Doublet Group distance statistics: 52368

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.007, 0.030, 0.052, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.006, 0.029, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.009, 0.033, 0.058, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.021, 0.124, 0.226, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.124 std_dev=0.103
O4'	A	0, 0.001, 0.139, 0.278, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.139 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.073, 0.255, 0.436, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.255 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.078, 0.301, 0.525, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.301 std_dev=0.223
O2'	A	0, 0.053, 0.347, 0.640, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.347 std_dev=0.293
C5'	A	0, 0.124, 0.431, 0.738, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.431 std_dev=0.307
C2'	B	0, 0.126, 0.434, 0.743, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.434 std_dev=0.309
O3'	A	0, 0.074, 0.476, 0.878, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.476 std_dev=0.402
O2'	B	0, 0.094, 0.540, 0.986, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.540 std_dev=0.446
O5'	A	0, -0.086, 0.783, 1.652, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.783 std_dev=0.869
C1'	B	0, 0.071, 0.951, 1.831, 2.121 max_d=2.121 avg_d=0.951 std_dev=0.880
C3'	B	0, 0.109, 0.991, 1.873, 2.143 max_d=2.143 avg_d=0.991 std_dev=0.882
O4'	B	0, 0.020, 1.166, 2.312, 2.724 max_d=2.724 avg_d=1.166 std_dev=1.146
P	A	0, -0.043, 1.134, 2.311, 2.756 max_d=2.756 avg_d=1.134 std_dev=1.177
C8	B	0, 0.064, 1.242, 2.421, 2.826 max_d=2.826 avg_d=1.242 std_dev=1.179
C4'	B	0, -0.006, 1.303, 2.612, 3.093 max_d=3.093 avg_d=1.303 std_dev=1.309
N9	B	0, -0.027, 1.300, 2.628, 3.123 max_d=3.123 avg_d=1.300 std_dev=1.327
OP2	A	0, -0.037, 1.295, 2.628, 3.128 max_d=3.128 avg_d=1.295 std_dev=1.332
OP1	A	0, -0.034, 1.372, 2.779, 3.305 max_d=3.305 avg_d=1.372 std_dev=1.406
O3'	B	0, -0.117, 1.635, 3.388, 4.066 max_d=4.066 avg_d=1.635 std_dev=1.752
C5'	B	0, -0.070, 1.781, 3.632, 4.333 max_d=4.333 avg_d=1.781 std_dev=1.851
OP2	B	0, 0.213, 2.091, 3.968, 4.554 max_d=4.554 avg_d=2.091 std_dev=1.877
N7	B	0, -0.130, 1.934, 3.998, 4.794 max_d=4.794 avg_d=1.934 std_dev=2.064
O5'	B	0, -0.066, 2.119, 4.304, 5.126 max_d=5.126 avg_d=2.119 std_dev=2.185
C4	B	0, -0.310, 2.069, 4.447, 5.400 max_d=5.400 avg_d=2.069 std_dev=2.378
P	B	0, -0.055, 2.550, 5.156, 6.129 max_d=6.129 avg_d=2.550 std_dev=2.605
N3	B	0, -0.469, 2.388, 5.246, 6.405 max_d=6.405 avg_d=2.388 std_dev=2.857
C5	B	0, -0.389, 2.477, 5.342, 6.492 max_d=6.492 avg_d=2.477 std_dev=2.865
OP1	B	0, -0.347, 3.303, 6.953, 8.390 max_d=8.390 avg_d=3.303 std_dev=3.650
