Doublet Group distance statistics: 52419

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.000, 0.080, 0.161, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.080 std_dev=0.080
OP1	A	0, 0.000, 0.134, 0.268, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.134 std_dev=0.134
C2'	A	0, 0.000, 0.134, 0.268, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.134 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.000, 0.146, 0.293, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.146 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.000, 0.214, 0.428, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.214 std_dev=0.214
O5'	A	0, 0.000, 0.222, 0.444, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.222 std_dev=0.222
P	A	0, 0.000, 0.235, 0.471, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.235 std_dev=0.235
O2'	A	0, 0.000, 0.265, 0.529, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.265 std_dev=0.265
C5'	A	0, 0.000, 0.285, 0.570, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.285 std_dev=0.285
O3'	A	0, 0.000, 0.302, 0.605, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.302 std_dev=0.302
OP2	A	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
C3'	B	0, 0.000, 0.429, 0.859, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.429 std_dev=0.429
O2'	B	0, 0.000, 0.474, 0.947, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.474 std_dev=0.474
O3'	B	0, 0.000, 0.510, 1.020, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.510 std_dev=0.510
C2'	B	0, 0.000, 0.643, 1.285, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.643 std_dev=0.643
C4'	B	0, 0.000, 0.859, 1.717, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.859 std_dev=0.859
O5'	B	0, 0.000, 0.985, 1.970, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.985 std_dev=0.985
O4'	B	0, 0.000, 0.993, 1.987, 1.987 max_d=1.987 avg_d=0.993 std_dev=0.993
C5'	B	0, 0.000, 1.024, 2.048, 2.048 max_d=2.048 avg_d=1.024 std_dev=1.024
C1'	B	0, 0.000, 1.210, 2.421, 2.421 max_d=2.421 avg_d=1.210 std_dev=1.210
P	B	0, 0.000, 1.911, 3.822, 3.822 max_d=3.822 avg_d=1.911 std_dev=1.911
N1	B	0, 0.000, 1.983, 3.966, 3.966 max_d=3.966 avg_d=1.983 std_dev=1.983
C6	B	0, 0.000, 2.026, 4.052, 4.052 max_d=4.052 avg_d=2.026 std_dev=2.026
OP2	B	0, 0.000, 2.296, 4.591, 4.591 max_d=4.591 avg_d=2.296 std_dev=2.296
OP1	B	0, 0.000, 2.914, 5.828, 5.828 max_d=5.828 avg_d=2.914 std_dev=2.914
C2	B	0, 0.000, 3.043, 6.086, 6.086 max_d=6.086 avg_d=3.043 std_dev=3.043
C5	B	0, 0.000, 3.070, 6.141, 6.141 max_d=6.141 avg_d=3.070 std_dev=3.070
O2	B	0, 0.000, 3.257, 6.515, 6.515 max_d=6.515 avg_d=3.257 std_dev=3.257
N3	B	0, 0.000, 3.955, 7.910, 7.910 max_d=7.910 avg_d=3.955 std_dev=3.955
C4	B	0, 0.000, 3.980, 7.960, 7.960 max_d=7.960 avg_d=3.980 std_dev=3.980
N4	B	0, 0.000, 5.018, 10.037, 10.037 max_d=10.037 avg_d=5.018 std_dev=5.018

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.19	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.01	0.01	0.04	0.18	0.09
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.07	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.08	0.02	0.05	0.04	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01
