Doublet Group distance statistics: 52433

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.016, 0.033, 0.051, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.010, 0.033, 0.056, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.033 std_dev=0.023
C2'	B	0, 0.198, 0.343, 0.488, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.343 std_dev=0.145
O2'	B	0, 0.251, 0.463, 0.674, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.463 std_dev=0.212
O4'	A	0, 0.260, 0.513, 0.766, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.513 std_dev=0.253
C2'	A	0, 0.249, 0.505, 0.762, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.505 std_dev=0.257
O2'	A	0, 0.244, 0.507, 0.770, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.507 std_dev=0.263
C3'	B	0, 0.311, 0.575, 0.838, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.575 std_dev=0.264
C1'	B	0, 0.311, 0.589, 0.868, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.589 std_dev=0.279
O3'	B	0, 0.344, 0.657, 0.970, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.657 std_dev=0.313
N9	B	0, 0.398, 0.751, 1.105, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.751 std_dev=0.353
C4'	A	0, 0.372, 0.772, 1.172, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.772 std_dev=0.400
C8	B	0, 0.480, 0.888, 1.296, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.888 std_dev=0.408
C3'	A	0, 0.427, 0.839, 1.251, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.839 std_dev=0.412
C4	B	0, 0.451, 0.885, 1.320, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.885 std_dev=0.435
C4'	B	0, 0.483, 0.930, 1.377, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.930 std_dev=0.447
O4'	B	0, 0.442, 0.892, 1.343, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.892 std_dev=0.450
N3	B	0, 0.439, 0.919, 1.399, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.919 std_dev=0.480
N7	B	0, 0.541, 1.049, 1.557, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.049 std_dev=0.508
C5	B	0, 0.547, 1.065, 1.584, 1.959 max_d=1.959 avg_d=1.065 std_dev=0.519
P	A	0, 0.563, 1.122, 1.682, 1.916 max_d=1.916 avg_d=1.122 std_dev=0.559
O3'	A	0, 0.625, 1.202, 1.779, 2.048 max_d=2.048 avg_d=1.202 std_dev=0.577
C2	B	0, 0.558, 1.157, 1.757, 2.282 max_d=2.282 avg_d=1.157 std_dev=0.600
OP2	A	0, 0.792, 1.421, 2.050, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.421 std_dev=0.629
C6	B	0, 0.657, 1.287, 1.917, 2.378 max_d=2.378 avg_d=1.287 std_dev=0.630
C5'	B	0, 0.633, 1.295, 1.957, 2.489 max_d=2.489 avg_d=1.295 std_dev=0.662
N1	B	0, 0.673, 1.337, 2.000, 2.540 max_d=2.540 avg_d=1.337 std_dev=0.664
C5'	A	0, 0.690, 1.357, 2.024, 2.255 max_d=2.255 avg_d=1.357 std_dev=0.667
OP1	A	0, 0.458, 1.179, 1.900, 2.277 max_d=2.277 avg_d=1.179 std_dev=0.721
N6	B	0, 0.745, 1.483, 2.222, 2.637 max_d=2.637 avg_d=1.483 std_dev=0.738
O5'	A	0, 0.899, 1.853, 2.807, 2.881 max_d=2.881 avg_d=1.853 std_dev=0.954
O5'	B	0, 0.812, 2.069, 3.325, 4.459 max_d=4.459 avg_d=2.069 std_dev=1.256
P	B	0, 0.907, 2.558, 4.209, 5.603 max_d=5.603 avg_d=2.558 std_dev=1.651
OP2	B	0, 0.752, 2.430, 4.108, 5.734 max_d=5.734 avg_d=2.430 std_dev=1.678
OP1	B	0, 1.168, 2.962, 4.757, 6.028 max_d=6.028 avg_d=2.962 std_dev=1.794

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.20	0.39	0.08
C2	0.01	0.00	0.16	0.23	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.30	0.03	0.15	0.14	0.31	0.12
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.08	0.12	0.16	0.06	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.56	0.16
