Doublet Group distance statistics: 52382

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 5, 15, 14, 2, 1, 0, 1, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.015, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.016, 0.025, 0.034, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.018, 0.031, 0.044, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.015, 0.029, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.019, 0.033, 0.046, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.024, 0.039, 0.054, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.039 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.023, 0.040, 0.056, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.040 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.028, 0.047, 0.065, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.047 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.040, 0.066, 0.091, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.066 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.059, 0.089, 0.119, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.089 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.285, 0.434, 0.583, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.434 std_dev=0.149
O3'	B	0, 0.241, 0.423, 0.604, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.423 std_dev=0.181
C3'	B	0, 0.159, 0.353, 0.548, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.353 std_dev=0.195
C4'	A	0, 0.466, 0.660, 0.855, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.660 std_dev=0.195
C2'	A	0, 0.383, 0.603, 0.823, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.603 std_dev=0.220
C4'	B	0, 0.330, 0.563, 0.796, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.563 std_dev=0.233
P	A	0, 0.336, 0.573, 0.810, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.573 std_dev=0.237
C5'	B	0, 0.547, 0.800, 1.052, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.800 std_dev=0.252
O5'	B	0, 0.318, 0.574, 0.830, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.574 std_dev=0.256
OP1	A	0, 0.320, 0.584, 0.848, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.584 std_dev=0.264
O2'	B	0, 0.628, 0.905, 1.181, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.905 std_dev=0.277
C3'	A	0, 0.549, 0.830, 1.110, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.830 std_dev=0.281
C2'	B	0, 0.239, 0.531, 0.822, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.531 std_dev=0.292
O2'	A	0, 0.553, 0.858, 1.163, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.858 std_dev=0.305
OP2	A	0, 0.802, 1.117, 1.432, 1.736 max_d=1.736 avg_d=1.117 std_dev=0.315
O4'	B	0, 0.423, 0.760, 1.097, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.760 std_dev=0.337
P	B	0, 0.603, 0.943, 1.282, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.943 std_dev=0.340
C1'	B	0, 0.402, 0.752, 1.102, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.752 std_dev=0.350
O3'	A	0, 0.768, 1.133, 1.499, 1.523 max_d=1.523 avg_d=1.133 std_dev=0.366
C5'	A	0, 0.863, 1.240, 1.617, 1.678 max_d=1.678 avg_d=1.240 std_dev=0.377
OP2	B	0, 0.956, 1.337, 1.717, 1.878 max_d=1.878 avg_d=1.337 std_dev=0.380
N1	B	0, 0.767, 1.168, 1.568, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.168 std_dev=0.400
O2	B	0, 1.201, 1.636, 2.072, 2.462 max_d=2.462 avg_d=1.636 std_dev=0.436
C6	B	0, 0.743, 1.185, 1.628, 2.113 max_d=2.113 avg_d=1.185 std_dev=0.442
O5'	A	0, 0.643, 1.088, 1.533, 2.000 max_d=2.000 avg_d=1.088 std_dev=0.445
C2	B	0, 1.161, 1.608, 2.056, 2.509 max_d=2.509 avg_d=1.608 std_dev=0.447
