Doublet Group distance statistics: 52429

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 10, 4, 2, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.002, 0.016, 0.031, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.004, 0.012, 0.028, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.012 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.003, 0.016, 0.035, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.016 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.004, 0.035, 0.067, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.035 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.032, 0.065, 0.097, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.065 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.027, 0.096, 0.165, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.096 std_dev=0.069
O2'	A	0, 0.045, 0.123, 0.201, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.123 std_dev=0.078
C4'	A	0, 0.034, 0.136, 0.238, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.136 std_dev=0.102
C8	B	0, 0.104, 0.222, 0.340, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.222 std_dev=0.118
C3'	A	0, 0.038, 0.156, 0.275, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.156 std_dev=0.119
N9	B	0, 0.128, 0.268, 0.408, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.268 std_dev=0.140
N7	B	0, 0.065, 0.205, 0.345, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.205 std_dev=0.140
C5	B	0, 0.086, 0.242, 0.398, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.242 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.118, 0.277, 0.435, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.277 std_dev=0.159
P	A	0, 0.160, 0.322, 0.484, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.322 std_dev=0.162
C5'	A	0, 0.049, 0.213, 0.377, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.213 std_dev=0.164
C1'	B	0, 0.179, 0.350, 0.521, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.350 std_dev=0.171
O4'	B	0, 0.236, 0.408, 0.580, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.408 std_dev=0.172
O3'	A	0, 0.094, 0.268, 0.443, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.268 std_dev=0.175
OP2	A	0, 0.237, 0.411, 0.586, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.411 std_dev=0.175
C5'	B	0, 0.207, 0.395, 0.583, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.395 std_dev=0.188
C4'	B	0, 0.192, 0.381, 0.570, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.381 std_dev=0.189
O5'	B	0, 0.197, 0.393, 0.588, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.393 std_dev=0.195
C2'	B	0, 0.130, 0.326, 0.522, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.326 std_dev=0.196
N3	B	0, 0.161, 0.359, 0.557, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.359 std_dev=0.198
C3'	B	0, 0.163, 0.365, 0.567, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.365 std_dev=0.202
P	B	0, 0.184, 0.387, 0.590, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.387 std_dev=0.203
C6	B	0, 0.106, 0.313, 0.520, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.313 std_dev=0.207
OP1	B	0, 0.275, 0.488, 0.700, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.488 std_dev=0.213
O2'	B	0, 0.158, 0.379, 0.600, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.379 std_dev=0.221
C2	B	0, 0.169, 0.392, 0.615, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.392 std_dev=0.223
OP2	B	0, 0.259, 0.489, 0.718, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.489 std_dev=0.229
N1	B	0, 0.149, 0.384, 0.618, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.384 std_dev=0.235
OP1	A	0, 0.178, 0.415, 0.652, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.415 std_dev=0.237
O3'	B	0, 0.162, 0.405, 0.648, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.405 std_dev=0.243
O5'	A	0, 0.071, 0.316, 0.561, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.316 std_dev=0.245
N6	B	0, 0.118, 0.363, 0.609, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.363 std_dev=0.246

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.20	0.13	0.07
C2	0.04	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.07	0.05	0.04	0.19	0.20	0.15	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.19	0.14	0.06
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.09	0.06	0.04	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.19	0.13	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.17	0.18	0.13	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.19	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.19	0.17	0.14	0.10
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.12	0.08	0.05	0.11	0.12	0.07	0.03	0.03	0.02	0.01	0.20	0.11	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.07	0.02	0.20	0.17	0.14	0.11
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.17	0.16	0.13	0.10
N1	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.06	0.03	0.21	0.19	0.14	0.11
N3	0.04	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.05	0.04	0.17	0.20	0.14	0.09
N6	0.03	0.02	0.06	0.09	0.02	0.06	0.02	0.11	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.09	0.03	0.22	0.17	0.15	0.12
N7	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.19	0.16	0.14	0.11
N9	0.00	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.14	0.18	0.13	0.08
