Doublet Group distance statistics: 52366

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.009, 0.031, 0.054, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.006, 0.029, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.010, 0.033, 0.057, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.011, 0.039, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.039 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.011, 0.041, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.041 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.008, 0.050, 0.092, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.050 std_dev=0.042
N7	A	0, 0.011, 0.057, 0.104, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.057 std_dev=0.047
C8	A	0, 0.015, 0.067, 0.119, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.067 std_dev=0.052
C2'	B	0, 0.112, 0.487, 0.863, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.487 std_dev=0.376
O2'	B	0, 0.136, 0.604, 1.073, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.604 std_dev=0.468
C8	B	0, 0.376, 1.285, 2.194, 1.933 max_d=1.933 avg_d=1.285 std_dev=0.909
C3'	B	0, 0.375, 1.287, 2.199, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.287 std_dev=0.912
O4'	A	0, 0.407, 1.392, 2.377, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.392 std_dev=0.985
C2'	A	0, 0.416, 1.420, 2.425, 2.153 max_d=2.153 avg_d=1.420 std_dev=1.004
C4'	A	0, 0.453, 1.552, 2.651, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.552 std_dev=1.099
C1'	B	0, 0.449, 1.560, 2.671, 2.502 max_d=2.502 avg_d=1.560 std_dev=1.111
N7	B	0, 0.503, 1.812, 3.121, 3.047 max_d=3.047 avg_d=1.812 std_dev=1.309
N9	B	0, 0.556, 1.900, 3.244, 2.854 max_d=2.854 avg_d=1.900 std_dev=1.344
C3'	A	0, 0.594, 2.032, 3.470, 3.128 max_d=3.128 avg_d=2.032 std_dev=1.438
O3'	B	0, 0.595, 2.039, 3.483, 3.161 max_d=3.161 avg_d=2.039 std_dev=1.444
O2'	A	0, 0.633, 2.163, 3.692, 3.254 max_d=3.254 avg_d=2.163 std_dev=1.529
C4'	B	0, 0.640, 2.186, 3.733, 3.315 max_d=3.315 avg_d=2.186 std_dev=1.546
O4'	B	0, 0.655, 2.246, 3.838, 3.490 max_d=3.490 avg_d=2.246 std_dev=1.591
O5'	B	0, 0.765, 2.624, 4.482, 4.076 max_d=4.076 avg_d=2.624 std_dev=1.859
O3'	A	0, 0.805, 2.777, 4.750, 4.391 max_d=4.391 avg_d=2.777 std_dev=1.972
OP2	B	0, 0.840, 2.906, 4.973, 4.623 max_d=4.623 avg_d=2.906 std_dev=2.066
C5'	A	0, 0.936, 3.203, 5.470, 4.927 max_d=4.927 avg_d=3.203 std_dev=2.267
C5'	B	0, 0.941, 3.216, 5.491, 4.902 max_d=4.902 avg_d=3.216 std_dev=2.275
C5	B	0, 0.948, 3.301, 5.654, 5.319 max_d=5.319 avg_d=3.301 std_dev=2.353
C4	B	0, 0.987, 3.376, 5.766, 5.177 max_d=5.177 avg_d=3.376 std_dev=2.389
P	B	0, 1.106, 3.794, 6.482, 5.900 max_d=5.900 avg_d=3.794 std_dev=2.688
O5'	A	0, 1.120, 3.829, 6.537, 5.846 max_d=5.846 avg_d=3.829 std_dev=2.709
N3	B	0, 1.384, 4.728, 8.071, 7.134 max_d=7.134 avg_d=4.728 std_dev=3.343
C6	B	0, 1.380, 4.806, 8.233, 7.745 max_d=7.745 avg_d=4.806 std_dev=3.427
