Doublet Group distance statistics: 52449

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.014, 0.037, 0.061, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.004, 0.029, 0.053, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.029 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.034 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.007, 0.034, 0.061, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.034 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.011, 0.038, 0.065, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.007, 0.042, 0.077, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.042 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.081, 0.242, 0.403, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.242 std_dev=0.161
C2'	A	0, 0.059, 0.232, 0.406, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.232 std_dev=0.174
O5'	A	0, 0.368, 0.635, 0.903, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.635 std_dev=0.267
O2'	B	0, 0.321, 0.624, 0.928, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.624 std_dev=0.303
C4'	A	0, 0.231, 0.558, 0.884, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.558 std_dev=0.327
C1'	B	0, 0.277, 0.638, 0.999, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.638 std_dev=0.361
N3	B	0, 0.420, 0.802, 1.183, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.802 std_dev=0.382
O3'	B	0, 0.424, 0.819, 1.214, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.819 std_dev=0.395
C2'	B	0, 0.223, 0.621, 1.018, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.621 std_dev=0.397
C3'	B	0, 0.378, 0.807, 1.235, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.807 std_dev=0.428
N9	B	0, 0.359, 0.787, 1.215, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.787 std_dev=0.428
O4'	B	0, 0.375, 0.817, 1.260, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.817 std_dev=0.443
C4'	B	0, 0.440, 0.901, 1.362, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.901 std_dev=0.461
C3'	A	0, 0.152, 0.618, 1.083, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.618 std_dev=0.465
C4	B	0, 0.350, 0.821, 1.293, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.821 std_dev=0.472
O2'	A	0, 0.226, 0.705, 1.185, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.705 std_dev=0.480
C2	B	0, 0.457, 0.944, 1.430, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.944 std_dev=0.486
C8	B	0, 0.526, 1.078, 1.630, 1.686 max_d=1.686 avg_d=1.078 std_dev=0.552
P	A	0, 0.259, 0.815, 1.372, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.815 std_dev=0.556
C5'	B	0, 0.539, 1.125, 1.710, 1.735 max_d=1.735 avg_d=1.125 std_dev=0.586
C5	B	0, 0.447, 1.094, 1.741, 1.975 max_d=1.975 avg_d=1.094 std_dev=0.647
C5'	A	0, 0.122, 0.793, 1.464, 1.979 max_d=1.979 avg_d=0.793 std_dev=0.671
N1	B	0, 0.432, 1.106, 1.780, 1.977 max_d=1.977 avg_d=1.106 std_dev=0.674
N7	B	0, 0.618, 1.295, 1.971, 2.288 max_d=2.288 avg_d=1.295 std_dev=0.677
O5'	B	0, 0.601, 1.311, 2.021, 2.104 max_d=2.104 avg_d=1.311 std_dev=0.710
OP1	A	0, 0.441, 1.166, 1.890, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.166 std_dev=0.725
C6	B	0, 0.412, 1.206, 2.000, 2.329 max_d=2.329 avg_d=1.206 std_dev=0.794
OP2	A	0, 0.285, 1.091, 1.897, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.091 std_dev=0.806
P	B	0, 0.827, 1.647, 2.467, 2.754 max_d=2.754 avg_d=1.647 std_dev=0.820
O3'	A	0, 0.154, 1.123, 2.093, 2.655 max_d=2.655 avg_d=1.123 std_dev=0.970
N6	B	0, 0.546, 1.536, 2.526, 3.074 max_d=3.074 avg_d=1.536 std_dev=0.990
OP1	B	0, 0.822, 1.895, 2.969, 3.696 max_d=3.696 avg_d=1.895 std_dev=1.074
OP2	B	0, 0.834, 2.182, 3.531, 4.277 max_d=4.277 avg_d=2.182 std_dev=1.349

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02	0.05	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.34	0.00	0.39	0.25	0.40	0.22
