Doublet Group distance statistics: 52458

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N9	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.002, 0.013, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.011
O2'	A	0, 0.014, 0.078, 0.141, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.078 std_dev=0.064
C2'	A	0, -0.039, 0.149, 0.338, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.149 std_dev=0.188
O4'	A	0, -0.023, 0.172, 0.368, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.172 std_dev=0.195
O5'	A	0, 0.040, 0.364, 0.688, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.364 std_dev=0.324
O2'	B	0, 0.113, 0.474, 0.835, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.474 std_dev=0.361
C3'	A	0, -0.060, 0.318, 0.697, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.318 std_dev=0.378
C4'	A	0, -0.068, 0.311, 0.690, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.311 std_dev=0.379
P	A	0, 0.164, 0.602, 1.040, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.602 std_dev=0.438
OP2	A	0, 0.050, 0.541, 1.032, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.541 std_dev=0.491
O3'	A	0, -0.017, 0.480, 0.977, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.480 std_dev=0.497
C2'	B	0, 0.102, 0.657, 1.212, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.657 std_dev=0.555
O4'	B	0, 0.082, 0.649, 1.216, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.649 std_dev=0.567
C5'	A	0, -0.123, 0.454, 1.031, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.454 std_dev=0.577
C3'	B	0, 0.297, 1.110, 1.922, 1.924 max_d=1.924 avg_d=1.110 std_dev=0.813
C1'	B	0, 0.384, 1.325, 2.267, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.325 std_dev=0.941
O3'	B	0, 0.209, 1.209, 2.208, 2.447 max_d=2.447 avg_d=1.209 std_dev=0.999
OP1	A	0, 0.134, 1.138, 2.142, 2.442 max_d=2.442 avg_d=1.138 std_dev=1.004
C4'	B	0, 0.414, 1.452, 2.491, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.452 std_dev=1.039
N9	B	0, 0.759, 2.609, 4.459, 4.076 max_d=4.076 avg_d=2.609 std_dev=1.850
O5'	B	0, 0.768, 2.643, 4.518, 4.154 max_d=4.154 avg_d=2.643 std_dev=1.875
C5'	B	0, 0.800, 2.738, 4.675, 4.211 max_d=4.211 avg_d=2.738 std_dev=1.938
C8	B	0, 0.898, 3.328, 5.758, 5.734 max_d=5.734 avg_d=3.328 std_dev=2.430
OP2	B	0, 1.111, 3.795, 6.478, 5.740 max_d=5.740 avg_d=3.795 std_dev=2.683
C4	B	0, 1.182, 4.049, 6.916, 6.262 max_d=6.262 avg_d=4.049 std_dev=2.867
P	B	0, 1.228, 4.195, 7.162, 6.380 max_d=6.380 avg_d=4.195 std_dev=2.967
N7	B	0, 1.314, 4.671, 8.028, 7.742 max_d=7.742 avg_d=4.671 std_dev=3.357
N3	B	0, 1.384, 4.826, 8.268, 7.790 max_d=7.790 avg_d=4.826 std_dev=3.442
C5	B	0, 1.482, 5.069, 8.656, 7.762 max_d=7.762 avg_d=5.069 std_dev=3.587
OP1	B	0, 1.640, 5.602, 9.564, 8.476 max_d=8.476 avg_d=5.602 std_dev=3.962
C2	B	0, 1.853, 6.429, 11.006, 10.290 max_d=10.290 avg_d=6.429 std_dev=4.577
C6	B	0, 1.951, 6.662, 11.372, 10.043 max_d=10.043 avg_d=6.662 std_dev=4.711
N1	B	0, 2.113, 7.262, 12.412, 11.364 max_d=11.364 avg_d=7.262 std_dev=5.150
N6	B	0, 2.289, 7.826, 13.363, 11.970 max_d=11.970 avg_d=7.826 std_dev=5.537

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.12	0.11	0.16	0.08
C2	0.02	0.00	0.16	0.34	0.00	0.20	0.00	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.43	0.04	0.27	0.24	0.45	0.20
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.14	0.17	0.08	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.09
C3'	0.03	0.34	0.00	0.00	0.26	0.00	0.24	0.01	0.28	0.08	0.33	0.31	0.26	0.15	0.14	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.02	0.08