OP2	A	0, 1.418, 4.846, 8.273, 7.369 max_d=7.369 avg_d=4.846 std_dev=3.427
OP1	B	0, 1.445, 4.944, 8.443, 7.583 max_d=7.583 avg_d=4.944 std_dev=3.499
O6	B	0, 1.408, 5.006, 8.604, 8.300 max_d=8.300 avg_d=5.006 std_dev=3.598
P	A	0, 1.497, 5.114, 8.731, 7.754 max_d=7.754 avg_d=5.114 std_dev=3.617
C2	B	0, 1.801, 6.151, 10.501, 9.311 max_d=9.311 avg_d=6.151 std_dev=4.350
OP1	A	0, 1.811, 6.187, 10.563, 9.401 max_d=9.401 avg_d=6.187 std_dev=4.376
N1	B	0, 1.811, 6.218, 10.624, 9.689 max_d=9.689 avg_d=6.218 std_dev=4.406
N2	B	0, 2.243, 7.660, 13.076, 11.555 max_d=11.555 avg_d=7.660 std_dev=5.416

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.33	0.32	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.13	0.00	0.27	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.05	0.26	0.48	1.17	0.36	0.76
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.24	0.45	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.08	0.28	0.03	0.14	0.13	0.26	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.41	0.08
C4	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.14	0.17	0.77	0.07	0.38
C4'	0.01	0.27	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.07	0.22	0.18	0.26	0.03	0.16	0.05	0.16	0.03	0.01	0.00	0.14	0.38	0.08
C5	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.16	0.07	0.08	0.72	0.08	0.30
C5'	0.01	0.50	0.02	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.13	0.38	0.35	0.46	0.05	0.29	0.08	0.13	0.03	0.00	0.00	0.13	0.18	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.14	0.13	0.18	0.93	0.19	0.49
C8	0.01	0.00	0.03	0.28	0.00	0.22	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.24	0.14	0.35	0.26	0.35	0.17
N1	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.18	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.06	0.21	0.37	1.13	0.34	0.70
N3	0.02	0.00	0.08	0.14	0.00	0.26	0.00	0.46	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.06	0.26	0.42	1.01	0.23	0.64
N6	0.02	0.00	0.06	0.13	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.18	0.09	0.12	0.89	0.18	0.44
N7	0.01	0.00	0.02	0.26	0.00	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.25	0.07	0.26	0.42	0.22	0.09
N9	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.01	0.09	0.46	0.22	0.11
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.10	0.16	0.15	0.13	0.14	0.21	0.13	0.16	0.17	0.21	0.12	0.00	0.08	0.11	0.21	0.08	0.78	0.33
O3'	0.02	0.05	0.06	0.01	0.08	0.03	0.16	0.03	0.14	0.24	0.06	0.06	0.18	0.25	0.12	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.56	0.21
O4'	0.01	0.26	0.01	0.01	0.14	0.01	0.07	0.00	0.13	0.14	0.21	0.26	0.09	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.05	0.32	0.26	0.06
