Doublet Group distance statistics: 52468

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C5	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C1'	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C4	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N9	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.000, 0.041, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.041 std_dev=0.041
N7	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
N6	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
O2'	B	0, 0.000, 0.408, 0.816, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.408 std_dev=0.408
C2'	B	0, 0.000, 0.670, 1.340, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.670 std_dev=0.670
O3'	B	0, 0.000, 0.705, 1.410, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.705 std_dev=0.705
O3'	A	0, 0.000, 0.741, 1.483, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.741 std_dev=0.741
C1'	B	0, 0.000, 0.964, 1.929, 1.929 max_d=1.929 avg_d=0.964 std_dev=0.964
C3'	A	0, 0.000, 1.002, 2.004, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.002 std_dev=1.002
C3'	B	0, 0.000, 1.049, 2.099, 2.099 max_d=2.099 avg_d=1.049 std_dev=1.049
N3	B	0, 0.000, 1.058, 2.116, 2.116 max_d=2.116 avg_d=1.058 std_dev=1.058
C2	B	0, 0.000, 1.111, 2.223, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.111 std_dev=1.111
N9	B	0, 0.000, 1.197, 2.394, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.197 std_dev=1.197
C4	B	0, 0.000, 1.206, 2.413, 2.413 max_d=2.413 avg_d=1.206 std_dev=1.206
O4'	A	0, 0.000, 1.240, 2.480, 2.480 max_d=2.480 avg_d=1.240 std_dev=1.240
C2'	A	0, 0.000, 1.271, 2.543, 2.543 max_d=2.543 avg_d=1.271 std_dev=1.271
N1	B	0, 0.000, 1.309, 2.618, 2.618 max_d=2.618 avg_d=1.309 std_dev=1.309
C4'	A	0, 0.000, 1.341, 2.681, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.341 std_dev=1.341
O4'	B	0, 0.000, 1.440, 2.881, 2.881 max_d=2.881 avg_d=1.440 std_dev=1.440
C5	B	0, 0.000, 1.481, 2.961, 2.961 max_d=2.961 avg_d=1.481 std_dev=1.481
C8	B	0, 0.000, 1.488, 2.977, 2.977 max_d=2.977 avg_d=1.488 std_dev=1.488
C4'	B	0, 0.000, 1.490, 2.979, 2.979 max_d=2.979 avg_d=1.490 std_dev=1.490
C6	B	0, 0.000, 1.530, 3.060, 3.060 max_d=3.060 avg_d=1.530 std_dev=1.530
N7	B	0, 0.000, 1.685, 3.371, 3.371 max_d=3.371 avg_d=1.685 std_dev=1.685
N6	B	0, 0.000, 1.809, 3.618, 3.618 max_d=3.618 avg_d=1.809 std_dev=1.809
O2'	A	0, 0.000, 2.230, 4.461, 4.461 max_d=4.461 avg_d=2.230 std_dev=2.230
C5'	B	0, 0.000, 2.278, 4.556, 4.556 max_d=4.556 avg_d=2.278 std_dev=2.278
C5'	A	0, 0.000, 2.668, 5.335, 5.335 max_d=5.335 avg_d=2.668 std_dev=2.668
O5'	B	0, 0.000, 3.233, 6.466, 6.466 max_d=6.466 avg_d=3.233 std_dev=3.233
O5'	A	0, 0.000, 3.543, 7.087, 7.087 max_d=7.087 avg_d=3.543 std_dev=3.543
P	B	0, 0.000, 4.584, 9.167, 9.167 max_d=9.167 avg_d=4.584 std_dev=4.584
OP2	B	0, 0.000, 4.710, 9.420, 9.420 max_d=9.420 avg_d=4.710 std_dev=4.710
P	A	0, 0.000, 5.084, 10.168, 10.168 max_d=10.168 avg_d=5.084 std_dev=5.084
OP1	B	0, 0.000, 5.530, 11.061, 11.061 max_d=11.061 avg_d=5.530 std_dev=5.530
OP2	A	0, 0.000, 5.588, 11.177, 11.177 max_d=11.177 avg_d=5.588 std_dev=5.588
OP1	A	0, 0.000, 5.640, 11.280, 11.280 max_d=11.280 avg_d=5.640 std_dev=5.640

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03
C2	0.03	0.00	0.34	0.31	0.02	0.34	0.02	0.84	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.07	0.16	1.23	0.98	1.60	1.40
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.17	0.01	0.08	0.05	0.16	0.18	0.27	0.33	0.12	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.23	0.22	0.31
C3'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.15	0.25	0.29	0.10	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.06	0.34	0.31