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.02	0.16	0.12	0.21	0.21	0.15	0.12	0.07	0.02	0.00	0.01	0.13	0.08	0.62	0.20
C4	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.17	0.02	0.11	0.14	0.30	0.10
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.08	0.05	0.10	0.10	0.07	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.21	0.43	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.17	0.02	0.14	0.11	0.29	0.12
C5'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.08	0.00	0.09	0.00	0.11	0.06	0.13	0.11	0.11	0.08	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.21	0.31	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.22	0.03	0.16	0.10	0.31	0.13
C8	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.03	0.17	0.13	0.28	0.11
N1	0.01	0.01	0.12	0.21	0.01	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.28	0.03	0.16	0.11	0.32	0.13
N3	0.01	0.01	0.16	0.21	0.00	0.10	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.26	0.03	0.12	0.16	0.31	0.11
N6	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.07	0.02	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.22	0.04	0.16	0.11	0.34	0.13
N7	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.16	0.02	0.17	0.12	0.27	0.13
N9	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.15	0.32	0.09
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.19	0.56	0.12
O3'	0.01	0.30	0.01	0.00	0.17	0.02	0.17	0.03	0.22	0.14	0.28	0.26	0.22	0.16	0.07	0.03	0.00	0.02	0.19	0.09	0.72	0.23
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.13	0.27	0.31	0.07
O5'	0.07	0.15	0.07	0.13	0.11	0.01	0.14	0.01	0.16	0.17	0.16	0.12	0.16	0.17	0.10	0.04	0.19	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.20	0.14	0.11	0.08	0.14	0.21	0.11	0.21	0.10	0.13	0.11	0.16	0.11	0.12	0.15	0.19	0.09	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.31	0.56	0.62	0.30	0.43	0.29	0.31	0.31	0.28	0.32	0.31	0.34	0.27	0.32	0.56	0.72	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.16	0.20	0.10	0.06	0.12	0.01	0.13	0.11	0.13	0.11	0.13	0.13	0.09	0.12	0.23	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.21	0.15	0.23	0.18	0.50	0.19	0.58	0.19	0.26	0.21	0.18	0.20	0.23	0.23	0.24	0.22	0.49	0.43	0.50	0.46	0.45
C2	0.24	0.17	0.11	0.12	0.15	0.41	0.15	0.44	0.17	0.21	0.19	0.13	0.19	0.18	0.19	0.34	0.17	0.49	0.33	0.36	0.43	0.38
C2'	0.23	0.13	0.12	0.18	0.11	0.45	0.11	0.50	0.10	0.20	0.13	0.09	0.11	0.16	0.18	0.23	0.19	0.44	0.36	0.52	0.54	0.42
C3'	0.19	0.14	0.13	0.18	0.08	0.39	0.08	0.46	0.08	0.17	0.13	0.09	0.08	0.13	0.14	0.21	0.20	0.37	0.32	0.58	0.61	0.44
C4	0.25	0.19	0.12	0.15	0.15	0.43	0.16	0.46	0.17	0.21	0.19	0.15	0.18	0.19	0.20	0.32	0.18	0.49	0.34	0.38	0.42	0.38
C4'	0.20	0.18	0.12	0.18	0.13	0.43	0.15	0.54	0.15	0.22	0.17	0.15	0.16	0.19	0.17	0.16	0.18	0.37	0.40	0.56	0.51	0.45
C5	0.24	0.19	0.11	0.12	0.15	0.39	0.15	0.40	0.16	0.20	0.19	0.15	0.17	0.18	0.19	0.35	0.17	0.47	0.30	0.34	0.41	0.35
C5'	0.17	0.21	0.15	0.17	0.15	0.37	0.16	0.51	0.17	0.21	0.19	0.18	0.18	0.19	0.17	0.19	0.16	0.30	0.39	0.61	0.55	0.48
C6	0.25	0.17	0.12	0.10	0.16	0.36	0.16	0.37	0.16	0.21	0.19	0.14	0.18	0.18	0.20	0.36	0.16	0.47	0.29	0.32	0.42	0.35
C8	0.25	0.22	0.14	0.18	0.18	0.44	0.19	0.46	0.19	0.24	0.21	0.19	0.20	0.21	0.22	0.29	0.19	0.46	0.35	0.40	0.43	0.38
N1	0.24	0.17	0.11	0.10	0.16	0.38	0.16	0.39	0.17	0.21	0.19	0.14	0.20	0.18	0.20	0.35	0.16	0.48	0.30	0.33	0.42	0.36
N3	0.24	0.18	0.12	0.15	0.14	0.44	0.15	0.48	0.16	0.21	0.19	0.14	0.18	0.18	0.20	0.32	0.18	0.49	0.35	0.39	0.43	0.39
N6	0.26	0.18	0.13	0.11	0.20	0.33	0.19	0.35	0.18	0.23	0.19	0.18	0.19	0.21	0.24	0.35	0.17	0.45	0.28	0.30	0.43	0.35