O5'	0.04	0.48	0.01	0.00	0.17	0.00	0.08	0.00	0.18	0.35	0.37	0.42	0.12	0.26	0.09	0.21	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.33	1.17	0.24	0.15	0.77	0.14	0.72	0.13	0.93	0.26	1.13	1.01	0.89	0.42	0.46	0.08	0.01	0.32	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.36	0.45	0.41	0.07	0.38	0.08	0.18	0.19	0.35	0.34	0.23	0.18	0.22	0.22	0.78	0.56	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.76	0.05	0.08	0.38	0.08	0.30	0.01	0.49	0.17	0.70	0.64	0.44	0.09	0.11	0.33	0.21	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.61	1.37	0.24	0.21	0.95	0.18	0.89	0.02	1.08	0.47	1.30	1.58	1.21	0.61	0.67	0.36	0.61	0.67	0.10	1.06	0.49	0.09	0.10
C2	0.58	2.13	0.22	0.39	1.29	0.23	1.25	0.55	1.66	0.46	2.07	2.56	1.75	0.76	0.76	0.33	0.78	0.42	0.35	1.67	1.34	0.43	0.72
C2'	0.86	1.68	0.47	0.16	1.20	0.33	1.11	0.08	1.32	0.67	1.59	1.95	1.50	0.80	0.90	0.60	0.41	0.84	0.14	1.29	0.52	0.08	0.10
C3'	1.24	1.86	0.90	0.55	1.48	0.74	1.40	0.48	1.55	1.06	1.76	2.06	1.73	1.15	1.26	1.00	0.24	1.19	0.54	1.52	0.15	0.47	0.32
C4	0.63	1.86	0.24	0.34	1.21	0.12	1.14	0.37	1.45	0.49	1.78	2.18	1.60	0.72	0.77	0.34	0.76	0.54	0.19	1.43	1.03	0.25	0.49
C4'	1.01	1.47	0.73	0.50	1.20	0.70	1.14	0.53	1.26	0.89	1.41	1.61	1.38	0.96	1.03	0.77	0.22	1.04	0.57	1.23	0.17	0.52	0.41
C5	0.61	1.98	0.21	0.40	1.27	0.21	1.20	0.52	1.54	0.48	1.89	2.30	1.69	0.75	0.78	0.31	0.81	0.48	0.31	1.52	1.23	0.34	0.63
C5'	1.40	1.69	1.23	1.05	1.52	1.14	1.47	0.92	1.54	1.29	1.65	1.78	1.64	1.34	1.41	1.25	0.83	1.38	0.96	1.52	0.60	0.91	0.80
C6	0.55	2.19	0.18	0.45	1.33	0.32	1.28	0.68	1.71	0.45	2.12	2.60	1.80	0.77	0.76	0.28	0.83	0.35	0.46	1.71	1.52	0.52	0.85
C8	0.67	1.50	0.24	0.31	1.08	0.09	0.99	0.16	1.19	0.51	1.42	1.68	1.36	0.68	0.75	0.34	0.76	0.69	0.06	1.15	0.67	0.11	0.23
N1	0.55	2.23	0.20	0.43	1.33	0.31	1.29	0.67	1.75	0.44	2.18	2.69	1.82	0.77	0.76	0.30	0.82	0.35	0.45	1.76	1.53	0.54	0.86
N3	0.62	1.95	0.24	0.33	1.23	0.14	1.17	0.40	1.52	0.48	1.88	2.33	1.64	0.73	0.76	0.35	0.73	0.50	0.22	1.51	1.11	0.30	0.54
N6	0.49	2.26	0.14	0.49	1.34	0.40	1.32	0.80	1.80	0.43	2.23	2.70	1.83	0.78	0.73	0.22	0.84	0.25	0.58	1.82	1.74	0.65	1.03
N7	0.63	1.76	0.21	0.39	1.21	0.16	1.13	0.43	1.39	0.50	1.67	1.98	1.56	0.73	0.78	0.30	0.82	0.56	0.23	1.35	1.02	0.23	0.48
N9	0.65	1.58	0.25	0.28	1.08	0.09	1.01	0.16	1.24	0.50	1.50	1.82	1.40	0.68	0.74	0.36	0.71	0.65	0.05	1.22	0.71	0.11	0.26
O2'	0.60	1.36	0.29	0.31	0.87	0.18	0.79	0.12	1.00	0.37	1.27	1.63	1.17	0.49	0.60	0.46	0.66	0.62	0.09	0.98	0.73	0.22	0.31
O3'	1.24	1.79	0.95	0.60	1.44	0.76	1.36	0.50	1.50	1.08	1.70	2.00	1.67	1.15	1.25	1.08	0.32	1.18	0.54	1.46	0.21	0.47	0.35
O4'	0.75	1.31	0.42	0.20	1.01	0.44	0.96	0.32	1.09	0.64	1.26	1.45	1.20	0.75	0.80	0.44	0.21	0.82	0.39	1.08	0.10	0.35	0.23
O5'	1.13	1.30	1.01	0.99	1.22	1.10	1.20	1.00	1.25	1.10	1.29	1.34	1.27	1.14	1.15	0.92	0.86	1.20	1.02	1.24	0.80	0.99	0.91
OP1	0.47	0.61	0.54	0.65	0.53	0.57	0.52	0.54	0.54	0.47	0.59	0.68	0.59	0.49	0.49	0.45	0.75	0.49	0.54	0.54	0.52	0.52	0.49
OP2	0.73	0.93	0.72	0.76	0.81	0.77	0.79	0.72	0.83	0.71	0.90	1.01	0.88	0.73	0.75	0.66	0.77	0.78	0.74	0.83	0.63	0.72	0.66
P	0.88	1.02	0.89	0.92	0.93	0.89	0.92	0.79	0.95	0.85	1.00	1.08	0.99	0.87	0.88	0.83	0.94	0.88	0.80	0.94	0.68	0.77	0.71