C4	0.01	0.00	0.11	0.26	0.00	0.15	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.28	0.02	0.27	0.14	0.40	0.16
C4'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.15	0.00	0.14	0.00	0.16	0.05	0.19	0.18	0.15	0.09	0.08	0.08	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05
C5	0.01	0.00	0.07	0.24	0.00	0.14	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.28	0.01	0.30	0.17	0.48	0.20
C5'	0.02	0.26	0.01	0.01	0.20	0.00	0.21	0.00	0.24	0.09	0.27	0.22	0.23	0.15	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01
C6	0.00	0.01	0.10	0.28	0.01	0.16	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.35	0.01	0.30	0.23	0.52	0.23
C8	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.03	0.26	0.16	0.34	0.15
N1	0.01	0.00	0.14	0.33	0.00	0.19	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.42	0.03	0.30	0.26	0.50	0.23
N3	0.02	0.00	0.17	0.31	0.00	0.18	0.01	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.37	0.04	0.25	0.18	0.39	0.16
N6	0.00	0.01	0.08	0.26	0.01	0.15	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.34	0.02	0.30	0.24	0.55	0.24
N7	0.00	0.01	0.02	0.15	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.17	0.02	0.29	0.16	0.46	0.19
N9	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.01	0.23	0.10	0.30	0.12
O2'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.04	0.07	0.08	0.01
O3'	0.03	0.43	0.02	0.01	0.28	0.01	0.28	0.01	0.35	0.09	0.42	0.37	0.34	0.17	0.14	0.00	0.00	0.02	0.17	0.25	0.06	0.11
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.10	0.02	0.00	0.14	0.20	0.11	0.09
O5'	0.12	0.27	0.03	0.11	0.27	0.01	0.30	0.00	0.30	0.26	0.30	0.25	0.30	0.29	0.23	0.04	0.17	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.11	0.24	0.06	0.13	0.14	0.05	0.17	0.07	0.23	0.16	0.26	0.18	0.24	0.16	0.10	0.07	0.25	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.45	0.05	0.02	0.40	0.04	0.48	0.02	0.52	0.34	0.50	0.39	0.55	0.46	0.30	0.08	0.06	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.20	0.09	0.08	0.16	0.05	0.20	0.01	0.23	0.15	0.23	0.16	0.24	0.19	0.12	0.01	0.11	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.96	0.05	0.26	0.33	0.12	0.15	0.32	0.37	0.51	0.75	0.81	0.24	0.39	0.12	0.13	0.47	0.04	0.36	0.53	0.43	0.47
C2	0.19	1.76	0.05	0.36	0.85	0.29	0.72	0.63	1.13	0.10	1.62	1.40	1.04	0.21	0.31	0.18	0.63	0.02	0.59	1.08	0.75	0.90
C2'	0.04	1.01	0.08	0.18	0.36	0.16	0.21	0.18	0.43	0.50	0.82	0.83	0.33	0.39	0.11	0.08	0.44	0.10	0.32	0.36	0.38	0.35
C3'	0.05	0.95	0.16	0.09	0.37	0.20	0.25	0.04	0.47	0.39	0.80	0.78	0.39	0.29	0.06	0.18	0.34	0.15	0.28	0.19	0.32	0.18
C4	0.17	1.58	0.05	0.35	0.76	0.27	0.61	0.58	0.96	0.11	1.41	1.29	0.85	0.11	0.27	0.19	0.63	0.03	0.54	0.94	0.66	0.79
C4'	0.13	0.68	0.19	0.10	0.18	0.21	0.05	0.04	0.17	0.53	0.49	0.58	0.08	0.43	0.14	0.25	0.22	0.15	0.31	0.07	0.34	0.19
C5	0.24	1.87	0.10	0.38	0.98	0.35	0.86	0.71	1.26	0.18	1.72	1.52	1.17	0.39	0.42	0.21	0.69	0.03	0.62	1.13	0.78	0.94
C5'	0.16	0.57	0.24	0.03	0.18	0.25	0.04	0.19	0.18	0.39	0.43	0.50	0.12	0.30	0.10	0.38	0.10	0.20	0.34	0.26	0.37	0.20
C6	0.28	2.07	0.11	0.39	1.10	0.39	1.02	0.78	1.47	0.30	1.97	1.65	1.42	0.55	0.51	0.21	0.70	0.03	0.69	1.27	0.88	1.05
C8	0.19	1.46	0.08	0.36	0.76	0.28	0.60	0.58	0.89	0.06	1.28	1.25	0.79	0.15	0.29	0.22	0.69	0.03	0.51	0.87	0.61	0.73
N1	0.25	1.99	0.08	0.38	1.02	0.36	0.93	0.73	1.38	0.21	1.88	1.57	1.32	0.43	0.44	0.20	0.67	0.03	0.66	1.23	0.85	1.02
N3	0.15	1.54	0.02	0.33	0.71	0.24	0.55	0.55	0.91	0.18	1.38	1.25	0.79	0.02	0.22	0.17	0.59	0.02	0.52	0.92	0.66	0.78
N6	0.34	2.29	0.14	0.40	1.26	0.45	1.25	0.87	1.74	0.51	2.24	1.80	1.73	0.80	0.64	0.22	0.72	0.03	0.76	1.42	0.99	1.18
