Doublet Group distance statistics: 52463

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C4	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N3	A	0, 0.000, 0.046, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.046 std_dev=0.046
C1'	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
N6	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
N9	A	0, 0.000, 0.053, 0.105, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N7	A	0, 0.000, 0.053, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.053 std_dev=0.053
C8	A	0, 0.000, 0.067, 0.134, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.067 std_dev=0.067
N6	B	0, 0.000, 0.371, 0.742, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.371 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.000, 0.372, 0.744, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.372 std_dev=0.372
C2'	B	0, 0.000, 0.462, 0.924, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.462 std_dev=0.462
C5	B	0, 0.000, 0.499, 0.998, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.499 std_dev=0.499
O3'	B	0, 0.000, 0.656, 1.311, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.656 std_dev=0.656
C4	B	0, 0.000, 0.687, 1.374, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.687 std_dev=0.687
C6	B	0, 0.000, 0.712, 1.424, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.712 std_dev=0.712
N9	B	0, 0.000, 0.973, 1.945, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.973 std_dev=0.973
C1'	B	0, 0.000, 1.078, 2.157, 2.157 max_d=2.157 avg_d=1.078 std_dev=1.078
O3'	A	0, 0.000, 1.080, 2.160, 2.160 max_d=2.160 avg_d=1.080 std_dev=1.080
C3'	B	0, 0.000, 1.090, 2.181, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.090 std_dev=1.090
C3'	A	0, 0.000, 1.138, 2.277, 2.277 max_d=2.277 avg_d=1.138 std_dev=1.138
C4'	A	0, 0.000, 1.224, 2.448, 2.448 max_d=2.448 avg_d=1.224 std_dev=1.224
O4'	A	0, 0.000, 1.254, 2.508, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.254 std_dev=1.254
C2'	A	0, 0.000, 1.325, 2.650, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.325 std_dev=1.325
N7	B	0, 0.000, 1.473, 2.946, 2.946 max_d=2.946 avg_d=1.473 std_dev=1.473
N3	B	0, 0.000, 1.579, 3.157, 3.157 max_d=3.157 avg_d=1.579 std_dev=1.579
C8	B	0, 0.000, 1.744, 3.488, 3.488 max_d=3.488 avg_d=1.744 std_dev=1.744
C4'	B	0, 0.000, 1.803, 3.606, 3.606 max_d=3.606 avg_d=1.803 std_dev=1.803
N1	B	0, 0.000, 1.819, 3.638, 3.638 max_d=3.638 avg_d=1.819 std_dev=1.819
O4'	B	0, 0.000, 1.930, 3.860, 3.860 max_d=3.860 avg_d=1.930 std_dev=1.930
C2	B	0, 0.000, 2.167, 4.333, 4.333 max_d=4.333 avg_d=2.167 std_dev=2.167
O2'	A	0, 0.000, 2.223, 4.446, 4.446 max_d=4.446 avg_d=2.223 std_dev=2.223
C5'	A	0, 0.000, 2.620, 5.240, 5.240 max_d=5.240 avg_d=2.620 std_dev=2.620
C5'	B	0, 0.000, 2.933, 5.866, 5.866 max_d=5.866 avg_d=2.933 std_dev=2.933
O5'	A	0, 0.000, 3.573, 7.146, 7.146 max_d=7.146 avg_d=3.573 std_dev=3.573
O5'	B	0, 0.000, 3.870, 7.741, 7.741 max_d=7.741 avg_d=3.870 std_dev=3.870
P	A	0, 0.000, 4.915, 9.830, 9.830 max_d=9.830 avg_d=4.915 std_dev=4.915
OP1	A	0, 0.000, 5.185, 10.370, 10.370 max_d=10.370 avg_d=5.185 std_dev=5.185
OP2	A	0, 0.000, 5.193, 10.386, 10.386 max_d=10.386 avg_d=5.193 std_dev=5.193
P	B	0, 0.000, 5.335, 10.669, 10.669 max_d=10.669 avg_d=5.335 std_dev=5.335
OP1	B	0, 0.000, 5.620, 11.240, 11.240 max_d=11.240 avg_d=5.620 std_dev=5.620
OP2	B	0, 0.000, 5.939, 11.878, 11.878 max_d=11.878 avg_d=5.939 std_dev=5.939

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.03	0.05	0.07	0.01
C2	0.06	0.00	0.24	0.31	0.00	0.31	0.01	0.82	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.06	0.21	1.00	0.69	1.08	0.96
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.01	0.09	0.15	0.14	0.08	0.21	0.23	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03	0.05