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.24	0.18	0.11
C2	0.05	0.00	0.25	0.16	0.01	0.10	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.30	0.23	0.23	0.36	0.01	0.45	0.52	0.42
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.02	0.11	0.15	0.19	0.31	0.25	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.32	0.19	0.14
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.16	0.21	0.15	0.19	0.14	0.21	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.18	0.30	0.11	0.11
C4	0.02	0.01	0.13	0.11	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.12	0.12	0.25	0.00	0.40	0.39	0.31
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.09	0.11	0.10	0.13	0.09	0.11	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.15	0.06	0.24	0.01	0.45	0.42	0.33
C5'	0.03	0.24	0.02	0.01	0.16	0.00	0.16	0.00	0.20	0.08	0.24	0.28	0.21	0.11	0.07	0.05	0.02	0.02	0.00	0.20	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.11	0.16	0.00	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.17	0.11	0.31	0.00	0.50	0.52	0.41
C8	0.01	0.01	0.15	0.21	0.01	0.11	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.25	0.13	0.04	0.01	0.34	0.18	0.11
N1	0.03	0.00	0.19	0.15	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.19	0.18	0.36	0.01	0.50	0.56	0.45
N2	0.06	0.00	0.31	0.19	0.01	0.13	0.00	0.28	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.38	0.31	0.28	0.39	0.00	0.45	0.55	0.44
N3	0.05	0.00	0.25	0.14	0.01	0.09	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.28	0.21	0.22	0.31	0.00	0.40	0.44	0.35
N7	0.01	0.00	0.09	0.21	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.24	0.06	0.13	0.02	0.42	0.29	0.23
N9	0.00	0.02	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.14	0.00	0.33	0.25	0.18
O2'	0.01	0.30	0.00	0.01	0.14	0.06	0.07	0.05	0.13	0.11	0.23	0.38	0.28	0.06	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.09	0.26	0.15	0.09
O3'	0.02	0.23	0.01	0.01	0.12	0.01	0.15	0.02	0.17	0.25	0.19	0.31	0.21	0.24	0.09	0.03	0.00	0.02	0.08	0.20	0.30	0.09	0.12
O4'	0.00	0.23	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.02	0.11	0.13	0.18	0.28	0.22	0.06	0.00	0.05	0.02	0.00	0.07	0.08	0.11	0.08	0.03
O5'	0.09	0.36	0.05	0.03	0.25	0.01	0.24	0.00	0.31	0.04	0.36	0.39	0.31	0.13	0.14	0.01	0.08	0.07	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.18	0.00	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.09	0.20	0.08	0.30	0.00	0.53	0.53	0.42
OP1	0.24	0.45	0.32	0.30	0.40	0.14	0.45	0.03	0.50	0.34	0.50	0.45	0.40	0.42	0.33	0.26	0.30	0.11	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.52	0.19	0.11	0.39	0.05	0.42	0.01	0.52	0.18	0.56	0.55	0.44	0.29	0.25	0.15	0.09	0.08	0.01	0.53	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.42	0.14	0.11	0.31	0.03	0.33	0.01	0.41	0.11	0.45	0.44	0.35	0.23	0.18	0.09	0.12	0.03	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00