Doublet Group distance statistics: 52455

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.010, 0.032, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.032 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.034, 0.139, 0.244, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.139 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.005, 0.124, 0.244, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.124 std_dev=0.120
O2'	A	0, -0.010, 0.123, 0.256, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.123 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.057, 0.239, 0.421, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.239 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.049, 0.232, 0.414, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.232 std_dev=0.183
C1'	B	0, 0.198, 0.403, 0.608, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.403 std_dev=0.205
C2'	B	0, 0.148, 0.367, 0.585, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.367 std_dev=0.219
OP2	A	0, 0.169, 0.419, 0.669, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.419 std_dev=0.250
C3'	B	0, 0.142, 0.393, 0.644, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.393 std_dev=0.251
O3'	A	0, 0.084, 0.353, 0.621, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.353 std_dev=0.268
P	A	0, 0.160, 0.428, 0.697, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.428 std_dev=0.268
O2'	B	0, 0.082, 0.353, 0.624, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.353 std_dev=0.271
O3'	B	0, 0.160, 0.434, 0.709, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.434 std_dev=0.275
C5'	A	0, 0.093, 0.370, 0.646, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.370 std_dev=0.277
O5'	A	0, 0.132, 0.424, 0.715, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.424 std_dev=0.292
OP1	A	0, 0.147, 0.441, 0.735, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.441 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.160, 0.472, 0.784, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.472 std_dev=0.312
O4'	B	0, 0.121, 0.434, 0.747, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.434 std_dev=0.313
N9	B	0, 0.205, 0.532, 0.858, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.532 std_dev=0.327
O5'	B	0, 0.109, 0.443, 0.776, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.443 std_dev=0.333
C5'	B	0, 0.211, 0.551, 0.892, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.551 std_dev=0.340
C8	B	0, 0.245, 0.673, 1.100, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.673 std_dev=0.427
C4	B	0, 0.286, 0.723, 1.161, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.723 std_dev=0.437
N3	B	0, 0.298, 0.752, 1.207, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.752 std_dev=0.455
P	B	0, 0.303, 0.777, 1.251, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.777 std_dev=0.474
OP2	B	0, 0.418, 0.920, 1.422, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.920 std_dev=0.502
OP1	B	0, 0.391, 0.956, 1.520, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.956 std_dev=0.564
C5	B	0, 0.404, 0.978, 1.553, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.978 std_dev=0.575
N7	B	0, 0.341, 0.916, 1.492, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.916 std_dev=0.575
C2	B	0, 0.445, 1.057, 1.669, 1.849 max_d=1.849 avg_d=1.057 std_dev=0.612
C6	B	0, 0.580, 1.299, 2.018, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.299 std_dev=0.719
N1	B	0, 0.597, 1.331, 2.065, 2.201 max_d=2.201 avg_d=1.331 std_dev=0.734
N6	B	0, 0.731, 1.599, 2.468, 2.541 max_d=2.541 avg_d=1.599 std_dev=0.868

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.04	0.02
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.01	0.09	0.10	0.08	0.09
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.10	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.07	0.02
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.10	0.10	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.10	0.09	0.06	0.08
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.02	0.13	0.12	0.09	0.12
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.09	0.06	0.04	0.10	0.11	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02
C6	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.14	0.14	0.12	0.13
C8	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.13	0.10	0.06	0.08
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.12	0.12	0.11	0.12
N3	0.02	0.01	0.10	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.11	0.01	0.07	0.08	0.06	0.07
N6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.16	0.17	0.15	0.16
N7	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.15	0.14	0.09	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.07	0.03	0.05
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.10	0.06	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.02
O3'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.10	0.03	0.12	0.11	0.09	0.04	0.03	0.05	0.00	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.05	0.03	0.02
