Doublet Group distance statistics: 52467

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C6	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N9	A	0, 0.000, 0.050, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.050 std_dev=0.050
O2'	B	0, 0.000, 0.194, 0.389, 0.389 max_d=0.389 avg_d=0.194 std_dev=0.194
C2'	B	0, 0.000, 0.349, 0.698, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.349 std_dev=0.349
C3'	B	0, 0.000, 0.435, 0.870, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.435 std_dev=0.435
O4'	A	0, 0.000, 0.695, 1.390, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.695 std_dev=0.695
C2'	A	0, 0.000, 0.820, 1.640, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.820 std_dev=0.820
C4'	A	0, 0.000, 0.985, 1.971, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.985 std_dev=0.985
O2'	A	0, 0.000, 1.047, 2.095, 2.095 max_d=2.095 avg_d=1.047 std_dev=1.047
OP2	B	0, 0.000, 1.079, 2.159, 2.159 max_d=2.159 avg_d=1.079 std_dev=1.079
P	B	0, 0.000, 1.100, 2.199, 2.199 max_d=2.199 avg_d=1.100 std_dev=1.100
C4'	B	0, 0.000, 1.109, 2.217, 2.217 max_d=2.217 avg_d=1.109 std_dev=1.109
O5'	A	0, 0.000, 1.155, 2.310, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.155 std_dev=1.155
C1'	B	0, 0.000, 1.196, 2.393, 2.393 max_d=2.393 avg_d=1.196 std_dev=1.196
OP1	B	0, 0.000, 1.211, 2.422, 2.422 max_d=2.422 avg_d=1.211 std_dev=1.211
O5'	B	0, 0.000, 1.237, 2.474, 2.474 max_d=2.474 avg_d=1.237 std_dev=1.237
C3'	A	0, 0.000, 1.240, 2.481, 2.481 max_d=2.481 avg_d=1.240 std_dev=1.240
O3'	B	0, 0.000, 1.269, 2.538, 2.538 max_d=2.538 avg_d=1.269 std_dev=1.269
O4'	B	0, 0.000, 1.416, 2.832, 2.832 max_d=2.832 avg_d=1.416 std_dev=1.416
C5'	B	0, 0.000, 1.431, 2.862, 2.862 max_d=2.862 avg_d=1.431 std_dev=1.431
C8	B	0, 0.000, 1.816, 3.633, 3.633 max_d=3.633 avg_d=1.816 std_dev=1.816
P	A	0, 0.000, 1.828, 3.656, 3.656 max_d=3.656 avg_d=1.828 std_dev=1.828
C5'	A	0, 0.000, 1.848, 3.697, 3.697 max_d=3.697 avg_d=1.848 std_dev=1.848
N9	B	0, 0.000, 1.887, 3.773, 3.773 max_d=3.773 avg_d=1.887 std_dev=1.887
O3'	A	0, 0.000, 1.901, 3.802, 3.802 max_d=3.802 avg_d=1.901 std_dev=1.901
OP2	A	0, 0.000, 2.610, 5.219, 5.219 max_d=5.219 avg_d=2.610 std_dev=2.610
OP1	A	0, 0.000, 2.719, 5.438, 5.438 max_d=5.438 avg_d=2.719 std_dev=2.719
N7	B	0, 0.000, 2.769, 5.537, 5.537 max_d=5.537 avg_d=2.769 std_dev=2.769
C4	B	0, 0.000, 2.946, 5.892, 5.892 max_d=5.892 avg_d=2.946 std_dev=2.946
N3	B	0, 0.000, 3.380, 6.760, 6.760 max_d=6.760 avg_d=3.380 std_dev=3.380
C5	B	0, 0.000, 3.512, 7.023, 7.023 max_d=7.023 avg_d=3.512 std_dev=3.512
C2	B	0, 0.000, 4.485, 8.970, 8.970 max_d=8.970 avg_d=4.485 std_dev=4.485
C6	B	0, 0.000, 4.691, 9.382, 9.382 max_d=9.382 avg_d=4.691 std_dev=4.691
N1	B	0, 0.000, 5.163, 10.326, 10.326 max_d=10.326 avg_d=5.163 std_dev=5.163
N6	B	0, 0.000, 5.385, 10.770, 10.770 max_d=10.770 avg_d=5.385 std_dev=5.385

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.66	0.02	0.32
C2	0.02	0.00	0.31	0.16	0.01	0.04	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.39	0.29	0.17	0.06	1.32	0.41	0.68
C2'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.14	0.00	0.03	0.00	0.11	0.22	0.23	0.32	0.06	0.14	0.02	0.00	0.04	0.00	0.17	0.71	0.15	0.52
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.27	0.09	0.17	0.04	0.22	0.08	0.00	0.01	0.01	0.37	0.74	0.19	0.62
C4	0.02	0.01	0.14	0.03	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.18	0.07	0.07	0.01	1.22	0.34	0.62
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.00	0.01	0.31	0.17	0.15