C4	0.03	0.02	0.17	0.14	0.00	0.16	0.00	0.38	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.07	0.56	0.29	0.68	0.57
C4'	0.01	0.34	0.01	0.00	0.16	0.00	0.07	0.01	0.14	0.15	0.27	0.34	0.10	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.20	0.09	0.02
C5	0.01	0.02	0.08	0.07	0.00	0.07	0.00	0.20	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.33	0.01	0.47	0.32
C5'	0.02	0.84	0.05	0.00	0.38	0.01	0.20	0.00	0.38	0.27	0.66	0.78	0.28	0.14	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.16	0.14	0.00	0.14	0.01	0.38	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.60	0.24	0.85	0.66
C8	0.02	0.02	0.18	0.15	0.00	0.15	0.01	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.10	0.38	0.64	0.36	0.48
N1	0.02	0.00	0.27	0.25	0.01	0.27	0.02	0.66	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.04	0.12	1.00	0.71	1.37	1.15
N3	0.04	0.00	0.33	0.29	0.01	0.34	0.01	0.78	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.09	0.07	0.17	1.11	0.86	1.32	1.19
N6	0.00	0.01	0.12	0.10	0.00	0.10	0.01	0.28	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.03	0.47	0.05	0.72	0.50
N7	0.02	0.03	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.17	0.55	0.12	0.27
N9	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.09	0.02
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.07	0.04	0.11	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.31	0.27	0.30	0.38
O3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.01	0.05	0.02	0.05	0.00	0.04	0.23	0.14	0.36	0.21
O4'	0.00	0.16	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.12	0.17	0.03	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.13	0.17	0.06	0.14
O5'	0.03	1.23	0.27	0.32	0.56	0.02	0.33	0.01	0.60	0.38	1.00	1.11	0.47	0.17	0.06	0.31	0.23	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.00	0.98	0.23	0.06	0.29	0.20	0.01	0.03	0.24	0.64	0.71	0.86	0.05	0.55	0.11	0.27	0.14	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	1.60	0.22	0.34	0.68	0.09	0.47	0.04	0.85	0.36	1.37	1.32	0.72	0.12	0.09	0.30	0.36	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	1.40	0.31	0.31	0.57	0.02	0.32	0.01	0.66	0.48	1.15	1.19	0.50	0.27	0.02	0.38	0.21	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.42	0.58	0.48	0.64	0.45	0.74	0.34	1.12	0.39	0.16	0.50	0.58	0.32	0.17	0.35	0.17	0.27	0.60	1.68	2.35	2.09	2.30
C2	0.26	0.44	0.41	0.66	0.25	0.70	0.11	1.14	0.16	0.06	0.32	0.43	0.07	0.08	0.15	0.16	0.36	0.48	1.64	2.44	2.22	2.34
C2'	0.24	0.24	0.20	0.17	0.33	0.35	0.43	0.86	0.42	0.53	0.33	0.21	0.47	0.55	0.38	0.57	0.14	0.07	1.39	2.15	2.13	2.15
C3'	0.13	0.04	0.22	0.08	0.08	0.25	0.10	0.76	0.08	0.17	0.05	0.04	0.07	0.14	0.13	0.51	0.44	0.12	1.48	2.51	2.22	2.35
C4	0.23	0.42	0.38	0.64	0.24	0.64	0.10	1.03	0.15	0.09	0.31	0.42	0.07	0.10	0.12	0.14	0.35	0.43	1.49	2.13	1.94	2.10
C4'	0.03	0.39	0.09	0.21	0.32	0.09	0.42	0.51	0.49	0.26	0.47	0.32	0.56	0.40	0.21	0.34	0.69	0.15	1.31	2.41	1.79	2.09
C5	0.15	0.35	0.35	0.64	0.14	0.57	0.02	0.91	0.04	0.22	0.22	0.35	0.06	0.23	0.02	0.13	0.42	0.34	1.29	1.78	1.62	1.80
C5'	0.59	0.13	0.70	0.95	0.17	0.66	0.03	0.23	0.12	0.12	0.03	0.24	0.27	0.08	0.30	0.89	1.51	0.53	0.57	1.78	1.11	1.36
C6	0.15	0.33	0.36	0.66	0.12	0.58	0.05	0.95	0.01	0.23	0.20	0.33	0.10	0.26	0.00	0.15	0.44	0.34	1.32	1.84	1.69	1.86
C8	0.15	0.38	0.33	0.61	0.17	0.51	0.02	0.80	0.09	0.21	0.26	0.37	0.00	0.19	0.03	0.11	0.40	0.32	1.14	1.50	1.33	1.56
N1	0.20	0.38	0.39	0.68	0.18	0.65	0.02	1.06	0.07	0.16	0.25	0.37	0.04	0.18	0.07	0.16	0.41	0.41	1.49	2.17	1.99	2.12
N3	0.29	0.46	0.41	0.64	0.30	0.71	0.17	1.14	0.22	0.01	0.36	0.46	0.14	0.01	0.19	0.15	0.32	0.50	1.67	2.48	2.26	2.38
N6	0.10	0.29	0.34	0.66	0.05	0.54	0.13	0.88	0.07	0.30	0.13	0.28	0.19	0.34	0.06	0.16	0.50	0.29	1.18	1.60	1.48	1.66
