Doublet Group distance statistics: 52448

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.008, 0.031, 0.054, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.031 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.005, 0.033, 0.061, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.033 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.008, 0.037, 0.066, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.037 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.055, 0.153, 0.251, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.153 std_dev=0.098
O4'	A	0, 0.025, 0.123, 0.222, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.123 std_dev=0.098
O2'	A	0, 0.132, 0.254, 0.376, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.254 std_dev=0.122
C4'	A	0, 0.039, 0.180, 0.320, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.180 std_dev=0.140
C3'	A	0, 0.104, 0.254, 0.404, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.254 std_dev=0.150
O3'	A	0, 0.166, 0.373, 0.581, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.373 std_dev=0.208
O2'	B	0, 0.348, 0.576, 0.803, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.576 std_dev=0.227
C5'	A	0, 0.081, 0.331, 0.580, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.331 std_dev=0.250
C2'	B	0, 0.355, 0.616, 0.877, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.616 std_dev=0.261
O5'	A	0, 0.081, 0.372, 0.663, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.372 std_dev=0.291
O3'	B	0, 0.578, 0.960, 1.343, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.960 std_dev=0.383
C3'	B	0, 0.778, 1.300, 1.823, 1.814 max_d=1.814 avg_d=1.300 std_dev=0.522
C8	B	0, 1.132, 1.832, 2.531, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.832 std_dev=0.700
P	A	0, 1.114, 1.820, 2.526, 2.404 max_d=2.404 avg_d=1.820 std_dev=0.706
C1'	B	0, 1.221, 1.990, 2.759, 2.509 max_d=2.509 avg_d=1.990 std_dev=0.769
OP2	A	0, 1.399, 2.270, 3.141, 2.847 max_d=2.847 avg_d=2.270 std_dev=0.871
N9	B	0, 1.450, 2.335, 3.220, 2.785 max_d=2.785 avg_d=2.335 std_dev=0.885
OP1	A	0, 1.462, 2.365, 3.267, 2.940 max_d=2.940 avg_d=2.365 std_dev=0.903
O4'	B	0, 1.553, 2.552, 3.550, 3.262 max_d=3.262 avg_d=2.552 std_dev=0.998
C4'	B	0, 1.562, 2.575, 3.589, 3.328 max_d=3.328 avg_d=2.575 std_dev=1.013
OP2	B	0, 1.749, 2.824, 3.899, 3.402 max_d=3.402 avg_d=2.824 std_dev=1.075
O5'	B	0, 1.775, 2.869, 3.963, 3.580 max_d=3.580 avg_d=2.869 std_dev=1.094
N7	B	0, 1.838, 2.965, 4.092, 3.594 max_d=3.594 avg_d=2.965 std_dev=1.127
P	B	0, 2.202, 3.568, 4.934, 4.359 max_d=4.359 avg_d=3.568 std_dev=1.366
C5'	B	0, 2.202, 3.583, 4.964, 4.458 max_d=4.458 avg_d=3.583 std_dev=1.381
C4	B	0, 2.327, 3.746, 5.166, 4.462 max_d=4.462 avg_d=3.746 std_dev=1.420
C5	B	0, 2.590, 4.168, 5.746, 4.980 max_d=4.980 avg_d=4.168 std_dev=1.578
N3	B	0, 2.898, 4.674, 6.450, 5.532 max_d=5.532 avg_d=4.674 std_dev=1.776
OP1	B	0, 3.396, 5.483, 7.569, 6.549 max_d=6.549 avg_d=5.483 std_dev=2.086
C6	B	0, 3.565, 5.736, 7.908, 6.813 max_d=6.813 avg_d=5.736 std_dev=2.172
C2	B	0, 3.753, 6.050, 8.346, 7.146 max_d=7.146 avg_d=6.050 std_dev=2.296
N6	B	0, 3.987, 6.416, 8.844, 7.623 max_d=7.623 avg_d=6.416 std_dev=2.428
