Doublet Group distance statistics: 52376

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.000, 0.085, 0.170, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.085 std_dev=0.085
N9	B	0, 0.000, 0.251, 0.501, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.251 std_dev=0.251
C4	B	0, 0.000, 0.269, 0.537, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.269 std_dev=0.269
N3	B	0, 0.000, 0.279, 0.559, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.279 std_dev=0.279
O4'	B	0, 0.000, 0.304, 0.607, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C1'	B	0, 0.000, 0.329, 0.658, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.329 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.000, 0.414, 0.829, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.414 std_dev=0.414
C5	B	0, 0.000, 0.436, 0.873, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.436 std_dev=0.436
C5'	B	0, 0.000, 0.447, 0.894, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.447 std_dev=0.447
O5'	B	0, 0.000, 0.449, 0.898, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.449 std_dev=0.449
C2	B	0, 0.000, 0.483, 0.966, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.483 std_dev=0.483
N7	B	0, 0.000, 0.484, 0.968, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.484 std_dev=0.484
C4'	B	0, 0.000, 0.491, 0.982, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.491 std_dev=0.491
C2'	B	0, 0.000, 0.530, 1.061, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.530 std_dev=0.530
P	B	0, 0.000, 0.608, 1.216, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.608 std_dev=0.608
N2	B	0, 0.000, 0.611, 1.222, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.611 std_dev=0.611
C6	B	0, 0.000, 0.613, 1.226, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.613 std_dev=0.613
N1	B	0, 0.000, 0.623, 1.247, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.623 std_dev=0.623
C3'	B	0, 0.000, 0.688, 1.376, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.688 std_dev=0.688
O2'	B	0, 0.000, 0.758, 1.516, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.758 std_dev=0.758
O3'	A	0, 0.000, 0.765, 1.529, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.765 std_dev=0.765
OP2	B	0, 0.000, 0.769, 1.539, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.769 std_dev=0.769
O6	B	0, 0.000, 0.786, 1.572, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.786 std_dev=0.786
OP1	B	0, 0.000, 0.796, 1.592, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.796 std_dev=0.796
O3'	B	0, 0.000, 1.029, 2.059, 2.059 max_d=2.059 avg_d=1.029 std_dev=1.029
C3'	A	0, 0.000, 1.149, 2.298, 2.298 max_d=2.298 avg_d=1.149 std_dev=1.149
O4'	A	0, 0.000, 1.301, 2.603, 2.603 max_d=2.603 avg_d=1.301 std_dev=1.301
C2'	A	0, 0.000, 1.331, 2.662, 2.662 max_d=2.662 avg_d=1.331 std_dev=1.331
C4'	A	0, 0.000, 1.478, 2.957, 2.957 max_d=2.957 avg_d=1.478 std_dev=1.478
O2'	A	0, 0.000, 2.269, 4.537, 4.537 max_d=4.537 avg_d=2.269 std_dev=2.269
C5'	A	0, 0.000, 2.900, 5.800, 5.800 max_d=5.800 avg_d=2.900 std_dev=2.900
O5'	A	0, 0.000, 3.758, 7.516, 7.516 max_d=7.516 avg_d=3.758 std_dev=3.758
OP2	A	0, 0.000, 5.030, 10.060, 10.060 max_d=10.060 avg_d=5.030 std_dev=5.030
P	A	0, 0.000, 5.100, 10.200, 10.200 max_d=10.200 avg_d=5.100 std_dev=5.100
OP1	A	0, 0.000, 5.996, 11.993, 11.993 max_d=11.993 avg_d=5.996 std_dev=5.996

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.22	0.00	0.43	0.19
C2	0.01	0.00	0.19	0.32	0.00	0.55	0.01	1.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.26	0.11	0.41	1.66	1.66	1.63	1.72
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.03	0.10	0.12	0.15	0.19	0.10	0.07	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.23	0.28	0.02
