Doublet Group distance statistics: 52365

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.004, 0.028, 0.053, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.028 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.006, 0.031, 0.057, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.011, 0.036, 0.062, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.036 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.012, 0.041, 0.071, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.041 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.015, 0.054, 0.093, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.054 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.038, 0.144, 0.249, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.144 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.004, 0.169, 0.334, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.169 std_dev=0.165
C4'	A	0, 0.134, 0.485, 0.837, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.485 std_dev=0.352
O3'	B	0, 0.146, 0.522, 0.898, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.522 std_dev=0.376
C5'	A	0, 0.176, 0.629, 1.081, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.629 std_dev=0.452
C3'	B	0, 0.202, 0.692, 1.182, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.692 std_dev=0.490
P	A	0, 0.206, 0.708, 1.210, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.708 std_dev=0.502
C3'	A	0, 0.211, 0.730, 1.249, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.730 std_dev=0.519
C2'	B	0, 0.229, 0.783, 1.337, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.783 std_dev=0.554
O2'	B	0, 0.236, 0.817, 1.398, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.817 std_dev=0.581
OP1	A	0, 0.255, 0.869, 1.483, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.869 std_dev=0.614
O2'	A	0, 0.229, 0.938, 1.647, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.938 std_dev=0.709
C4'	B	0, 0.320, 1.109, 1.898, 1.771 max_d=1.771 avg_d=1.109 std_dev=0.789
C1'	B	0, 0.305, 1.127, 1.949, 1.936 max_d=1.936 avg_d=1.127 std_dev=0.822
O4'	B	0, 0.331, 1.202, 2.073, 2.037 max_d=2.037 avg_d=1.202 std_dev=0.871
O5'	A	0, 0.348, 1.230, 2.112, 2.026 max_d=2.026 avg_d=1.230 std_dev=0.882
O3'	A	0, 0.405, 1.398, 2.391, 2.211 max_d=2.211 avg_d=1.398 std_dev=0.993
OP2	A	0, 0.386, 1.407, 2.427, 2.388 max_d=2.388 avg_d=1.407 std_dev=1.020
C5'	B	0, 0.561, 1.955, 3.349, 3.154 max_d=3.154 avg_d=1.955 std_dev=1.394
N9	B	0, 0.581, 1.994, 3.407, 3.102 max_d=3.102 avg_d=1.994 std_dev=1.413
O5'	B	0, 0.522, 1.957, 3.392, 3.400 max_d=3.400 avg_d=1.957 std_dev=1.435
C8	B	0, 0.749, 2.557, 4.364, 3.843 max_d=3.843 avg_d=2.557 std_dev=1.808
C4	B	0, 0.761, 2.597, 4.433, 3.916 max_d=3.916 avg_d=2.597 std_dev=1.836
N3	B	0, 0.798, 2.725, 4.652, 4.117 max_d=4.117 avg_d=2.725 std_dev=1.927
P	B	0, 0.816, 2.787, 4.757, 4.212 max_d=4.212 avg_d=2.787 std_dev=1.971
