Doublet Group distance statistics: 52421

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C8	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C2'	B	0, 0.000, 0.361, 0.722, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.361 std_dev=0.361
C3'	B	0, 0.000, 0.498, 0.996, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.498 std_dev=0.498
O4'	A	0, 0.000, 0.635, 1.269, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.635 std_dev=0.635
C2'	A	0, 0.000, 0.708, 1.415, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.708 std_dev=0.708
O2'	B	0, 0.000, 0.775, 1.550, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.775 std_dev=0.775
C4'	A	0, 0.000, 0.895, 1.789, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.895 std_dev=0.895
O2'	A	0, 0.000, 0.944, 1.888, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.944 std_dev=0.944
C3'	A	0, 0.000, 1.067, 2.134, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.067 std_dev=1.067
C1'	B	0, 0.000, 1.356, 2.712, 2.712 max_d=2.712 avg_d=1.356 std_dev=1.356
C4'	B	0, 0.000, 1.510, 3.020, 3.020 max_d=3.020 avg_d=1.510 std_dev=1.510
C5'	A	0, 0.000, 1.562, 3.123, 3.123 max_d=3.123 avg_d=1.562 std_dev=1.562
O3'	A	0, 0.000, 1.562, 3.125, 3.125 max_d=3.125 avg_d=1.562 std_dev=1.562
O3'	B	0, 0.000, 1.625, 3.249, 3.249 max_d=3.249 avg_d=1.625 std_dev=1.625
O5'	A	0, 0.000, 1.677, 3.355, 3.355 max_d=3.355 avg_d=1.677 std_dev=1.677
O5'	B	0, 0.000, 1.747, 3.493, 3.493 max_d=3.493 avg_d=1.747 std_dev=1.747
O4'	B	0, 0.000, 1.895, 3.791, 3.791 max_d=3.791 avg_d=1.895 std_dev=1.895
C5'	B	0, 0.000, 2.013, 4.027, 4.027 max_d=4.027 avg_d=2.013 std_dev=2.013
P	A	0, 0.000, 2.073, 4.147, 4.147 max_d=4.147 avg_d=2.073 std_dev=2.073
OP2	A	0, 0.000, 2.236, 4.472, 4.472 max_d=4.472 avg_d=2.236 std_dev=2.236
N1	B	0, 0.000, 2.304, 4.607, 4.607 max_d=4.607 avg_d=2.304 std_dev=2.304
OP1	B	0, 0.000, 2.368, 4.737, 4.737 max_d=4.737 avg_d=2.368 std_dev=2.368
P	B	0, 0.000, 2.507, 5.015, 5.015 max_d=5.015 avg_d=2.507 std_dev=2.507
C6	B	0, 0.000, 2.560, 5.120, 5.120 max_d=5.120 avg_d=2.560 std_dev=2.560
OP2	B	0, 0.000, 2.754, 5.507, 5.507 max_d=5.507 avg_d=2.754 std_dev=2.754
O2	B	0, 0.000, 2.846, 5.692, 5.692 max_d=5.692 avg_d=2.846 std_dev=2.846
OP1	A	0, 0.000, 3.022, 6.044, 6.044 max_d=6.044 avg_d=3.022 std_dev=3.022
C2	B	0, 0.000, 3.107, 6.214, 6.214 max_d=6.214 avg_d=3.107 std_dev=3.107
C5	B	0, 0.000, 3.619, 7.238, 7.238 max_d=7.238 avg_d=3.619 std_dev=3.619
N3	B	0, 0.000, 4.186, 8.372, 8.372 max_d=8.372 avg_d=4.186 std_dev=4.186
C4	B	0, 0.000, 4.460, 8.921, 8.921 max_d=8.921 avg_d=4.460 std_dev=4.460
N4	B	0, 0.000, 5.572, 11.145, 11.145 max_d=11.145 avg_d=5.572 std_dev=5.572

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.07	0.14	0.17
C2	0.03	0.00	0.37	0.29	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.44	0.43	0.11	0.24	0.48	0.03	0.34
C2'	0.00	0.37	0.00	0.00	0.20	0.01	0.11	0.01	0.19	0.12	0.30	0.36	0.15	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.09	0.04	0.22	0.23
C3'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.13	0.00	0.04	0.01	0.12	0.20	0.23	0.28	0.07	0.12	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.25	0.21
