Doublet Group distance statistics: 52464

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C2'	B	0, 0.000, 0.519, 1.037, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.519 std_dev=0.519
O2'	B	0, 0.000, 0.561, 1.122, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.561 std_dev=0.561
OP2	B	0, 0.000, 0.712, 1.423, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.712 std_dev=0.712
C4'	B	0, 0.000, 0.798, 1.595, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.798 std_dev=0.798
O2'	A	0, 0.000, 0.807, 1.614, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.807 std_dev=0.807
C3'	B	0, 0.000, 0.810, 1.621, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.810 std_dev=0.810
C5'	B	0, 0.000, 0.868, 1.736, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.868 std_dev=0.868
C2'	A	0, 0.000, 0.871, 1.742, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.871 std_dev=0.871
O4'	A	0, 0.000, 0.919, 1.837, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.919 std_dev=0.919
O5'	B	0, 0.000, 1.115, 2.231, 2.231 max_d=2.231 avg_d=1.115 std_dev=1.115
P	B	0, 0.000, 1.240, 2.481, 2.481 max_d=2.481 avg_d=1.240 std_dev=1.240
C1'	B	0, 0.000, 1.345, 2.690, 2.690 max_d=2.690 avg_d=1.345 std_dev=1.345
O4'	B	0, 0.000, 1.400, 2.799, 2.799 max_d=2.799 avg_d=1.400 std_dev=1.400
C4'	A	0, 0.000, 1.432, 2.864, 2.864 max_d=2.864 avg_d=1.432 std_dev=1.432
C3'	A	0, 0.000, 1.479, 2.957, 2.957 max_d=2.957 avg_d=1.479 std_dev=1.479
OP1	B	0, 0.000, 1.647, 3.293, 3.293 max_d=3.293 avg_d=1.647 std_dev=1.647
O3'	B	0, 0.000, 2.061, 4.122, 4.122 max_d=4.122 avg_d=2.061 std_dev=2.061
O3'	A	0, 0.000, 2.076, 4.152, 4.152 max_d=4.152 avg_d=2.076 std_dev=2.076
C5'	A	0, 0.000, 2.293, 4.586, 4.586 max_d=4.586 avg_d=2.293 std_dev=2.293
N9	B	0, 0.000, 2.559, 5.118, 5.118 max_d=5.118 avg_d=2.559 std_dev=2.559
O5'	A	0, 0.000, 2.785, 5.570, 5.570 max_d=5.570 avg_d=2.785 std_dev=2.785
C8	B	0, 0.000, 3.100, 6.200, 6.200 max_d=6.200 avg_d=3.100 std_dev=3.100
P	A	0, 0.000, 3.454, 6.908, 6.908 max_d=6.908 avg_d=3.454 std_dev=3.454
N3	B	0, 0.000, 3.526, 7.051, 7.051 max_d=7.051 avg_d=3.526 std_dev=3.526
C4	B	0, 0.000, 3.566, 7.131, 7.131 max_d=7.131 avg_d=3.566 std_dev=3.566
OP2	A	0, 0.000, 3.691, 7.383, 7.383 max_d=7.383 avg_d=3.691 std_dev=3.691
OP1	A	0, 0.000, 3.995, 7.990, 7.990 max_d=7.990 avg_d=3.995 std_dev=3.995
N7	B	0, 0.000, 4.384, 8.768, 8.768 max_d=8.768 avg_d=4.384 std_dev=4.384
C5	B	0, 0.000, 4.676, 9.352, 9.352 max_d=9.352 avg_d=4.676 std_dev=4.676
C2	B	0, 0.000, 4.686, 9.372, 9.372 max_d=9.372 avg_d=4.686 std_dev=4.686
N1	B	0, 0.000, 5.826, 11.652, 11.652 max_d=11.652 avg_d=5.826 std_dev=5.826
C6	B	0, 0.000, 5.869, 11.738, 11.738 max_d=11.738 avg_d=5.869 std_dev=5.869
N6	B	0, 0.000, 7.045, 14.090, 14.090 max_d=14.090 avg_d=7.045 std_dev=7.045

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.30	0.31	0.25	0.32
C2	0.02	0.00	0.32	0.18	0.00	0.20	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.27	0.38	0.31	0.28	0.52	0.36
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.18	0.01	0.11	0.01	0.17	0.13	0.27	0.31	0.14	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.02	0.10
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.13	0.01	0.13	0.03	0.16	0.03	0.18	0.16	0.16	0.08	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.04
C4	0.01	0.00	0.18	0.13	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.17	0.21	0.49	0.50	0.60	0.55
