Doublet Group distance statistics: 52450

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.025, 0.036, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.019, 0.036, 0.052, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.025, 0.043, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.043 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.027, 0.049, 0.070, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.049 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.030, 0.053, 0.075, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.053 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.032, 0.055, 0.078, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.055 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.035, 0.060, 0.085, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.060 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.033, 0.059, 0.085, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.059 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.039, 0.067, 0.095, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.067 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.040, 0.069, 0.099, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.069 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.072, 0.122, 0.172, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.122 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.002, 0.137, 0.272, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.137 std_dev=0.135
C2'	B	0, 0.246, 0.439, 0.633, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.439 std_dev=0.194
O4'	B	0, 0.233, 0.430, 0.628, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.430 std_dev=0.197
C2'	A	0, -0.027, 0.187, 0.400, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.187 std_dev=0.214
C4'	A	0, -0.058, 0.160, 0.377, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.160 std_dev=0.218
P	A	0, 0.129, 0.348, 0.566, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.348 std_dev=0.218
O3'	A	0, -0.036, 0.189, 0.413, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.189 std_dev=0.224
OP2	A	0, 0.249, 0.480, 0.710, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.480 std_dev=0.230
C3'	A	0, -0.065, 0.195, 0.454, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.195 std_dev=0.260
OP1	A	0, 0.091, 0.382, 0.672, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.382 std_dev=0.291
O2'	B	0, 0.243, 0.556, 0.869, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.556 std_dev=0.313
O2'	A	0, 0.000, 0.314, 0.627, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.314 std_dev=0.314
C3'	B	0, 0.187, 0.553, 0.919, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.553 std_dev=0.366
C5'	A	0, -0.138, 0.270, 0.679, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.270 std_dev=0.409
C1'	B	0, 0.162, 0.588, 1.014, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.588 std_dev=0.426
O3'	B	0, 0.057, 0.509, 0.962, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.509 std_dev=0.452
O5'	A	0, -0.095, 0.360, 0.815, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.360 std_dev=0.455
C4'	B	0, 0.234, 0.784, 1.335, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.784 std_dev=0.550
C5'	B	0, 0.370, 1.502, 2.634, 4.030 max_d=4.030 avg_d=1.502 std_dev=1.132
N9	B	0, -0.224, 0.939, 2.101, 3.729 max_d=3.729 avg_d=0.939 std_dev=1.163
O5'	B	0, 0.136, 1.305, 2.475, 3.994 max_d=3.994 avg_d=1.305 std_dev=1.169
C8	B	0, -0.278, 1.276, 2.830, 5.001 max_d=5.001 avg_d=1.276 std_dev=1.554
OP2	B	0, -0.241, 1.493, 3.227, 5.656 max_d=5.656 avg_d=1.493 std_dev=1.734
P	B	0, -0.287, 1.558, 3.404, 5.997 max_d=5.997 avg_d=1.558 std_dev=1.846
C4	B	0, -0.641, 1.229, 3.100, 5.771 max_d=5.771 avg_d=1.229 std_dev=1.870
OP1	B	0, 0.209, 2.296, 4.383, 7.175 max_d=7.175 avg_d=2.296 std_dev=2.087
N3	B	0, -0.948, 1.281, 3.510, 6.718 max_d=6.718 avg_d=1.281 std_dev=2.229
N7	B	0, -0.647, 1.622, 3.890, 7.106 max_d=7.106 avg_d=1.622 std_dev=2.269