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.14	0.00	0.06	0.01	0.14	0.15	0.25	0.29	0.11	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.26	0.06	0.05	0.15
C4	0.04	0.00	0.13	0.14	0.00	0.15	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.11	0.45	0.30	0.46	0.38
C4'	0.03	0.31	0.01	0.00	0.15	0.00	0.07	0.01	0.15	0.13	0.25	0.30	0.11	0.07	0.00	0.11	0.07	0.01	0.01	0.07	0.19	0.08
C5	0.02	0.01	0.09	0.06	0.00	0.07	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.04	0.27	0.15	0.24	0.18
C5'	0.04	0.82	0.15	0.01	0.42	0.01	0.28	0.00	0.45	0.16	0.68	0.75	0.37	0.03	0.10	0.02	0.17	0.02	0.00	0.22	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.14	0.14	0.00	0.15	0.01	0.45	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.09	0.51	0.30	0.50	0.42
C8	0.03	0.01	0.08	0.15	0.00	0.13	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.16	0.15	0.11	0.32	0.25	0.37	0.41
N1	0.04	0.00	0.21	0.25	0.00	0.25	0.01	0.68	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.16	0.83	0.55	0.88	0.78
N3	0.06	0.00	0.23	0.29	0.00	0.30	0.01	0.75	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.06	0.22	0.88	0.61	0.94	0.83
N6	0.01	0.01	0.12	0.11	0.01	0.11	0.01	0.37	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.13	0.06	0.40	0.20	0.36	0.29
N7	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.16	0.14	0.06	0.14	0.16	0.22	0.26
N9	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.00	0.04	0.03	0.05	0.02
O2'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.03	0.11	0.06	0.02	0.04	0.16	0.06	0.16	0.09	0.16	0.05	0.00	0.02	0.05	0.14	0.04	0.01	0.09
O3'	0.13	0.06	0.01	0.01	0.10	0.07	0.12	0.17	0.12	0.15	0.08	0.06	0.13	0.14	0.12	0.02	0.00	0.07	0.29	0.02	0.11	0.16
O4'	0.00	0.21	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.02	0.09	0.11	0.16	0.22	0.06	0.06	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.06	0.11	0.03
O5'	0.03	1.00	0.09	0.26	0.45	0.01	0.27	0.00	0.51	0.32	0.83	0.88	0.40	0.14	0.04	0.14	0.29	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.05	0.69	0.01	0.06	0.30	0.07	0.15	0.22	0.30	0.25	0.55	0.61	0.20	0.16	0.03	0.04	0.02	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	1.08	0.03	0.05	0.46	0.19	0.24	0.14	0.50	0.37	0.88	0.94	0.36	0.22	0.05	0.01	0.11	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.96	0.05	0.15	0.38	0.08	0.18	0.02	0.42	0.41	0.78	0.83	0.29	0.26	0.02	0.09	0.16	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.86	0.34	0.70	0.09	0.79	0.15	1.45	0.15	0.80	0.62	0.66	0.01	0.66	0.35	0.07	0.18	0.58	2.03	2.79	2.54	2.68
C2	0.03	0.94	0.24	0.66	0.23	0.54	0.02	1.16	0.25	0.57	0.70	0.76	0.08	0.49	0.13	0.11	0.28	0.23	1.59	2.35	2.25	2.25
C2'	0.03	1.58	0.09	0.64	0.66	0.85	0.49	1.57	0.89	0.36	1.39	1.26	0.78	0.10	0.08	0.26	0.24	0.49	2.03	2.74	2.66	2.76
C3'	0.14	1.66	0.22	0.20	0.78	0.62	0.58	1.42	0.97	0.28	1.47	1.37	0.84	0.03	0.21	0.56	0.30	0.37	2.00	2.79	2.84	2.89
C4	0.02	0.87	0.23	0.63	0.22	0.48	0.03	1.07	0.21	0.54	0.63	0.72	0.06	0.47	0.13	0.11	0.26	0.20	1.52	2.26	2.05	2.12
C4'	0.20	1.22	0.34	0.14	0.50	0.23	0.21	1.00	0.49	0.47	0.97	1.06	0.30	0.36	0.07	0.72	0.79	0.16	1.73	2.75	2.64	2.66
C5	0.10	0.76	0.20	0.58	0.23	0.30	0.00	0.80	0.18	0.39	0.53	0.66	0.04	0.35	0.03	0.07	0.33	0.00	1.17	1.85	1.61	1.68
C5'	0.84	1.60	1.01	0.95	1.03	0.56	0.74	0.16	0.95	0.19	1.36	1.50	0.75	0.24	0.70	1.30	1.66	0.56	0.91	1.92	1.90	1.84
C6	0.12	0.75	0.20	0.60	0.23	0.28	0.01	0.78	0.18	0.36	0.53	0.65	0.04	0.34	0.02	0.05	0.37	0.04	1.12	1.78	1.59	1.63
C8	0.08	0.69	0.19	0.52	0.20	0.27	0.02	0.74	0.14	0.39	0.46	0.62	0.01	0.35	0.05	0.07	0.27	0.01	1.16	1.80	1.48	1.60
N1	0.05	0.86	0.22	0.64	0.24	0.41	0.00	0.96	0.22	0.46	0.62	0.71	0.07	0.41	0.07	0.08	0.34	0.08	1.34	2.04	1.91	1.92
N3	0.08	0.96	0.24	0.66	0.22	0.60	0.04	1.24	0.24	0.63	0.72	0.77	0.08	0.53	0.18	0.13	0.23	0.32	1.72	2.51	2.39	2.41
