Doublet Group distance statistics: 52426

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 7, 2, 9, 12, 9, 8, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.020, 0.030, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.022, 0.038, 0.054, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.016, 0.032, 0.049, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.020, 0.042, 0.065, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.023, 0.049, 0.076, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.049 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.024, 0.052, 0.081, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.052 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.037, 0.080, 0.124, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.080 std_dev=0.044
N7	A	0, 0.043, 0.090, 0.136, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.090 std_dev=0.047
C8	A	0, 0.047, 0.100, 0.153, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.100 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.057, 0.191, 0.325, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.191 std_dev=0.134
C2'	A	0, 0.145, 0.295, 0.445, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.295 std_dev=0.150
O2'	A	0, 0.241, 0.430, 0.619, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.430 std_dev=0.189
O2'	B	0, 0.328, 0.520, 0.711, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.520 std_dev=0.191
C4'	A	0, 0.074, 0.281, 0.489, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.281 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.168, 0.392, 0.615, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.392 std_dev=0.223
C2'	B	0, 0.398, 0.675, 0.952, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.675 std_dev=0.277
O3'	B	0, 0.420, 0.719, 1.018, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.719 std_dev=0.299
O3'	A	0, 0.277, 0.588, 0.899, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.588 std_dev=0.311
C5'	A	0, 0.152, 0.512, 0.872, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.512 std_dev=0.360
C3'	B	0, 0.481, 0.923, 1.366, 2.118 max_d=2.118 avg_d=0.923 std_dev=0.443
P	A	0, 0.320, 0.809, 1.298, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.809 std_dev=0.489
O5'	A	0, 0.097, 0.598, 1.098, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.598 std_dev=0.500
OP1	B	0, 0.314, 0.819, 1.325, 2.335 max_d=2.335 avg_d=0.819 std_dev=0.505
C1'	B	0, 0.525, 1.091, 1.656, 2.114 max_d=2.114 avg_d=1.091 std_dev=0.566
OP2	A	0, 0.421, 1.001, 1.581, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.001 std_dev=0.580
N9	B	0, 0.585, 1.307, 2.029, 2.609 max_d=2.609 avg_d=1.307 std_dev=0.722
C8	B	0, 0.655, 1.390, 2.126, 2.820 max_d=2.820 avg_d=1.390 std_dev=0.736
OP1	A	0, 0.292, 1.042, 1.792, 2.930 max_d=2.930 avg_d=1.042 std_dev=0.750
C4'	B	0, 0.654, 1.410, 2.166, 3.115 max_d=3.115 avg_d=1.410 std_dev=0.756
O4'	B	0, 0.649, 1.463, 2.277, 3.087 max_d=3.087 avg_d=1.463 std_dev=0.814
N7	B	0, 0.730, 1.663, 2.597, 3.301 max_d=3.301 avg_d=1.663 std_dev=0.934
C4	B	0, 0.611, 1.555, 2.499, 3.138 max_d=3.138 avg_d=1.555 std_dev=0.944
P	B	0, 0.927, 1.951, 2.976, 3.944 max_d=3.944 avg_d=1.951 std_dev=1.024
N3	B	0, 0.569, 1.611, 2.654, 3.357 max_d=3.357 avg_d=1.611 std_dev=1.043
C5'	B	0, 0.802, 1.875, 2.949, 4.252 max_d=4.252 avg_d=1.875 std_dev=1.074
C5	B	0, 0.711, 1.800, 2.888, 3.630 max_d=3.630 avg_d=1.800 std_dev=1.089
O5'	B	0, 0.803, 1.894, 2.985, 3.911 max_d=3.911 avg_d=1.894 std_dev=1.091
C2	B	0, 0.650, 1.969, 3.288, 4.340 max_d=4.340 avg_d=1.969 std_dev=1.319
C6	B	0, 0.786, 2.167, 3.547, 4.651 max_d=4.651 avg_d=2.167 std_dev=1.380
N1	B	0, 0.761, 2.257, 3.753, 5.008 max_d=5.008 avg_d=2.257 std_dev=1.496
N6	B	0, 0.890, 2.454, 4.019, 5.306 max_d=5.306 avg_d=2.454 std_dev=1.564