C5	0.03	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	1.37	0.47	0.72
C5'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.05	0.16	0.15	0.08	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.24	0.33	0.00
C6	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.17	0.01	0.03	0.06	1.47	0.54	0.77
C8	0.01	0.01	0.22	0.27	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.37	0.17	0.05	1.12	0.33	0.59
N1	0.02	0.00	0.23	0.09	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.16	0.12	0.07	1.44	0.51	0.75
N3	0.02	0.00	0.32	0.17	0.00	0.03	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.38	0.29	0.18	0.03	1.18	0.30	0.60
N6	0.04	0.00	0.06	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.12	0.09	0.01	0.06	1.52	0.62	0.80
N7	0.02	0.00	0.14	0.22	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.09	0.34	0.12	0.00	1.32	0.49	0.71
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.02	0.03	1.04	0.24	0.53
O2'	0.00	0.39	0.00	0.00	0.18	0.05	0.08	0.05	0.17	0.16	0.30	0.38	0.12	0.09	0.01	0.00	0.12	0.05	0.15	0.45	0.06	0.38
O3'	0.04	0.29	0.04	0.01	0.07	0.05	0.09	0.01	0.01	0.37	0.16	0.29	0.09	0.34	0.08	0.12	0.00	0.04	0.58	0.63	0.33	0.72
O4'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.03	0.17	0.12	0.18	0.01	0.12	0.02	0.05	0.04	0.00	0.27	0.39	0.19	0.05
O5'	0.09	0.06	0.17	0.37	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.05	0.07	0.03	0.06	0.00	0.03	0.15	0.58	0.27	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.66	1.32	0.71	0.74	1.22	0.31	1.37	0.24	1.47	1.12	1.44	1.18	1.52	1.32	1.04	0.45	0.63	0.39	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.02	0.41	0.15	0.19	0.34	0.17	0.47	0.33	0.54	0.33	0.51	0.30	0.62	0.49	0.24	0.06	0.33	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.32	0.68	0.52	0.62	0.62	0.15	0.72	0.00	0.77	0.59	0.75	0.60	0.80	0.71	0.53	0.38	0.72	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.72	0.90	0.11	0.09	0.82	0.45	0.80	0.40	0.85	0.67	0.89	0.87	0.84	0.71	0.74	0.01	0.63	0.92	0.50	0.28	0.49	0.42
C2	0.84	1.98	0.17	0.21	1.51	0.15	1.61	0.02	1.90	1.05	2.07	1.70	1.97	1.33	1.14	0.02	0.84	0.86	0.27	0.24	0.37	0.32
C2'	0.15	0.39	0.43	0.59	0.26	0.10	0.24	0.11	0.29	0.10	0.36	0.35	0.28	0.14	0.17	0.50	1.05	0.33	0.02	0.26	0.01	0.08
C3'	0.08	0.21	0.45	0.70	0.08	0.20	0.01	0.29	0.03	0.10	0.13	0.20	0.02	0.11	0.02	0.34	1.14	0.20	0.21	0.63	0.25	0.37
C4	0.84	1.67	0.17	0.19	1.35	0.21	1.39	0.09	1.59	0.97	1.71	1.49	1.62	1.17	1.06	0.01	0.82	0.91	0.33	0.21	0.40	0.33
C4'	0.65	0.43	0.18	0.03	0.45	0.51	0.34	0.36	0.30	0.37	0.34	0.50	0.23	0.30	0.49	0.33	0.46	0.82	0.39	0.08	0.29	0.16
C5	0.85	1.93	0.18	0.23	1.54	0.05	1.62	0.10	1.87	1.07	2.01	1.70	1.92	1.35	1.17	0.04	0.86	0.84	0.21	0.13	0.33	0.25
C5'	0.91	0.56	0.58	0.26	0.60	0.71	0.43	0.42	0.37	0.49	0.43	0.68	0.27	0.37	0.67	0.92	0.12	0.97	0.45	0.23	0.27	0.09
C6	0.84	2.22	0.19	0.24	1.70	0.02	1.84	0.20	2.18	1.16	2.35	1.89	2.27	1.51	1.24	0.04	0.87	0.77	0.13	0.12	0.28	0.21
C8	0.84	1.37	0.17	0.19	1.20	0.20	1.21	0.08	1.32	0.90	1.39	1.28	1.32	1.03	1.00	0.02	0.83	0.93	0.33	0.11	0.39	0.29
N1	0.84	2.20	0.18	0.24	1.66	0.04	1.80	0.12	2.15	1.13	2.33	1.86	2.25	1.47	1.21	0.04	0.87	0.80	0.17	0.19	0.31	0.25
N3	0.83	1.71	0.16	0.18	1.35	0.24	1.40	0.13	1.62	0.96	1.76	1.51	1.66	1.17	1.05	0.00	0.79	0.91	0.35	0.27	0.41	0.36
N6	0.82	2.44	0.21	0.25	1.85	0.14	2.05	0.35	2.46	1.24	2.64	2.04	2.59	1.68	1.31	0.05	0.85	0.66	0.01	0.06	0.21	0.12
N7	0.84	1.77	0.18	0.24	1.49	0.00	1.54	0.16	1.73	1.06	1.83	1.60	1.76	1.30	1.16	0.05	0.86	0.83	0.19	0.05	0.32	0.21
