Doublet Group distance statistics: 52404

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.005, 0.022, 0.038, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.008, 0.032, 0.056, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.032 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.005, 0.031, 0.057, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.026
O2'	A	0, 0.065, 0.233, 0.401, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.233 std_dev=0.168
C2'	A	0, 0.048, 0.220, 0.391, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.220 std_dev=0.172
O4'	A	0, 0.044, 0.223, 0.402, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.223 std_dev=0.179
C4'	A	0, 0.062, 0.333, 0.603, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.333 std_dev=0.270
C3'	A	0, 0.070, 0.348, 0.627, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.348 std_dev=0.279
O3'	A	0, 0.089, 0.444, 0.799, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.444 std_dev=0.355
C1'	B	0, 0.141, 0.575, 1.008, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.575 std_dev=0.433
N1	B	0, 0.127, 0.566, 1.005, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.566 std_dev=0.439
C5'	A	0, 0.117, 0.622, 1.127, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.622 std_dev=0.505
O2'	B	0, 0.141, 0.656, 1.171, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.656 std_dev=0.515
C2'	B	0, 0.132, 0.665, 1.198, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.665 std_dev=0.533
C5	B	0, 0.195, 0.809, 1.423, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.809 std_dev=0.614
C6	B	0, 0.196, 0.830, 1.464, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.830 std_dev=0.634
O5'	A	0, 0.164, 0.823, 1.481, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.823 std_dev=0.659
OP1	B	0, 0.174, 0.845, 1.516, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.845 std_dev=0.671
O4'	B	0, 0.216, 0.990, 1.765, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.990 std_dev=0.775
C4	B	0, 0.170, 1.007, 1.844, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.007 std_dev=0.837
C3'	B	0, 0.227, 1.076, 1.925, 1.835 max_d=1.835 avg_d=1.076 std_dev=0.849
C2	B	0, 0.227, 1.102, 1.976, 2.116 max_d=2.116 avg_d=1.102 std_dev=0.874
O3'	B	0, 0.226, 1.122, 2.018, 1.881 max_d=1.881 avg_d=1.122 std_dev=0.896
P	A	0, 0.233, 1.193, 2.153, 2.116 max_d=2.116 avg_d=1.193 std_dev=0.960
C4'	B	0, 0.256, 1.224, 2.191, 2.069 max_d=2.069 avg_d=1.224 std_dev=0.967
P	B	0, 0.248, 1.215, 2.183, 2.355 max_d=2.355 avg_d=1.215 std_dev=0.968
OP2	B	0, 0.271, 1.322, 2.373, 2.561 max_d=2.561 avg_d=1.322 std_dev=1.051
N4	B	0, 0.225, 1.298, 2.371, 2.862 max_d=2.862 avg_d=1.298 std_dev=1.073
OP2	A	0, 0.270, 1.371, 2.473, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.371 std_dev=1.102
N3	B	0, 0.283, 1.400, 2.518, 2.729 max_d=2.729 avg_d=1.400 std_dev=1.117
O5'	B	0, 0.286, 1.430, 2.575, 2.738 max_d=2.738 avg_d=1.430 std_dev=1.144
C5'	B	0, 0.308, 1.486, 2.664, 2.605 max_d=2.605 avg_d=1.486 std_dev=1.178
OP1	A	0, 0.284, 1.478, 2.671, 2.702 max_d=2.702 avg_d=1.478 std_dev=1.193
O2	B	0, 0.320, 1.537, 2.754, 2.632 max_d=2.632 avg_d=1.537 std_dev=1.217

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.32	0.18	0.25
C2	0.01	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.25	0.41	0.19	0.29