C2	0.07	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.35	0.47	0.11	0.50	0.28	0.58	0.32
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.22	0.06	0.06	0.10	0.12	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.61	0.64	0.76	0.58
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.20	0.00	0.31	0.02	0.30	0.36	0.22	0.13	0.37	0.39	0.21	0.02	0.01	0.02	0.28	0.47	0.22	0.22
C4	0.04	0.01	0.07	0.20	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.31	0.27	0.05	0.50	0.27	0.56	0.31
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.13	0.22	0.07	0.07	0.18	0.22	0.10	0.29	0.02	0.00	0.01	0.19	0.17	0.09
C5	0.02	0.00	0.04	0.31	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.15	0.02	0.52	0.27	0.59	0.34
C5'	0.08	0.12	0.22	0.02	0.13	0.00	0.23	0.00	0.24	0.26	0.17	0.10	0.31	0.31	0.13	0.08	0.20	0.01	0.01	0.40	0.31	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.30	0.00	0.13	0.00	0.24	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.43	0.20	0.03	0.51	0.27	0.60	0.34
C8	0.02	0.01	0.06	0.36	0.01	0.22	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.28	0.14	0.09	0.52	0.28	0.54	0.34
N1	0.05	0.00	0.10	0.22	0.00	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.41	0.34	0.07	0.51	0.27	0.60	0.33
N3	0.07	0.00	0.12	0.13	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.49	0.12	0.49	0.29	0.56	0.31
N6	0.01	0.01	0.05	0.37	0.00	0.18	0.01	0.31	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.45	0.18	0.03	0.51	0.27	0.60	0.36
N7	0.01	0.00	0.03	0.39	0.01	0.22	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.37	0.16	0.07	0.52	0.29	0.58	0.36
N9	0.01	0.01	0.01	0.21	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.15	0.01	0.49	0.28	0.52	0.30
O2'	0.02	0.35	0.00	0.02	0.31	0.29	0.39	0.08	0.43	0.28	0.41	0.29	0.45	0.37	0.22	0.00	0.02	0.21	0.32	0.43	0.69	0.40
O3'	0.34	0.47	0.02	0.01	0.27	0.02	0.15	0.20	0.20	0.14	0.34	0.49	0.18	0.16	0.15	0.02	0.00	0.22	0.22	0.31	0.31	0.20
O4'	0.00	0.11	0.03	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.09	0.07	0.12	0.03	0.07	0.01	0.21	0.22	0.00	0.17	0.20	0.10	0.08
O5'	0.39	0.50	0.61	0.28	0.50	0.01	0.52	0.01	0.51	0.52	0.51	0.49	0.51	0.52	0.49	0.32	0.22	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.28	0.64	0.47	0.27	0.19	0.27	0.40	0.27	0.28	0.27	0.29	0.27	0.29	0.28	0.43	0.31	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.40	0.58	0.76	0.22	0.56	0.17	0.59	0.31	0.60	0.54	0.60	0.56	0.60	0.58	0.52	0.69	0.31	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.32	0.58	0.22	0.31	0.09	0.34	0.01	0.34	0.34	0.33	0.31	0.36	0.36	0.30	0.40	0.20	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.21	0.16	0.18	0.18	0.27	0.21	0.23	0.19	0.29	0.19	0.17	0.21	0.28	0.24	0.17	0.27	0.28	0.40	0.74	0.53	0.41
C2	0.39	0.41	0.23	0.22	0.44	0.37	0.52	0.31	0.51	0.54	0.46	0.37	0.54	0.57	0.45	0.15	0.26	0.46	0.72	1.07	0.52	0.59
C2'	0.30	0.19	0.34	0.30	0.21	0.28	0.22	0.31	0.14	0.35	0.11	0.20	0.16	0.31	0.30	0.39	0.26	0.30	0.20	0.52	0.72	0.40
C3'	0.16	0.31	0.15	0.18	0.10	0.18	0.08	0.17	0.07	0.23	0.21	0.25	0.04	0.19	0.15	0.18	0.19	0.18	0.34	0.67	0.37	0.31
C4	0.33	0.26	0.20	0.19	0.29	0.31	0.33	0.24	0.24	0.44	0.20	0.21	0.26	0.43	0.36	0.15	0.25	0.38	0.60	0.96	0.45	0.49
C4'	0.23	0.51	0.20	0.27	0.33	0.22	0.30	0.23	0.35	0.23	0.45	0.46	0.33	0.24	0.26	0.18	0.30	0.23	0.33	0.59	0.47	0.35
C5	0.38	0.46	0.23	0.23	0.37	0.33	0.41	0.26	0.33	0.52	0.40	0.35	0.31	0.50	0.43	0.16	0.27	0.41	0.70	1.05	0.44	0.54
C5'	0.30	0.51	0.31	0.28	0.39	0.19	0.35	0.23	0.38	0.30	0.45	0.49	0.35	0.30	0.32	0.36	0.20	0.29	0.32	0.48	0.52	0.32
C6	0.44	0.57	0.27	0.27	0.51	0.38	0.59	0.31	0.58	0.62	0.60	0.46	0.57	0.66	0.52	0.17	0.29	0.48	0.82	1.15	0.52	0.63
C8	0.25	0.34	0.17	0.16	0.07	0.22	0.12	0.18	0.10	0.33	0.25	0.22	0.11	0.27	0.23	0.14	0.23	0.26	0.51	0.87	0.39	0.41
N1	0.44	0.53	0.26	0.26	0.51	0.39	0.61	0.33	0.62	0.61	0.59	0.45	0.66	0.66	0.51	0.15	0.28	0.50	0.81	1.15	0.55	0.64
