Doublet Group distance statistics: 52398

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 3, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.006, 0.026, 0.047, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.003, 0.025, 0.046, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.008, 0.037, 0.066, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.037 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.021, 0.051, 0.081, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.051 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.010, 0.046, 0.082, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.046 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.018, 0.077, 0.136, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.077 std_dev=0.059
C2'	A	0, 0.021, 0.091, 0.161, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.091 std_dev=0.070
O2'	A	0, 0.040, 0.134, 0.228, 0.324 max_d=0.324 avg_d=0.134 std_dev=0.094
C3'	A	0, 0.049, 0.179, 0.310, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.179 std_dev=0.130
O3'	A	0, 0.053, 0.212, 0.372, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.212 std_dev=0.160
C4'	A	0, 0.063, 0.233, 0.404, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.233 std_dev=0.171
C2'	B	0, 0.280, 0.504, 0.728, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.504 std_dev=0.224
O2'	B	0, 0.300, 0.540, 0.780, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.540 std_dev=0.240
O3'	B	0, 0.290, 0.560, 0.831, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.560 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.252, 0.531, 0.810, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.531 std_dev=0.279
C3'	B	0, 0.328, 0.613, 0.898, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.613 std_dev=0.285
N1	B	0, 0.318, 0.635, 0.953, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.635 std_dev=0.318
C5'	A	0, 0.161, 0.485, 0.809, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.485 std_dev=0.324
C6	B	0, 0.401, 0.778, 1.154, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.778 std_dev=0.377
C4'	B	0, 0.356, 0.737, 1.118, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.737 std_dev=0.381
C5	B	0, 0.448, 0.849, 1.250, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.849 std_dev=0.401
O5'	A	0, 0.191, 0.609, 1.028, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.609 std_dev=0.419
O4'	B	0, 0.332, 0.787, 1.241, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.787 std_dev=0.454
P	A	0, 0.284, 0.788, 1.293, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.788 std_dev=0.505
C5'	B	0, 0.500, 1.078, 1.656, 1.724 max_d=1.724 avg_d=1.078 std_dev=0.578
C4	B	0, 0.413, 0.992, 1.570, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.992 std_dev=0.578
C2	B	0, 0.188, 0.888, 1.588, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.888 std_dev=0.700
O5'	B	0, 0.577, 1.281, 1.984, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.281 std_dev=0.704
OP1	A	0, 0.327, 1.034, 1.740, 2.126 max_d=2.126 avg_d=1.034 std_dev=0.706
OP2	A	0, 0.271, 1.018, 1.764, 2.232 max_d=2.232 avg_d=1.018 std_dev=0.746
N4	B	0, 0.444, 1.196, 1.949, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.196 std_dev=0.752
N3	B	0, 0.205, 1.081, 1.958, 2.622 max_d=2.622 avg_d=1.081 std_dev=0.876
P	B	0, 0.698, 1.640, 2.582, 2.881 max_d=2.881 avg_d=1.640 std_dev=0.942