C2	B	0, -0.761, 3.173, 7.108, 8.719 max_d=8.719 avg_d=3.173 std_dev=3.935
C6	B	0, -0.702, 3.353, 7.409, 9.059 max_d=9.059 avg_d=3.353 std_dev=4.055
N1	B	0, -0.877, 3.642, 8.162, 10.012 max_d=10.012 avg_d=3.642 std_dev=4.519
N2	B	0, -0.955, 3.589, 8.132, 9.999 max_d=9.999 avg_d=3.589 std_dev=4.544
O6	B	0, -0.827, 3.883, 8.593, 10.511 max_d=10.511 avg_d=3.883 std_dev=4.710

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.07
C2	0.03	0.00	0.05	0.20	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.32	0.12	0.45	0.42	0.38	0.41
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.18	0.22	0.25	0.18
C3'	0.03	0.20	0.01	0.00	0.18	0.00	0.18	0.01	0.20	0.11	0.21	0.19	0.20	0.14	0.13	0.02	0.01	0.01	0.28	0.40	0.28	0.27
C4	0.02	0.01	0.04	0.18	0.00	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.21	0.06	0.13	0.07	0.06	0.06
C4'	0.00	0.11	0.02	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.14	0.09	0.13	0.09	0.16	0.11	0.08	0.10	0.01	0.00	0.02	0.17	0.09	0.02
C5	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.13	0.00	0.27	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.20	0.01	0.04	0.17	0.11	0.16
C5'	0.05	0.20	0.03	0.01	0.22	0.01	0.27	0.00	0.29	0.23	0.26	0.16	0.32	0.27	0.18	0.09	0.02	0.02	0.01	0.34	0.24	0.01
C6	0.00	0.01	0.03	0.20	0.01	0.14	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.26	0.03	0.09	0.08	0.06	0.07
C8	0.02	0.01	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.07	0.07	0.23	0.39	0.26	0.36
N1	0.01	0.01	0.04	0.21	0.01	0.13	0.02	0.26	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.31	0.08	0.29	0.22	0.20	0.21
N3	0.04	0.01	0.05	0.19	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.28	0.13	0.42	0.38	0.33	0.35
N6	0.02	0.01	0.03	0.20	0.02	0.16	0.02	0.32	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.25	0.01	0.03	0.21	0.14	0.17
N7	0.01	0.01	0.01	0.14	0.00	0.11	0.00	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.10	0.12	0.04	0.19	0.40	0.26	0.36
N9	0.00	0.01	0.03	0.13	0.00	0.08	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.06	0.13	0.08	0.14
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.04	0.10	0.07	0.09	0.06	0.09	0.05	0.06	0.07	0.10	0.04	0.00	0.03	0.12	0.04	0.04	0.11	0.03
O3'	0.00	0.32	0.01	0.01	0.21	0.01	0.20	0.02	0.26	0.07	0.31	0.28	0.25	0.12	0.11	0.03	0.00	0.01	0.26	0.48	0.29	0.30
O4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.08	0.13	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.12	0.05	0.13	0.12
O5'	0.03	0.45	0.18	0.28	0.13	0.02	0.04	0.01	0.09	0.23	0.29	0.42	0.03	0.19	0.06	0.04	0.26	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.42	0.22	0.40	0.07	0.17	0.17	0.34	0.08	0.39	0.22	0.38	0.21	0.40	0.13	0.04	0.48	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02