C5	B	0, -0.855, 1.569, 3.992, 7.452 max_d=7.452 avg_d=1.569 std_dev=2.424
C2	B	0, -1.392, 1.596, 4.585, 8.893 max_d=8.893 avg_d=1.596 std_dev=2.988
C6	B	0, -1.319, 1.874, 5.067, 9.648 max_d=9.648 avg_d=1.874 std_dev=3.193
N1	B	0, -1.551, 1.864, 5.279, 10.194 max_d=10.194 avg_d=1.864 std_dev=3.415
N6	B	0, -1.640, 2.218, 6.076, 11.608 max_d=11.608 avg_d=2.218 std_dev=3.858

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.23	0.20	0.09	0.10
C2	0.02	0.00	0.10	0.06	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.11	0.11	0.29	0.22	0.09	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.05	0.07	0.08	0.10	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.44	0.08	0.32	0.16
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.04	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.28	0.09	0.34	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.05	0.06	0.34	0.20	0.09	0.09
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.07	0.05	0.08	0.07	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.11	0.10
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.04	0.04	0.40	0.16	0.09	0.09
C5'	0.03	0.16	0.03	0.01	0.14	0.00	0.17	0.00	0.19	0.13	0.18	0.13	0.20	0.17	0.11	0.03	0.01	0.01	0.01	0.18	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.06	0.06	0.39	0.16	0.10	0.09
C8	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.05	0.05	0.46	0.13	0.09	0.10
N1	0.02	0.00	0.08	0.04	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.09	0.34	0.19	0.09	0.09
N3	0.02	0.00	0.10	0.06	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.21	0.10	0.10	0.27	0.24	0.08	0.11
N6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.05	0.05	0.41	0.15	0.10	0.10
N7	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.46	0.14	0.10	0.12
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.35	0.18	0.08	0.09
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.13	0.02	0.10	0.03	0.15	0.06	0.21	0.21	0.13	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.46	0.08	0.39	0.21
O3'	0.03	0.11	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.05	0.09	0.10	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.06	0.15	0.06	0.32	0.06
O4'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.05	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.07	0.34	0.15	0.30
O5'	0.23	0.29	0.44	0.28	0.34	0.01	0.40	0.01	0.39	0.46	0.34	0.27	0.41	0.46	0.35	0.46	0.15	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.20	0.22	0.08	0.09	0.20	0.10	0.16	0.18	0.16	0.13	0.19	0.24	0.15	0.14	0.18	0.08	0.06	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.09	0.32	0.34	0.09	0.11	0.09	0.12	0.10	0.09	0.09	0.08	0.10	0.10	0.08	0.39	0.32	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.10	0.16	0.13	0.09	0.10	0.09	0.01	0.09	0.10	0.09	0.11	0.10	0.12	0.09	0.21	0.06	0.30	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	1.75	0.17	0.40	1.02	0.58	0.90	0.89	1.22	0.22	1.61	1.50	1.14	0.44	0.52	0.17	0.42	0.10	0.62	1.35	0.32	0.82
C2	0.43	2.15	0.12	0.37	1.18	0.56	1.01	1.13	1.44	0.16	1.98	1.80	1.33	0.42	0.58	0.18	0.30	0.07	1.00	1.79	0.87	1.35
C2'	0.48	1.84	0.11	0.21	1.24	0.44	1.20	0.62	1.49	0.56	1.77	1.61	1.46	0.82	0.77	0.11	0.21	0.12	0.28	0.90	0.19	0.38
C3'	0.32	1.43	0.12	0.21	0.94	0.41	0.95	0.50	1.20	0.44	1.41	1.21	1.20	0.66	0.57	0.11	0.25	0.11	0.16	0.76	0.36	0.22
C4	0.40	1.91	0.13	0.39	1.06	0.58	0.87	1.10	1.23	0.11	1.70	1.64	1.11	0.33	0.51	0.17	0.31	0.06	0.93	1.68	0.75	1.23
C4'	0.12	0.98	0.32	0.41	0.49	0.53	0.40	0.66	0.62	0.18	0.88	0.82	0.56	0.16	0.19	0.19	0.45	0.22	0.40	1.06	0.14	0.51
C5	0.38	1.73	0.10	0.35	0.93	0.54	0.70	1.15	1.03	0.06	1.50	1.52	0.88	0.16	0.43	0.15	0.22	0.05	1.06	1.77	0.94	1.39
C5'	0.19	0.35	0.46	0.41	0.11	0.48	0.19	0.54	0.13	0.48	0.23	0.28	0.16	0.42	0.24	0.26	0.39	0.31	0.34	0.89	0.14	0.42
C6	0.39	1.81	0.09	0.33	0.96	0.50	0.73	1.16	1.08	0.06	1.58	1.56	0.92	0.16	0.44	0.15	0.19	0.06	1.14	1.84	1.08	1.51
C8	0.34	1.43	0.11	0.38	0.79	0.58	0.56	1.06	0.82	0.09	1.21	1.30	0.68	0.10	0.36	0.13	0.26	0.05	0.89	1.55	0.68	1.13