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.09	0.10	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.04	0.17	0.09
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.04	0.09	0.06	0.12	0.12	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.28	0.28	0.30	0.30
C4	0.00	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.27	0.40	0.23	0.31
C4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.10	0.02
C5	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.30	0.44	0.30	0.36
C5'	0.01	0.09	0.03	0.04	0.06	0.01	0.06	0.00	0.07	0.03	0.09	0.08	0.07	0.04	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.23	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.30	0.46	0.30	0.36
C8	0.00	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.33	0.44	0.36	0.40
N1	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.28	0.44	0.24	0.33
N3	0.00	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.01	0.24	0.38	0.17	0.27
N6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.31	0.48	0.34	0.39
N7	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.33	0.46	0.38	0.41
N9	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.39	0.25	0.32
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.21	0.10
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.07	0.02	0.06	0.07	0.10	0.05	0.14	0.13	0.10	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.52	0.52	0.59	0.55
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.40	0.39	0.38	0.39
O5'	0.24	0.25	0.08	0.28	0.27	0.02	0.30	0.01	0.30	0.33	0.28	0.24	0.31	0.33	0.28	0.08	0.52	0.40	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.41	0.04	0.28	0.40	0.04	0.44	0.23	0.46	0.44	0.44	0.38	0.48	0.46	0.39	0.02	0.52	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.19	0.17	0.30	0.23	0.10	0.30	0.29	0.30	0.36	0.24	0.17	0.34	0.38	0.25	0.21	0.59	0.38	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.29	0.09	0.30	0.31	0.02	0.36	0.01	0.36	0.40	0.33	0.27	0.39	0.41	0.32	0.10	0.55	0.39	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.38	0.02	0.09	0.30	0.08	0.19	0.11	0.15	0.23	0.40	0.33	0.50	0.08	0.22	0.23	0.54	0.17	0.74	0.53
C2	0.06	0.33	0.08	0.24	0.20	0.28	0.11	0.29	0.14	0.09	0.38	0.25	0.55	0.02	0.30	0.15	0.22	0.07	0.67	0.37
C2'	0.28	0.33	0.21	0.18	0.28	0.28	0.24	0.29	0.24	0.28	0.33	0.28	0.38	0.17	0.12	0.36	0.60	0.25	0.78	0.58
C3'	0.37	0.27	0.31	0.37	0.28	0.51	0.31	0.53	0.34	0.33	0.26	0.26	0.24	0.19	0.32	0.52	0.70	0.34	0.81	0.65
C4	0.05	0.39	0.07	0.22	0.26	0.20	0.11	0.20	0.09	0.14	0.42	0.30	0.60	0.04	0.31	0.05	0.30	0.08	0.69	0.40
C4'	0.29	0.29	0.13	0.19	0.30	0.47	0.29	0.52	0.29	0.29	0.30	0.30	0.28	0.09	0.05	0.51	0.76	0.34	0.80	0.67
C5	0.08	0.41	0.12	0.29	0.26	0.32	0.11	0.32	0.13	0.11	0.45	0.30	0.68	0.06	0.37	0.18	0.16	0.03	0.64	0.32
C5'	0.31	0.23	0.14	0.29	0.28	0.68	0.33	0.74	0.34	0.30	0.24	0.28	0.15	0.22	0.10	0.64	0.85	0.44	0.83	0.74
C6	0.13	0.36	0.14	0.32	0.21	0.40	0.14	0.42	0.19	0.07	0.42	0.26	0.64	0.06	0.38	0.28	0.07	0.05	0.60	0.26
C8	0.08	0.45	0.09	0.25	0.32	0.17	0.16	0.14	0.11	0.21	0.47	0.35	0.65	0.10	0.39	0.06	0.31	0.06	0.69	0.39
N1	0.11	0.33	0.12	0.29	0.18	0.37	0.14	0.39	0.19	0.07	0.38	0.24	0.58	0.04	0.34	0.25	0.11	0.05	0.62	0.29
N3	0.05	0.36	0.06	0.20	0.24	0.19	0.10	0.20	0.10	0.12	0.39	0.27	0.55	0.02	0.27	0.06	0.32	0.10	0.70	0.42