C4	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.03	0.19	0.08
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.03	0.06	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.06
C5	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.18	0.05
C5'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.10	0.03	0.00	0.08	0.11	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.00
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.02	0.01	0.07	0.01	0.17	0.03
C8	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.08	0.02	0.22	0.07
N1	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.02	0.00	0.05	0.02	0.16	0.05
N3	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.05	0.00	0.01	0.04	0.18	0.10
N6	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.09	0.02	0.14	0.00
N7	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.03	0.11	0.01	0.18	0.02
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.21	0.10
O2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.06	0.05	0.05	0.08	0.02	0.11	0.12	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.06	0.04	0.02
O3'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.09	0.02	0.05	0.05	0.09	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.09	0.11	0.05
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.07	0.21	0.16
O5'	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.08	0.05	0.01	0.09	0.11	0.04	0.07	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.04	0.02	0.06	0.03	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.06	0.09	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.19	0.18	0.07	0.03	0.19	0.06	0.18	0.02	0.17	0.22	0.16	0.18	0.14	0.18	0.21	0.04	0.11	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.09	0.05	0.01	0.08	0.06	0.05	0.00	0.03	0.07	0.05	0.10	0.00	0.02	0.10	0.02	0.05	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.67	0.90	0.32	0.18	0.40	0.23	0.04	0.44	0.09	0.55	0.78	0.34	1.30	0.32	0.25	0.57	0.69	1.39	1.12	1.03
C2	0.79	1.57	0.32	0.11	1.28	0.02	0.74	0.60	0.58	0.99	1.66	1.37	1.97	0.27	0.12	0.55	0.60	1.40	0.91	0.99
C2'	0.57	0.75	0.22	0.12	0.21	0.21	0.14	0.39	0.06	0.41	0.60	0.13	1.17	0.25	0.18	0.51	0.72	1.38	1.24	1.05
C3'	0.38	0.39	0.09	0.05	0.18	0.16	0.45	0.34	0.31	0.14	0.20	0.29	0.80	0.16	0.11	0.36	0.73	1.09	1.22	0.92
C4	0.75	1.38	0.31	0.10	1.01	0.01	0.54	0.61	0.44	0.86	1.39	1.05	1.78	0.28	0.12	0.52	0.61	1.26	0.87	0.92
C4'	0.36	0.25	0.14	0.11	0.35	0.25	0.59	0.26	0.41	0.05	0.02	0.48	0.64	0.21	0.20	0.37	0.73	1.09	1.26	0.94
C5	0.73	1.52	0.27	0.04	1.22	0.12	0.73	0.66	0.56	0.94	1.59	1.31	1.91	0.24	0.03	0.43	0.55	1.03	0.68	0.78
C5'	0.10	0.17	0.04	0.02	0.76	0.13	0.92	0.22	0.71	0.29	0.43	0.91	0.19	0.09	0.08	0.14	0.72	0.64	1.16	0.74
C6	0.73	1.67	0.26	0.02	1.46	0.16	0.91	0.68	0.68	1.04	1.82	1.61	2.05	0.21	0.01	0.41	0.53	1.06	0.65	0.79
C8	0.68	1.17	0.29	0.06	0.79	0.08	0.39	0.62	0.33	0.73	1.13	0.80	1.56	0.30	0.07	0.41	0.56	0.86	0.69	0.71
N1	0.76	1.68	0.28	0.05	1.46	0.09	0.89	0.66	0.67	1.04	1.83	1.60	2.05	0.22	0.05	0.47	0.57	1.25	0.77	0.90
N3	0.77	1.41	0.33	0.13	1.03	0.08	0.55	0.57	0.45	0.88	1.43	1.08	1.81	0.29	0.15	0.57	0.63	1.45	0.99	1.03
N6	0.67	1.75	0.21	0.04	1.64	0.26	1.05	0.71	0.77	1.07	1.97	1.84	2.09	0.15	0.06	0.31	0.48	0.90	0.50	0.68