OP2	B	0, 0.827, 2.983, 5.140, 5.023 max_d=5.023 avg_d=2.983 std_dev=2.156
OP1	B	0, 0.901, 3.118, 5.335, 4.963 max_d=4.963 avg_d=3.118 std_dev=2.217
N7	B	0, 0.961, 3.285, 5.609, 5.005 max_d=5.005 avg_d=3.285 std_dev=2.324
C5	B	0, 0.965, 3.296, 5.627, 5.014 max_d=5.014 avg_d=3.296 std_dev=2.331
C2	B	0, 1.029, 3.521, 6.014, 5.429 max_d=5.429 avg_d=3.521 std_dev=2.493
N2	B	0, 1.143, 3.927, 6.712, 6.139 max_d=6.139 avg_d=3.927 std_dev=2.784
C6	B	0, 1.184, 4.055, 6.926, 6.255 max_d=6.255 avg_d=4.055 std_dev=2.871
N1	B	0, 1.193, 4.089, 6.986, 6.332 max_d=6.332 avg_d=4.089 std_dev=2.896
O6	B	0, 1.384, 4.748, 8.111, 7.378 max_d=7.378 avg_d=4.748 std_dev=3.364

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.13	0.11	0.31	0.14
C2	0.03	0.00	0.16	0.14	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.40	0.18	0.06	0.21	0.19	0.26	0.18
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.12	0.02	0.11	0.04	0.13	0.03	0.15	0.15	0.12	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.15	0.14	0.37	0.11
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.13	0.00	0.16	0.03	0.17	0.17	0.16	0.13	0.19	0.19	0.10	0.07	0.01	0.01	0.22	0.21	0.24	0.08
C4	0.02	0.00	0.12	0.13	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.12	0.06	0.23	0.19	0.26	0.18
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.09	0.02	0.03	0.06	0.09	0.03	0.17	0.03	0.01	0.03	0.05	0.29	0.05
C5	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.17	0.06	0.28	0.24	0.30	0.22
C5'	0.04	0.05	0.04	0.03	0.08	0.00	0.13	0.00	0.12	0.16	0.08	0.04	0.15	0.17	0.08	0.14	0.02	0.02	0.01	0.08	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.13	0.17	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.31	0.19	0.07	0.28	0.26	0.33	0.23
C8	0.00	0.00	0.03	0.17	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.09	0.17	0.04	0.30	0.22	0.26	0.20
N1	0.03	0.00	0.15	0.16	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.19	0.07	0.25	0.23	0.30	0.21
N3	0.02	0.00	0.15	0.13	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.16	0.06	0.18	0.17	0.26	0.16
N6	0.02	0.01	0.12	0.19	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.29	0.22	0.08	0.31	0.30	0.40	0.27
N7	0.01	0.00	0.07	0.19	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.16	0.21	0.05	0.32	0.26	0.34	0.24
N9	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.08	0.04	0.22	0.17	0.26	0.16
O2'	0.05	0.40	0.00	0.07	0.28	0.17	0.25	0.14	0.31	0.09	0.38	0.37	0.29	0.16	0.15	0.00	0.10	0.11	0.20	0.20	0.32	0.08
O3'	0.03	0.18	0.03	0.01	0.12	0.03	0.17	0.02	0.19	0.17	0.19	0.16	0.22	0.21	0.08	0.10	0.00	0.03	0.22	0.31	0.16	0.13
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.07	0.06	0.08	0.05	0.04	0.11	0.03	0.00	0.14	0.08	0.31	0.15