C4	0.02	0.00	0.20	0.13	0.00	0.01	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.19	0.06	0.25	0.47	0.11	0.37
C4'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.10	0.04	0.08	0.04	0.09	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.17	0.20	0.06
C5	0.02	0.00	0.11	0.04	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.09	0.03	0.33	0.68	0.16	0.49
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.18	0.21	0.13	0.06	0.22	0.23	0.12	0.03	0.03	0.00	0.00	0.24	0.17	0.02
C6	0.02	0.00	0.19	0.12	0.01	0.01	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.19	0.06	0.34	0.75	0.13	0.51
C8	0.00	0.00	0.12	0.20	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.21	0.07	0.31	0.59	0.27	0.49
N1	0.03	0.00	0.30	0.23	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.37	0.35	0.09	0.30	0.64	0.06	0.43
N3	0.03	0.00	0.36	0.28	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.42	0.39	0.10	0.20	0.36	0.04	0.29
N6	0.02	0.00	0.15	0.07	0.01	0.04	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.13	0.04	0.38	0.90	0.16	0.58
N7	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.03	0.36	0.77	0.26	0.57
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.22	0.37	0.17	0.34
O2'	0.00	0.44	0.00	0.00	0.23	0.02	0.15	0.03	0.24	0.08	0.37	0.42	0.20	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.05	0.10	0.25	0.17
O3'	0.01	0.43	0.01	0.00	0.19	0.00	0.09	0.03	0.19	0.21	0.35	0.39	0.13	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.32	0.18
O4'	0.00	0.11	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.07	0.09	0.10	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.04	0.00
O5'	0.08	0.24	0.09	0.07	0.25	0.01	0.33	0.00	0.34	0.31	0.30	0.20	0.38	0.36	0.22	0.05	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.07	0.48	0.04	0.02	0.47	0.17	0.68	0.24	0.75	0.59	0.64	0.36	0.90	0.77	0.37	0.10	0.14	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.03	0.22	0.25	0.11	0.20	0.16	0.17	0.13	0.27	0.06	0.04	0.16	0.26	0.17	0.25	0.32	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.34	0.23	0.21	0.37	0.06	0.49	0.02	0.51	0.49	0.43	0.29	0.58	0.57	0.34	0.17	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.12	0.19	0.08	0.13	0.68	0.11	0.79	0.02	0.16	0.03	0.22	0.26	0.09	0.41	0.89	0.55	0.71	0.43	0.65
C2	0.49	0.74	0.18	0.21	0.69	0.32	0.55	0.45	0.48	0.57	0.78	0.73	0.84	0.36	0.69	0.74	0.49	0.49	0.58	0.59
C2'	0.16	0.56	0.61	0.47	0.89	0.22	0.85	0.29	0.67	0.50	0.76	1.00	0.35	0.31	0.60	0.30	0.03	0.18	0.25	0.03
C3'	0.24	0.68	0.59	0.52	1.12	0.13	1.12	0.11	0.91	0.66	0.93	1.25	0.40	0.09	0.56	0.15	0.26	0.06	0.53	0.23
C4	0.53	0.67	0.17	0.19	0.55	0.39	0.45	0.50	0.42	0.54	0.66	0.56	0.79	0.33	0.68	0.82	0.50	0.51	0.55	0.59
C4'	0.26	0.20	0.14	0.07	0.63	0.67	0.62	0.68	0.39	0.15	0.45	0.79	0.03	0.24	0.22	0.70	0.29	0.50	0.05	0.36
C5	0.59	1.00	0.14	0.25	0.95	0.21	0.76	0.30	0.65	0.76	1.06	1.00	1.11	0.44	0.81	0.75	0.44	0.36	0.58	0.51
C5'	0.34	0.08	0.06	0.07	0.53	0.70	0.55	0.65	0.33	0.06	0.32	0.68	0.16	0.47	0.03	0.68	0.25	0.44	0.02	0.31
