Doublet Group distance statistics: 52414

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.006, 0.024, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.011, 0.039, 0.066, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.039 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.011, 0.040, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.040 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.008, 0.037, 0.067, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.037 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.012, 0.045, 0.079, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.045 std_dev=0.034
N3	A	0, 0.006, 0.042, 0.077, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.042 std_dev=0.035
C2	A	0, 0.008, 0.045, 0.082, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.027, 0.115, 0.202, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.115 std_dev=0.087
O4'	A	0, 0.027, 0.185, 0.343, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.185 std_dev=0.158
C3'	B	0, 0.009, 0.179, 0.350, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.179 std_dev=0.171
O3'	B	0, 0.090, 0.311, 0.532, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.311 std_dev=0.221
C2'	B	0, -0.009, 0.215, 0.440, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.215 std_dev=0.224
C4'	B	0, 0.034, 0.381, 0.727, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.381 std_dev=0.347
C5'	B	0, 0.011, 0.361, 0.711, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.361 std_dev=0.350
O2'	A	0, 0.114, 0.466, 0.819, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.466 std_dev=0.353
C4'	A	0, 0.173, 0.607, 1.041, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.607 std_dev=0.434
C3'	A	0, 0.144, 0.629, 1.115, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.629 std_dev=0.486
P	A	0, 0.203, 0.725, 1.248, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.725 std_dev=0.523
OP1	A	0, 0.270, 0.951, 1.633, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.951 std_dev=0.681
OP2	A	0, 0.300, 1.025, 1.750, 1.560 max_d=1.560 avg_d=1.025 std_dev=0.725
O5'	A	0, 0.272, 1.018, 1.763, 1.767 max_d=1.767 avg_d=1.018 std_dev=0.746
O3'	A	0, 0.201, 0.954, 1.707, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.954 std_dev=0.753
O2'	B	0, 0.311, 1.089, 1.867, 1.770 max_d=1.770 avg_d=1.089 std_dev=0.778
C5'	A	0, 0.268, 1.063, 1.857, 1.910 max_d=1.910 avg_d=1.063 std_dev=0.794
O5'	B	0, 0.322, 1.124, 1.926, 1.821 max_d=1.821 avg_d=1.124 std_dev=0.802
O4'	B	0, 0.325, 1.138, 1.952, 1.851 max_d=1.851 avg_d=1.138 std_dev=0.813
C1'	B	0, 0.398, 1.378, 2.358, 2.200 max_d=2.200 avg_d=1.378 std_dev=0.980
P	B	0, 0.546, 1.906, 3.267, 3.085 max_d=3.085 avg_d=1.906 std_dev=1.361
OP1	B	0, 0.621, 2.157, 3.694, 3.463 max_d=3.463 avg_d=2.157 std_dev=1.537
N1	B	0, 0.706, 2.414, 4.123, 3.707 max_d=3.707 avg_d=2.414 std_dev=1.709
OP2	B	0, 0.778, 2.682, 4.586, 4.229 max_d=4.229 avg_d=2.682 std_dev=1.904
C6	B	0, 0.827, 2.824, 4.821, 4.249 max_d=4.249 avg_d=2.824 std_dev=1.997
C2	B	0, 0.974, 3.346, 5.719, 5.227 max_d=5.227 avg_d=3.346 std_dev=2.372
O2	B	0, 0.989, 3.423, 5.857, 5.449 max_d=5.449 avg_d=3.423 std_dev=2.434
C5	B	0, 1.178, 4.024, 6.869, 6.075 max_d=6.075 avg_d=4.024 std_dev=2.845
N3	B	0, 1.280, 4.386, 7.493, 6.799 max_d=6.799 avg_d=4.386 std_dev=3.107
C4	B	0, 1.375, 4.700, 8.026, 7.194 max_d=7.194 avg_d=4.700 std_dev=3.325
N4	B	0, 1.716, 5.871, 10.026, 9.013 max_d=9.013 avg_d=5.871 std_dev=4.155

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.27	0.00	0.16	0.25	0.16	0.17
C2	0.05	0.00	0.03	0.04	0.02	0.11	0.02	0.33	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.09	0.39	0.09	0.03	0.11	0.01	0.02