N7	0.27	1.85	0.13	0.39	1.01	0.37	0.90	0.73	1.26	0.23	1.69	1.54	1.17	0.45	0.47	0.23	0.73	0.04	0.63	1.10	0.76	0.92
N9	0.13	1.31	0.03	0.32	0.61	0.21	0.43	0.49	0.72	0.23	1.13	1.10	0.60	0.07	0.18	0.18	0.60	0.03	0.46	0.77	0.56	0.65
O2'	0.16	0.78	0.05	0.16	0.16	0.07	0.23	0.18	0.19	0.77	0.55	0.63	0.23	0.70	0.28	0.14	0.29	0.03	0.24	0.31	0.30	0.27
O3'	0.11	0.89	0.20	0.04	0.31	0.23	0.18	0.11	0.39	0.44	0.73	0.73	0.32	0.35	0.05	0.26	0.26	0.19	0.30	0.23	0.34	0.12
O4'	0.08	0.71	0.13	0.22	0.18	0.14	0.07	0.16	0.17	0.57	0.51	0.61	0.07	0.46	0.15	0.09	0.37	0.08	0.34	0.28	0.39	0.34
O5'	0.21	0.76	0.21	0.25	0.45	0.02	0.45	0.09	0.58	0.42	0.72	0.63	0.57	0.41	0.30	0.04	0.01	0.07	0.09	0.37	0.15	0.09
OP1	0.82	0.65	0.72	0.36	0.60	0.73	0.52	0.64	0.55	0.50	0.62	0.67	0.52	0.44	0.62	0.92	0.01	0.88	0.66	0.52	0.68	0.50
OP2	0.20	1.15	0.37	0.32	0.86	0.18	0.95	0.16	1.14	0.52	1.23	0.97	1.17	0.75	0.55	0.16	0.01	0.08	0.08	0.47	0.13	0.21
P	0.14	0.59	0.16	0.05	0.34	0.28	0.38	0.22	0.53	0.07	0.62	0.45	0.55	0.23	0.10	0.29	0.00	0.27	0.26	0.20	0.35	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.44	0.00	0.21	0.23	0.25	0.20
C2	0.02	0.00	0.32	0.41	0.01	0.47	0.00	0.70	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.62	0.54	0.68	0.64	0.79	0.63
C2'	0.00	0.32	0.00	0.01	0.17	0.07	0.08	0.37	0.15	0.17	0.25	0.32	0.10	0.10	0.03	0.00	0.04	0.03	0.15	0.29	0.13	0.17
C3'	0.08	0.41	0.01	0.00	0.27	0.01	0.28	0.04	0.33	0.29	0.37	0.38	0.33	0.31	0.16	0.01	0.02	0.03	0.27	0.02	0.31	0.18
C4	0.01	0.01	0.17	0.27	0.00	0.18	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.45	0.26	0.08	0.50	0.09	0.16
C4'	0.03	0.47	0.07	0.01	0.18	0.00	0.07	0.01	0.14	0.35	0.33	0.47	0.09	0.28	0.08	0.21	0.03	0.00	0.01	0.20	0.16	0.06
C5	0.01	0.00	0.08	0.28	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.38	0.09	0.38	0.89	0.54	0.57
C5'	0.15	0.70	0.37	0.04	0.31	0.01	0.08	0.00	0.23	0.37	0.51	0.68	0.10	0.29	0.03	0.28	0.14	0.02	0.01	0.39	0.34	0.03
C6	0.01	0.00	0.15	0.33	0.01	0.14	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.47	0.21	0.13	0.78	0.28	0.33
C8	0.01	0.01	0.17	0.29	0.00	0.35	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.52	0.18	0.29	1.05	1.30	1.22	1.21
N1	0.01	0.00	0.25	0.37	0.00	0.33	0.00	0.51	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.57	0.39	0.36	0.57	0.41	0.27
N3	0.02	0.00	0.32	0.38	0.00	0.47	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.59	0.55	0.62	0.57	0.65	0.57
N6	0.01	0.00	0.10	0.33	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.43	0.13	0.33	1.03	0.56	0.60
N7	0.01	0.00	0.10	0.31	0.00	0.28	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.44	0.21	0.17	0.94	1.42	1.21	1.20
N9	0.00	0.01	0.03	0.16	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.34	0.02	0.44	0.62	0.51	0.51
O2'	0.01	0.31	0.00	0.01	0.04	0.21	0.16	0.28	0.06	0.52	0.16	0.32	0.16	0.44	0.18	0.00	0.08	0.16	0.12	0.22	0.13	0.01
O3'	0.44	0.62	0.04	0.02	0.45	0.03	0.38	0.14	0.47	0.18	0.57	0.59	0.43	0.21	0.34	0.08	0.00	0.32	0.24	0.25	0.33	0.20
O4'	0.00	0.54	0.03	0.03	0.26	0.00	0.09	0.02	0.21	0.29	0.39	0.55	0.13	0.17	0.02	0.16	0.32	0.00	0.10	0.09	0.19	0.12
O5'	0.21	0.68	0.15	0.27	0.08	0.01	0.38	0.01	0.13	1.05	0.36	0.62	0.33	0.94	0.44	0.12	0.24	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.23	0.64	0.29	0.02	0.50	0.20	0.89	0.39	0.78	1.30	0.57	0.57	1.03	1.42	0.62	0.22	0.25	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.79	0.13	0.31	0.09	0.16	0.54	0.34	0.28	1.22	0.41	0.65	0.56	1.21	0.51	0.13	0.33	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.63	0.17	0.18	0.16	0.06	0.57	0.03	0.33	1.21	0.27	0.57	0.60	1.20	0.51	0.01	0.20	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00