O5'	0.13	0.21	0.15	0.22	0.23	0.03	0.28	0.01	0.28	0.30	0.25	0.18	0.31	0.32	0.22	0.20	0.22	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.11	0.19	0.14	0.21	0.19	0.05	0.24	0.08	0.26	0.22	0.23	0.17	0.30	0.26	0.17	0.20	0.31	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.26	0.37	0.24	0.26	0.29	0.30	0.26	0.33	0.26	0.30	0.26	0.40	0.34	0.26	0.32	0.16	0.31	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.18	0.11	0.08	0.18	0.05	0.22	0.01	0.23	0.20	0.21	0.16	0.27	0.24	0.16	0.08	0.13	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.30	0.08	0.26	0.30	0.33	0.61	0.50	0.53	0.76	0.21	0.61	0.26	0.89	0.42	0.23	0.11	0.34	0.43	0.69	0.45	0.79	0.55
C2	0.13	1.08	0.16	0.19	0.37	0.40	0.25	0.71	0.52	0.52	1.00	1.41	0.77	0.52	0.18	0.27	0.16	0.35	0.68	0.41	0.89	1.18	0.92
C2'	0.19	0.26	0.05	0.22	0.35	0.27	0.66	0.43	0.66	0.73	0.37	0.48	0.21	0.89	0.41	0.23	0.06	0.30	0.37	0.85	0.41	0.76	0.51
C3'	0.13	0.27	0.02	0.08	0.38	0.07	0.64	0.17	0.71	0.58	0.52	0.20	0.18	0.75	0.36	0.26	0.14	0.14	0.13	0.86	0.17	0.43	0.22
C4	0.17	0.94	0.17	0.20	0.35	0.38	0.22	0.64	0.35	0.53	0.77	1.20	0.73	0.53	0.21	0.26	0.15	0.34	0.58	0.22	0.73	1.03	0.78
C4'	0.24	0.39	0.14	0.11	0.51	0.10	0.75	0.17	0.80	0.67	0.63	0.21	0.29	0.82	0.47	0.29	0.12	0.20	0.13	0.90	0.03	0.38	0.17
C5	0.24	1.10	0.23	0.15	0.59	0.37	0.48	0.66	0.74	0.34	1.06	1.25	0.88	0.26	0.30	0.24	0.18	0.33	0.61	0.63	0.84	1.09	0.84
C5'	0.20	0.35	0.19	0.07	0.39	0.13	0.54	0.09	0.59	0.47	0.50	0.26	0.26	0.57	0.34	0.33	0.25	0.13	0.09	0.66	0.22	0.09	0.10
C6	0.24	1.24	0.23	0.13	0.68	0.38	0.66	0.70	1.01	0.31	1.30	1.40	0.95	0.30	0.33	0.24	0.19	0.32	0.68	0.98	0.98	1.21	0.96
C8	0.26	0.72	0.23	0.19	0.38	0.33	0.20	0.52	0.31	0.34	0.57	0.86	0.65	0.28	0.24	0.22	0.15	0.32	0.45	0.19	0.57	0.80	0.60
N1	0.17	1.23	0.20	0.16	0.56	0.40	0.49	0.72	0.87	0.36	1.26	1.47	0.90	0.31	0.24	0.26	0.18	0.32	0.71	0.84	0.98	1.23	0.98
N3	0.13	0.91	0.13	0.21	0.24	0.39	0.25	0.67	0.27	0.63	0.72	1.27	0.65	0.70	0.23	0.27	0.14	0.35	0.62	0.26	0.76	1.09	0.82
N6	0.30	1.29	0.26	0.09	0.82	0.35	0.89	0.68	1.25	0.34	1.42	1.40	1.01	0.52	0.45	0.22	0.21	0.30	0.70	1.33	1.09	1.24	1.01
N7	0.32	0.96	0.26	0.13	0.62	0.34	0.52	0.59	0.69	0.27	0.91	1.06	0.83	0.22	0.37	0.22	0.18	0.34	0.53	0.60	0.76	0.94	0.73
N9	0.19	0.67	0.15	0.23	0.23	0.36	0.25	0.56	0.17	0.58	0.44	0.91	0.56	0.61	0.26	0.24	0.13	0.34	0.49	0.21	0.58	0.88	0.64
O2'	0.17	0.30	0.06	0.17	0.45	0.23	0.87	0.45	0.94	0.86	0.57	0.50	0.21	1.11	0.48	0.38	0.07	0.29	0.40	1.23	0.41	0.85	0.56
O3'	0.24	0.60	0.11	0.06	0.60	0.05	0.87	0.14	1.02	0.70	0.88	0.46	0.43	0.91	0.50	0.26	0.20	0.18	0.10	1.19	0.18	0.36	0.17
O4'	0.21	0.07	0.06	0.22	0.39	0.24	0.66	0.37	0.61	0.72	0.33	0.24	0.05	0.83	0.45	0.22	0.07	0.28	0.31	0.71	0.26	0.58	0.37
O5'	0.34	0.35	0.36	0.15	0.42	0.12	0.48	0.11	0.47	0.47	0.41	0.27	0.34	0.50	0.41	0.39	0.02	0.23	0.10	0.48	0.19	0.16	0.12
OP1	0.21	0.30	0.30	0.04	0.29	0.06	0.35	0.28	0.37	0.32	0.33	0.30	0.27	0.38	0.26	0.45	0.02	0.06	0.25	0.40	0.35	0.25	0.26
OP2	0.21	0.30	0.12	0.21	0.34	0.32	0.41	0.48	0.43	0.35	0.38	0.25	0.28	0.42	0.29	0.10	0.02	0.32	0.44	0.47	0.61	0.42	0.50
