Doublet Group distance statistics: 52400

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C2'	A	0, 0.022, 0.053, 0.084, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.053 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.009, 0.047, 0.102, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.047 std_dev=0.055
O2'	A	0, 0.041, 0.104, 0.167, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.104 std_dev=0.063
C3'	A	0, 0.027, 0.109, 0.191, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.109 std_dev=0.082
C4'	A	0, 0.008, 0.101, 0.195, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.101 std_dev=0.094
O3'	A	0, 0.038, 0.194, 0.350, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.194 std_dev=0.156
O5'	A	0, 0.046, 0.208, 0.370, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.208 std_dev=0.162
C5'	A	0, 0.005, 0.168, 0.332, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.168 std_dev=0.164
O2'	B	0, 0.003, 0.307, 0.612, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.307 std_dev=0.305
C2'	B	0, 0.028, 0.343, 0.657, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.343 std_dev=0.315
P	A	0, -0.003, 0.451, 0.905, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.451 std_dev=0.454
OP1	B	0, -0.042, 0.673, 1.388, 2.161 max_d=2.161 avg_d=0.673 std_dev=0.715
C3'	B	0, -0.210, 0.576, 1.362, 2.294 max_d=2.294 avg_d=0.576 std_dev=0.786
OP2	A	0, -0.128, 0.762, 1.651, 2.321 max_d=2.321 avg_d=0.762 std_dev=0.889
OP2	B	0, -0.133, 0.787, 1.706, 2.759 max_d=2.759 avg_d=0.787 std_dev=0.919
P	B	0, -0.168, 0.759, 1.687, 2.749 max_d=2.749 avg_d=0.759 std_dev=0.928
C1'	B	0, -0.309, 0.644, 1.597, 2.738 max_d=2.738 avg_d=0.644 std_dev=0.953
O5'	B	0, -0.297, 0.856, 2.010, 3.382 max_d=3.382 avg_d=0.856 std_dev=1.154
O3'	B	0, -0.463, 0.765, 1.993, 3.494 max_d=3.494 avg_d=0.765 std_dev=1.228
O2	B	0, -0.493, 0.745, 1.984, 3.497 max_d=3.497 avg_d=0.745 std_dev=1.239
OP1	A	0, -0.191, 1.071, 2.332, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.071 std_dev=1.261
C4'	B	0, -0.477, 0.884, 2.245, 3.893 max_d=3.893 avg_d=0.884 std_dev=1.361
N1	B	0, -0.547, 0.863, 2.274, 3.991 max_d=3.991 avg_d=0.863 std_dev=1.410
C5'	B	0, -0.488, 0.972, 2.432, 4.195 max_d=4.195 avg_d=0.972 std_dev=1.460
O4'	B	0, -0.528, 0.962, 2.453, 4.262 max_d=4.262 avg_d=0.962 std_dev=1.491
C2	B	0, -0.671, 0.929, 2.528, 4.488 max_d=4.488 avg_d=0.929 std_dev=1.599
C6	B	0, -0.730, 1.080, 2.889, 5.100 max_d=5.100 avg_d=1.080 std_dev=1.809
N3	B	0, -1.008, 1.228, 3.464, 6.215 max_d=6.215 avg_d=1.228 std_dev=2.236
C5	B	0, -1.074, 1.381, 3.836, 6.851 max_d=6.851 avg_d=1.381 std_dev=2.455
C4	B	0, -1.224, 1.455, 4.135, 7.433 max_d=7.433 avg_d=1.455 std_dev=2.679
N4	B	0, -1.595, 1.772, 5.139, 9.290 max_d=9.290 avg_d=1.772 std_dev=3.367

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.32	0.17	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.06	0.02	0.10	0.65	0.14	0.13
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.52	0.05	0.14
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.55	0.04	0.17
C4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.09	0.53	0.09	0.09
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.34	0.24	0.06
C5	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.12	0.61	0.16	0.09
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.06	0.03	0.09	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.32	0.29	0.00
C6	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.13	0.71	0.22	0.11
C8	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.40	0.11	0.10
N1	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.12	0.71	0.20	0.13
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.02	0.08	0.57	0.08	0.12
N6	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.14	0.78	0.27	0.12
N7	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.12	0.59	0.16	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.07	0.39	0.09	0.07
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.07	0.08	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.49	0.14	0.11
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.06	0.07	0.05	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.13	0.60	0.05	0.19
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.19	0.32	0.09