N9	0.82	1.32	0.16	0.15	1.13	0.31	1.13	0.21	1.25	0.85	1.33	1.23	1.25	0.97	0.94	0.00	0.77	0.95	0.40	0.21	0.44	0.36
O2'	0.04	0.05	0.51	0.55	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.02	0.00	0.03	0.59	0.92	0.32	0.09	0.10	0.09	0.05
O3'	0.56	0.59	1.05	1.14	0.68	0.63	0.76	0.65	0.76	0.76	0.67	0.58	0.81	0.81	0.68	0.89	1.39	0.37	0.64	1.06	0.69	0.79
O4'	1.03	0.92	0.49	0.30	0.94	0.88	0.87	0.75	0.86	0.86	0.88	0.96	0.82	0.83	0.95	0.49	0.23	1.25	0.80	0.44	0.71	0.62
O5'	0.60	0.02	0.33	0.20	0.16	0.70	0.01	0.50	0.09	0.20	0.08	0.16	0.18	0.04	0.31	0.62	0.03	0.77	0.45	0.20	0.26	0.11
OP1	0.07	0.23	0.10	0.10	0.19	0.02	0.30	0.31	0.36	0.22	0.32	0.15	0.42	0.33	0.12	0.35	0.01	0.01	0.29	0.66	0.41	0.60
OP2	0.09	0.27	0.22	0.21	0.32	0.11	0.56	0.50	0.60	0.52	0.46	0.15	0.73	0.68	0.26	0.84	0.03	0.06	0.55	1.46	0.78	1.04
P	0.21	0.19	0.20	0.04	0.14	0.14	0.26	0.12	0.33	0.15	0.29	0.09	0.40	0.28	0.04	0.53	0.01	0.18	0.11	0.70	0.23	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.37	0.10	0.02
C2	0.02	0.00	0.27	0.23	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.33	0.13	0.19	0.54	0.29	0.10
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.16	0.00	0.12	0.02	0.17	0.06	0.23	0.26	0.14	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.14	0.37	0.21	0.01
C3'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.14	0.00	0.11	0.01	0.16	0.04	0.21	0.21	0.13	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.16	0.29	0.20	0.03
C4	0.01	0.00	0.16	0.14	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.19	0.08	0.17	0.54	0.25	0.06
C4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.12	0.02	0.04
C5	0.00	0.00	0.12	0.11	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.17	0.07	0.21	0.59	0.32	0.09
C5'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.12	0.06	0.12	0.07	0.14	0.09	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.17	0.16	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.24	0.10	0.24	0.59	0.37	0.13
C8	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.16	0.57	0.22	0.00
N1	0.01	0.00	0.23	0.21	0.00	0.01	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.31	0.12	0.22	0.57	0.35	0.13
N3	0.02	0.00	0.26	0.21	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.29	0.11	0.16	0.51	0.24	0.06
N6	0.01	0.01	0.14	0.13	0.00	0.03	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.22	0.10	0.26	0.59	0.43	0.17
N7	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.20	0.61	0.32	0.07
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.14	0.51	0.18	0.01
O2'	0.01	0.22	0.01	0.02	0.10	0.05	0.07	0.05	0.12	0.06	0.18	0.20	0.10	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.31	0.13	0.05
O3'	0.02	0.33	0.03	0.02	0.19	0.01	0.17	0.01	0.24	0.02	0.31	0.29	0.22	0.06	0.07	0.04	0.00	0.00	0.15	0.18	0.21	0.03
O4'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.08	0.00	0.07	0.02	0.10	0.04	0.12	0.11	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.25	0.06	0.06
O5'	0.07	0.19	0.14	0.16	0.17	0.01	0.21	0.01	0.24	0.16	0.22	0.16	0.26	0.20	0.14	0.06	0.15	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.37	0.54	0.37	0.29	0.54	0.12	0.59	0.09	0.59	0.57	0.57	0.51	0.59	0.61	0.51	0.31	0.18	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.29	0.21	0.20	0.25	0.02	0.32	0.01	0.37	0.22	0.35	0.24	0.43	0.32	0.18	0.13	0.21	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.10	0.01	0.03	0.06	0.04	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.06	0.17	0.07	0.01	0.05	0.03	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00