OP2	0.00	0.38	0.25	0.28	0.06	0.09	0.11	0.24	0.06	0.26	0.20	0.33	0.14	0.26	0.08	0.11	0.29	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.41	0.18	0.27	0.06	0.02	0.16	0.01	0.07	0.36	0.21	0.35	0.17	0.36	0.14	0.03	0.30	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.61	0.16	0.68	0.45	0.44	0.38	0.66	0.44	0.20	0.53	0.72	0.59	0.23	0.32	0.05	1.20	0.10	0.56	0.41	0.75	0.72	0.62
C2	0.44	2.01	0.11	0.68	1.29	0.76	1.31	1.13	1.68	0.62	1.98	2.40	1.65	0.91	0.79	0.14	1.24	0.08	1.13	1.72	1.59	1.02	1.22
C2'	0.48	0.60	0.11	0.66	0.49	0.25	0.40	0.52	0.42	0.29	0.50	0.69	0.62	0.28	0.43	0.13	1.27	0.36	0.45	0.37	0.73	0.69	0.54
C3'	0.35	0.39	0.14	0.59	0.33	0.22	0.26	0.44	0.26	0.20	0.30	0.45	0.42	0.17	0.31	0.03	1.09	0.28	0.40	0.22	0.59	0.62	0.46
C4	0.43	1.76	0.11	0.67	1.16	0.73	1.15	1.05	1.43	0.55	1.69	2.08	1.50	0.79	0.72	0.13	1.21	0.07	1.00	1.44	1.36	0.93	1.07
C4'	0.17	0.12	0.22	0.52	0.11	0.22	0.09	0.36	0.11	0.08	0.13	0.14	0.13	0.08	0.12	0.06	0.86	0.14	0.29	0.14	0.33	0.50	0.32
C5	0.44	2.30	0.15	0.64	1.47	0.89	1.49	1.22	1.89	0.69	2.23	2.72	1.90	1.03	0.87	0.18	1.15	0.20	1.20	1.92	1.60	1.01	1.27
C5'	0.10	0.16	0.33	0.57	0.13	0.37	0.15	0.48	0.17	0.13	0.18	0.18	0.13	0.15	0.11	0.23	0.81	0.12	0.42	0.19	0.41	0.57	0.43
C6	0.44	2.61	0.16	0.65	1.62	0.94	1.70	1.31	2.20	0.76	2.60	3.13	2.09	1.18	0.94	0.19	1.16	0.25	1.34	2.28	1.82	1.09	1.42
C8	0.41	1.69	0.14	0.63	1.15	0.80	1.11	1.05	1.36	0.53	1.59	1.92	1.50	0.76	0.72	0.15	1.10	0.17	0.96	1.35	1.21	0.86	0.99
N1	0.45	2.42	0.13	0.67	1.52	0.88	1.59	1.26	2.06	0.72	2.43	2.90	1.94	1.10	0.90	0.18	1.21	0.17	1.29	2.13	1.80	1.09	1.39
N3	0.43	1.64	0.10	0.68	1.08	0.67	1.07	1.00	1.34	0.52	1.59	1.95	1.39	0.74	0.69	0.11	1.24	0.04	0.97	1.35	1.36	0.93	1.05
N6	0.42	3.01	0.18	0.62	1.83	1.04	1.96	1.43	2.59	0.85	3.05	3.63	2.34	1.37	1.02	0.23	1.10	0.36	1.50	2.70	2.02	1.17	1.59
N7	0.43	2.35	0.19	0.61	1.52	0.94	1.53	1.24	1.91	0.70	2.25	2.74	1.99	1.05	0.90	0.19	1.05	0.29	1.21	1.93	1.53	0.98	1.24
N9	0.40	1.35	0.10	0.66	0.92	0.65	0.88	0.92	1.07	0.44	1.26	1.56	1.20	0.60	0.60	0.11	1.19	0.04	0.83	1.06	1.10	0.83	0.89
O2'	0.60	0.24	0.07	0.52	0.32	0.10	0.21	0.14	0.14	0.30	0.15	0.24	0.36	0.18	0.42	0.27	1.15	0.66	0.07	0.12	0.32	0.44	0.17
O3'	0.50	0.22	0.03	0.43	0.30	0.07	0.20	0.14	0.14	0.28	0.14	0.22	0.32	0.19	0.37	0.20	0.92	0.54	0.11	0.10	0.28	0.40	0.17
O4'	0.09	0.22	0.32	0.67	0.14	0.48	0.12	0.62	0.15	0.09	0.18	0.28	0.21	0.10	0.10	0.22	1.01	0.13	0.51	0.14	0.57	0.67	0.55
O5'	0.45	0.28	0.72	0.93	0.35	0.78	0.36	0.86	0.32	0.43	0.30	0.24	0.31	0.41	0.40	0.69	1.15	0.52	0.82	0.33	0.79	0.94	0.83
OP1	0.95	1.01	1.02	1.05	0.96	0.99	0.96	1.00	0.97	0.93	1.00	1.03	0.99	0.95	0.94	0.99	1.05	0.94	1.00	0.98	0.80	1.12	0.98
OP2	0.40	0.18	0.68	0.90	0.26	0.74	0.26	0.83	0.22	0.36	0.19	0.15	0.21	0.33	0.33	0.68	1.13	0.46	0.85	0.22	0.82	0.94	0.84
