Doublet Group distance statistics: 52471

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C1'	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.000, 0.046, 0.093, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.046 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.000, 0.154, 0.308, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.154 std_dev=0.154
C2'	A	0, 0.000, 0.156, 0.312, 0.312 max_d=0.312 avg_d=0.156 std_dev=0.156
C4'	A	0, 0.000, 0.198, 0.395, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.198 std_dev=0.198
O2'	A	0, 0.000, 0.210, 0.419, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.210 std_dev=0.210
C3'	A	0, 0.000, 0.242, 0.484, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.242 std_dev=0.242
O3'	A	0, 0.000, 0.297, 0.593, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.297 std_dev=0.297
C3'	B	0, 0.000, 0.332, 0.663, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.332 std_dev=0.332
O3'	B	0, 0.000, 0.346, 0.692, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.346 std_dev=0.346
P	A	0, 0.000, 0.381, 0.763, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.381 std_dev=0.381
C2'	B	0, 0.000, 0.397, 0.794, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.397 std_dev=0.397
C5'	A	0, 0.000, 0.414, 0.828, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.414 std_dev=0.414
O5'	A	0, 0.000, 0.426, 0.851, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.426 std_dev=0.426
OP2	A	0, 0.000, 0.445, 0.890, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.445 std_dev=0.445
C4'	B	0, 0.000, 0.517, 1.034, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.517 std_dev=0.517
OP1	A	0, 0.000, 0.523, 1.045, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.523 std_dev=0.523
O2'	B	0, 0.000, 0.565, 1.130, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.565 std_dev=0.565
O4'	B	0, 0.000, 0.786, 1.571, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.786 std_dev=0.786
C5'	B	0, 0.000, 0.806, 1.611, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.806 std_dev=0.806
O5'	B	0, 0.000, 0.933, 1.866, 1.866 max_d=1.866 avg_d=0.933 std_dev=0.933
C1'	B	0, 0.000, 1.129, 2.258, 2.258 max_d=2.258 avg_d=1.129 std_dev=1.129
N9	B	0, 0.000, 1.741, 3.483, 3.483 max_d=3.483 avg_d=1.741 std_dev=1.741
C8	B	0, 0.000, 1.899, 3.797, 3.797 max_d=3.797 avg_d=1.899 std_dev=1.899
P	B	0, 0.000, 2.092, 4.184, 4.184 max_d=4.184 avg_d=2.092 std_dev=2.092
OP2	B	0, 0.000, 2.500, 5.000, 5.000 max_d=5.000 avg_d=2.500 std_dev=2.500
C4	B	0, 0.000, 2.726, 5.453, 5.453 max_d=5.453 avg_d=2.726 std_dev=2.726
N7	B	0, 0.000, 2.823, 5.646, 5.646 max_d=5.646 avg_d=2.823 std_dev=2.823
OP1	B	0, 0.000, 3.162, 6.324, 6.324 max_d=6.324 avg_d=3.162 std_dev=3.162
C5	B	0, 0.000, 3.243, 6.486, 6.486 max_d=6.486 avg_d=3.243 std_dev=3.243
N3	B	0, 0.000, 3.304, 6.608, 6.608 max_d=6.608 avg_d=3.304 std_dev=3.304
C2	B	0, 0.000, 4.231, 8.462, 8.462 max_d=8.462 avg_d=4.231 std_dev=4.231
C6	B	0, 0.000, 4.251, 8.501, 8.501 max_d=8.501 avg_d=4.251 std_dev=4.251
N1	B	0, 0.000, 4.682, 9.364, 9.364 max_d=9.364 avg_d=4.682 std_dev=4.682
N6	B	0, 0.000, 4.931, 9.861, 9.861 max_d=9.861 avg_d=4.931 std_dev=4.931

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.09	0.09
C2	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.09	0.13	0.23	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.05	0.06	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.11	0.03