N7	0.67	1.40	0.24	0.01	1.10	0.21	0.65	0.68	0.50	0.87	1.44	1.17	1.80	0.23	0.03	0.34	0.51	0.79	0.56	0.65
N9	0.72	1.15	0.32	0.12	0.72	0.07	0.32	0.56	0.28	0.72	1.09	0.72	1.55	0.31	0.16	0.52	0.63	1.19	0.90	0.90
O2'	0.58	0.72	0.24	0.14	0.14	0.29	0.21	0.33	0.10	0.40	0.55	0.03	1.14	0.26	0.20	0.56	0.75	1.62	1.42	1.19
O3'	0.32	0.24	0.05	0.04	0.38	0.21	0.63	0.24	0.44	0.02	0.00	0.54	0.65	0.13	0.10	0.35	0.72	1.07	1.31	0.92
O4'	0.55	0.59	0.29	0.19	0.05	0.27	0.24	0.38	0.14	0.32	0.41	0.04	0.97	0.31	0.30	0.49	0.72	1.24	1.14	0.98
O5'	0.11	0.06	0.05	0.04	0.55	0.02	0.71	0.26	0.56	0.19	0.27	0.66	0.28	0.10	0.00	0.10	0.58	0.29	0.84	0.49
OP1	0.15	0.64	0.12	0.02	1.07	0.07	1.06	0.08	0.83	0.59	0.89	1.20	0.39	0.11	0.01	0.06	0.23	0.63	0.39	0.09
OP2	0.22	0.11	0.04	0.06	0.19	0.04	0.29	0.06	0.20	0.02	0.02	0.25	0.34	0.26	0.01	0.16	0.13	0.47	0.18	0.10
P	0.07	0.16	0.05	0.00	0.54	0.04	0.63	0.08	0.49	0.23	0.34	0.63	0.10	0.13	0.00	0.07	0.29	0.30	0.41	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.16	0.01	0.21	0.52	0.20	0.24
C2	0.02	0.00	0.10	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.07	0.07	0.01	0.32	0.10	0.02
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.09	0.03	0.06	0.15	0.03	0.05	0.11	0.09	0.12	0.00	0.03	0.01	0.33	0.89	0.42	0.53
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.38	0.00	0.44	0.03	0.38	0.22	0.27	0.41	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.51	0.03	0.18
C4	0.01	0.00	0.09	0.38	0.00	0.16	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.22	0.01	0.22	0.04	0.41	0.34
C4'	0.00	0.02	0.03	0.00	0.16	0.00	0.24	0.01	0.23	0.09	0.07	0.18	0.08	0.24	0.02	0.00	0.02	0.18	0.00	0.06
C5	0.01	0.00	0.06	0.44	0.00	0.24	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.34	0.08	0.27	0.15	0.42	0.40
C5'	0.08	0.01	0.15	0.03	0.18	0.01	0.25	0.00	0.20	0.04	0.08	0.22	0.09	0.08	0.12	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.38	0.00	0.23	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.28	0.10	0.15	0.03	0.18	0.21
N1	0.01	0.00	0.05	0.22	0.00	0.09	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.04	0.00	0.03	0.30	0.02	0.01
N3	0.01	0.00	0.11	0.27	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.05	0.05	0.10	0.15	0.27	0.18
N4	0.01	0.01	0.09	0.41	0.00	0.18	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.27	0.01	0.28	0.16	0.54	0.45
O2	0.02	0.01	0.12	0.02	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.28	0.13	0.11	0.48	0.00	0.10
O2'	0.03	0.24	0.00	0.01	0.26	0.24	0.20	0.08	0.16	0.17	0.27	0.29	0.23	0.00	0.01	0.14	0.20	0.82	0.41	0.44
O3'	0.16	0.07	0.03	0.00	0.22	0.02	0.34	0.12	0.28	0.04	0.05	0.27	0.28	0.01	0.00	0.13	0.22	0.20	0.26	0.05
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.10	0.00	0.05	0.01	0.13	0.14	0.13	0.00	0.09	0.17	0.03	0.02
O5'	0.21	0.01	0.33	0.02	0.22	0.02	0.27	0.01	0.15	0.03	0.10	0.28	0.11	0.20	0.22	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.52	0.32	0.89	0.51	0.04	0.18	0.15	0.04	0.03	0.30	0.15	0.16	0.48	0.82	0.20	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.10	0.42	0.03	0.41	0.00	0.42	0.02	0.18	0.02	0.27	0.54	0.00	0.41	0.26	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.02	0.53	0.18	0.34	0.06	0.40	0.02	0.21	0.01	0.18	0.45	0.10	0.44	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00