C3'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.16	0.01	0.09	0.00	0.17	0.14	0.26	0.31	0.15	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.30	0.22	0.13
C4	0.00	0.00	0.10	0.16	0.00	0.27	0.00	0.55	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.15	0.04	0.22	0.97	0.74	0.96	0.89
C4'	0.01	0.55	0.01	0.01	0.27	0.00	0.15	0.00	0.28	0.20	0.44	0.54	0.24	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.39	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.15	0.00	0.35	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.10	0.02	0.11	0.83	0.57	0.80	0.73
C5'	0.03	1.14	0.03	0.00	0.55	0.00	0.35	0.00	0.60	0.30	0.93	1.05	0.50	0.11	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.33	0.29	0.00
C6	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.28	0.01	0.60	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.04	0.21	1.14	0.98	1.10	1.09
C8	0.00	0.01	0.12	0.14	0.01	0.20	0.01	0.30	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.18	0.09	0.30	0.15	0.07
N1	0.00	0.01	0.15	0.26	0.00	0.44	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.09	0.32	1.49	1.47	1.46	1.53
N3	0.01	0.01	0.19	0.31	0.00	0.54	0.01	1.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.24	0.09	0.42	1.48	1.35	1.44	1.47
N6	0.04	0.01	0.10	0.15	0.03	0.24	0.03	0.50	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.09	0.01	0.17	1.07	0.89	1.02	1.01
N7	0.00	0.02	0.07	0.08	0.03	0.10	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.34	0.04	0.34	0.17
N9	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.43	0.13	0.51	0.33
O2'	0.02	0.26	0.01	0.00	0.15	0.02	0.10	0.01	0.14	0.04	0.22	0.24	0.09	0.02	0.05	0.00	0.00	0.03	0.06	0.25	0.23	0.08
O3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.09	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.31	0.24	0.20	0.15
O4'	0.01	0.41	0.03	0.00	0.22	0.00	0.11	0.01	0.21	0.18	0.32	0.42	0.17	0.10	0.00	0.03	0.02	0.00	0.31	0.06	0.50	0.27
O5'	0.22	1.66	0.02	0.21	0.97	0.00	0.83	0.00	1.14	0.09	1.49	1.48	1.07	0.34	0.43	0.06	0.31	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.00	1.66	0.23	0.30	0.74	0.14	0.57	0.33	0.98	0.30	1.47	1.35	0.89	0.04	0.13	0.25	0.24	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.43	1.63	0.28	0.22	0.96	0.39	0.80	0.29	1.10	0.15	1.46	1.44	1.02	0.34	0.51	0.23	0.20	0.50	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.19	1.72	0.02	0.13	0.89	0.08	0.73	0.00	1.09	0.07	1.53	1.47	1.01	0.17	0.33	0.08	0.15	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.06	0.01	0.03	0.14	0.06	0.19	0.03	0.18	0.21	0.12	0.05	0.07	0.23	0.15	0.06	0.10	0.12	0.03	0.21	0.06	0.03	0.01
C2	0.17	0.21	0.17	0.22	0.09	0.20	0.16	0.17	0.05	0.29	0.17	0.38	0.07	0.30	0.18	0.10	0.23	0.18	0.13	0.08	0.12	0.11	0.14
C2'	0.05	0.52	0.02	0.05	0.22	0.03	0.18	0.01	0.27	0.01	0.43	0.75	0.38	0.05	0.09	0.01	0.11	0.03	0.06	0.25	0.05	0.09	0.05
C3'	0.18	0.20	0.16	0.17	0.02	0.22	0.01	0.19	0.09	0.15	0.19	0.36	0.07	0.10	0.11	0.17	0.17	0.20	0.09	0.10	0.09	0.03	0.10
C4	0.18	0.15	0.14	0.15	0.11	0.17	0.17	0.13	0.08	0.27	0.09	0.31	0.03	0.27	0.18	0.09	0.14	0.18	0.07	0.09	0.04	0.04	0.08
C4'	0.64	0.34	0.48	0.44	0.46	0.62	0.36	0.56	0.24	0.48	0.21	0.29	0.48	0.39	0.53	0.54	0.37	0.69	0.40	0.15	0.38	0.28	0.41
C5	0.18	0.24	0.18	0.21	0.05	0.20	0.09	0.15	0.06	0.27	0.22	0.33	0.10	0.23	0.17	0.15	0.23	0.19	0.09	0.04	0.05	0.03	0.08
C5'	1.01	0.28	0.88	0.86	0.54	1.09	0.30	1.01	0.02	0.60	0.01	0.22	0.60	0.38	0.72	1.08	0.87	1.11	0.74	0.17	0.74	0.48	0.71
C6	0.17	0.31	0.21	0.28	0.00	0.23	0.03	0.19	0.17	0.27	0.34	0.40	0.15	0.23	0.15	0.17	0.32	0.18	0.14	0.17	0.11	0.08	0.12
C8	0.17	0.08	0.09	0.05	0.08	0.12	0.09	0.06	0.03	0.18	0.05	0.15	0.01	0.16	0.14	0.10	0.03	0.16	0.02	0.03	0.06	0.07	0.02
N1	0.16	0.28	0.20	0.27	0.04	0.22	0.09	0.19	0.09	0.28	0.30	0.41	0.12	0.27	0.16	0.14	0.30	0.18	0.15	0.08	0.14	0.11	0.14