OP1	B	0, 0.729, 1.205, 1.680, 2.436 max_d=2.436 avg_d=1.205 std_dev=0.475
C5	B	0, 1.069, 1.584, 2.099, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.584 std_dev=0.515
N3	B	0, 1.484, 2.018, 2.553, 3.011 max_d=3.011 avg_d=2.018 std_dev=0.535
C4	B	0, 1.442, 2.003, 2.565, 3.059 max_d=3.059 avg_d=2.003 std_dev=0.561
N4	B	0, 1.764, 2.422, 3.080, 3.558 max_d=3.558 avg_d=2.422 std_dev=0.658

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.22	0.28	0.32	0.11
C2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.04	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.04	0.25	0.25	0.32	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.09	0.07	0.11	0.05	0.08	0.03	0.00	0.05	0.02	0.13	0.14	0.47	0.15
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.11	0.02	0.10	0.17	0.08	0.08	0.13	0.16	0.07	0.02	0.01	0.01	0.11	0.13	0.49	0.21
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.02	0.26	0.25	0.31	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.13	0.07	0.04	0.12	0.14	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.16	0.31	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.10	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.02	0.26	0.21	0.29	0.13
C5'	0.06	0.18	0.03	0.02	0.19	0.00	0.25	0.00	0.26	0.25	0.22	0.15	0.28	0.28	0.17	0.04	0.07	0.02	0.01	0.18	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.10	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.26	0.20	0.29	0.13
C8	0.01	0.01	0.09	0.17	0.01	0.13	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.21	0.05	0.26	0.22	0.27	0.12
N1	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.07	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.03	0.26	0.22	0.31	0.13
N3	0.03	0.00	0.11	0.08	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.11	0.04	0.25	0.27	0.32	0.13
N6	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.12	0.01	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.19	0.03	0.26	0.18	0.28	0.13
N7	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01	0.14	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.23	0.04	0.26	0.19	0.26	0.13
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.25	0.26	0.30	0.12
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.04	0.05	0.04	0.07	0.07	0.12	0.16	0.06	0.06	0.02	0.00	0.12	0.05	0.07	0.14	0.50	0.16
O3'	0.05	0.10	0.05	0.01	0.06	0.04	0.14	0.07	0.14	0.21	0.09	0.11	0.19	0.23	0.07	0.12	0.00	0.05	0.21	0.31	0.69	0.40
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.05	0.00	0.24	0.38	0.23	0.17
O5'	0.22	0.25	0.13	0.11	0.26	0.01	0.26	0.01	0.26	0.26	0.26	0.25	0.26	0.26	0.25	0.07	0.21	0.24	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.28	0.25	0.14	0.13	0.25	0.16	0.21	0.18	0.20	0.22	0.22	0.27	0.18	0.19	0.26	0.14	0.31	0.38	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.32	0.47	0.49	0.31	0.31	0.29	0.16	0.29	0.27	0.31	0.32	0.28	0.26	0.30	0.50	0.69	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.13	0.15	0.21	0.13	0.08	0.13	0.01	0.13	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.16	0.40	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.10	0.09	0.08	0.09	0.19	0.11	0.22	0.12	0.10	0.10	0.09	0.12	0.20	0.10	0.23	0.16	0.19	0.26	0.18
C2	0.12	0.12	0.10	0.10	0.12	0.19	0.12	0.24	0.13	0.12	0.13	0.13	0.15	0.17	0.11	0.23	0.21	0.24	0.26	0.22
C2'	0.16	0.13	0.16	0.16	0.13	0.24	0.15	0.26	0.16	0.15	0.12	0.12	0.12	0.23	0.15	0.26	0.21	0.25	0.28	0.22
C3'	0.24	0.20	0.24	0.24	0.21	0.31	0.23	0.33	0.24	0.23	0.19	0.20	0.18	0.27	0.23	0.31	0.29	0.33	0.34	0.30
C4	0.12	0.11	0.09	0.09	0.10	0.20	0.11	0.24	0.12	0.11	0.11	0.10	0.14	0.18	0.11	0.24	0.20	0.22	0.26	0.20