O5'	0.06	0.09	0.05	0.02	0.10	0.03	0.13	0.02	0.14	0.13	0.12	0.07	0.16	0.15	0.09	0.04	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.10	0.04	0.04	0.09	0.03	0.12	0.03	0.14	0.10	0.12	0.08	0.17	0.14	0.07	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.04	0.08	0.07	0.06	0.06	0.04	0.09	0.04	0.12	0.06	0.11	0.06	0.15	0.09	0.03	0.07	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.09	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.02	0.13	0.08	0.12	0.07	0.16	0.13	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.53	0.21	0.15	0.43	0.27	0.43	0.28	0.47	0.33	0.52	0.50	0.47	0.37	0.37	0.23	0.10	0.31	0.19	0.26	0.09	0.21
C2	0.30	0.65	0.20	0.14	0.49	0.24	0.53	0.25	0.61	0.39	0.67	0.54	0.64	0.47	0.39	0.21	0.11	0.29	0.15	0.18	0.12	0.14
C2'	0.29	0.55	0.17	0.10	0.41	0.21	0.40	0.21	0.46	0.27	0.53	0.50	0.46	0.32	0.32	0.20	0.08	0.26	0.12	0.20	0.08	0.14
C3'	0.24	0.47	0.13	0.07	0.34	0.15	0.31	0.13	0.38	0.19	0.45	0.43	0.37	0.24	0.25	0.18	0.07	0.20	0.07	0.15	0.12	0.09
C4	0.32	0.61	0.21	0.14	0.48	0.24	0.49	0.25	0.55	0.37	0.61	0.55	0.56	0.43	0.39	0.22	0.10	0.30	0.16	0.20	0.10	0.15
C4'	0.21	0.38	0.13	0.08	0.29	0.16	0.27	0.16	0.31	0.18	0.36	0.36	0.30	0.21	0.23	0.17	0.07	0.18	0.10	0.21	0.08	0.14
C5	0.29	0.61	0.20	0.14	0.47	0.22	0.49	0.22	0.55	0.37	0.60	0.54	0.56	0.43	0.37	0.20	0.12	0.27	0.14	0.16	0.15	0.13
C5'	0.11	0.25	0.05	0.01	0.16	0.06	0.14	0.06	0.18	0.06	0.22	0.23	0.17	0.09	0.11	0.11	0.03	0.07	0.06	0.17	0.12	0.09
C6	0.27	0.63	0.19	0.15	0.46	0.21	0.51	0.21	0.60	0.38	0.65	0.51	0.62	0.46	0.37	0.19	0.14	0.26	0.14	0.15	0.19	0.13
C8	0.33	0.50	0.22	0.15	0.43	0.25	0.42	0.25	0.45	0.34	0.48	0.49	0.45	0.37	0.37	0.23	0.11	0.30	0.16	0.20	0.11	0.16
N1	0.28	0.64	0.19	0.14	0.47	0.22	0.53	0.22	0.62	0.39	0.68	0.52	0.66	0.47	0.37	0.19	0.12	0.26	0.14	0.15	0.17	0.12
N3	0.32	0.63	0.21	0.14	0.49	0.25	0.51	0.26	0.58	0.38	0.64	0.55	0.60	0.45	0.39	0.22	0.10	0.30	0.16	0.21	0.09	0.16
N6	0.24	0.59	0.19	0.16	0.43	0.20	0.50	0.19	0.60	0.37	0.65	0.45	0.63	0.46	0.34	0.18	0.17	0.23	0.15	0.16	0.25	0.16
N7	0.30	0.53	0.20	0.15	0.44	0.22	0.44	0.21	0.48	0.34	0.51	0.50	0.48	0.39	0.36	0.20	0.14	0.27	0.14	0.16	0.16	0.14
N9	0.34	0.56	0.22	0.15	0.46	0.26	0.45	0.27	0.50	0.35	0.54	0.53	0.50	0.40	0.38	0.24	0.10	0.31	0.18	0.23	0.09	0.18
O2'	0.30	0.58	0.18	0.11	0.43	0.24	0.43	0.24	0.49	0.30	0.56	0.52	0.49	0.35	0.34	0.20	0.09	0.29	0.16	0.25	0.09	0.19
O3'	0.22	0.48	0.12	0.05	0.32	0.11	0.30	0.08	0.37	0.16	0.45	0.42	0.36	0.21	0.23	0.18	0.06	0.16	0.06	0.14	0.14	0.08
O4'	0.28	0.42	0.20	0.14	0.35	0.24	0.34	0.26	0.37	0.27	0.40	0.40	0.37	0.30	0.31	0.22	0.11	0.27	0.18	0.28	0.10	0.22
O5'	0.09	0.23	0.04	0.02	0.15	0.03	0.13	0.03	0.17	0.07	0.21	0.20	0.16	0.10	0.10	0.11	0.01	0.03	0.09	0.14	0.19	0.09
OP1	0.05	0.09	0.06	0.07	0.06	0.08	0.08	0.12	0.07	0.12	0.07	0.08	0.08	0.11	0.07	0.05	0.03	0.07	0.15	0.16	0.22	0.15
OP2	0.08	0.17	0.04	0.01	0.11	0.01	0.11	0.06	0.14	0.09	0.16	0.15	0.14	0.10	0.08	0.11	0.01	0.04	0.13	0.15	0.28	0.16
P	0.06	0.15	0.03	0.02	0.09	0.01	0.09	0.04	0.11	0.07	0.13	0.13	0.10	0.08	0.06	0.08	0.01	0.02	0.10	0.13	0.21	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.15	0.15	0.28	0.19
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.10	0.07	0.19	0.23	0.43	0.29
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.07	0.05	0.08	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.00	0.03	0.02	0.17	0.17	0.31	0.21
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.15	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.06	0.21	0.25	0.42	0.30
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.06	0.06	0.01
C5	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.05	0.24	0.33	0.50	0.37
C5'	0.04	0.07	0.07	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.10	0.07	0.07	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03
C6	0.00	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.05	0.25	0.34	0.52	0.38
C8	0.01	0.00	0.08	0.04	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.15	0.05	0.08	0.24	0.33	0.46	0.36
N1	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.06	0.22	0.29	0.48	0.34
N3	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.07	0.18	0.20	0.39	0.25
N6	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.08	0.04	0.27	0.40	0.56	0.43
N7	0.00	0.01	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.15	0.06	0.06	0.25	0.38	0.52	0.41
N9	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.05	0.20	0.24	0.38	0.28
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.07	0.02	0.11	0.07	0.11	0.15	0.09	0.06	0.13	0.15	0.07	0.00	0.07	0.03	0.19	0.21	0.42	0.27
O3'	0.06	0.10	0.03	0.01	0.08	0.03	0.07	0.02	0.08	0.05	0.09	0.10	0.08	0.06	0.06	0.07	0.00	0.03	0.06	0.10	0.15	0.06
O4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.06	0.07	0.04	0.06	0.05	0.03	0.03	0.00	0.06	0.07	0.11	0.07
O5'	0.15	0.19	0.17	0.07	0.21	0.02	0.24	0.00	0.25	0.24	0.22	0.18	0.27	0.25	0.20	0.19	0.06	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.15	0.23	0.17	0.08	0.25	0.06	0.33	0.06	0.34	0.33	0.29	0.20	0.40	0.38	0.24	0.21	0.10	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.43	0.31	0.15	0.42	0.06	0.50	0.01	0.52	0.46	0.48	0.39	0.56	0.52	0.38	0.42	0.15	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.29	0.21	0.07	0.30	0.01	0.37	0.03	0.38	0.36	0.34	0.25	0.43	0.41	0.28	0.27	0.06	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00