C4'	0.00	0.20	0.01	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.06	0.19	0.15	0.19	0.02	0.13	0.04	0.02	0.03	0.00	0.01	0.10	0.09	0.00
C5	0.00	0.00	0.11	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.16	0.11	0.68	0.75	0.86	0.80
C5'	0.01	0.33	0.01	0.03	0.12	0.00	0.00	0.00	0.11	0.31	0.25	0.29	0.04	0.22	0.06	0.01	0.05	0.00	0.00	0.25	0.14	0.00
C6	0.01	0.00	0.17	0.16	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.22	0.19	0.62	0.70	0.87	0.74
C8	0.02	0.00	0.13	0.03	0.00	0.19	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.19	0.89	0.96	0.88	0.99
N1	0.02	0.00	0.27	0.18	0.00	0.15	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.26	0.31	0.45	0.47	0.70	0.53
N3	0.02	0.00	0.31	0.16	0.00	0.19	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.23	0.37	0.28	0.25	0.43	0.31
N6	0.01	0.00	0.14	0.16	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.21	0.14	0.72	0.85	1.03	0.88
N7	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.09	0.90	1.04	1.06	1.07
N9	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.56	0.58	0.55	0.61
O2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.13	0.02	0.06	0.01	0.13	0.13	0.23	0.27	0.09	0.07	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.07	0.10	0.03
O3'	0.01	0.27	0.01	0.00	0.17	0.03	0.16	0.05	0.22	0.00	0.26	0.23	0.21	0.08	0.06	0.01	0.00	0.02	0.30	0.33	0.41	0.35
O4'	0.00	0.38	0.01	0.01	0.21	0.00	0.11	0.00	0.19	0.19	0.31	0.37	0.14	0.09	0.01	0.04	0.02	0.00	0.23	0.32	0.16	0.26
O5'	0.30	0.31	0.12	0.01	0.49	0.01	0.68	0.00	0.62	0.89	0.45	0.28	0.72	0.90	0.56	0.03	0.30	0.23	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.31	0.28	0.08	0.01	0.50	0.10	0.75	0.25	0.70	0.96	0.47	0.25	0.85	1.04	0.58	0.07	0.33	0.32	0.03	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.52	0.02	0.13	0.60	0.09	0.86	0.14	0.87	0.88	0.70	0.43	1.03	1.06	0.55	0.10	0.41	0.16	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.32	0.36	0.10	0.04	0.55	0.00	0.80	0.00	0.74	0.99	0.53	0.31	0.88	1.07	0.61	0.03	0.35	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.65	1.55	0.02	0.43	1.41	0.16	1.72	0.25	1.91	1.34	1.81	1.31	2.10	1.70	1.14	0.32	1.14	0.64	0.26	0.10	0.27	0.33
C2	0.85	2.63	0.09	0.39	2.20	0.26	2.81	0.35	3.33	1.97	3.19	2.09	3.83	2.67	1.66	0.38	1.25	0.66	0.21	0.11	0.25	0.26
C2'	1.11	1.67	0.44	0.10	1.59	0.52	1.77	0.48	1.88	1.54	1.83	1.52	1.98	1.74	1.43	0.21	0.58	1.22	1.00	0.65	0.91	1.07
C3'	1.11	1.40	0.47	0.19	1.43	0.66	1.58	0.73	1.61	1.53	1.53	1.31	1.69	1.64	1.37	0.23	0.48	1.28	1.06	0.54	0.99	1.14
C4	0.84	2.29	0.05	0.42	2.00	0.22	2.49	0.31	2.84	1.81	2.71	1.88	3.16	2.38	1.56	0.36	1.28	0.71	0.25	0.06	0.25	0.30
C4'	0.44	0.93	0.13	0.46	0.92	0.14	1.17	0.13	1.25	1.05	1.12	0.79	1.40	1.27	0.81	0.36	1.04	0.49	0.05	0.45	0.12	0.16
C5	0.90	2.53	0.06	0.43	2.18	0.21	2.68	0.29	3.08	1.89	2.98	2.08	3.37	2.48	1.66	0.38	1.33	0.74	0.25	0.02	0.23	0.29
C5'	0.21	0.59	0.32	0.65	0.66	0.33	0.94	0.25	0.97	0.93	0.80	0.48	1.13	1.13	0.59	0.55	1.21	0.25	0.31	0.71	0.16	0.15
C6	0.92	2.84	0.09	0.40	2.34	0.24	2.93	0.31	3.48	1.99	3.41	2.27	3.89	2.68	1.74	0.39	1.30	0.71	0.23	0.04	0.23	0.27
C8	0.85	1.90	0.00	0.48	1.75	0.14	2.03	0.21	2.22	1.56	2.15	1.65	2.35	1.92	1.42	0.34	1.35	0.82	0.32	0.04	0.25	0.34
N1	0.89	2.84	0.10	0.39	2.34	0.26	2.97	0.34	3.56	2.03	3.45	2.24	4.08	2.77	1.74	0.39	1.28	0.67	0.21	0.08	0.24	0.26
N3	0.81	2.35	0.07	0.40	2.02	0.24	2.56	0.33	2.97	1.85	2.83	1.90	3.38	2.47	1.55	0.37	1.23	0.66	0.22	0.11	0.26	0.27