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.06	0.07	0.06	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.08	0.16	0.12	0.04
O3'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.07	0.09	0.06	0.05	0.09	0.09	0.05	0.03	0.00	0.02	0.18	0.16	0.12	0.07
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.13	0.21	0.13	0.08
O5'	0.09	0.19	0.04	0.06	0.17	0.02	0.19	0.01	0.20	0.17	0.21	0.17	0.22	0.19	0.14	0.08	0.18	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.20	0.20	0.19	0.19	0.18	0.19	0.17	0.20	0.17	0.16	0.19	0.20	0.17	0.16	0.18	0.16	0.16	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.15	0.14	0.13	0.13	0.10	0.14	0.11	0.14	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.13	0.12	0.12	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.06	0.06	0.09	0.03	0.10	0.01	0.11	0.10	0.11	0.09	0.12	0.11	0.08	0.04	0.07	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.13	0.08	0.07	0.11	0.08	0.11	0.12	0.13	0.09	0.14	0.12	0.15	0.11	0.09	0.09	0.10	0.09	0.07	0.10	0.03	0.03
C2	0.07	0.17	0.07	0.07	0.11	0.07	0.13	0.12	0.17	0.10	0.19	0.13	0.20	0.12	0.08	0.08	0.10	0.07	0.09	0.12	0.06	0.06
C2'	0.10	0.13	0.09	0.07	0.11	0.08	0.12	0.10	0.13	0.10	0.14	0.13	0.15	0.12	0.10	0.09	0.10	0.10	0.06	0.10	0.03	0.04
C3'	0.10	0.13	0.07	0.05	0.12	0.05	0.13	0.09	0.14	0.12	0.14	0.12	0.15	0.13	0.11	0.08	0.06	0.11	0.05	0.05	0.04	0.01
C4	0.07	0.14	0.07	0.07	0.10	0.08	0.11	0.12	0.14	0.10	0.15	0.12	0.16	0.12	0.08	0.08	0.10	0.07	0.09	0.12	0.06	0.06
C4'	0.10	0.14	0.07	0.06	0.13	0.05	0.14	0.10	0.15	0.12	0.15	0.13	0.16	0.15	0.11	0.08	0.06	0.11	0.06	0.05	0.07	0.02
C5	0.09	0.14	0.09	0.09	0.10	0.09	0.11	0.13	0.12	0.13	0.14	0.12	0.13	0.14	0.09	0.10	0.11	0.09	0.10	0.14	0.08	0.09
C5'	0.15	0.18	0.12	0.12	0.17	0.10	0.18	0.10	0.18	0.17	0.18	0.17	0.19	0.18	0.16	0.12	0.11	0.16	0.09	0.03	0.12	0.06
C6	0.10	0.15	0.10	0.10	0.11	0.10	0.12	0.13	0.14	0.13	0.16	0.13	0.15	0.14	0.10	0.11	0.12	0.10	0.10	0.14	0.09	0.09
C8	0.09	0.12	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.13	0.10	0.13	0.11	0.12	0.10	0.12	0.09	0.10	0.12	0.09	0.10	0.13	0.09	0.09
N1	0.09	0.17	0.09	0.08	0.11	0.09	0.13	0.13	0.16	0.12	0.18	0.13	0.18	0.13	0.09	0.10	0.10	0.08	0.10	0.13	0.08	0.08
N3	0.07	0.16	0.06	0.06	0.10	0.07	0.12	0.12	0.16	0.09	0.17	0.13	0.19	0.12	0.07	0.07	0.09	0.06	0.09	0.11	0.06	0.06
N6	0.12	0.16	0.12	0.12	0.12	0.12	0.13	0.13	0.13	0.14	0.15	0.14	0.14	0.15	0.12	0.13	0.14	0.12	0.11	0.16	0.10	0.11
N7	0.11	0.12	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.13	0.10	0.16	0.11	0.12	0.10	0.15	0.12	0.12	0.13	0.11	0.11	0.15	0.10	0.11
N9	0.07	0.13	0.07	0.07	0.10	0.08	0.11	0.12	0.13	0.10	0.13	0.12	0.14	0.12	0.08	0.08	0.11	0.07	0.08	0.11	0.06	0.06
O2'	0.10	0.14	0.08	0.07	0.12	0.08	0.12	0.08	0.14	0.10	0.14	0.13	0.15	0.12	0.10	0.09	0.09	0.11	0.06	0.14	0.08	0.07
O3'	0.09	0.12	0.08	0.07	0.12	0.06	0.13	0.08	0.14	0.12	0.13	0.11	0.15	0.14	0.11	0.08	0.08	0.11	0.02	0.02	0.03	0.01
O4'	0.09	0.14	0.09	0.07	0.12	0.08	0.13	0.13	0.14	0.10	0.15	0.13	0.16	0.13	0.10	0.10	0.09	0.10	0.08	0.07	0.05	0.01
O5'	0.15	0.20	0.15	0.14	0.20	0.13	0.23	0.16	0.23	0.21	0.22	0.19	0.25	0.24	0.19	0.18	0.14	0.13	0.16	0.18	0.30	0.21
OP1	0.09	0.11	0.09	0.08	0.11	0.08	0.14	0.12	0.14	0.14	0.12	0.10	0.16	0.15	0.11	0.11	0.09	0.11	0.11	0.11	0.13	0.11
OP2	0.15	0.14	0.12	0.10	0.15	0.14	0.17	0.16	0.16	0.18	0.15	0.14	0.18	0.18	0.16	0.12	0.09	0.17	0.14	0.12	0.14	0.12
P	0.08	0.11	0.09	0.07	0.11	0.08	0.13	0.11	0.13	0.12	0.12	0.10	0.15	0.14	0.10	0.12	0.07	0.09	0.08	0.07	0.16	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.05	0.06	0.08	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.08	0.11	0.09	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.08	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.08	0.09	0.10	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.10	0.12	0.12	0.10
C5'	0.02	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.04	0.08	0.10	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.10	0.13	0.12	0.11
C8	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04	0.10	0.11	0.12	0.10
N1	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.04	0.09	0.12	0.11	0.10
N3	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.07	0.09	0.09	0.08
N6	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.11	0.14	0.14	0.12
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.11	0.13	0.13	0.11
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.08	0.08	0.10	0.08
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.04	0.07	0.06	0.08	0.09	0.08	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.08	0.04
O3'	0.07	0.11	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.09	0.06	0.10	0.11	0.09	0.07	0.07	0.03	0.00	0.06	0.04	0.05	0.07	0.05
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.06	0.09	0.08
O5'	0.05	0.08	0.04	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.10	0.10	0.09	0.07	0.11	0.11	0.08	0.03	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.11	0.04	0.03	0.09	0.02	0.12	0.02	0.13	0.11	0.12	0.09	0.14	0.13	0.08	0.03	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.09	0.08	0.06	0.10	0.05	0.12	0.06	0.12	0.12	0.11	0.09	0.14	0.13	0.10	0.08	0.07	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.04	0.02	0.09	0.02	0.10	0.01	0.11	0.10	0.10	0.08	0.12	0.11	0.08	0.04	0.05	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00