N3	0.17	0.14	0.13	0.16	0.12	0.17	0.20	0.14	0.12	0.29	0.06	0.33	0.02	0.30	0.19	0.07	0.15	0.18	0.09	0.16	0.08	0.08	0.11
N6	0.13	0.36	0.21	0.30	0.09	0.22	0.11	0.18	0.32	0.21	0.42	0.41	0.21	0.14	0.08	0.17	0.37	0.15	0.14	0.35	0.12	0.06	0.11
N7	0.20	0.18	0.19	0.17	0.03	0.18	0.03	0.11	0.07	0.21	0.17	0.23	0.08	0.15	0.15	0.19	0.18	0.18	0.03	0.07	0.02	0.05	0.01
N9	0.15	0.06	0.07	0.05	0.12	0.11	0.15	0.07	0.10	0.22	0.00	0.18	0.01	0.22	0.16	0.04	0.02	0.15	0.00	0.11	0.03	0.02	0.02
O2'	0.61	0.83	0.48	0.41	0.59	0.53	0.41	0.51	0.39	0.34	0.58	1.06	0.84	0.28	0.53	0.61	0.34	0.63	0.47	0.27	0.44	0.38	0.44
O3'	0.13	0.08	0.22	0.24	0.03	0.19	0.07	0.19	0.11	0.04	0.04	0.18	0.12	0.10	0.05	0.32	0.32	0.13	0.21	0.17	0.23	0.15	0.17
O4'	0.68	0.56	0.46	0.39	0.60	0.59	0.52	0.52	0.43	0.57	0.44	0.54	0.65	0.52	0.62	0.48	0.28	0.71	0.39	0.35	0.34	0.29	0.40
O5'	0.75	0.09	0.58	0.54	0.24	0.83	0.05	0.72	0.32	0.23	0.26	0.16	0.38	0.02	0.41	0.86	0.56	0.87	0.38	0.55	0.36	0.04	0.33
OP1	1.66	0.72	1.38	1.35	0.95	1.81	0.53	1.69	0.15	0.93	0.24	0.79	1.12	0.57	1.18	1.75	1.35	1.88	1.24	0.20	1.23	0.76	1.18
OP2	0.89	0.21	0.65	0.64	0.38	1.02	0.10	0.95	0.17	0.39	0.12	0.26	0.49	0.14	0.55	0.90	0.62	1.08	0.60	0.41	0.62	0.27	0.58
P	1.15	0.29	0.96	0.94	0.51	1.31	0.16	1.20	0.18	0.53	0.12	0.34	0.65	0.21	0.73	1.28	0.97	1.33	0.80	0.47	0.81	0.39	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.01	0.01
C2	0.00	0.00	0.10	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.08	0.06	0.09	0.02	0.03	0.05	0.02
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.12	0.11	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.12	0.01	0.08	0.06	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.08	0.05
C4	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.03	0.10	0.02	0.05	0.06	0.04
C4'	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.11	0.01	0.07	0.09	0.07
C5'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02
C6	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.10	0.00	0.07	0.09	0.06
C8	0.01	0.01	0.09	0.12	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.04	0.12	0.02	0.09	0.09	0.10
N1	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.03	0.05	0.09	0.01	0.05	0.07	0.04
N2	0.01	0.01	0.12	0.08	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.17	0.13	0.08	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00
N3	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.14	0.09	0.05	0.09	0.03	0.04	0.04	0.02
N7	0.02	0.01	0.07	0.11	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.14	0.02	0.12	0.01	0.10	0.11	0.11
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.02	0.05	0.04	0.05
O2'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.06	0.07	0.01	0.07	0.03	0.07	0.09	0.17	0.14	0.06	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.06	0.06
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.04	0.15	0.03	0.13	0.09	0.14	0.05	0.01	0.00	0.01	0.13	0.07	0.05	0.14	0.11
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.05	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.03	0.02	0.02	0.00
O5'	0.06	0.09	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.12	0.09	0.07	0.09	0.12	0.10	0.04	0.13	0.06	0.00	0.10	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.03	0.10	0.00	0.07	0.11	0.08
OP1	0.03	0.03	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.09	0.05	0.01	0.04	0.10	0.05	0.04	0.05	0.02	0.02	0.07	0.00	0.03	0.02
OP2	0.01	0.05	0.02	0.08	0.06	0.05	0.09	0.04	0.09	0.09	0.07	0.03	0.04	0.11	0.04	0.06	0.14	0.02	0.03	0.11	0.03	0.00	0.02
P	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.03	0.07	0.02	0.06	0.10	0.04	0.00	0.02	0.11	0.05	0.06	0.11	0.00	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00