N1	B	0, 4.128, 6.647, 9.166, 7.859 max_d=7.859 avg_d=6.647 std_dev=2.519

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.23	0.20	0.14
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.27	0.22	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.15	0.09
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.07	0.08	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.09	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.27	0.23	0.17
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.11	0.10	0.06
C5	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.28	0.24	0.19
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.28	0.23	0.19
C8	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.29	0.24	0.19
N1	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.27	0.23	0.18
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.26	0.21	0.16
N6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.28	0.24	0.19
N7	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.29	0.24	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.27	0.23	0.17
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.18	0.17	0.10
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.07	0.04	0.09	0.08	0.07	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.08	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.21	0.19	0.14
O5'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.06	0.04	0.06	0.05	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.23	0.27	0.18	0.12	0.27	0.11	0.28	0.04	0.28	0.29	0.27	0.26	0.28	0.29	0.27	0.18	0.08	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.22	0.15	0.09	0.23	0.10	0.24	0.02	0.23	0.24	0.23	0.21	0.24	0.24	0.23	0.17	0.08	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.09	0.04	0.17	0.06	0.19	0.01	0.19	0.19	0.18	0.16	0.19	0.20	0.17	0.10	0.04	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.59	0.07	0.10	0.38	0.09	0.37	0.22	0.47	0.20	0.57	0.49	0.46	0.26	0.24	0.07	0.09	0.09	0.24	0.37	0.28	0.28
C2	0.17	0.73	0.06	0.11	0.48	0.16	0.54	0.32	0.71	0.26	0.81	0.57	0.75	0.39	0.29	0.05	0.11	0.10	0.30	0.57	0.36	0.40
C2'	0.13	0.58	0.05	0.13	0.37	0.13	0.38	0.27	0.49	0.19	0.59	0.47	0.50	0.27	0.22	0.06	0.12	0.06	0.28	0.43	0.28	0.32
C3'	0.09	0.46	0.05	0.16	0.29	0.17	0.30	0.29	0.39	0.14	0.47	0.37	0.40	0.22	0.17	0.06	0.15	0.07	0.30	0.40	0.26	0.31
C4	0.17	0.66	0.06	0.09	0.44	0.12	0.47	0.27	0.60	0.24	0.69	0.54	0.60	0.34	0.28	0.05	0.09	0.09	0.27	0.47	0.32	0.34
C4'	0.11	0.41	0.06	0.13	0.26	0.11	0.26	0.21	0.32	0.13	0.39	0.34	0.32	0.18	0.16	0.07	0.12	0.07	0.23	0.30	0.24	0.24
C5	0.16	0.61	0.06	0.09	0.44	0.13	0.48	0.27	0.59	0.25	0.65	0.50	0.58	0.35	0.28	0.05	0.09	0.09	0.28	0.47	0.32	0.34
C5'	0.09	0.28	0.07	0.15	0.18	0.12	0.18	0.19	0.22	0.09	0.27	0.24	0.22	0.13	0.11	0.08	0.14	0.08	0.21	0.24	0.21	0.21
C6	0.15	0.62	0.07	0.11	0.45	0.16	0.52	0.30	0.66	0.27	0.70	0.50	0.69	0.40	0.28	0.05	0.11	0.10	0.30	0.54	0.36	0.39
C8	0.16	0.48	0.06	0.08	0.35	0.09	0.35	0.21	0.41	0.20	0.47	0.43	0.39	0.26	0.24	0.06	0.08	0.08	0.24	0.33	0.27	0.26
N1	0.16	0.69	0.06	0.12	0.47	0.17	0.54	0.32	0.71	0.27	0.78	0.54	0.77	0.41	0.29	0.05	0.12	0.11	0.31	0.59	0.38	0.41
N3	0.17	0.72	0.06	0.10	0.47	0.14	0.50	0.29	0.66	0.25	0.77	0.57	0.68	0.36	0.29	0.05	0.10	0.09	0.29	0.52	0.34	0.36