N1	0.42	2.02	0.10	0.35	1.09	0.53	0.89	1.16	1.29	0.07	1.82	1.71	1.16	0.29	0.52	0.17	0.24	0.07	1.10	1.85	1.03	1.48
N3	0.41	2.11	0.14	0.39	1.17	0.59	1.02	1.09	1.44	0.20	1.94	1.77	1.34	0.45	0.59	0.18	0.34	0.07	0.91	1.70	0.72	1.22
N6	0.37	1.65	0.07	0.28	0.84	0.43	0.59	1.15	0.91	0.14	1.40	1.44	0.73	0.05	0.36	0.14	0.12	0.07	1.22	1.85	1.25	1.62
N7	0.35	1.43	0.09	0.33	0.76	0.52	0.50	1.15	0.76	0.15	1.18	1.29	0.60	0.04	0.32	0.12	0.16	0.03	1.07	1.70	0.93	1.36
N9	0.37	1.73	0.15	0.40	0.98	0.60	0.80	1.02	1.11	0.11	1.53	1.51	1.00	0.30	0.48	0.16	0.36	0.08	0.81	1.54	0.57	1.05
O2'	0.68	2.46	0.23	0.13	1.70	0.36	1.75	0.55	2.13	0.96	2.45	2.10	2.13	1.32	1.12	0.14	0.14	0.24	0.19	0.79	0.30	0.28
O3'	0.38	1.72	0.10	0.20	1.14	0.40	1.20	0.51	1.52	0.59	1.76	1.41	1.56	0.87	0.71	0.10	0.28	0.11	0.14	0.79	0.40	0.21
O4'	0.11	1.19	0.39	0.57	0.55	0.69	0.40	0.96	0.67	0.27	1.03	1.00	0.57	0.15	0.16	0.26	0.62	0.27	0.73	1.49	0.45	0.94
O5'	0.39	0.70	0.11	0.05	0.38	0.06	0.15	0.13	0.24	0.20	0.49	0.71	0.12	0.21	0.21	0.38	0.01	0.27	0.06	0.78	0.16	0.27
OP1	0.16	0.28	0.03	0.05	0.08	0.05	0.42	0.33	0.35	0.70	0.07	0.33	0.57	0.79	0.21	0.26	0.02	0.09	0.41	1.18	0.38	0.72
OP2	0.09	0.31	0.06	0.03	0.48	0.03	0.77	0.09	0.75	0.86	0.54	0.22	0.91	0.98	0.48	0.46	0.01	0.09	0.08	0.60	0.12	0.21
P	0.17	0.22	0.02	0.01	0.05	0.02	0.33	0.18	0.27	0.56	0.04	0.27	0.44	0.62	0.15	0.32	0.00	0.10	0.17	0.84	0.08	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.24	0.00	0.11	0.21	0.07	0.03
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.34	0.07	0.21	0.45	0.55	0.35
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.15	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.08	0.52	0.30
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.17	0.00	0.29	0.01	0.26	0.41	0.16	0.03	0.33	0.41	0.22	0.02	0.01	0.02	0.07	0.28	0.24	0.03
C4	0.02	0.01	0.03	0.17	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.23	0.12	0.05	0.21	0.48	0.51	0.34
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.08	0.18	0.02	0.06	0.11	0.17	0.08	0.27	0.03	0.00	0.01	0.15	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.29	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.10	0.03	0.29	0.65	0.79	0.50
C5'	0.06	0.06	0.15	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.17	0.09	0.06	0.17	0.19	0.09	0.12	0.16	0.02	0.01	0.13	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.26	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.04	0.03	0.31	0.68	0.87	0.55
C8	0.01	0.01	0.02	0.41	0.00	0.18	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.33	0.02	0.25	0.64	0.65	0.44
N1	0.02	0.00	0.04	0.16	0.00	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.17	0.05	0.27	0.58	0.74	0.47
N3	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.37	0.07	0.16	0.37	0.40	0.26
N6	0.02	0.01	0.03	0.33	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.35	0.15	0.03	0.36	0.79	1.04	0.65
N7	0.01	0.01	0.02	0.41	0.01	0.17	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.33	0.01	0.31	0.76	0.91	0.58
N9	0.01	0.01	0.01	0.22	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.02	0.01	0.17	0.44	0.37	0.27
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.23	0.27	0.30	0.12	0.32	0.23	0.30	0.20	0.35	0.29	0.18	0.00	0.04	0.19	0.25	0.12	0.69	0.29
O3'	0.24	0.34	0.01	0.01	0.12	0.03	0.10	0.16	0.04	0.33	0.17	0.37	0.15	0.33	0.02	0.04	0.00	0.17	0.11	0.66	0.10	0.28
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.03	0.01	0.01	0.19	0.17	0.00	0.12	0.19	0.11	0.12
O5'	0.11	0.21	0.36	0.07	0.21	0.01	0.29	0.01	0.31	0.25	0.27	0.16	0.36	0.31	0.17	0.25	0.11	0.12	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.21	0.45	0.08	0.28	0.48	0.15	0.65	0.13	0.68	0.64	0.58	0.37	0.79	0.76	0.44	0.12	0.66	0.19	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.55	0.52	0.24	0.51	0.14	0.79	0.11	0.87	0.65	0.74	0.40	1.04	0.91	0.37	0.69	0.10	0.11	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.35	0.30	0.03	0.34	0.03	0.50	0.01	0.55	0.44	0.47	0.26	0.65	0.58	0.27	0.29	0.28	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00