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.24	0.20	0.18	0.16
C3'	0.04	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.02	0.10	0.16	0.07	0.04	0.12	0.16	0.08	0.01	0.02	0.01	0.11	0.02	0.15	0.11
C4	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.31	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.31	0.04	0.03	0.13	0.04	0.05
C4'	0.02	0.11	0.02	0.00	0.12	0.00	0.16	0.00	0.16	0.17	0.14	0.09	0.18	0.18	0.12	0.04	0.10	0.00	0.01	0.15	0.06	0.06
C5	0.01	0.02	0.02	0.11	0.00	0.16	0.00	0.38	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.24	0.04	0.07	0.14	0.03	0.05
C5'	0.09	0.33	0.01	0.02	0.31	0.00	0.38	0.00	0.40	0.35	0.38	0.29	0.43	0.40	0.27	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.17	0.05
C6	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.16	0.01	0.40	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.28	0.04	0.09	0.16	0.05	0.06
C8	0.01	0.04	0.02	0.16	0.02	0.17	0.01	0.35	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.09	0.05	0.14	0.05	0.06
N1	0.03	0.01	0.03	0.07	0.02	0.14	0.01	0.38	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.35	0.07	0.07	0.14	0.04	0.05
N3	0.05	0.00	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.29	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.39	0.10	0.02	0.13	0.04	0.05
N6	0.02	0.01	0.02	0.12	0.01	0.18	0.01	0.43	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.25	0.05	0.12	0.21	0.08	0.09
N7	0.01	0.03	0.02	0.16	0.02	0.18	0.01	0.40	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.07	0.08	0.16	0.04	0.06
N9	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.27	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.07	0.23	0.03	0.06	0.17	0.08	0.09
O2'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.10	0.04	0.12	0.02	0.14	0.08	0.12	0.08	0.15	0.11	0.07	0.00	0.03	0.07	0.23	0.21	0.17	0.16
O3'	0.27	0.39	0.06	0.02	0.31	0.10	0.24	0.03	0.28	0.15	0.35	0.39	0.25	0.16	0.23	0.03	0.00	0.20	0.17	0.01	0.34	0.21
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.04	0.04	0.09	0.07	0.10	0.05	0.07	0.03	0.07	0.20	0.00	0.16	0.39	0.23	0.25
O5'	0.16	0.03	0.24	0.11	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.05	0.07	0.02	0.12	0.08	0.06	0.23	0.17	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.25	0.11	0.20	0.02	0.13	0.15	0.14	0.03	0.16	0.14	0.14	0.13	0.21	0.16	0.17	0.21	0.01	0.39	0.00	0.00	0.03	0.01
OP2	0.16	0.01	0.18	0.15	0.04	0.06	0.03	0.17	0.05	0.05	0.04	0.04	0.08	0.04	0.08	0.17	0.34	0.23	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.17	0.02	0.16	0.11	0.05	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.09	0.06	0.09	0.16	0.21	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.51	0.86	0.11	0.08	0.66	0.16	0.41	0.13	0.35	0.57	0.87	0.68	1.10	0.27	0.09	0.40	0.09	0.44	0.15	0.20
C2	0.55	0.96	0.20	0.16	0.78	0.25	0.49	0.18	0.41	0.64	1.00	0.83	1.17	0.35	0.12	0.48	0.13	0.55	0.22	0.27
C2'	0.55	0.94	0.11	0.07	0.79	0.15	0.55	0.06	0.47	0.66	0.96	0.82	1.15	0.25	0.06	0.42	0.02	0.27	0.06	0.05
C3'	0.66	0.92	0.28	0.30	0.76	0.37	0.58	0.25	0.54	0.71	0.92	0.77	1.11	0.24	0.28	0.56	0.24	0.15	0.28	0.21
C4	0.53	0.88	0.18	0.14	0.67	0.23	0.41	0.17	0.35	0.59	0.88	0.70	1.10	0.33	0.11	0.46	0.12	0.51	0.21	0.25
C4'	0.52	0.67	0.11	0.17	0.43	0.29	0.26	0.15	0.27	0.48	0.62	0.41	0.88	0.07	0.14	0.45	0.06	0.21	0.09	0.07
C5	0.49	0.78	0.19	0.14	0.57	0.24	0.33	0.18	0.29	0.52	0.77	0.58	0.99	0.33	0.11	0.44	0.15	0.53	0.24	0.27
C5'	0.44	0.41	0.07	0.18	0.14	0.36	0.02	0.28	0.09	0.30	0.31	0.09	0.61	0.01	0.16	0.43	0.12	0.22	0.19	0.16
C6	0.48	0.79	0.21	0.15	0.59	0.25	0.34	0.19	0.30	0.53	0.79	0.61	0.99	0.35	0.11	0.44	0.16	0.55	0.26	0.29