P	0.09	0.16	0.17	0.01	0.22	0.09	0.31	0.23	0.31	0.29	0.25	0.10	0.13	0.35	0.19	0.25	0.01	0.04	0.20	0.35	0.29	0.15	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.19	0.02	0.23	0.42	0.13
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.03	0.37	0.01	0.26	0.38	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.03	0.07	0.12	0.04	0.08	0.07	0.12	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.08	0.18	0.28	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.13	0.00	0.20	0.02	0.18	0.27	0.11	0.10	0.08	0.28	0.15	0.02	0.00	0.01	0.05	0.21	0.13	0.15	0.03
C4	0.02	0.00	0.05	0.13	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.05	0.42	0.01	0.28	0.38	0.23
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.16	0.24	0.11	0.05	0.06	0.24	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.21	0.16	0.03
C5	0.02	0.00	0.08	0.20	0.00	0.18	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.20	0.07	0.55	0.00	0.31	0.34	0.29
C5'	0.05	0.17	0.03	0.02	0.23	0.00	0.33	0.00	0.32	0.39	0.24	0.13	0.15	0.42	0.23	0.01	0.03	0.03	0.01	0.36	0.11	0.08	0.03
C6	0.02	0.00	0.07	0.18	0.00	0.16	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.06	0.55	0.00	0.30	0.34	0.30
C8	0.01	0.00	0.12	0.27	0.00	0.24	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.27	0.08	0.58	0.00	0.33	0.34	0.28
N1	0.02	0.00	0.04	0.11	0.00	0.11	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.05	0.47	0.00	0.29	0.36	0.26
N2	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.02	0.32	0.02	0.24	0.39	0.20
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.11	0.03	0.33	0.01	0.26	0.39	0.20
N7	0.02	0.00	0.12	0.28	0.00	0.24	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.29	0.08	0.63	0.01	0.33	0.31	0.33
N9	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.13	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.14	0.06	0.41	0.01	0.28	0.39	0.20
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.03	0.10	0.07	0.07	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.03	0.26	0.24	0.03
O3'	0.03	0.09	0.03	0.00	0.11	0.01	0.20	0.03	0.17	0.27	0.09	0.15	0.11	0.29	0.14	0.06	0.00	0.02	0.08	0.21	0.13	0.14	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.06	0.08	0.05	0.02	0.03	0.08	0.06	0.02	0.02	0.00	0.16	0.07	0.25	0.40	0.13
O5'	0.19	0.37	0.09	0.05	0.42	0.01	0.55	0.01	0.55	0.58	0.47	0.32	0.33	0.63	0.41	0.01	0.08	0.16	0.00	0.60	0.03	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.21	0.01	0.19	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.21	0.07	0.60	0.00	0.32	0.32	0.33
OP1	0.23	0.26	0.18	0.13	0.28	0.21	0.31	0.11	0.30	0.33	0.29	0.24	0.26	0.33	0.28	0.26	0.13	0.25	0.03	0.32	0.00	0.02	0.01
OP2	0.42	0.38	0.28	0.15	0.38	0.16	0.34	0.08	0.34	0.34	0.36	0.39	0.39	0.31	0.39	0.24	0.14	0.40	0.01	0.32	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.22	0.06	0.03	0.23	0.03	0.29	0.03	0.30	0.28	0.26	0.20	0.20	0.33	0.20	0.03	0.07	0.13	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00