N6	0.19	0.64	0.18	0.56	0.23	0.15	0.03	0.59	0.16	0.25	0.44	0.58	0.02	0.25	0.05	0.01	0.42	0.18	0.86	1.46	1.26	1.30
N7	0.18	0.63	0.16	0.50	0.22	0.15	0.01	0.57	0.14	0.28	0.42	0.58	0.01	0.27	0.03	0.04	0.33	0.14	0.92	1.54	1.25	1.33
N9	0.05	0.85	0.24	0.61	0.20	0.51	0.05	1.08	0.19	0.57	0.60	0.71	0.05	0.48	0.16	0.11	0.22	0.26	1.57	2.30	2.03	2.14
O2'	0.71	1.18	0.76	1.44	0.16	1.66	0.08	2.29	0.56	0.84	1.07	0.75	0.51	0.50	0.48	0.41	1.10	1.22	2.61	3.02	3.07	3.17
O3'	0.68	1.08	0.52	0.93	0.10	1.48	0.04	2.31	0.43	1.00	0.95	0.70	0.35	0.68	0.54	0.13	0.40	1.25	2.87	3.36	3.61	3.68
O4'	0.14	0.92	0.20	0.01	0.29	0.18	0.04	0.88	0.19	0.59	0.63	0.83	0.01	0.54	0.06	0.63	0.64	0.11	1.59	2.58	2.29	2.37
O5'	1.51	1.91	1.67	1.72	1.51	1.37	1.17	0.67	1.28	0.77	1.64	1.91	1.04	0.72	1.29	1.85	2.39	1.31	0.14	1.31	1.11	1.06
OP1	1.24	1.07	1.45	1.89	0.84	1.62	0.41	1.08	0.39	0.28	0.72	1.19	0.07	0.05	0.81	1.70	2.83	1.26	0.17	0.81	0.76	0.61
OP2	1.94	2.21	2.06	2.42	1.94	1.99	1.66	1.43	1.73	1.36	2.00	2.21	1.51	1.30	1.78	2.09	3.05	1.81	0.58	0.53	0.49	0.35
P	1.85	1.88	2.01	2.37	1.64	2.01	1.27	1.40	1.29	1.05	1.59	1.95	1.02	0.90	1.54	2.14	3.18	1.78	0.52	0.60	0.50	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00	0.27	0.46	0.27	0.30
C2	0.02	0.00	0.17	0.21	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.13	0.08	0.35	0.88	0.35	0.47
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.18	0.08	0.10	0.14	0.17	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.57	0.77	0.54	0.66
C3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.21	0.00	0.27	0.02	0.30	0.22	0.26	0.16	0.33	0.27	0.17	0.01	0.00	0.01	0.30	0.26	0.23	0.35
C4	0.01	0.00	0.08	0.21	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.08	0.04	0.35	0.86	0.35	0.46
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.06	0.02	0.12	0.12	0.06	0.24	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.00
C5	0.01	0.00	0.04	0.27	0.00	0.09	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.03	0.03	0.35	1.02	0.37	0.51
C5'	0.08	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.03	0.02	0.03	0.08	0.06	0.02	0.06	0.16	0.02	0.00	0.23	0.08	0.02
C6	0.01	0.00	0.08	0.30	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.27	0.03	0.04	0.35	1.06	0.37	0.52
C8	0.00	0.00	0.10	0.22	0.00	0.11	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.05	0.05	0.34	0.93	0.37	0.49
N1	0.02	0.00	0.14	0.26	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.25	0.04	0.07	0.35	1.00	0.37	0.51
N3	0.02	0.00	0.17	0.16	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.18	0.08	0.34	0.78	0.34	0.43
N6	0.00	0.01	0.07	0.33	0.00	0.12	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.10	0.03	0.33	1.14	0.37	0.53
N7	0.01	0.00	0.05	0.27	0.00	0.12	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.09	0.02	0.34	1.06	0.38	0.52
N9	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.07	0.00	0.34	0.77	0.34	0.43
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.21	0.24	0.26	0.06	0.27	0.22	0.25	0.17	0.29	0.26	0.17	0.00	0.01	0.18	0.29	0.49	0.31	0.39
O3'	0.24	0.13	0.01	0.00	0.08	0.01	0.03	0.16	0.03	0.05	0.04	0.18	0.10	0.09	0.07	0.01	0.00	0.16	0.07	0.20	0.04	0.03
O4'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.08	0.03	0.02	0.00	0.18	0.16	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02
O5'	0.27	0.35	0.57	0.30	0.35	0.01	0.35	0.00	0.35	0.34	0.35	0.34	0.33	0.34	0.34	0.29	0.07	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00
OP1	0.46	0.88	0.77	0.26	0.86	0.17	1.02	0.23	1.06	0.93	1.00	0.78	1.14	1.06	0.77	0.49	0.20	0.02	0.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.27	0.35	0.54	0.23	0.35	0.07	0.37	0.08	0.37	0.37	0.37	0.34	0.37	0.38	0.34	0.31	0.04	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.30	0.47	0.66	0.35	0.46	0.00	0.51	0.02	0.52	0.49	0.51	0.43	0.53	0.52	0.43	0.39	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00