C6	0.57	1.14	0.14	0.27	1.17	0.10	0.93	0.20	0.75	0.84	1.28	1.28	1.25	0.47	0.84	0.66	0.41	0.29	0.61	0.48
C8	0.63	0.73	0.14	0.20	0.59	0.40	0.48	0.46	0.47	0.61	0.69	0.58	0.84	0.34	0.76	0.90	0.48	0.44	0.52	0.54
N1	0.53	0.99	0.16	0.25	1.01	0.18	0.80	0.29	0.66	0.73	1.11	1.11	1.08	0.43	0.78	0.68	0.44	0.37	0.61	0.53
N3	0.48	0.56	0.18	0.17	0.44	0.43	0.36	0.56	0.35	0.46	0.54	0.44	0.68	0.29	0.62	0.81	0.53	0.57	0.55	0.63
N6	0.58	1.40	0.11	0.31	1.52	0.06	1.19	0.02	0.93	0.99	1.64	1.70	1.49	0.52	0.90	0.54	0.34	0.14	0.62	0.40
N7	0.67	1.10	0.12	0.27	1.02	0.16	0.82	0.24	0.72	0.85	1.14	1.06	1.21	0.47	0.87	0.77	0.42	0.30	0.57	0.47
N9	0.52	0.48	0.17	0.15	0.31	0.52	0.25	0.61	0.29	0.42	0.41	0.28	0.61	0.25	0.61	0.89	0.53	0.57	0.50	0.61
O2'	0.25	0.80	0.66	0.46	1.18	0.28	1.07	0.39	0.82	0.66	1.06	1.35	0.61	0.33	0.52	0.29	0.00	0.27	0.28	0.08
O3'	0.61	1.25	0.80	0.72	1.83	0.11	1.79	0.16	1.47	1.18	1.59	2.02	0.90	0.15	0.56	0.20	0.65	0.39	1.04	0.64
O4'	0.72	0.38	0.17	0.26	0.07	1.06	0.09	1.12	0.26	0.43	0.19	0.05	0.52	0.33	0.10	1.21	0.83	0.97	0.67	0.92
O5'	0.53	0.25	0.29	0.22	0.09	0.73	0.15	0.60	0.00	0.23	0.08	0.19	0.44	0.59	0.02	0.75	0.34	0.43	0.20	0.37
OP1	0.08	0.06	0.09	0.04	0.35	0.09	0.45	0.07	0.35	0.12	0.18	0.43	0.12	0.33	0.02	0.10	0.24	0.10	0.25	0.19
OP2	0.01	0.25	0.12	0.22	0.77	0.07	0.95	0.38	0.79	0.38	0.47	0.88	0.08	0.71	0.01	0.07	0.69	0.61	0.86	0.72
P	0.14	0.03	0.13	0.03	0.36	0.18	0.46	0.00	0.35	0.10	0.18	0.43	0.17	0.47	0.00	0.18	0.20	0.06	0.25	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.06
C2	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.08	0.19	0.15
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.12	0.03	0.02
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.04	0.08	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.16	0.07	0.07
C4	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.03	0.09	0.15	0.22	0.17
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.07	0.12	0.14	0.12
C5'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.05	0.03	0.06	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.06	0.08	0.07
N1	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.12	0.10
N3	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.07	0.13	0.23	0.18
N4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.03	0.10	0.20	0.25	0.19
O2	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.04	0.01	0.03	0.06	0.20	0.15
O2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01
O3'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.04	0.03	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.25	0.14	0.12
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.10
O5'	0.01	0.04	0.02	0.03	0.09	0.01	0.07	0.00	0.04	0.03	0.07	0.10	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.02	0.08	0.12	0.16	0.15	0.07	0.12	0.05	0.06	0.04	0.13	0.20	0.06	0.10	0.25	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.19	0.03	0.07	0.22	0.02	0.14	0.00	0.08	0.12	0.23	0.25	0.20	0.00	0.14	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.15	0.02	0.07	0.17	0.02	0.12	0.00	0.07	0.10	0.18	0.19	0.15	0.01	0.12	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00