O5'	0.04	0.10	0.04	0.09	0.09	0.01	0.12	0.00	0.13	0.09	0.12	0.08	0.14	0.12	0.07	0.05	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.65	0.52	0.55	0.53	0.34	0.61	0.32	0.71	0.40	0.71	0.57	0.78	0.59	0.39	0.49	0.60	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.14	0.05	0.04	0.09	0.24	0.16	0.29	0.22	0.11	0.20	0.08	0.27	0.16	0.09	0.14	0.05	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.14	0.17	0.09	0.06	0.09	0.00	0.11	0.10	0.13	0.12	0.12	0.10	0.07	0.11	0.19	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.18	0.18	0.54	0.47	0.62	0.35	0.51	0.16	0.05	0.41	0.63	0.05	0.08	0.86	0.50	0.25	0.10	0.44	0.34
C2	0.26	0.96	0.12	0.35	1.51	0.16	1.24	0.11	0.88	0.71	1.40	1.83	0.74	0.20	0.70	0.22	0.24	0.22	0.12	0.10
C2'	0.34	0.20	0.19	0.64	0.59	0.76	0.45	0.63	0.20	0.05	0.49	0.79	0.05	0.07	1.01	0.61	0.29	0.11	0.44	0.35
C3'	0.45	0.11	0.22	0.76	0.51	0.96	0.38	0.82	0.12	0.05	0.40	0.71	0.10	0.09	1.18	0.80	0.38	0.11	0.49	0.39
C4	0.16	0.82	0.12	0.41	1.25	0.27	1.03	0.16	0.72	0.58	1.18	1.48	0.63	0.16	0.78	0.10	0.14	0.17	0.20	0.13
C4'	0.61	0.19	0.27	0.74	0.13	1.04	0.06	0.90	0.17	0.30	0.08	0.27	0.32	0.14	1.09	0.97	0.50	0.17	0.59	0.49
C5	0.35	1.13	0.14	0.35	1.65	0.15	1.39	0.13	1.03	0.86	1.56	1.90	0.89	0.20	0.73	0.28	0.30	0.26	0.12	0.12
C5'	0.68	0.25	0.29	0.83	0.08	1.22	0.07	1.07	0.23	0.36	0.09	0.20	0.37	0.21	1.21	1.12	0.58	0.19	0.63	0.52
C6	0.47	1.32	0.17	0.29	1.99	0.16	1.66	0.25	1.23	1.02	1.85	2.34	1.03	0.24	0.66	0.46	0.43	0.32	0.15	0.19
C8	0.12	0.73	0.12	0.47	1.06	0.35	0.90	0.24	0.65	0.53	1.00	1.21	0.55	0.12	0.86	0.12	0.12	0.16	0.28	0.17
N1	0.41	1.20	0.15	0.30	1.86	0.14	1.54	0.21	1.12	0.92	1.72	2.24	0.94	0.23	0.66	0.40	0.38	0.29	0.14	0.17
N3	0.13	0.75	0.12	0.41	1.20	0.27	0.98	0.17	0.67	0.52	1.12	1.46	0.56	0.17	0.75	0.10	0.13	0.16	0.20	0.14
N6	0.62	1.51	0.22	0.24	2.35	0.27	1.99	0.41	1.48	1.22	2.12	2.79	1.17	0.26	0.59	0.66	0.59	0.41	0.27	0.31
N7	0.36	1.11	0.16	0.37	1.56	0.17	1.35	0.13	1.03	0.87	1.47	1.73	0.86	0.18	0.75	0.27	0.30	0.26	0.13	0.11
N9	0.09	0.56	0.13	0.48	0.90	0.43	0.74	0.31	0.49	0.36	0.84	1.08	0.40	0.11	0.85	0.22	0.10	0.12	0.32	0.22
O2'	0.41	0.05	0.20	0.58	0.34	0.77	0.24	0.66	0.07	0.12	0.26	0.51	0.15	0.09	0.88	0.68	0.35	0.12	0.48	0.39
O3'	0.53	0.05	0.25	0.80	0.44	1.08	0.31	0.94	0.05	0.14	0.32	0.66	0.18	0.11	1.21	0.93	0.45	0.14	0.52	0.43
O4'	0.50	0.14	0.24	0.61	0.16	0.81	0.08	0.69	0.12	0.23	0.12	0.27	0.25	0.10	0.92	0.76	0.40	0.14	0.55	0.44
O5'	0.47	0.10	0.23	0.85	0.44	1.09	0.34	0.93	0.13	0.09	0.34	0.60	0.07	0.25	1.34	0.87	0.42	0.18	0.53	0.41
OP1	0.87	0.39	0.67	1.37	0.58	1.76	0.57	1.64	0.53	0.53	0.45	0.72	0.37	0.50	1.70	1.40	1.00	0.80	0.91	0.93
OP2	0.43	0.47	0.46	0.73	0.61	0.78	0.54	0.65	0.40	0.39	0.57	0.71	0.46	0.69	1.03	0.56	0.24	0.20	0.52	0.23
P	0.76	0.26	0.54	1.20	0.24	1.41	0.20	1.24	0.26	0.38	0.20	0.36	0.36	0.33	1.63	1.15	0.68	0.34	0.74	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.21	0.15
C2	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.14	0.06	0.16
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.08	0.39	0.23
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.25	0.55	0.15
C4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.31	0.31	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.38	0.06
C5	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.11	0.34	0.36	0.14
C5'	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.11	0.28	0.01
C6	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.10	0.25	0.21	0.15
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.13	0.05	0.16
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.09	0.23	0.17	0.16
N4	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.11	0.37	0.40	0.13
O2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.03	0.07	0.07	0.09	0.16
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.46	0.28
O3'	0.06	0.06	0.03	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.05	0.00	0.05	0.04	0.32	0.60	0.13
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.18	0.07
O5'	0.05	0.08	0.03	0.05	0.10	0.01	0.11	0.00	0.10	0.08	0.09	0.11	0.07	0.04	0.04	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.02	0.14	0.08	0.25	0.31	0.16	0.34	0.11	0.25	0.13	0.23	0.37	0.07	0.09	0.32	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.06	0.39	0.55	0.31	0.38	0.36	0.28	0.21	0.05	0.17	0.40	0.09	0.46	0.60	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.16	0.23	0.15	0.14	0.06	0.14	0.01	0.15	0.16	0.16	0.13	0.16	0.28	0.13	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00