.32	0.32	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.26	0.17	0.01	0.12	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.06	0.12	0.21	0.00	0.45	0.75	0.38
C8	0.02	0.01	0.30	0.24	0.00	0.16	0.00	0.46	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.04	0.09	0.45	0.01	1.54	0.43	0.71
N1	0.03	0.00	0.46	0.34	0.00	0.16	0.00	0.44	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.48	0.09	0.20	0.58	0.01	0.34	1.29	0.90
N2	0.06	0.00	0.71	0.58	0.01	0.27	0.00	0.78	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.67	0.13	0.32	1.19	0.01	1.41	2.31	1.84
N3	0.05	0.01	0.59	0.44	0.00	0.21	0.00	0.56	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.53	0.11	0.26	0.76	0.01	0.48	1.47	1.04
N7	0.01	0.00	0.16	0.16	0.01	0.15	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.03	0.04	0.36	0.01	1.43	0.42	0.60
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.10	0.01	0.88	0.33	0.18
O2'	0.00	0.57	0.00	0.01	0.31	0.01	0.20	0.08	0.31	0.21	0.48	0.67	0.53	0.08	0.06	0.00	0.02	0.02	0.06	0.25	0.67	0.58	0.07
O3'	0.03	0.11	0.01	0.00	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.04	0.09	0.13	0.11	0.03	0.02	0.02	0.00	0.09	0.03	0.04	0.35	0.33	0.08
O4'	0.00	0.26	0.01	0.02	0.14	0.00	0.07	0.01	0.12	0.09	0.20	0.32	0.26	0.04	0.01	0.02	0.09	0.00	0.12	0.09	0.46	0.21	0.07
O5'	0.09	0.85	0.07	0.04	0.26	0.01	0.04	0.01	0.21	0.45	0.58	1.19	0.76	0.36	0.10	0.06	0.03	0.12	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.18	0.12	0.01	0.12	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.04	0.09	0.11	0.00	0.65	0.61	0.30
OP1	0.67	0.72	0.68	0.42	0.35	0.33	0.76	0.32	0.45	1.54	0.34	1.41	0.48	1.43	0.88	0.67	0.35	0.46	0.01	0.65	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	1.70	0.50	0.38	0.76	0.19	0.50	0.17	0.75	0.43	1.29	2.31	1.47	0.42	0.33	0.58	0.33	0.21	0.01	0.61	0.01	0.00	0.00
P	0.08	1.26	0.07	0.06	0.35	0.03	0.19	0.01	0.38	0.71	0.90	1.84	1.04	0.60	0.18	0.07	0.08	0.07	0.00	0.30	0.01	0.00	0.00