C8	0.48	0.70	0.17	0.13	0.47	0.22	0.26	0.16	0.24	0.48	0.67	0.46	0.92	0.29	0.10	0.42	0.13	0.46	0.20	0.23
N1	0.52	0.88	0.21	0.15	0.70	0.25	0.43	0.18	0.36	0.59	0.91	0.74	1.09	0.35	0.11	0.46	0.15	0.56	0.25	0.28
N3	0.55	0.96	0.19	0.14	0.78	0.23	0.50	0.17	0.41	0.65	1.00	0.83	1.19	0.33	0.11	0.47	0.12	0.52	0.20	0.24
N6	0.43	0.68	0.20	0.14	0.49	0.24	0.26	0.18	0.23	0.45	0.68	0.49	0.87	0.34	0.09	0.41	0.17	0.56	0.29	0.32
N7	0.46	0.66	0.19	0.14	0.44	0.25	0.23	0.18	0.21	0.45	0.63	0.43	0.86	0.31	0.10	0.42	0.15	0.51	0.24	0.27
N9	0.52	0.83	0.16	0.12	0.62	0.21	0.37	0.15	0.32	0.56	0.82	0.63	1.06	0.30	0.11	0.43	0.11	0.47	0.18	0.22
O2'	0.51	1.05	0.06	0.02	0.97	0.05	0.70	0.12	0.57	0.72	1.14	1.05	1.25	0.26	0.06	0.35	0.07	0.31	0.06	0.08
O3'	0.76	1.13	0.47	0.41	1.01	0.41	0.79	0.26	0.71	0.87	1.17	1.05	1.31	0.47	0.37	0.61	0.30	0.09	0.36	0.24
O4'	0.40	0.64	0.05	0.06	0.39	0.08	0.19	0.14	0.18	0.39	0.61	0.39	0.89	0.19	0.11	0.30	0.22	0.53	0.29	0.32
O5'	0.17	0.11	0.13	0.01	0.16	0.11	0.20	0.05	0.14	0.02	0.12	0.22	0.25	0.16	0.02	0.14	0.04	0.14	0.15	0.10
OP1	0.24	0.22	0.10	0.17	0.36	0.31	0.39	0.27	0.27	0.17	0.27	0.43	0.30	0.05	0.03	0.28	0.10	0.18	0.30	0.19
OP2	0.14	0.48	0.20	0.06	0.68	0.02	0.63	0.07	0.49	0.40	0.61	0.75	0.39	0.05	0.01	0.08	0.03	0.05	0.12	0.04
P	0.11	0.19	0.09	0.06	0.35	0.13	0.36	0.10	0.27	0.14	0.27	0.41	0.20	0.04	0.01	0.11	0.04	0.09	0.17	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.19	0.00	0.13	0.10	0.12	0.11
C2	0.01	0.00	0.11	0.12	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.17	0.04	0.12	0.09	0.11	0.09
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.10	0.11	0.12	0.02	0.09	0.05	0.20	0.01	0.03	0.03	0.28	0.26	0.38	0.31
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.19	0.01	0.21	0.04	0.18	0.11	0.15	0.21	0.11	0.03	0.02	0.01	0.06	0.05	0.08	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.19	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.33	0.07	0.05	0.21	0.24	0.29	0.22
C4'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.15	0.06	0.04	0.11	0.08	0.20	0.02	0.01	0.04	0.05	0.05	0.05
C5	0.02	0.01	0.10	0.21	0.00	0.15	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.37	0.09	0.07	0.25	0.27	0.29	0.25
C5'	0.03	0.04	0.11	0.04	0.15	0.01	0.20	0.00	0.18	0.07	0.08	0.18	0.06	0.07	0.07	0.01	0.01	0.06	0.04	0.04
C6	0.02	0.01	0.12	0.18	0.01	0.15	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.32	0.07	0.08	0.20	0.18	0.16	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.08	0.03	0.12	0.09	0.08	0.08
N3	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.25	0.13	0.04	0.15	0.15	0.20	0.14
N4	0.02	0.02	0.05	0.21	0.00	0.11	0.02	0.18	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.36	0.08	0.06	0.24	0.30	0.37	0.28
O2	0.03	0.00	0.20	0.11	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.13	0.29	0.06	0.12	0.08	0.08	0.08
O2'	0.05	0.16	0.01	0.03	0.33	0.20	0.37	0.07	0.32	0.19	0.25	0.36	0.13	0.00	0.03	0.13	0.20	0.17	0.43	0.25
O3'	0.19	0.17	0.03	0.02	0.07	0.02	0.09	0.07	0.07	0.08	0.13	0.08	0.29	0.03	0.00	0.10	0.06	0.15	0.06	0.08
O4'	0.00	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.04	0.06	0.06	0.13	0.10	0.00	0.11	0.08	0.07	0.08
O5'	0.13	0.12	0.28	0.06	0.21	0.04	0.25	0.01	0.20	0.12	0.15	0.24	0.12	0.20	0.06	0.11	0.00	0.04	0.03	0.00
OP1	0.10	0.09	0.26	0.05	0.24	0.05	0.27	0.06	0.18	0.09	0.15	0.30	0.08	0.17	0.15	0.08	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.11	0.38	0.08	0.29	0.05	0.29	0.04	0.16	0.08	0.20	0.37	0.08	0.43	0.06	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.09	0.31	0.07	0.22	0.05	0.25	0.04	0.16	0.08	0.14	0.28	0.08	0.25	0.08	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00