N6	0.19	0.33	0.18	0.37	0.17	0.49	0.19	0.53	0.27	0.09	0.42	0.25	0.64	0.09	0.41	0.40	0.13	0.11	0.53	0.17
N7	0.07	0.47	0.14	0.32	0.30	0.33	0.12	0.31	0.11	0.14	0.50	0.34	0.76	0.10	0.42	0.16	0.14	0.03	0.64	0.30
N9	0.10	0.41	0.05	0.18	0.30	0.10	0.15	0.09	0.11	0.20	0.43	0.33	0.58	0.07	0.30	0.10	0.40	0.11	0.71	0.45
O2'	0.27	0.34	0.19	0.16	0.29	0.28	0.23	0.29	0.23	0.28	0.34	0.29	0.39	0.15	0.11	0.35	0.64	0.26	0.77	0.60
O3'	0.40	0.20	0.40	0.52	0.24	0.63	0.34	0.66	0.39	0.33	0.17	0.20	0.12	0.27	0.51	0.57	0.73	0.37	0.80	0.66
O4'	0.16	0.35	0.08	0.14	0.31	0.17	0.22	0.22	0.18	0.23	0.38	0.33	0.43	0.22	0.31	0.32	0.64	0.22	0.75	0.59
O5'	0.09	0.06	0.03	0.07	0.07	0.24	0.09	0.26	0.10	0.08	0.06	0.07	0.06	0.14	0.01	0.23	0.26	0.20	0.27	0.12
OP1	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.13	0.08	0.16	0.08	0.04	0.03	0.06	0.03	0.08	0.03	0.10	0.02	0.46	0.01	0.18
OP2	0.20	0.38	0.27	0.14	0.30	0.04	0.19	0.05	0.16	0.25	0.38	0.31	0.47	0.35	0.01	0.09	0.43	0.85	0.43	0.58
P	0.04	0.12	0.08	0.02	0.07	0.09	0.01	0.09	0.01	0.05	0.11	0.07	0.18	0.16	0.01	0.06	0.11	0.53	0.07	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.21	0.18	0.32	0.07
C2	0.01	0.00	0.11	0.04	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.08	0.14	0.08	0.16	0.58	0.30
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.09	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01	0.51	0.52	0.13	0.37
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.36	0.52	0.07	0.33
C4	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.22	0.17	0.48	0.16
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.30	0.03
C5	0.02	0.00	0.08	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.01	0.14	0.46	0.17	0.31	0.18
C5'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.10	0.05	0.15	0.07	0.23	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.30	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.03	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.17	0.02	0.17	0.52	0.23	0.29	0.25
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.23	0.08	0.41	0.08
N3	0.01	0.00	0.09	0.03	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.07	0.09	0.09	0.24	0.61	0.32
N4	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.21	0.23	0.47	0.18
O2	0.00	0.01	0.19	0.07	0.01	0.16	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.40	0.13	0.26	0.21	0.24	0.66	0.43
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.17	0.02	0.18	0.05	0.40	0.00	0.01	0.01	0.52	0.63	0.21	0.44
O3'	0.03	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.13	0.01	0.00	0.01	0.20	0.48	0.07	0.24
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.03	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.09	0.03	0.26	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.50	0.20
O5'	0.21	0.08	0.51	0.36	0.22	0.00	0.46	0.00	0.52	0.23	0.09	0.21	0.21	0.52	0.20	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.16	0.52	0.52	0.17	0.15	0.17	0.07	0.23	0.08	0.24	0.23	0.24	0.63	0.48	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.58	0.13	0.07	0.48	0.30	0.31	0.30	0.29	0.41	0.61	0.47	0.66	0.21	0.07	0.50	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.30	0.37	0.33	0.16	0.03	0.18	0.01	0.25	0.08	0.32	0.18	0.43	0.44	0.24	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00