N6	0.93	3.05	0.10	0.38	2.42	0.23	3.00	0.29	3.64	1.98	3.65	2.40	4.04	2.68	1.76	0.39	1.29	0.70	0.23	0.01	0.22	0.26
N7	0.92	2.32	0.03	0.46	2.06	0.17	2.41	0.23	2.70	1.73	2.64	1.98	2.85	2.20	1.60	0.37	1.37	0.80	0.28	0.03	0.23	0.30
N9	0.79	1.91	0.02	0.44	1.73	0.17	2.10	0.26	2.33	1.60	2.22	1.61	2.54	2.03	1.39	0.34	1.26	0.74	0.29	0.03	0.27	0.33
O2'	0.92	1.48	0.33	0.02	1.35	0.41	1.51	0.37	1.64	1.26	1.62	1.33	1.73	1.45	1.19	0.15	0.55	1.02	0.88	0.68	0.88	1.01
O3'	1.20	1.25	0.66	0.48	1.31	0.99	1.39	1.17	1.37	1.42	1.31	1.23	1.40	1.44	1.33	0.48	0.06	1.43	1.43	0.98	1.53	1.69
O4'	0.23	1.10	0.36	0.77	0.99	0.58	1.35	0.68	1.52	1.03	1.38	0.86	1.75	1.40	0.75	0.64	1.40	0.17	0.33	0.74	0.21	0.23
O5'	0.15	0.27	0.37	0.53	0.44	0.15	0.71	0.17	0.68	0.87	0.47	0.21	0.85	0.98	0.49	0.69	1.18	0.31	0.14	0.17	0.58	0.45
OP1	0.72	0.99	1.10	1.01	0.75	0.59	0.53	0.10	0.62	0.21	0.84	0.98	0.46	0.19	0.59	1.26	1.26	0.46	0.43	0.44	0.21	0.00
OP2	0.49	0.23	0.05	0.16	0.57	0.42	0.81	0.80	0.68	1.18	0.42	0.24	0.81	1.16	0.76	0.42	0.51	0.67	0.55	0.18	0.94	0.75
P	0.21	0.24	0.68	0.72	0.00	0.35	0.30	0.08	0.23	0.57	0.02	0.29	0.42	0.64	0.11	1.02	1.32	0.03	0.11	0.30	0.43	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.15	0.09	0.22	0.12
C2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.09	0.20	0.04	0.59	0.19
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.08	0.02	0.07	0.00	0.09	0.00	0.11	0.11	0.09	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.23	0.31	0.18	0.19
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.16	0.07	0.16	0.11	0.17	0.11	0.07	0.01	0.00	0.00	0.28	0.47	0.09	0.23
C4	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.04	0.30	0.10	0.63	0.28
C4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.08	0.01	0.01	0.05	0.07	0.03	0.06	0.01	0.00	0.00	0.18	0.16	0.00
C5	0.00	0.00	0.07	0.13	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.02	0.43	0.21	0.87	0.42
C5'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.00	0.03	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.32	0.28	0.01
C6	0.00	0.00	0.09	0.16	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.04	0.40	0.15	0.92	0.40
C8	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.55	0.38	0.84	0.51
N1	0.01	0.00	0.11	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.07	0.30	0.04	0.78	0.29
N3	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.08	0.17	0.03	0.49	0.16
N6	0.00	0.00	0.09	0.17	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.02	0.47	0.22	1.08	0.49
N7	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.04	0.57	0.37	1.02	0.56
N9	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.33	0.18	0.55	0.30
O2'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.04	0.11	0.23	0.03	0.10
O3'	0.02	0.19	0.04	0.00	0.14	0.01	0.16	0.01	0.19	0.07	0.21	0.15	0.21	0.12	0.08	0.07	0.00	0.01	0.18	0.54	0.13	0.15
O4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.08	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01
O5'	0.15	0.20	0.23	0.28	0.30	0.00	0.43	0.00	0.40	0.55	0.30	0.17	0.47	0.57	0.33	0.11	0.18	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.09	0.04	0.31	0.47	0.10	0.18	0.21	0.32	0.15	0.38	0.04	0.03	0.22	0.37	0.18	0.23	0.54	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.59	0.18	0.09	0.63	0.16	0.87	0.28	0.92	0.84	0.78	0.49	1.08	1.02	0.55	0.03	0.13	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.19	0.19	0.23	0.28	0.00	0.42	0.01	0.40	0.51	0.29	0.16	0.49	0.56	0.30	0.10	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00