P	0.66	0.42	0.85	1.02	0.51	0.94	0.50	1.00	0.44	0.60	0.42	0.36	0.47	0.57	0.58	0.86	1.16	0.74	1.00	0.44	0.92	1.08	1.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.31	0.07
C2	0.06	0.00	0.27	0.31	0.02	0.16	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.22	0.39	0.04	0.18	0.02	0.06	0.23	0.08
C2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.12	0.01	0.06	0.00	0.10	0.08	0.21	0.32	0.25	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.28	0.06	0.25	0.06	0.17
C3'	0.01	0.31	0.01	0.00	0.15	0.00	0.09	0.01	0.14	0.11	0.26	0.37	0.28	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.45	0.09	0.38	0.08	0.32
C4	0.01	0.02	0.12	0.15	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.23	0.02	0.08	0.24	0.09
C4'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.05	0.13	0.20	0.15	0.03	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.26	0.01
C5	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.34	0.03	0.14	0.19	0.17
C5'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.07	0.12	0.19	0.13	0.05	0.03	0.04	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.27	0.00
C6	0.01	0.01	0.10	0.14	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.02	0.36	0.00	0.16	0.18	0.20
C8	0.01	0.02	0.08	0.11	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.33	0.07	0.13	0.24	0.14
N1	0.05	0.01	0.21	0.26	0.03	0.13	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.17	0.33	0.04	0.26	0.02	0.10	0.19	0.13
N2	0.07	0.00	0.32	0.37	0.02	0.20	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.28	0.48	0.05	0.13	0.03	0.04	0.24	0.06
N3	0.05	0.01	0.25	0.28	0.01	0.15	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.19	0.34	0.03	0.14	0.01	0.04	0.26	0.06
N7	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.39	0.07	0.17	0.19	0.21
N9	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.20	0.04	0.07	0.28	0.07
O2'	0.03	0.22	0.00	0.02	0.08	0.04	0.04	0.04	0.08	0.05	0.17	0.28	0.19	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.09	0.05	0.18	0.14	0.05
O3'	0.01	0.39	0.02	0.00	0.18	0.00	0.12	0.01	0.19	0.12	0.33	0.48	0.34	0.07	0.05	0.04	0.00	0.00	0.48	0.15	0.54	0.21	0.43
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.18	0.05	0.13	0.48	0.23
O5'	0.06	0.18	0.28	0.45	0.23	0.01	0.34	0.00	0.36	0.33	0.26	0.13	0.14	0.39	0.20	0.09	0.48	0.18	0.00	0.45	0.00	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.07	0.02	0.03	0.01	0.07	0.04	0.05	0.15	0.05	0.45	0.00	0.23	0.21	0.29
OP1	0.03	0.06	0.25	0.38	0.08	0.06	0.14	0.02	0.16	0.13	0.10	0.04	0.04	0.17	0.07	0.18	0.54	0.13	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.23	0.06	0.08	0.24	0.26	0.19	0.27	0.18	0.24	0.19	0.24	0.26	0.19	0.28	0.14	0.21	0.48	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.08	0.17	0.32	0.09	0.01	0.17	0.00	0.20	0.14	0.13	0.06	0.06	0.21	0.07	0.05	0.43	0.23	0.01	0.29	0.00	0.00	0.00