N7	0.09	0.31	0.30	0.61	0.08	0.47	0.08	0.76	0.01	0.29	0.18	0.30	0.11	0.29	0.05	0.11	0.45	0.26	1.06	1.39	1.25	1.47
N9	0.26	0.46	0.39	0.63	0.28	0.63	0.15	0.98	0.21	0.06	0.35	0.45	0.13	0.05	0.16	0.13	0.33	0.44	1.44	2.00	1.80	2.00
O2'	0.07	0.38	0.04	0.68	0.46	0.83	0.73	1.34	0.75	0.77	0.58	0.26	0.90	0.91	0.44	0.34	0.50	0.35	1.68	2.23	2.52	2.37
O3'	0.64	0.58	0.51	0.63	0.56	1.02	0.46	1.49	0.44	0.44	0.51	0.63	0.37	0.38	0.56	0.16	0.29	0.91	2.27	3.15	2.77	3.07
O4'	0.30	0.72	0.26	0.18	0.59	0.37	0.63	0.74	0.71	0.40	0.75	0.64	0.74	0.52	0.44	0.01	0.29	0.40	1.44	2.30	1.76	2.09
O5'	1.24	0.64	1.32	1.62	0.72	1.40	0.47	0.97	0.35	0.67	0.45	0.80	0.14	0.41	0.89	1.42	2.18	1.24	0.21	0.92	0.25	0.54
OP1	1.30	0.51	1.33	1.94	0.52	1.84	0.04	1.47	0.13	0.25	0.12	0.76	0.50	0.15	0.70	1.43	2.79	1.43	0.67	0.44	0.68	0.13
OP2	1.87	1.34	1.87	2.48	1.32	2.38	0.95	2.12	0.84	1.05	1.05	1.51	0.54	0.76	1.43	1.75	3.02	2.07	1.31	0.04	0.82	0.59
P	1.72	1.03	1.74	2.31	1.06	2.16	0.68	1.79	0.54	0.85	0.73	1.24	0.23	0.52	1.22	1.72	3.02	1.85	1.00	0.17	0.68	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.23	0.21	0.01	0.27
C2	0.01	0.00	0.16	0.03	0.01	0.30	0.01	0.47	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.47	0.36	0.34	0.58	0.85	0.80	0.61
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.09	0.01	0.04	0.13	0.07	0.09	0.12	0.17	0.05	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.48	0.61	0.36	0.65
C3'	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.26	0.15	0.32
C4	0.01	0.01	0.09	0.01	0.00	0.14	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.24	0.18	0.02	0.00	0.19	0.06
C4'	0.01	0.30	0.01	0.00	0.14	0.00	0.07	0.00	0.15	0.14	0.25	0.27	0.11	0.07	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.09	0.17	0.04
C5	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.17	0.10	0.22	0.40	0.12	0.38
C5'	0.05	0.47	0.13	0.01	0.15	0.00	0.03	0.00	0.17	0.36	0.37	0.41	0.09	0.24	0.09	0.07	0.09	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01
C6	0.00	0.02	0.07	0.02	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.28	0.22	0.18	0.01	0.09	0.11	0.12
C8	0.00	0.01	0.09	0.03	0.00	0.14	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.02	0.15	0.83	1.19	0.71	1.06
N1	0.00	0.01	0.12	0.00	0.01	0.25	0.01	0.37	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.40	0.30	0.29	0.37	0.50	0.54	0.34
N3	0.02	0.01	0.17	0.05	0.00	0.27	0.01	0.41	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.44	0.36	0.33	0.48	0.70	0.71	0.50
N6	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.11	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.23	0.19	0.13	0.13	0.35	0.08	0.32
N7	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.06	0.67	1.09	0.62	0.94
N9	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.14	0.01	0.37	0.48	0.18	0.48
O2'	0.00	0.47	0.00	0.01	0.27	0.05	0.18	0.07	0.28	0.14	0.40	0.44	0.23	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.42	0.57	0.24	0.60
O3'	0.16	0.36	0.01	0.00	0.24	0.01	0.17	0.09	0.22	0.02	0.30	0.36	0.19	0.06	0.14	0.03	0.00	0.12	0.03	0.05	0.28	0.02
O4'	0.00	0.34	0.00	0.01	0.18	0.01	0.10	0.00	0.18	0.15	0.29	0.33	0.13	0.06	0.01	0.02	0.12	0.00	0.04	0.05	0.15	0.01
O5'	0.23	0.58	0.48	0.22	0.02	0.00	0.22	0.00	0.01	0.83	0.37	0.48	0.13	0.67	0.37	0.42	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.21	0.85	0.61	0.26	0.00	0.09	0.40	0.01	0.09	1.19	0.50	0.70	0.35	1.09	0.48	0.57	0.05	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02
OP2	0.01	0.80	0.36	0.15	0.19	0.17	0.12	0.07	0.11	0.71	0.54	0.71	0.08	0.62	0.18	0.24	0.28	0.15	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.27	0.61	0.65	0.32	0.06	0.04	0.38	0.01	0.12	1.06	0.34	0.50	0.32	0.94	0.48	0.60	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00