OP1	B	0, 0.789, 1.743, 2.697, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.743 std_dev=0.954
O2	B	0, 0.013, 1.028, 2.044, 2.871 max_d=2.871 avg_d=1.028 std_dev=1.016
OP2	B	0, 0.714, 1.804, 2.893, 3.380 max_d=3.380 avg_d=1.804 std_dev=1.090

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.12	0.05	0.18	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.09	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.30	0.25	0.51	0.30
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.04	0.14	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.10	0.04	0.10	0.08	0.11	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.10	0.05
C4	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.29	0.20	0.45	0.26
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.07	0.04	0.11	0.09	0.05	0.05	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02
C5	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.35	0.27	0.56	0.34
C5'	0.03	0.14	0.02	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.20	0.16	0.18	0.11	0.23	0.20	0.12	0.05	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.37	0.33	0.63	0.39
C8	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.29	0.17	0.40	0.25
N1	0.02	0.00	0.03	0.10	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.35	0.30	0.59	0.36
N3	0.02	0.00	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.26	0.19	0.42	0.24
N6	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.40	0.38	0.70	0.43
N7	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.35	0.27	0.55	0.35
N9	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.24	0.13	0.33	0.19
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.07	0.04	0.03	0.03	0.00	0.06	0.02	0.04	0.04	0.10	0.04
O3'	0.02	0.09	0.03	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.10	0.04	0.10	0.08	0.11	0.07	0.04	0.06	0.00	0.02	0.07	0.07	0.12	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.08	0.11	0.06
O5'	0.12	0.30	0.07	0.05	0.29	0.02	0.35	0.00	0.37	0.29	0.35	0.26	0.40	0.35	0.24	0.04	0.07	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.05	0.25	0.04	0.05	0.20	0.04	0.27	0.05	0.33	0.17	0.30	0.19	0.38	0.27	0.13	0.04	0.07	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.51	0.14	0.10	0.45	0.05	0.56	0.01	0.63	0.40	0.59	0.42	0.70	0.55	0.33	0.10	0.12	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.30	0.05	0.05	0.26	0.02	0.34	0.01	0.39	0.25	0.36	0.24	0.43	0.35	0.19	0.04	0.06	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.10	0.13	0.12	0.16	0.23	0.25	0.21	0.26	0.16	0.11	0.16	0.14	0.17	0.06	0.28	0.13	0.20	0.11	0.17
C2	0.24	0.26	0.14	0.12	0.13	0.25	0.27	0.23	0.34	0.17	0.28	0.15	0.47	0.20	0.13	0.35	0.14	0.17	0.10	0.15
C2'	0.19	0.13	0.17	0.14	0.18	0.23	0.29	0.20	0.31	0.18	0.15	0.18	0.21	0.22	0.11	0.27	0.13	0.19	0.12	0.15
C3'	0.16	0.16	0.16	0.13	0.18	0.20	0.28	0.19	0.29	0.16	0.18	0.20	0.24	0.22	0.12	0.21	0.14	0.21	0.16	0.15
C4	0.22	0.19	0.13	0.11	0.11	0.25	0.26	0.22	0.32	0.16	0.20	0.11	0.36	0.19	0.11	0.33	0.13	0.16	0.08	0.14
C4'	0.10	0.10	0.10	0.08	0.15	0.17	0.20	0.18	0.19	0.12	0.12	0.17	0.11	0.14	0.06	0.18	0.12	0.18	0.13	0.14
C5	0.24	0.26	0.14	0.13	0.13	0.25	0.27	0.21	0.34	0.17	0.27	0.14	0.47	0.21	0.16	0.34	0.14	0.16	0.12	0.15
C5'	0.07	0.09	0.07	0.06	0.13	0.16	0.15	0.20	0.13	0.07	0.11	0.15	0.12	0.11	0.06	0.14	0.15	0.21	0.15	0.15
C6	0.25	0.34	0.16	0.15	0.18	0.25	0.28	0.21	0.36	0.19	0.36	0.21	0.59	0.22	0.19	0.35	0.16	0.17	0.16	0.16
C8	0.21	0.14	0.13	0.10	0.12	0.24	0.25	0.20	0.30	0.15	0.14	0.12	0.28	0.19	0.10	0.30	0.12	0.16	0.08	0.13