N7	0.25	0.21	0.12	0.12	0.16	0.37	0.17	0.38	0.17	0.21	0.20	0.18	0.18	0.19	0.20	0.35	0.18	0.46	0.30	0.34	0.41	0.34
N9	0.25	0.21	0.14	0.19	0.17	0.46	0.18	0.51	0.18	0.24	0.20	0.18	0.19	0.21	0.21	0.28	0.20	0.48	0.38	0.43	0.43	0.40
O2'	0.23	0.14	0.10	0.17	0.13	0.46	0.14	0.53	0.13	0.22	0.14	0.11	0.14	0.18	0.19	0.22	0.17	0.45	0.38	0.52	0.49	0.42
O3'	0.22	0.18	0.22	0.23	0.14	0.37	0.14	0.45	0.15	0.20	0.18	0.15	0.15	0.17	0.18	0.28	0.23	0.35	0.32	0.66	0.71	0.49
O4'	0.28	0.24	0.22	0.29	0.22	0.52	0.24	0.63	0.23	0.31	0.23	0.22	0.24	0.28	0.26	0.24	0.28	0.47	0.48	0.54	0.47	0.50
O5'	0.13	0.23	0.14	0.10	0.14	0.38	0.14	0.48	0.17	0.15	0.21	0.20	0.16	0.13	0.12	0.28	0.01	0.31	0.35	0.60	0.62	0.48
OP1	0.11	0.09	0.17	0.17	0.08	0.24	0.12	0.39	0.09	0.20	0.06	0.10	0.12	0.19	0.13	0.21	0.02	0.23	0.33	0.60	0.59	0.48
OP2	0.26	0.36	0.33	0.25	0.35	0.24	0.39	0.38	0.41	0.37	0.40	0.33	0.44	0.40	0.33	0.47	0.01	0.16	0.61	0.99	0.78	0.78
P	0.06	0.12	0.11	0.01	0.08	0.16	0.09	0.25	0.11	0.10	0.12	0.10	0.11	0.10	0.07	0.21	0.00	0.11	0.22	0.60	0.53	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.20	0.17	0.30	0.14
C2	0.02	0.00	0.14	0.09	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.09	0.08	0.26	0.17	0.28	0.22
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.12	0.06	0.10	0.10	0.15	0.06	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.46	0.38	0.39	0.36
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.09	0.04	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.31	0.43	0.44	0.35
C4	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.03	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.04	0.28	0.18	0.31	0.22
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.03	0.04	0.05	0.09	0.04	0.06	0.01	0.00	0.02	0.17	0.31	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02	0.31	0.27	0.43	0.30
C5'	0.07	0.12	0.12	0.02	0.15	0.01	0.21	0.00	0.20	0.25	0.16	0.10	0.22	0.26	0.16	0.08	0.05	0.02	0.01	0.10	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.04	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.03	0.31	0.29	0.44	0.32
C8	0.01	0.01	0.10	0.07	0.00	0.10	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.09	0.06	0.34	0.28	0.48	0.30
N1	0.02	0.00	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.08	0.06	0.29	0.23	0.35	0.27
N3	0.02	0.00	0.15	0.09	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.09	0.08	0.25	0.16	0.26	0.18
N6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.06	0.03	0.32	0.36	0.53	0.37
N7	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.09	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.11	0.08	0.04	0.34	0.35	0.57	0.37
N9	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.28	0.17	0.32	0.20
O2'	0.03	0.24	0.00	0.01	0.12	0.06	0.08	0.08	0.11	0.12	0.18	0.24	0.10	0.11	0.05	0.00	0.06	0.04	0.48	0.45	0.49	0.43
O3'	0.09	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.06	0.09	0.08	0.09	0.06	0.08	0.07	0.06	0.00	0.11	0.18	0.45	0.46	0.31
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.06	0.08	0.03	0.04	0.01	0.04	0.11	0.00	0.10	0.12	0.41	0.18
O5'	0.20	0.26	0.46	0.31	0.28	0.02	0.31	0.01	0.31	0.34	0.29	0.25	0.32	0.34	0.28	0.48	0.18	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.17	0.17	0.38	0.43	0.18	0.17	0.27	0.10	0.29	0.28	0.23	0.16	0.36	0.35	0.17	0.45	0.45	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.28	0.39	0.44	0.31	0.31	0.43	0.29	0.44	0.48	0.35	0.26	0.53	0.57	0.32	0.49	0.46	0.41	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.22	0.36	0.35	0.22	0.08	0.30	0.01	0.32	0.30	0.27	0.18	0.37	0.37	0.20	0.43	0.31	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00