C4	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.19	0.14
C4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05
C5	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.12	0.23	0.15
C5'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.07	0.10	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03
C6	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.09	0.15	0.27	0.18
C8	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.02	0.08	0.17	0.11
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.10	0.15	0.26	0.18
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.07	0.11	0.19	0.15
N6	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.10	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.04	0.02	0.00	0.06	0.11	0.18	0.31	0.19
N7	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.22	0.12
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.08	0.15	0.12
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.04	0.06	0.00	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.18	0.06
O4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.10
O5'	0.00	0.09	0.02	0.04	0.05	0.01	0.06	0.00	0.09	0.02	0.10	0.07	0.11	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.05	0.13	0.00	0.04	0.10	0.01	0.12	0.01	0.15	0.08	0.15	0.11	0.18	0.10	0.08	0.01	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.23	0.01	0.11	0.19	0.00	0.23	0.01	0.27	0.17	0.26	0.19	0.31	0.22	0.15	0.03	0.18	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.03	0.03	0.14	0.05	0.15	0.03	0.18	0.11	0.18	0.15	0.19	0.12	0.12	0.03	0.06	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.57	1.05	0.26	0.17	0.62	0.21	0.34	0.43	0.47	0.06	0.81	1.02	0.27	0.05	0.37	0.19	0.22	0.51	0.53	1.61	0.77	0.99
C2	0.73	1.95	0.27	0.10	1.22	0.05	1.03	0.54	1.32	0.37	1.76	1.73	1.18	0.54	0.77	0.12	0.17	0.55	0.55	1.61	0.52	0.95
C2'	0.49	0.93	0.18	0.12	0.49	0.18	0.18	0.43	0.30	0.19	0.66	0.92	0.07	0.22	0.26	0.15	0.16	0.45	0.53	1.57	0.90	1.01
C3'	0.35	0.59	0.09	0.05	0.23	0.12	0.10	0.43	0.02	0.38	0.31	0.62	0.26	0.45	0.06	0.12	0.09	0.32	0.51	1.31	0.89	0.91
C4	0.70	1.67	0.26	0.10	1.07	0.07	0.85	0.53	1.08	0.28	1.47	1.53	0.93	0.41	0.68	0.13	0.17	0.55	0.53	1.49	0.47	0.87
C4'	0.33	0.41	0.16	0.14	0.11	0.20	0.23	0.36	0.18	0.45	0.13	0.47	0.41	0.55	0.01	0.22	0.19	0.32	0.49	1.31	0.95	0.92
C5	0.76	1.91	0.26	0.08	1.26	0.00	1.09	0.53	1.35	0.46	1.74	1.73	1.23	0.64	0.82	0.10	0.13	0.54	0.48	1.26	0.22	0.70
C5'	0.16	0.09	0.05	0.05	0.15	0.09	0.48	0.38	0.46	0.63	0.19	0.17	0.68	0.76	0.21	0.20	0.12	0.16	0.48	0.91	0.85	0.75
C6	0.79	2.18	0.27	0.08	1.43	0.02	1.29	0.52	1.61	0.59	2.03	1.93	1.51	0.81	0.93	0.09	0.14	0.55	0.47	1.26	0.15	0.68
C8	0.71	1.44	0.27	0.11	0.98	0.06	0.77	0.48	0.94	0.29	1.25	1.37	0.80	0.39	0.66	0.15	0.16	0.55	0.45	1.11	0.22	0.63
N1	0.77	2.17	0.28	0.09	1.39	0.01	1.23	0.54	1.57	0.52	2.01	1.90	1.46	0.74	0.89	0.10	0.15	0.55	0.51	1.45	0.32	0.82
N3	0.69	1.70	0.27	0.12	1.05	0.09	0.83	0.53	1.07	0.24	1.49	1.54	0.91	0.36	0.66	0.13	0.19	0.54	0.56	1.66	0.62	0.99
N6	0.82	2.42	0.28	0.07	1.59	0.06	1.51	0.49	1.88	0.75	2.30	2.10	1.81	1.03	1.05	0.07	0.12	0.54	0.40	1.06	0.06	0.53
N7	0.76	1.80	0.26	0.06	1.23	0.03	1.06	0.50	1.29	0.48	1.63	1.66	1.17	0.65	0.82	0.09	0.10	0.53	0.43	1.02	0.06	0.55
N9	0.66	1.38	0.26	0.13	0.88	0.11	0.64	0.50	0.81	0.16	1.16	1.30	0.65	0.23	0.56	0.15	0.19	0.54	0.52	1.43	0.51	0.86
O2'	0.49	0.86	0.22	0.17	0.43	0.27	0.09	0.34	0.20	0.25	0.57	0.86	0.05	0.31	0.22	0.19	0.19	0.49	0.49	1.70	1.06	1.08