N1	0.25	0.33	0.15	0.14	0.18	0.25	0.28	0.22	0.36	0.18	0.36	0.21	0.57	0.21	0.17	0.36	0.15	0.16	0.14	0.15
N3	0.22	0.19	0.13	0.11	0.11	0.25	0.26	0.23	0.32	0.16	0.20	0.11	0.37	0.19	0.10	0.34	0.13	0.18	0.07	0.15
N6	0.27	0.43	0.19	0.18	0.24	0.24	0.29	0.22	0.38	0.22	0.46	0.28	0.71	0.23	0.22	0.35	0.18	0.18	0.21	0.18
N7	0.24	0.23	0.14	0.13	0.12	0.24	0.26	0.20	0.33	0.16	0.23	0.12	0.43	0.21	0.18	0.33	0.14	0.16	0.12	0.15
N9	0.20	0.13	0.13	0.11	0.12	0.24	0.25	0.21	0.30	0.16	0.13	0.12	0.25	0.18	0.07	0.31	0.12	0.17	0.08	0.15
O2'	0.17	0.12	0.15	0.12	0.18	0.21	0.26	0.19	0.27	0.17	0.14	0.19	0.14	0.19	0.09	0.25	0.12	0.18	0.14	0.15
O3'	0.14	0.17	0.15	0.11	0.19	0.18	0.25	0.19	0.26	0.14	0.20	0.21	0.25	0.21	0.11	0.18	0.16	0.23	0.22	0.18
O4'	0.16	0.13	0.14	0.12	0.19	0.21	0.23	0.21	0.23	0.17	0.15	0.20	0.10	0.16	0.08	0.24	0.14	0.20	0.13	0.18
O5'	0.05	0.20	0.10	0.01	0.15	0.09	0.21	0.14	0.20	0.09	0.20	0.17	0.32	0.15	0.02	0.05	0.10	0.22	0.12	0.12
OP1	0.03	0.11	0.08	0.04	0.16	0.15	0.16	0.24	0.12	0.07	0.14	0.19	0.12	0.09	0.02	0.08	0.16	0.34	0.11	0.18
OP2	0.25	0.49	0.27	0.11	0.28	0.08	0.34	0.08	0.34	0.27	0.46	0.29	0.71	0.30	0.03	0.17	0.07	0.27	0.07	0.10
P	0.08	0.22	0.13	0.02	0.16	0.05	0.22	0.11	0.21	0.11	0.21	0.18	0.34	0.16	0.00	0.02	0.08	0.23	0.09	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.22	0.05	0.01	0.18	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.27	0.11	0.24	0.43	0.45	0.50	0.47
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.21	0.02	0.17	0.04	0.37	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.03
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.04	0.05	0.08	0.08	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.21	0.26	0.28	0.21
C4'	0.00	0.18	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.13	0.03	0.17	0.08	0.28	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.15	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.17	0.20	0.14	0.12	0.23	0.24
C5'	0.02	0.36	0.01	0.01	0.15	0.01	0.13	0.00	0.22	0.08	0.35	0.17	0.53	0.05	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.21	0.12	0.01	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.17	0.28	0.25	0.21	0.32	0.34
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.11	0.11	0.12	0.09
N3	0.01	0.00	0.17	0.05	0.00	0.17	0.00	0.35	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.09	0.17	0.44	0.49	0.56	0.50
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.24	0.31	0.34	0.26
O2	0.01	0.00	0.37	0.08	0.01	0.28	0.01	0.53	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.48	0.20	0.44	0.59	0.63	0.69	0.69
O2'	0.01	0.27	0.00	0.02	0.06	0.04	0.15	0.05	0.21	0.03	0.23	0.07	0.48	0.00	0.04	0.05	0.03	0.08	0.06	0.04
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.09	0.02	0.17	0.03	0.17	0.04	0.09	0.10	0.20	0.04	0.00	0.02	0.07	0.12	0.14	0.08
O4'	0.00	0.24	0.01	0.02	0.02	0.00	0.20	0.01	0.28	0.02	0.17	0.03	0.44	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.06	0.06
O5'	0.03	0.43	0.03	0.05	0.21	0.02	0.14	0.00	0.25	0.11	0.44	0.24	0.59	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.45	0.06	0.08	0.26	0.05	0.12	0.04	0.21	0.11	0.49	0.31	0.63	0.08	0.12	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.50	0.06	0.09	0.28	0.04	0.23	0.01	0.32	0.12	0.56	0.34	0.69	0.06	0.14	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.47	0.03	0.05	0.21	0.02	0.24	0.01	0.34	0.09	0.50	0.26	0.69	0.04	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00