OP2	B	0, 1.303, 3.180, 5.057, 5.626 max_d=5.626 avg_d=3.180 std_dev=1.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.17	0.14	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.16	0.04	0.11	0.18	0.29	0.11
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.08	0.06	0.10	0.11	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.19	0.06
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.08	0.11	0.11	0.09	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.20	0.06
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.11	0.19	0.23	0.09
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.05	0.05	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.08	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.14	0.20	0.26	0.10
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.07	0.05	0.10	0.11	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.12	0.04	0.14	0.21	0.30	0.11
C8	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.09	0.04	0.17	0.21	0.18	0.09
N1	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.15	0.04	0.13	0.20	0.31	0.11
N3	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.04	0.10	0.18	0.25	0.10
N6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.13	0.05	0.15	0.23	0.32	0.12
N7	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.10	0.04	0.17	0.21	0.24	0.10
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.19	0.17	0.09
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.04	0.06	0.04	0.08	0.05	0.11	0.11	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.09	0.19	0.04
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.12	0.09	0.15	0.13	0.13	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.12	0.14	0.26	0.08
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.20	0.12	0.11
O5'	0.07	0.11	0.04	0.07	0.11	0.01	0.14	0.01	0.14	0.17	0.13	0.10	0.15	0.17	0.11	0.04	0.12	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.18	0.07	0.07	0.19	0.08	0.20	0.08	0.21	0.21	0.20	0.18	0.23	0.21	0.19	0.09	0.14	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.29	0.19	0.20	0.23	0.17	0.26	0.19	0.30	0.18	0.31	0.25	0.32	0.24	0.17	0.19	0.26	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.06	0.06	0.09	0.03	0.10	0.02	0.11	0.09	0.11	0.10	0.12	0.10	0.09	0.04	0.08	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.53	0.25	0.25	0.29	0.29	0.29	0.34	0.40	0.19	0.51	0.41	0.40	0.21	0.20	0.33	0.26	0.29	0.30	0.27	0.20	0.27
C2	0.42	0.20	0.27	0.29	0.22	0.56	0.17	0.62	0.15	0.32	0.21	0.18	0.17	0.23	0.33	0.30	0.20	0.67	0.57	0.20	0.77	0.50
C2'	0.20	0.32	0.23	0.19	0.15	0.23	0.15	0.26	0.22	0.16	0.31	0.23	0.22	0.13	0.15	0.31	0.18	0.27	0.22	0.34	0.17	0.23
C3'	0.13	0.27	0.20	0.13	0.13	0.13	0.12	0.17	0.17	0.13	0.25	0.21	0.17	0.11	0.11	0.30	0.14	0.16	0.11	0.43	0.19	0.20
C4	0.35	0.32	0.27	0.28	0.16	0.50	0.15	0.54	0.21	0.26	0.32	0.20	0.22	0.18	0.25	0.32	0.21	0.58	0.50	0.19	0.60	0.42
C4'	0.18	0.50	0.18	0.14	0.33	0.10	0.31	0.17	0.39	0.18	0.48	0.43	0.38	0.23	0.22	0.28	0.20	0.15	0.12	0.42	0.32	0.20
C5	0.44	0.23	0.27	0.29	0.21	0.56	0.17	0.60	0.16	0.33	0.23	0.18	0.16	0.24	0.33	0.30	0.18	0.68	0.56	0.19	0.78	0.47
C5'	0.24	0.49	0.16	0.12	0.35	0.23	0.32	0.27	0.38	0.21	0.45	0.45	0.35	0.24	0.26	0.24	0.16	0.26	0.21	0.50	0.47	0.29
C6	0.51	0.19	0.27	0.30	0.33	0.61	0.27	0.67	0.18	0.41	0.17	0.30	0.16	0.33	0.43	0.26	0.18	0.76	0.63	0.22	0.96	0.54
C8	0.29	0.42	0.27	0.28	0.21	0.45	0.20	0.47	0.28	0.22	0.38	0.33	0.27	0.18	0.21	0.34	0.22	0.48	0.42	0.19	0.48	0.35
N1	0.48	0.19	0.27	0.30	0.31	0.60	0.26	0.67	0.17	0.39	0.17	0.28	0.16	0.31	0.41	0.27	0.18	0.75	0.63	0.22	0.93	0.54
N3	0.36	0.29	0.27	0.28	0.16	0.50	0.14	0.56	0.20	0.26	0.30	0.18	0.22	0.18	0.26	0.32	0.22	0.58	0.51	0.20	0.61	0.44
N6	0.58	0.38	0.27	0.30	0.49	0.64	0.41	0.70	0.31	0.50	0.28	0.52	0.26	0.44	0.54	0.22	0.18	0.82	0.68	0.27	1.13	0.58