O3'	0.30	0.43	0.06	0.06	0.09	0.14	0.27	0.37	0.23	0.50	0.11	0.48	0.49	0.62	0.04	0.13	0.07	0.30	0.46	1.23	0.99	0.88
O4'	0.46	0.71	0.25	0.19	0.37	0.24	0.08	0.41	0.16	0.23	0.46	0.73	0.04	0.27	0.20	0.22	0.25	0.43	0.53	1.51	0.82	0.98
O5'	0.21	0.30	0.01	0.04	0.03	0.04	0.25	0.46	0.20	0.45	0.06	0.35	0.39	0.52	0.08	0.16	0.01	0.14	0.47	0.71	0.53	0.58
OP1	0.02	0.35	0.05	0.02	0.43	0.01	0.67	0.16	0.70	0.64	0.55	0.23	0.85	0.79	0.38	0.29	0.00	0.02	0.15	0.20	0.13	0.02
OP2	0.41	0.57	0.09	0.01	0.35	0.00	0.16	0.21	0.22	0.02	0.40	0.60	0.09	0.04	0.24	0.28	0.02	0.27	0.16	0.03	0.16	0.02
P	0.22	0.19	0.02	0.02	0.02	0.02	0.20	0.26	0.17	0.32	0.01	0.25	0.31	0.38	0.04	0.21	0.01	0.15	0.23	0.14	0.08	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.10	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.28	0.01	0.06	0.24	0.60	0.21
C2	0.03	0.00	0.14	0.07	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.33	0.18	0.24	0.12	0.33	0.01
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.20	0.07	0.08	0.11	0.13	0.05	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.23	0.66	0.90	0.59
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.13	0.00	0.21	0.01	0.21	0.26	0.14	0.03	0.25	0.27	0.15	0.01	0.00	0.01	0.03	0.23	0.39	0.21
C4	0.02	0.00	0.08	0.13	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.12	0.18	0.12	0.27	0.11	0.36	0.01
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.07	0.10	0.01	0.06	0.02	0.19	0.00	0.01	0.02	0.05	0.39	0.08
C5	0.03	0.00	0.04	0.21	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.21	0.03	0.10	0.39	0.01	0.20	0.10
C5'	0.10	0.16	0.20	0.01	0.12	0.01	0.09	0.00	0.10	0.02	0.14	0.16	0.08	0.04	0.08	0.02	0.19	0.03	0.01	0.26	0.32	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.21	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.19	0.07	0.12	0.40	0.00	0.14	0.13
C8	0.02	0.01	0.08	0.26	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.11	0.01	0.41	0.02	0.32	0.06
N1	0.03	0.00	0.11	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.20	0.16	0.33	0.05	0.21	0.08
N3	0.03	0.00	0.13	0.03	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.17	0.19	0.16	0.41	0.06
N6	0.03	0.01	0.05	0.25	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.23	0.02	0.11	0.46	0.08	0.00	0.21
N7	0.04	0.01	0.04	0.27	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.28	0.12	0.04	0.47	0.05	0.13	0.16
N9	0.01	0.01	0.00	0.15	0.01	0.02	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.16	0.10	0.04	0.26	0.13	0.45	0.06
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.12	0.19	0.21	0.02	0.19	0.26	0.11	0.01	0.23	0.28	0.16	0.00	0.01	0.13	0.21	0.76	1.02	0.63
O3'	0.28	0.33	0.03	0.00	0.18	0.00	0.03	0.19	0.07	0.11	0.20	0.36	0.02	0.12	0.10	0.01	0.00	0.21	0.14	0.10	0.18	0.03
O4'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.12	0.01	0.10	0.03	0.12	0.01	0.16	0.17	0.11	0.04	0.04	0.13	0.21	0.00	0.14	0.08	0.40	0.00
O5'	0.06	0.24	0.23	0.03	0.27	0.02	0.39	0.01	0.40	0.41	0.33	0.19	0.46	0.47	0.26	0.21	0.14	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.24	0.12	0.66	0.23	0.11	0.05	0.01	0.26	0.00	0.02	0.05	0.16	0.08	0.05	0.13	0.76	0.10	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00
OP2	0.60	0.33	0.90	0.39	0.36	0.39	0.20	0.32	0.14	0.32	0.21	0.41	0.00	0.13	0.45	1.02	0.18	0.40	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.21	0.01	0.59	0.21	0.01	0.08	0.10	0.01	0.13	0.06	0.08	0.06	0.21	0.16	0.06	0.63	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00