C4'	0.17	0.15	0.17	0.18	0.16	0.25	0.18	0.29	0.19	0.17	0.15	0.16	0.16	0.23	0.18	0.24	0.24	0.28	0.33	0.26
C5	0.13	0.11	0.09	0.10	0.10	0.20	0.11	0.24	0.13	0.12	0.11	0.10	0.15	0.17	0.11	0.25	0.21	0.24	0.25	0.21
C5'	0.30	0.31	0.27	0.25	0.31	0.33	0.31	0.35	0.31	0.31	0.31	0.31	0.32	0.29	0.26	0.33	0.31	0.37	0.37	0.33
C6	0.14	0.13	0.10	0.11	0.12	0.20	0.12	0.24	0.13	0.13	0.13	0.12	0.17	0.15	0.11	0.24	0.22	0.25	0.25	0.22
C8	0.12	0.10	0.09	0.09	0.09	0.21	0.11	0.24	0.13	0.11	0.10	0.09	0.13	0.19	0.11	0.26	0.19	0.21	0.25	0.19
N1	0.13	0.13	0.10	0.11	0.13	0.19	0.13	0.24	0.13	0.13	0.14	0.14	0.16	0.16	0.11	0.23	0.22	0.25	0.26	0.22
N3	0.12	0.11	0.09	0.09	0.11	0.19	0.11	0.24	0.12	0.11	0.12	0.12	0.14	0.18	0.11	0.24	0.20	0.23	0.27	0.21
N6	0.15	0.14	0.12	0.12	0.13	0.20	0.14	0.24	0.15	0.14	0.14	0.13	0.18	0.15	0.12	0.24	0.24	0.27	0.25	0.23
N7	0.14	0.10	0.09	0.10	0.09	0.21	0.12	0.24	0.13	0.12	0.10	0.09	0.14	0.17	0.11	0.27	0.21	0.24	0.24	0.21
N9	0.12	0.10	0.09	0.09	0.09	0.20	0.11	0.23	0.12	0.11	0.10	0.09	0.13	0.19	0.11	0.24	0.18	0.21	0.25	0.19
O2'	0.15	0.12	0.17	0.16	0.12	0.23	0.14	0.26	0.15	0.14	0.12	0.12	0.13	0.25	0.16	0.24	0.21	0.23	0.30	0.22
O3'	0.39	0.34	0.43	0.42	0.36	0.44	0.39	0.45	0.40	0.38	0.33	0.35	0.31	0.45	0.43	0.42	0.44	0.46	0.45	0.44
O4'	0.13	0.13	0.13	0.12	0.12	0.18	0.14	0.22	0.15	0.13	0.12	0.12	0.15	0.21	0.16	0.22	0.17	0.18	0.28	0.19
O5'	0.18	0.19	0.07	0.12	0.19	0.31	0.20	0.35	0.20	0.18	0.19	0.19	0.20	0.13	0.02	0.30	0.26	0.30	0.38	0.30
OP1	0.08	0.09	0.09	0.08	0.09	0.15	0.10	0.12	0.10	0.08	0.09	0.09	0.12	0.15	0.02	0.17	0.11	0.10	0.22	0.14
OP2	0.07	0.12	0.16	0.17	0.11	0.13	0.13	0.21	0.13	0.09	0.12	0.11	0.17	0.19	0.01	0.07	0.29	0.29	0.30	0.29
P	0.05	0.06	0.03	0.01	0.04	0.08	0.05	0.07	0.06	0.05	0.06	0.05	0.10	0.09	0.00	0.09	0.06	0.10	0.12	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.15	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.04	0.14	0.16	0.09	0.09
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.07	0.12	0.08	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.08	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.19	0.23	0.18	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.03	0.06	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.05	0.04	0.21	0.24	0.20	0.19
C5'	0.03	0.08	0.04	0.01	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.08	0.10	0.14	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.18	0.20	0.15	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.13	0.16	0.09	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.04	0.16	0.19	0.13	0.13
N4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.05	0.03	0.21	0.25	0.21	0.20
O2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.09	0.07	0.11	0.14	0.08	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.07	0.03	0.05	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.13	0.10	0.08
O3'	0.05	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.00	0.04	0.03	0.11	0.08	0.03
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.07	0.01	0.04	0.00	0.06	0.18	0.07	0.08
O5'	0.07	0.14	0.07	0.03	0.19	0.01	0.21	0.01	0.18	0.13	0.16	0.21	0.11	0.08	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.15	0.16	0.12	0.11	0.23	0.12	0.24	0.07	0.20	0.16	0.19	0.25	0.14	0.13	0.11	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.09	0.08	0.08	0.18	0.06	0.20	0.06	0.15	0.09	0.13	0.21	0.08	0.10	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.09	0.06	0.03	0.18	0.03	0.19	0.01	0.14	0.08	0.13	0.20	0.06	0.08	0.03	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00