N3	0.34	0.26	0.20	0.20	0.34	0.33	0.40	0.27	0.35	0.46	0.27	0.25	0.37	0.47	0.39	0.16	0.25	0.41	0.61	0.97	0.49	0.52
N6	0.48	0.65	0.31	0.31	0.57	0.40	0.69	0.35	0.71	0.70	0.73	0.53	0.74	0.77	0.57	0.20	0.32	0.52	0.91	1.23	0.61	0.70
N7	0.34	0.48	0.23	0.22	0.26	0.27	0.25	0.22	0.23	0.44	0.39	0.36	0.20	0.38	0.35	0.17	0.26	0.34	0.66	1.00	0.38	0.48
N9	0.26	0.18	0.17	0.16	0.15	0.26	0.20	0.21	0.11	0.35	0.11	0.07	0.14	0.32	0.27	0.17	0.23	0.30	0.48	0.84	0.45	0.42
O2'	0.27	0.13	0.35	0.30	0.24	0.31	0.30	0.32	0.27	0.38	0.18	0.15	0.32	0.39	0.30	0.45	0.33	0.30	0.27	0.54	0.83	0.46
O3'	0.17	0.75	0.16	0.27	0.40	0.19	0.37	0.22	0.49	0.22	0.68	0.61	0.46	0.25	0.24	0.21	0.30	0.18	0.41	0.74	0.30	0.35
O4'	0.22	0.48	0.17	0.27	0.34	0.29	0.34	0.26	0.39	0.27	0.45	0.42	0.38	0.30	0.27	0.11	0.38	0.24	0.42	0.72	0.53	0.43
O5'	0.43	0.64	0.35	0.09	0.57	0.08	0.56	0.05	0.59	0.48	0.62	0.62	0.58	0.51	0.51	0.49	0.01	0.29	0.16	0.41	0.70	0.31
OP1	0.06	0.16	0.08	0.10	0.11	0.30	0.09	0.38	0.12	0.04	0.15	0.15	0.11	0.05	0.07	0.29	0.02	0.19	0.16	0.45	0.72	0.23
OP2	0.22	0.42	0.26	0.02	0.33	0.12	0.33	0.21	0.37	0.27	0.41	0.39	0.37	0.30	0.27	0.48	0.02	0.07	0.23	0.53	0.90	0.38
P	0.18	0.30	0.19	0.01	0.24	0.11	0.23	0.17	0.26	0.20	0.28	0.28	0.25	0.21	0.21	0.36	0.00	0.07	0.14	0.43	0.73	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.48	0.75	0.51	0.47
C2	0.06	0.00	0.16	0.11	0.01	0.14	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.31	0.15	0.18	0.64	1.12	0.93	0.76
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.06	0.08	0.07	0.13	0.15	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.45	0.68	0.27	0.31
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.09	0.10	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.37	0.50	0.19
C4	0.03	0.01	0.09	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.08	0.09	0.66	1.13	0.89	0.76
C4'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.10	0.10	0.14	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.28	0.41	0.08
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.04	0.72	1.31	1.04	0.87
C5'	0.03	0.09	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.07	0.19	0.06	0.09	0.10	0.18	0.08	0.05	0.03	0.01	0.00	0.41	0.33	0.01
C6	0.03	0.00	0.08	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.08	0.08	0.72	1.34	1.09	0.89
C8	0.01	0.02	0.07	0.04	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.03	0.10	0.73	1.29	0.96	0.85
N1	0.05	0.00	0.13	0.09	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.13	0.14	0.69	1.25	1.03	0.84
N3	0.06	0.00	0.15	0.10	0.00	0.14	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.30	0.14	0.18	0.61	1.03	0.84	0.70
N6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.07	0.05	0.74	1.43	1.16	0.94
N7	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.05	0.74	1.41	1.09	0.92
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.65	1.07	0.80	0.71
O2'	0.01	0.31	0.00	0.01	0.16	0.00	0.10	0.05	0.17	0.12	0.26	0.30	0.13	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.42	0.73	0.34	0.29
O3'	0.03	0.15	0.01	0.00	0.08	0.01	0.06	0.03	0.08	0.03	0.13	0.14	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.04	0.12	0.32	0.59	0.24
O4'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.10	0.14	0.18	0.05	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.37	0.57	0.65	0.44
O5'	0.48	0.64	0.45	0.14	0.66	0.02	0.72	0.00	0.72	0.73	0.69	0.61	0.74	0.74	0.65	0.42	0.12	0.37	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.75	1.12	0.68	0.37	1.13	0.28	1.31	0.41	1.34	1.29	1.25	1.03	1.43	1.41	1.07	0.73	0.32	0.57	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.51	0.93	0.27	0.50	0.89	0.41	1.04	0.33	1.09	0.96	1.03	0.84	1.16	1.09	0.80	0.34	0.59	0.65	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.47	0.76	0.31	0.19	0.76	0.08	0.87	0.01	0.89	0.85	0.84	0.70	0.94	0.92	0.71	0.29	0.24	0.44	0.01	0.01	0.01	0.00