N6	0.15	0.54	0.08	0.12	0.41	0.17	0.50	0.31	0.62	0.27	0.62	0.44	0.67	0.41	0.27	0.07	0.12	0.12	0.30	0.55	0.38	0.40
N7	0.15	0.48	0.06	0.08	0.38	0.10	0.39	0.23	0.45	0.23	0.49	0.43	0.43	0.30	0.26	0.06	0.08	0.08	0.25	0.37	0.28	0.29
N9	0.16	0.59	0.06	0.09	0.40	0.10	0.40	0.23	0.50	0.21	0.59	0.50	0.48	0.29	0.25	0.06	0.08	0.09	0.25	0.39	0.29	0.29
O2'	0.15	0.62	0.06	0.12	0.39	0.12	0.40	0.25	0.52	0.20	0.63	0.50	0.52	0.29	0.24	0.06	0.11	0.08	0.27	0.43	0.28	0.31
O3'	0.08	0.44	0.06	0.19	0.27	0.20	0.29	0.32	0.39	0.13	0.46	0.35	0.40	0.21	0.15	0.06	0.17	0.09	0.32	0.42	0.27	0.33
O4'	0.16	0.47	0.07	0.10	0.31	0.08	0.29	0.17	0.36	0.16	0.44	0.40	0.34	0.20	0.20	0.08	0.09	0.10	0.20	0.29	0.25	0.23
O5'	0.10	0.25	0.06	0.10	0.16	0.07	0.15	0.10	0.19	0.09	0.23	0.22	0.19	0.11	0.11	0.08	0.11	0.08	0.14	0.15	0.19	0.14
OP1	0.15	0.28	0.15	0.17	0.23	0.10	0.24	0.14	0.27	0.20	0.28	0.26	0.27	0.22	0.19	0.14	0.13	0.11	0.22	0.19	0.29	0.22
OP2	0.11	0.31	0.11	0.13	0.23	0.06	0.26	0.09	0.30	0.19	0.32	0.25	0.33	0.24	0.17	0.11	0.13	0.07	0.18	0.16	0.27	0.19
P	0.11	0.23	0.11	0.17	0.18	0.09	0.19	0.13	0.22	0.16	0.23	0.20	0.23	0.18	0.15	0.11	0.15	0.09	0.20	0.18	0.26	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.04	0.03	0.16	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.13	0.02	0.07	0.05	0.16	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.19	0.11
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.05	0.04	0.07	0.10	0.05	0.02	0.00	0.00	0.06	0.08	0.12	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.01	0.08	0.04	0.15	0.06
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.05	0.02	0.11	0.05	0.13	0.05
C5'	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.06	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	0.02	0.11	0.06	0.13	0.06
C8	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.03	0.13	0.04	0.12	0.05
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.10	0.02	0.09	0.05	0.14	0.06
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.13	0.02	0.06	0.04	0.17	0.06
N6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.05	0.03	0.13	0.07	0.11	0.07
N7	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.05	0.03	0.13	0.05	0.11	0.05
N9	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.08	0.04	0.15	0.06
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.10	0.06	0.11	0.02	0.12	0.07	0.13	0.12	0.13	0.09	0.06	0.00	0.05	0.04	0.08	0.06	0.21	0.11
O3'	0.08	0.13	0.01	0.00	0.08	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.10	0.13	0.05	0.05	0.04	0.05	0.00	0.06	0.07	0.16	0.14	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.04	0.13	0.06
O5'	0.04	0.07	0.09	0.06	0.08	0.01	0.11	0.01	0.11	0.13	0.09	0.06	0.13	0.13	0.08	0.08	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.05	0.07	0.08	0.04	0.07	0.05	0.08	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04	0.06	0.16	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.16	0.19	0.12	0.15	0.08	0.13	0.03	0.13	0.12	0.14	0.17	0.11	0.11	0.15	0.21	0.14	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.06	0.11	0.07	0.06	0.02	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.06	0.11	0.09	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00