N7	0.42	0.29	0.27	0.29	0.19	0.55	0.17	0.57	0.19	0.31	0.27	0.20	0.18	0.23	0.31	0.31	0.18	0.65	0.52	0.18	0.73	0.44
N9	0.27	0.43	0.27	0.28	0.21	0.42	0.21	0.45	0.30	0.20	0.41	0.32	0.30	0.17	0.19	0.34	0.24	0.44	0.41	0.21	0.41	0.35
O2'	0.17	0.41	0.21	0.17	0.23	0.17	0.24	0.21	0.33	0.16	0.42	0.32	0.34	0.18	0.16	0.30	0.19	0.20	0.18	0.34	0.16	0.19
O3'	0.12	0.23	0.19	0.09	0.11	0.11	0.11	0.19	0.14	0.14	0.21	0.17	0.14	0.11	0.11	0.32	0.11	0.13	0.11	0.50	0.29	0.23
O4'	0.24	0.64	0.25	0.24	0.42	0.19	0.41	0.24	0.51	0.24	0.61	0.55	0.50	0.30	0.28	0.35	0.30	0.18	0.21	0.31	0.18	0.21
O5'	0.13	0.30	0.08	0.07	0.17	0.28	0.14	0.33	0.17	0.14	0.25	0.27	0.15	0.12	0.12	0.22	0.01	0.25	0.22	0.58	0.35	0.35
OP1	0.14	0.22	0.08	0.08	0.13	0.32	0.11	0.40	0.11	0.16	0.16	0.21	0.11	0.15	0.12	0.19	0.02	0.27	0.33	0.83	0.56	0.48
OP2	0.27	0.40	0.37	0.14	0.37	0.05	0.42	0.11	0.44	0.41	0.43	0.37	0.47	0.44	0.35	0.53	0.02	0.12	0.20	0.61	0.24	0.23
P	0.06	0.21	0.14	0.01	0.10	0.17	0.09	0.21	0.11	0.14	0.17	0.19	0.11	0.13	0.07	0.26	0.01	0.11	0.16	0.59	0.29	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.16	0.68	0.39	0.13
C2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.02	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.22	0.24	0.09	0.34	0.98	0.96	0.33
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.07	0.10	0.09	0.10	0.08	0.09	0.04	0.00	0.02	0.02	0.13	0.39	0.44	0.14
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.04	0.12	0.06	0.10	0.07	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.28	0.23	0.15
C4	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.14	0.05	0.36	0.98	0.91	0.33
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.12	0.05	0.06	0.09	0.12	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.22	0.20	0.06
C5	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01	0.07	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.04	0.45	1.09	1.17	0.44
C5'	0.06	0.16	0.06	0.02	0.18	0.01	0.25	0.00	0.25	0.28	0.20	0.13	0.29	0.30	0.18	0.05	0.03	0.02	0.01	0.13	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01	0.07	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.13	0.05	0.46	1.11	1.25	0.47
C8	0.02	0.02	0.10	0.12	0.01	0.12	0.01	0.28	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.08	0.06	0.07	0.47	1.06	1.02	0.41
N1	0.03	0.00	0.09	0.06	0.01	0.05	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.19	0.20	0.07	0.41	1.06	1.14	0.42
N3	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.21	0.23	0.09	0.29	0.92	0.81	0.27
N6	0.02	0.02	0.08	0.07	0.01	0.09	0.01	0.29	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.12	0.10	0.05	0.51	1.15	1.39	0.54
N7	0.01	0.03	0.09	0.11	0.01	0.12	0.01	0.30	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.07	0.05	0.05	0.51	1.14	1.27	0.51
N9	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.34	0.92	0.76	0.28
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.12	0.02	0.09	0.05	0.13	0.08	0.19	0.21	0.12	0.07	0.04	0.00	0.04	0.02	0.14	0.40	0.57	0.17
O3'	0.08	0.24	0.02	0.01	0.14	0.02	0.09	0.03	0.13	0.06	0.20	0.23	0.10	0.05	0.07	0.04	0.00	0.06	0.08	0.32	0.22	0.16
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.09	0.05	0.05	0.01	0.02	0.06	0.00	0.09	0.69	0.13	0.16
O5'	0.16	0.34	0.13	0.08	0.36	0.02	0.45	0.01	0.46	0.47	0.41	0.29	0.51	0.51	0.34	0.14	0.08	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.68	0.98	0.39	0.28	0.98	0.22	1.09	0.13	1.11	1.06	1.06	0.92	1.15	1.14	0.92	0.40	0.32	0.69	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.96	0.44	0.23	0.91	0.20	1.17	0.40	1.25	1.02	1.14	0.81	1.39	1.27	0.76	0.57	0.22	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.33	0.14	0.15	0.33	0.06	0.44	0.01	0.47	0.41	0.42	0.27	0.54	0.51	0.28	0.17	0.16	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00